Os06g0547900

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os06g0547900

Description

Similar to Shaggy-related protein kinase eta (EC 2.7.1.-) (ASK-eta) (BRASSINOSTEROID-INSENSITIVE 2) (ULTRACURVATA1)

Version

NM_001064359.1 GI:115468449 GeneID:4341251

Length

6798 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os06g0547900, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 6

Location

Chromosome 6:21594834..21601631

Sequence Coding Region

21594969..21595079,21596046..21596135,21596234..21596293,21596376..21596648,21596740..21596814
,21596897..21596953,21597643..21597783,21597889..21597939,21598017..21598112
,21598305..21598388,21600562..21600663,21601083..21601154

Expression

GEO Profiles:Os06g0547900

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggccgcgatgccaggtgggcccgaccttgccggggccggtggcgccgtcgccgtcgccgtcgacgcgatgcaggtcgacgacccgccgcgtgcgtccgccgaggagaagcatggtcccactataatgggaggaaatgatccagtcacaggtcatataatttcaactactattggagggaagaacgatgagcccaaaaggactattagctatatggctgaacgagttgttggaactggatcctttggtgttgtattccaggcaaaatgccttgagactggtgaaactgttgccattaagaaggtcttacaggacaaacgatacaagaacagagagttacagataatgcgatcaatggatcattgcaatgtcatctccctaaagcattgtttcttctctaccacaagcagagatgaacttttccttaacttagtcatggagtttgttcccgagtcactttatcgtgtcctgaaacactacaaagatatgaagcagaggatgccacttatatatgtcaaactttacatgtatcagatattccgcggattagcttacattcacactgttcctggagtttgtcaccgagatataaagccacaaaatatcttggttgatcctcttacccaccaagtgaaggtctgtgattttgggagtgctaaaatgctgattaaaggtgaagcaaatatatcttacatatgctcacgttactatcgtgctcctgagctcatatttggtgcaactgagtacacaacatcaattgatatatggtctgctggatgtgttcttgctgagctgcttcttggtcaacctctgtttcctggtgaaagtgcagtggaccagcttgttgagataattaaggttttgggtactccaacgcgagaggaaatccgttgtatgaatcccaattacacagaattcaaatttccgcagataaaagcatgcccatggcacaagatcttccacaagcgaatgcctcccgaagcaatagatcttgtgtcccgtctccttcagtattcgccaaatctgcgatgtactgcgctggaggcatgtgctcattcattttttgatgagttacgagaaccacatgcaaaactgccaaatggccgtccgtttccgcctctgttcaactttaagcaagaattagcaaatacacacccagagctcgtgagcaggctgttaccagaacatgcgcagcggcattcaggattttaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAAMPGGPDLAGAGGAVAVAVDAMQVDDPPRASAEEKHGPTIMG GNDPVTGHIISTTIGGKNDEPKRTISYMAERVVGTGSFGVVFQAKCLETGETVAIKKV LQDKRYKNRELQIMRSMDHCNVISLKHCFFSTTSRDELFLNLVMEFVPESLYRVLKHY KDMKQRMPLIYVKLYMYQIFRGLAYIHTVPGVCHRDIKPQNILVDPLTHQVKVCDFGS AKMLIKGEANISYICSRYYRAPELIFGATEYTTSIDIWSAGCVLAELLLGQPLFPGES AVDQLVEIIKVLGTPTREEIRCMNPNYTEFKFPQIKACPWHKIFHKRMPPEAIDLVSR LLQYSPNLRCTALEACAHSFFDELREPHAKLPNGRPFPPLFNFKQELANTHPELVSRL LPEHAQRHSGF</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>136..246#1213..1302#1401..1460#1543..1815#1907..1981#2064..2120#2810..2950#3056..3106#3184..3279#3472..3555#5729..5830#6250..6321#agcctcctcccatcaccgaggagagagagagagagagagagtagtgagagaggaagacgagagagccgcctccgcggccatcgccgccgccgcagcagcggggccactaccccgactgccccctcccctcctcccatggccgcgatgccaggtgggcccgaccttgccggggccggtggcgccgtcgccgtcgccgtcgacgcgatgcaggtcgacgacccgccgcgtgcgtccgccgaggagaaggtgagcgttcgccgtcctcccgccgcgtgcgggggccgcgcggcactgggctgggccgcccgagcggctagggtttccatatgctttgaccagcacccttcccctccccacggcgtacctggatctgccgcctcggcggtggatctgctagctgctgtcgattcgttttgtgggagctgggcgcgctccggatctgcccgcgccgtattatttctactatggattactcccgtttctgccattttggggactaatgactaatcctgtggtgattagcgctagactgtgctttgcgtggttacgctttgcttcgcggagaggcgaacgtgctgggcgcctgggcgctttgcgagcgttaccgctctctggtggcaacttttgtgcatcccaagcttgcttccttctagttagcttgtgaggattaatgtgaaatggcagttagcttagggtgttggattgtctatgggccagtatttatgtgtcctgttgacctgttcggatggtattgttctccagtagtttctgcatggattgttgtttatttgagttaaagtggaaatgccaattaatttttaagttaaaattgaaaatgcgcattaatttttaagttaaaactgggaatgcccattagtttttaggtcatttagttgatataccagctttcggcgggaatacagttcaaacatgccacgtttgcctatatgggttcagacacttggttttaccggttagtgcaatcaccgaaatgcctttgtagtatttaggtaatgttacttggaatcacataaagctttctactgctaatactgaaatagctcctgtaaactgatggcatctgttagttctaggtttttatgaactacgaacttcatgagcttgattgtttgtttaagtttcttctggttgctgatcattatattgcctatgtcttgccctatcttatggttcgtttccatgtcatggcagcatggtcccactataatgggaggaaatgatccagtcacaggtcatataatttcaactactattggagggaagaacgatgagcccaaaagggtatgctattatttttggacaaagaatgtcgcatgaagtttcttaagtatggagataataatttcattctaacttgattctaactttttgtcctctagactattagctatatggctgaacgagttgttggaactggatcctttggtgttgtattccaggttagagatatcttcctgatgttctcaccatgattctggattacataactttatcgtattagtcttgtgcatgtgcatgcaggcaaaatgccttgagactggtgaaactgttgccattaagaaggtcttacaggacaaacgatacaagaacagagagttacagataatgcgatcaatggatcattgcaatgtcatctccctaaagcattgtttcttctctaccacaagcagagatgaacttttccttaacttagtcatggagtttgttcccgagtcactttatcgtgtcctgaaacactacaaagatatgaagcagaggatgccacttatatatgtcaaactttacatgtatcaggtgggtgatggttctagtgtgtgttgttttaatgcttaacttaaatggtgctcattacttaattgctaatattccattctatctcatgcagatattccgcggattagcttacattcacactgttcctggagtttgtcaccgagatataaagccacaaaatatcttggtatgcccttttcttcttaccaagcgtatcatgttttcacactgctgcagctgaaaattcttggttttgattgtgttgataggttgatcctcttacccaccaagtgaaggtctgtgattttgggagtgctaaaatgctggtatgtaaaggctgatagataatgttattgtcttcttgagctataatgactgcattccaattgcatgttcatataatcatatttgatttgtggcggatgctactagaccatatcatggtggttattgtgttacctatgttaattttgcttttatttaaagtaatttagtaagcaatatgtaatttctagttttgttattgctctaatgttagtaaaacaaatgacccaatattaattggtcattggtgatagatccttgacttcaaccttgttggcctaatctatactataacacaagagaacataatagtaaacataatggtagttatgactttaaaacttaatgttatctatatattttatctaaacttttaagttaataaaatcattataatcaactattggtctatttaagcttcttgttcaactacctgtagtcaaattattgttgatttaatgagtgattgaggccagtttaatgctaccatcgactctgttcagattgggcatgttcgtttggtttttatgtgcttatatgtaaactaatcacatgaattacttttgtattatttacatggaaattaactgaacaatcctcttgatagaaaatggttctatacagcctatccataggttctttcttgtccagttctactttttaatactgtatttaaatgccaaactgccagattaaaggtgaagcaaatatatcttacatatgctcacgttactatcgtgctcctgagctcatatttggtgcaactgagtacacaacatcaattgatatatggtctgctggatgtgttcttgctgagctgcttcttggtcaagtaagtactcttatattttgtttttatcatttcttaacttgttcagttgtggtagtagcatcttgaattatactaaatgcatcctttcttttgcaattttatcagcctctgtttcctggtgaaagtgcagtggaccagcttgttgagataattaaggtacttagttcttaaaagtttgtagcaaatttactatctcatttttgaaagaattgaaaaacagtaacttcttgcaggttttgggtactccaacgcgagaggaaatccgttgtatgaatcccaattacacagaattcaaatttccgcagataaaagcatgcccatggcacaaggtatgtggaccactctccttatactgcaccatttaaattcaatacttcattggtggattgagaagtatctccagtttgagtcaacattgtcagacaaatgaagacgtgaaatttcagtgtgcactatgcatataacttgcatcatccgttaggagttccccatgaagtaattttgcaatggtattactgcagatcttccacaagcgaatgcctcccgaagcaatagatcttgtgtcccgtctccttcagtattcgccaaatctgcgatgtactgcggtaagtttttgatgcttgatttcctgattgaaacttgaaagtatattaaaattgctgcatgcctattaaattttacacacatttgaaattcactaaaaagaaccagatgatagaacatggtaatggtagttgtcgctagactcggactcacagtgctcgttttggttaattaaagtttgtacatccatgctagtgaccccatttctcatcacgtggttgtgtgtgaccctatatttcaaattatgttggtaaacggttggttatttggtgctaatcaaaagaatcgaagagctaatgctgttcaaggttgaggaaacaacaacaattcaacattgagaaattaaaaaaaaaatgtgttgcttgaatttactaggaaacttgggtgaaatcaagatagtttctggtttctcattggggttcagaattttcctgaaatctacaaaatcaaaccccagtgatgcgagaacagtttgtcctaaacattatgcacagaacaatgcaccatcttctattcatgccgagtgaccctgcttccttctcttgccacccaatgggcttgaatgtctaatgtgcaagtaaaaaagaagacagttaggtcatcggaaccatgaattcatagtgttctctgttagttcctgaaagggtcacttaggcctaggaaggacgccggggggggggggggggggggttgaatgggctaatttgaaacttaagtaaatgcggaagcaaggcttttcggaaattctgaaaatcacagagtaaacgcacagctcaaagtatgctagatctaggtactcacaaatatgaagaacaagcacaaacagcaactagactagtagtgccacaaacaagcaatgctagaggagggagagagggatttcaccgaggttcttgcaagatgaggtgttcctgaagtttgaatacttgaggggattctagtctccgttgaggagctcaccaagagccaggtcttcgctaaccctttcctctagaggttgcacaaaacactcattccactaatggtaactctttcctttcggtggtgagatctgaccctcacaaacttctcctggccaaccacaagtgaatcagtggatcaagagtgacacctaaccgtccaggaatcctcaactcatactcaaataagttgttagtcctctctaatcacattattattaatcaccaaaataattaggggcctagacgcactttcagttttccttcttccattcttaaaattctaatatcacataatatgctagcaatgtattcctcattactatgatgtatacagtctagta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External Link(s)

NCBI Gene:Os06g0547900, RefSeq:Os06g0547900