Os06g0612150

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os06g0612150

Description

RNA polymerase, alpha subunit domain containing protein

Version

NM_001187970.1 GI:297725070 GeneID:9270399

Length

9728 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os06g0612150, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 6

Location

Chromosome 6:25288910..25298637

Sequence Coding Region

25296105..25296332

Expression

GEO Profiles:Os06g0612150

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>tcaaacactgtatttctttttagcacatacaatgctgattttgatggagatgaaatgaatgtgcactttccacaagatgaaatatctcgtgctgaggccatcaacattgttgatgcaaataagcagtacattggtccaaggagtggggatgctgtcagaggcctcattcaggtaacactgtgcatatgcagttgggatgtttcggttcttccacactgttgctgttga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>SNTVFLFSTYNADFDGDEMNVHFPQDEISRAEAINIVDANKQYI GPRSGDAVRGLIQVTLCICSWDVSVLPHCCC</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>7196..7423#agcgccgcttgaaacccctcctcctcccttctccctccacactgcgcggcggtggcccaaggccggcgaatccccacctcctcctcccccctctcgcctccgccgcgcggggggcggccgccgcctcctctcctcgcccgccgccacctccccccacttgtttctgggcagagcgcgcgctcgcgagctcgaggatggccgacgtgcggcccgacgaggtttggttgccggatcattcccagtgattttgcaagtcgtagcatatattccctttgcttctcagtgctagaaatttcatctcgttgcgcttgttttggtgtgttagaacgcgtaccgatatgcttacgattaaggttggggcgcttcagtcctgaaaggttttcaggaaaagcatggcctatttgtgtcttgtcacttttcactgactgtcttattttttttcttttggtttcgagttagtgggggataaatcgcatgattctaattggacttttagtgtacatatgtatattgcagtttgagccttattcctaggtgatcatttacggtctgctgttaaatggttttgcttcttgcgcaggccgcatcagaggaagtgaattctatccacttcagcttctacaatgatgatgaaattaagaggatcagtgttaaacagataacaaagtcggatcgtgtcgatgccaagaactgtcctgtgccaggtggattacttgacccagcaatgggacccacgaatgatactgacacgtgagtacctatccaactattgaaatcgcgcttcgagtgaacacttgttaattacacttaatcctagagatcagctcacatggaactgatacaatctttgacttcagaacaatcatgggtagcatgtgttttattttgcaacattagggtcatcaagatttagcagatttccggttcttttggatatcaatttgtacctcaatagtcagcctagaaaatttagattaagggtctgtttggcagagctctaactcctaaatttagctccaagagttgagtttggagtggagttgattaaacccagctccacctctccagttcgttttgtgagagcgctccacccagctctgctcccattttaggtggagctaaaactgtttggctaggctccagctccagcagaggtggagctggagctgtgccaaactgaccctaacatactaaacagatctttaatttattttttaaaagttagtttaatttgtccggcactttcaatcaaattacagtattgaccattcatgcattggatgtcttatcatagcatttcaaatagattttatgcatgatagaatcaattctaagaggtcatttgaaaatggattatcactgatcaaggattaacttttgtcagtgcttacaacgtgaggattacctcatgtctgtctgcttttttttttgggatcattataaaagataagttttattaggtactaagtttatttgaatctataatgctacatgttttgagggactatttttgttttcatttactttaactcgggggtatatttgatgcaacccttgaagtttctttttgcatgtatcttttttttttgggaaaattagaattttcagtttttgaccatgtctaaattttatgtacagctgcaagagttgtggtcagcagtccattcgctgccccggccattttggccatatcgaattggcgaaaccactatttaatccattgctttttatgagtcttaaaaaccttctccaggttacgtgcttccattgtcacaagttccggttgaacaaggaacaggtgtgcccatgttcatcttatttattttgtttttcaattttctttatcttggagcattcaaggttctgtcgcatcactaaaatatttgattttctgtttactttattaggcagacagatacacaaatgagcttgaactattagtaagaggtgatattgctcatgctaaaaatttggaagacttgggtggcaaagtactttcgaaagaagatgatgaaactgaggccacttcaggtgataaatcggctcgttcggagagggagaataaaacttggacatcgatccaactgaaggaggctctttcgattttctcaaagctaatgaagaaaagacagaagaaatgtgcacattgtgaaaaaaagaatccaattatcaaaaatcctatatatggttggttgatcaaggtacccgtgatgattttaatggcttaaatcttttaggcagtaccatctaacccacaggttacattgattttttaaagatgaacacgtgtcttcctaaaccatggatagggtgctggttgacgtcagccttacgatacacgcttctcaggcagtgcaatgtagaggcacttctgtaaaaggattttttttttttgggggggggtgtaattcctttttaatgatgggtgggaagtatcccaacaaaattccaatctagtggcatgacagcaattagcctaacaggagtgatagaacggtgccgttaaaccatagtggcagaaatgcaattggcccatgttatcacccggtggtgtaaatatgaacatcaaatataatctagcaaattttggatgttgtagtatgttataattccacacaatattttatgattagattcagtggcatattagagtaaacaacagagataaagtttggtataggttgcgattttgtactgtccaccagtactctttatatatatatatatatatatatatatatttaaaaattgcttctcagtcgattttagcctttttttggtaaggttttataacatctctttccttgcattaagcttatccttctcttttccattcaccctctggaaaggggagggtaagctatgggtaggggggggggggtggatgccactctgtgggaacctgtttatcaactaaatgaatataaaattcatagtatgcattagaaaaagcaaagtgatttccccttattttattgcactacactaggtcaaatggtactgacagagtgaccggtgtgtttgcaattttttacggtatatttatgggtaggtcaggttggttgagtaagtaggcatgctctttgccgaggtcgtgtacctttgcatggcatgatttagcatccgtcagcagcattagcaatttcgctttttccttgatgatatcttatacttcttggaactgatatgtctgttgcattatagttcttcactattcactacatgtggtttgtaggatacaacttcttcctctgtaagagcaaatgcgattgccaatgctaaactgagtggagatggtcatgttaatgactcaagagaaactggtgtttccggtcttgatgaagaactaacttcacctggtactttgtccagaagatcaaccaatgaaacaagacgcatttctgatgatacaatcaaagaaatggtggcatcatcaggaaagaaacatctcttgactacagaggttataatactgctatctgtttgagtttaaaggaagccttcatcaatgcagtaccttatgcaagtttttgttccacactactgagcacgtcctttctcaaatgcttcaggttgaatctattctgaaagatttgtggaaaaaggaagcaaggttctgcatgttactatgtgatttccaacagaatacattgagtgtatcagaaaagagaaggggctatgagatgtttttcttgaagaatctgctagtggcaccgaacagattccgcccctcaattagctctagtcttggagtaagtacatcctgctggtataactgactaaatcctgttctgaagtaactaaccgcttctgttatgtgacagatcatggaacatccacaaaatgttctgctcagcaaagtgcaagagtccaatcttgcgcttcagcagagtattgctgcttctaatcatatggaagttcttagaagatggatggatctgcaaagaaatgtaaatgtgctgtatgatagtagtaaaggcctttgtaagtatatctccttctaatgtagaccactcccctttattttcgttgctaacacataaaaagctaaggtgcatcttttcacataactacctggtttccctgcaaaaaaaaagacataactacctggttaacttcttgaaatttgacctcagagcagcgaagtcttatgtgcttttgttgcataaaattgttgttggacataattgtaaacaacttacgctcttataagacggaattcatctcagaagaatatattcaattcaaaccaatgaacttcctggatcattggcccatgtgctagttggagcaagatcatgattcatgaatgcatgttacgttctctcttttgtagatgcattcatgcatcccttaaaagaaggtagtggtggtggcagtgaatctgccaccctacctattttcattgcaaattacccccttgaacttctttatattaagaaacaatcagatctaaatggatatacacatataaatcaaatcgatactccttttaaaagaaaaagtagtggtggtggcagtgaatctgccatcccacctacttccattgcaaattaccccttgaacttctttatattaagaaacaatcaaatctaaatggatagccacatgtaaaatcgaattaaggtgaacattccctatagagaaaaatgtggaacacaatattataataaattttcttttagtaaaagattgtctcactcttttacattttcgaaagtgagagacaatcttgactctgaccgtgcttgtatatatgggttctagtggtttctctgtagatgttgttgagtcgattatctactttatcatttcagtttctgggttacatatgtttttccagacgagaagggattgttaaaaaaaaaaaaacctcaccaacaatgaattatgctccctttttatgaattgtgatttaatctaaaaatgtgcctagttctatttggtagtgttgagatgaactattaatttatta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External Link(s)

NCBI Gene:Os06g0612150, RefSeq:Os06g0612150