Os06g0581300

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os06g0581300

Description

Protein of unknown function DUF1475 family protein

Version

NM_001064473.1 GI:115468677 GeneID:4341379

Length

5697 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os06g0581300, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 6

Location

Chromosome 6:23576283..23581979

Sequence Coding Region

23576375..23576502,23576999..23577050,23577867..23577940,23578056..23578145,23578656..23578799
,23579708..23579759,23580362..23580435,23581107..23581196,23581760..23581823

Expression

GEO Profiles:Os06g0581300

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008399:23576283..23581979 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggcggcggcgggatccataggcgtgtacagggcggtgttcgcggcgctgggcgctctcatgctgggcaccctggtgtacacctgcgtcaccgacggctcgccgtttcgcctcgagctgctcaccccgtggttggtggcaacactgattgatttttatgtcaatgtgactgcgatttcgacttgggttatctacaaggaagtaaattggattagttctttcttttgggtagttctgttgtactgttttggcagtattgctacatgtgcttatgttgttgtgaagctttttgaaataaaaacttccggaccttcacaagatccacttgatcttttattcctcaggcaaggagatctatccgaaagaaagtcctcttttgtcataattgggagaattattttcagcattttgggggcaatgatggctgcagtcgtaatttatactgtcatcactgatggactacctttcaggaaggacttgttgaccccgtggatggcggcaaccttaattgacttctatataaatgtcttcgcaatatcggtatgggttgctcacaaggagtcaaactggatatctactgccatctggatatgcttgttaatatgctttggaagcatcacgacatgtggctacattgtcatacaacttttccaagtgtcgtaccgagacccaatctatcatgtgctattgaactctcataacaagagcctcaacgcagagcagggaagacttccaagcattataccccctagctctgccaaagtatga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAAAGSIGVYRAVFAALGALMLGTLVYTCVTDGSPFRLELLTPW LVATLIDFYVNVTAISTWVIYKEVNWISSFFWVVLLYCFGSIATCAYVVVKLFEIKTS GPSQDPLDLLFLRQGDLSERKSSFVIIGRIIFSILGAMMAAVVIYTVITDGLPFRKDL LTPWMAATLIDFYINVFAISVWVAHKESNWISTAIWICLLICFGSITTCGYIVIQLFQ VSYRDPIYHVLLNSHNKSLNAEQGRLPSIIPPSSAKV</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>93..220#717..768#1585..1658#1774..1863#2374..2517#3426..3477#4080..4153#4825..4914#5478..5541#tttcgtctcgcggtgagtttttggtagtttagtttgatacaccacttcgtttgataccctcggcgaccgcgcggcggccagcgggcgcatccatggcggcggcgggatccataggcgtgtacagggcggtgttcgcggcgctgggcgctctcatgctgggcaccctggtgtacacctgcgtcaccgacggctcgccgtttcgcctcgagctgctcaccccgtgagtgcgttgatacaccacttcgttttccttccccctccatggaagaggattgggtgctagttactgccgcgaattttggtagtgctggctaatttcagatgtgctagttactgattgttagtcagctattgctttttttactaaagtagaccatttcaagcttttggatttttgttttaaatttaggcgtaatgattagcaaatgttgggagtcactagtactattttaagtattattccaatgttattgtctgtgacctgcacaatggtgctgcagaaagacaggaagtataggtagttctcgatggatgcaactttggataattaagtgcaccaattatgctctagacctctaggtttgtagtttgtgcccaaggctttgagagagtttgtatgttcttaacgaatgaactatgtgttgcatcagagtagggaggtcagaactattgtccaaaagcgccttaacttgaagttgtaatttttctctgtgtaggtggttggtggcaacactgattgatttttatgtcaatgtgactgcgatttcggtaattcatttatctctgtgctgtactttgcgccctcttcaccaactagttattttgttacgaaggaagtgtttacaagcagtatgattagaaggaattattttctggagcgtgaagtgaaagcggcagcagtcaattgtttgcatgcattgtacaaaagtgcaatatgttctaccattttttaaatctgttatttacgaataaattcaatgttgccaaaacatatttcataggagatataatgcttggagttagaccttttttttttctgtgtgtactcaattgataaaatgtttgctaaatttgcgaatctggtgaaattttgatttccaccaaacatagttcctgatctgtatgagggaatggtatctaactggttgaagctttaactaaattgcatgacgattgatctcagatatgaaatgatagtagagaagttttgttgtattatctctcttaacatgtattttttttttgtgtgtgtgtgtgtgaagtttggagcttttgctgatatttctgctccaactccaatctgtgtaccactgaaaaactaacagagaattcttttgtgtgtcttatcctaattagctcctttcccctgattaagacaaacaatttctagattccaccttaaatatatacacaaactaaaggatatttggatctgcaagggttgaccactcaaatgctttgctctacatgatataaataatgtaaaagaaaatcattatttatttgtccgcttcatgtatggagatacaattttaaatattatttcatcttgatgtgagctagagatgttcttgcatgttgcagacttgggttatctacaaggaagtaaattggattagttctttcttttgggtagttctgttgtactgttttggcaggtactcatttccttcttgataatatttgtggcttgtcaaactttcataattctgtttgaatggagatattcattttacctaatgtgatcatccttttttcctgttatcttttcagtattgctacatgtgcttatgttgttgtgaagctttttgaaataaaaacttccggaccttcacaagatccacttgatcttttattcctcaggtacagattcaaatttttcctagcgtatgcaggatgaaaagattttagtttgatgcttttgacagcataatttggcaaatcaagtaaaaaaaagttttttttttacatgctgatattgaaaacagaaatggatttggcaattttgttctttttctgggctgggggcactgatggtctggtggacatggactataagaagcttatattggttcatggttacgctatgttctctttcaactttggggggacctgtgaaatgtgttatcctgtagatttcaacacctacaacaagaaacttttgctttcacagtttttgcatcttttgggtctagatccctcatatgttgagtaatatacctaacactccaaattccatagttccatagtgcatgctctcaccaatgtggtgaccttgtgtcacattctggatgtctaaggaatattgttgttcatatatcaattgttattcttatcttctgtgttttgaggtgtttctcaacttcttttcaggcaaggagatctatccgaaagaaagtcctcttttgtcataattgggagaattattttcagcattttgggggcaatgatggctgcagtcgtaatttatactgtcatcactgatggactacctttcaggaaggacttgttgaccccgtaagtgaaccatatttgctcagattatttaagaaaccttattttctttaagtacattctaagtccagttgaatgcagcaagcaaaatggataaatcccagtgattgaatgaaagatcacagaggcatagattgataatacagctaaaggaaattttgaaaataatatatttaataagcaagacaaatgtgtatttacaagtgctataagcaccctatgctgaatttacattcaagagttaaactagtaactgtcttgttaggagcacttagcacttaccatagttgtgtacaggcaaggagaacattttacttgtgttctggacttatcttctaaaaatttgactgcaaatagtcataaaaaattctgaaataacttagcagtatagatcattatctataaaaacaatgtgtaaaaattcaactgcaaatgtggcttgtattgggagaaacaaaaaaacaaatatcagtgaatagtagctttccctttttctttttgccattccactttccgttgaatttttcctttctatttcttcatgtccacatcaaatttagatttgaaattttctatcatgatagttgatagatttattttgtatcaccactaccaaattatttgagaaattttcatgactattttcaccataagagtaggaagcacaggaagtccatgcagagttaaaaaaagaattttggaggccagccctaagtaatgctctggaagtacattttcgattagtatagtgttgtatatgttttcacatgatttgttaaatttatcagtacatgcttcaaacatgctaactctgtagatgttgtctggcactttttattttcttttttccttattatacttgtgttatcaattagaaaaatatcaaatttaatattttcctttgcattcaggtggatggcggcaaccttaattgacttctatataaatgtcttcgcaatatcggtaaattacattctttggtttttagaaattgttccaagtaattttgtgcgacacactagtttgcctgcatgaatgcatctgcatcttggaaattgttgttcatatttttgtgcaaacggtgggaaacgatttttatttgctaaaactacttttgcatgactctattgttatttggaacagttgtcttaagctcagctctaatcatgccatggcacccacagttttctgctaatagttttttggtatttgttatgaaaatatattccattaaaatctacaacacattaatccttatgtccagtatattttatcatttttttctttcctctttgaaaatatgtgaagataatcttattttttaaaaataaaaacataagcgctaattagcaatgctagcacaacctcccacctactgaaaaggtgtttccatgaagtaattaatacgtcctgcaactataaaatggcagggcactgctggctggtagagtggtagcgtcctaggcactgcatgtagtggctatatcttctatcagtaaattaaaaagaaaaccatcatagtggctatatcttctatcagtaaatttttggtgatatgtctgcaggtatgggttgctcacaaggagtcaaactggatatctactgccatctggatatgcttgttaatatgctttggaaggtacacaattttttgttgaggattataaaggaaacatctcattggatatctactgccatctgggttgctttcgaaggattatattgctacattgcattggggttatatttgtccttgtgacttggattttactgcatgaactttgtagaatattttttgtttgcacttcttaatcataaggtgcaactagtagttactgccacctatcaaatactgtagataaaatattctacagattttggcaacaaattagtcaaattcccaagtatagataatatacaaaaattataccaatagattgacatttcaaagtgcgttcatacaatataagtttgataactactgatatatattttttgagaaatcaattatcgaagtttaatcttgaagacttttaaatcaagtatgccttataaaaatcaatgaaggttgtgccatgttagctgtatgatgcatacatttttcctgccacttgtattttctagtgcttctccttatgagtagtgtctagattatgtttatttgtatatgggaggcactttcctgctcaagaatagttagtcacgtaatatgaacatctatagtaaattcatcagtgagttatgcgcatcatgatgtatttatttgtaaggaacttattgaccctttccactttttttcatttgatctagcatcacgacatgtggctacattgtcatacaacttttccaagtgtcgtaccgagacccaatctatcatgtgctattgaactctcataacaagtatggcattgttccctcccactaatccctgatcttctccaagccttgttagcttgtggttgtctaaactttgcttgacatatggtcatttatctggtatttatatgtctgaaatgtaggaagatttgaaaatatcattgaagagttatgttattcttggtatacaataatattacctcaataaatggtgtatcgtctagacaaatagggaattctcggtgtaattacatatcattctcagtgtaatgacataactttggcaatttctctacaaaaggaccagactatatgcagtttgcagctcctttatctgtcgtgttttttaattaaccctttatttgtatatctgatttagtcgatttgcaaaagttttcttcattgtagttgttatcaaaattgtaaggtcatgtaacacaaagggttactaaagtgaagtaaagaaaatgtgactgtcttgtttaactgggaaattatttgaattgccaaataagtttgcagtcttgctgaaatcgggctcgcaagactcttttgatttgatacatctctatcttgagtgtgtgaaggagcctcaacgcagagcagggaagacttccaagcattataccccctagctctgccaaagtatgaagaatatgtaagccatcttttgccagttcttttgcagacagaattccaatatgcagggattcagatcattctcattttgttctttctgttggagttagaaaaatctttgcttcggcatactctcaaatataatagctttgaattctggacccctgg</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os06g0581300, RefSeq:Os06g0581300