Os06g0622000
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Structured Information
| Gene Name |
Os06g0622000 |
|---|---|
| Description |
ATP-binding region, ATPase-like domain containing protein |
| Version |
NM_001064631.1 GI:115468993 GeneID:4341550 |
| Length |
11046 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0622000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:25863848..25874893 |
| Sequence Coding Region |
25864504..25864604,25864685..25864778,25864861..25865068,25865382..25865494,25866334..25866471 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008399:25863848..25874893 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008399:25863848..25874893 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcggatgaaacacttgatttgaatgagccgccacatgaaaatcaaggtggtggcttgaactatgtattattacaaaaagattctaagaacatatgccgcaccaaagtctgtgatattccagttaaagtgccctcggtttggtcaattgttaggtttgtgccaactaaggtgtaccagcagtgtgatttcctgaaattttcactgcttcctgaacctgaagatgatcgtcagaatattgaatggggaaagttcatgcgtttcctctgggacaatcagagggttgctgtagttagattcagctcctttgccttacatattttccctcctcaatctcatgaatctcatgaacgccctaacttctcacatgcggtggtcatgtatgagcaaaaagatcctggagactgcaaaccgatggctggagtatctgatgctttaaaaaggtcatacagaagtgatttccaatctggctcgatgaatccaaagtcatatttgagagaggagatttgtgatagtggcccaaatcctaaggagatgaatgcctcgcgtgtcacagagctgcacaaatcagttccagaatcatcaccatgtgagtctgttgaagatggccctagaattttagatccaatagtgaaaaagagaaccaccactcttgcaaaaaattttgtcagcacggatcctagttatctgcgaacactcagtcagacacatgctggctgggtctttggagcaatagcagagctcattgacaactctagagatgcagatgcatcaaggttgaatatttcagtcaaatcattgttttcgaagaaagcagacaaaaaaatccctgtcttgtctgtaattgatgatgggcatggaatgacttgtgctgaaatgatgagaatgatctcattcggtcacaaaagaccggataagcaacgccaggatcaaattgggaggtttggaattggatttaagactggtgctatgaaacttggcagagatgcaattgtgctaacccaaacttcatcttccagatcagtggccttcctatctcagtcttttaatgaaaataaagataatcttgagatacctgtggtgacatatcgtaaagaagggcaatacatggaagttgattcaagtgtccaatctgaagctactgctgaatataacctgaatgctattaaggaattttctcccttcaatgagtatttcattggagaaaagctagggatatttggtgaagacggtactggaacacagatttatatatggaatttagatagatggggtgcagattacaccttggactggagttcagggaagccatctgaagatcctgtccaccatggtcgtggagacatactaatccgttcaagaagagtcagattgcgcccaggacaaacaagtaacaatgtaccattggactattctcttcagtcctatttggaagttatgttcctgaatcctcggatgaagatctctgtccaagggtcttcggtcaaaactcgccctttagcaaagacccttaacaagacatctgttatatctggtgaaataatgggtaggactattcaattgacccttggaaggagcaatgtagaatgggacagaatgaactgtggaattttcttgtattggcatggccgtctaatagagtcttacaaacgagttggaggtcaaaagcataatgctgacatgggacgtggagtaattggagttgcagatatcacagaccttattgatgatgaagatggtaattcatgggttcttaacagtaaacaagggttccaagattgtgaaatgtatgctaaactggaggagtggcttggtaggaaagcggatgaatactgggatacaaattttgacactctcgaattgagaaaagggagtgagcgctataaggctgatcatgagtgggttcagtgctacagctgtcgtaaatggagaatattgaatgcaggcttcgatacaaagtctctgccagatgaatggttttgctacatgccaccattcaatgggaaatgtgaggttgcagagcaacaaatggcacgtggtgtcattgtgataggtgagaaacgatctgaacatgataagcgtgataggattacccagcaggaagaggtggctaaggtaaatgcaagagaaactaggtccgatgacagccagtctcaaaaatttactcaagatgaagatgtgaaggacgtcaaactaatctcaacggttgtcaacaagaaaaggaaatcatccaatgggacccggtcgatggacaaaaacaacagcgaagataagcatgatgatgctgaaggcgactcctcacaaactcagcctggtacccctcgccctgttttgaagaggatacgtaggggccctgctagaagttgtaagcagtcatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MADETLDLNEPPHENQGGGLNYVLLQKDSKNICRTKVCDIPVKV PSVWSIVRFVPTKVYQQCDFLKFSLLPEPEDDRQNIEWGKFMRFLWDNQRVAVVRFSS FALHIFPPQSHESHERPNFSHAVVMYEQKDPGDCKPMAGVSDALKRSYRSDFQSGSMN PKSYLREEICDSGPNPKEMNASRVTELHKSVPESSPCESVEDGPRILDPIVKKRTTTL AKNFVSTDPSYLRTLSQTHAGWVFGAIAELIDNSRDADASRLNISVKSLFSKKADKKI PVLSVIDDGHGMTCAEMMRMISFGHKRPDKQRQDQIGRFGIGFKTGAMKLGRDAIVLT QTSSSRSVAFLSQSFNENKDNLEIPVVTYRKEGQYMEVDSSVQSEATAEYNLNAIKEF SPFNEYFIGEKLGIFGEDGTGTQIYIWNLDRWGADYTLDWSSGKPSEDPVHHGRGDIL IRSRRVRLRPGQTSNNVPLDYSLQSYLEVMFLNPRMKISVQGSSVKTRPLAKTLNKTS VISGEIMGRTIQLTLGRSNVEWDRMNCGIFLYWHGRLIESYKRVGGQKHNADMGRGVI GVADITDLIDDEDGNSWVLNSKQGFQDCEMYAKLEEWLGRKADEYWDTNFDTLELRKG SERYKADHEWVQCYSCRKWRILNAGFDTKSLPDEWFCYMPPFNGKCEVAEQQMARGVI VIGEKRSEHDKRDRITQQEEVAKVNARETRSDDSQSQKFTQDEDVKDVKLISTVVNKK RKSSNGTRSMDKNNSEDKHDDAEGDSSQTQPGTPRPVLKRIRRGPARSCKQS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>10290..10390#10116..10209#9826..10033#9400..9512#8423..8560#8240..8323#7564..7722#7402..7485#6399..6734#6197..6298#5086..5269#4195..4540#3648..3795#3036..3186#2372..2453#1877..1925#tccgatccgaataagccctaaggctagtaggcgagcggaagcggcgtccgccttcaatgctccttcgtatcgccagcacaaaacacgccccgcttcgccgcgcccaaaatcccaccgccgccgcctcctcacccgctgcgcgctcgccgccgtggccgccgcctccgtctccgcctcgcctccgatccctcccggtaatgcccgccgccaccgccaagccctagcttccttccgctatcactcgcgcttcgtttttttttttggtggtgggggggttggttcgctaccaccgccgtggattccggtggttcgtgtgtgcgtgtgtgcatgcgctccgcggccggcgccggagtgctcgtgggtggttgttttttgcgagaaccggggcttgggggggtttggggttttgaggcgaagtggggtttttggtggtggtttcacgactcgcttgcgtgcagtggtttggtacgcgatcggaggctcgattttttttttcattttctcccttgagaaaaatgtgtctagttcaaacccctcaccgctctgatttttttctcctgttcttttttttgggggtaaaagttactgtgcgtggcctttgacgtttgggttttgaggtgaagtgggtagtggtggtgttcgtgacgtgctttgcggttgctcgcgtagtggttggtgcgtgatcgggagattcgggtgcccaaaattttctcttggttagaaatgtgtggaggtggtccattctctctccgctttcagttttatttctctctctgttttttttggtaatttactttgcaatcctattgatgcctttgatgcgcattaagaacttgttttctgagattttttttttgggtgctcatggtctttatagaagacggagtcttttgggatttttgtgggggttgaaggtggtgtcttttaccgagctcggtgtgtaaccaaagtattcactcctgcaataaatgcttaatgtttcggacaagatttggttaaacttttgaaactttgaccatgagtaacttctcaaatgcttagttttgtgtagatttgccttgaaaagttctatcatagcatcataagcttattctaatggtgaatgttttaaaagtttaatcaaatcttgtcctaaatgccaaatatttatgattggaggtgttaagtgacataaatcaccactttggaccgtgatctcaagtactttttgttgctttctttcttctatagtggaatcacattaatatgttgagttatgcgaggctgtaaggagggcatttgatgagtcatggccttcattgaagccttggagctgcatttaacattttaatatactggagagttgagcctcgttgctgcttgcttgtacctgacttatgtagttatgtagggctgaatctgatgtttttataatttgtagcattgcttagttcgattcatctggatagttttaagcatgttatctggcatgtatttagcattctgggatatattattcaccagcaaattcttgtcgtgtttgacctttgtgatgagttttggtcggattggcctgtttgcccagctgatttttttttcttttggcattatttaataacttatagatgaatagtcatgtaacttgggatttgataagtttgcttcctctagtttgaacaattaatgatgtacgatactgtgagtctactataccacatttctggatctactggcttgtttaatggtcatatgttactccagaatgacaattgacctgcttagttaatactcatgcttggtttcagtttcagtttacatgcatgatgatcttttgcttttagaaaatatagttatcatttgatggttgttgctgttcatagggggtgaagagaaggagatggcggatgaaacacttgatttgaatgagccgccacatgaaaatcaaggtatgattatatgagatgcgttgccataaaggatggccaattggccatatcctttctgtagaccaggttccactgcaaaattaagaggaaactgcaccaagtccacttgtacccctgaaacttcacatattgcaaaatctgtggaaactctatcacctatactcctaagtttatattaacagctctagttttgtacttttaactgatcaacagtgttgatagatgtggatagggtcctagtacctcactttaacatgtgatgaagtggcaaacctgtccagcctttttttataacttaaaaatggtagtaatgccaatatgttaacatttattcacatcaattatgaatgatgcttgcttcttttatattgttgttagaattatcctttttggtagaatacatactgtgtgaatttttgcctgaaggatatatttttttgtggtaggtggtggcttgaactatgtattattacaaaaagattctaagaacatatgccgcaccaaagtctgtgatattccagttaaagtgtaagttgatctctttttcttttcctgatctgtgaatactttacaagttttacatcatcatccattggccaaaactattgtcagataaatattgttgatgttctctatcgcatactgtcatcgattggttaaatctacaatctacagtgtgtattagtgggttttcctcttctgttataaagttcaatgctggtgtgttcatgttttcatactagcatcatctgactgctcccgctgtttcacagtacttgtcagagaccctgagccctccattgctctcagtcaaaataaatagtcaccagcaatgatttcaaccatacataccccctgttaaatgccatgctacaactacccaatctcatatgctatcatcaaaatagtggtagagcttttgtaaaaatatatactactaaagtgaattgctgcagctatactgttaatttactcaaatctacaaacatttaatcaacatgtcggtaaaaaaaccatgacttttttttgggtgtgttgttgtggggggtggggtgatttgtttcttaatttcatggaggtatcttatgtctgtgcttttcacatttacaggccctcggtttggtcaattgttaggtttgtgccaactaaggtgtaccagcagtgtgatttcctgaaattttcactgcttcctgaacctgaagatgatcgtcagaatattgaatggggaaagttcatgcgtttcctctgggacaatcagagggtaattattgtttctattgcatgtcataattgctaataaaaatatacaagataggtgctctaaaaaaatatatacaagatattttatctttttttgttacttatttgttcaagtaaaatggggcaaaggattgaccatttggatactatcgtacttcttactgagaacccgcactaggtggggtaggtgtcggacatgggacaaataacagggacatataggctgataggggggaggccatgcactgtagtaccttttatcttccaattaatcaacttttgtcagggttttgttcccctgcaagtcagtaggcatgttgtattttattattagcactattagcattgttctgttctctacttgccattttgtattttattattaacatcattagcaatgttctctgttcttttcttgcctgtaatgtggggtccttgttctttttcggtgcttttttgaaggttgctgtagttagattcagctcctttgccttacatattttccctcctcaatctcatgaatctcatgaacgccctaacttctcacatgcggtggtcatgtatgagcaaaaagatcctggagactgcaaaccgatggctggagtatctggtgagagttttcctatgctgattgttgaacaggaatgctatgcttggatggtttacttctccttttattttggctgaccctatgctaattttatataaaaaaaaacttgaaatttaacaattggcaatacattccagtaatctttgtttcatcaatattggtctattaatccccaagagttgcaattggagtcccttctttttttttattacttcatttgtattctcacttgtccatggtgttggaggaagctctctctatagttaacatcaaagatatacaccataatatgcgtgtagtcagctatgagctatttgctgattcgtttctttgtggtatttaactttattcacttgtctattatgccaccagaatgacacatgaatattgctatgacagatgctttaaaaaggtcatacagaagtgatttccaatctggctcgatgaatccaaagtcatatttgagagaggagatttgtgatagtggcccaaatcctaaggagatgaatgcctcgcgtgtcacagagctgcacaaatcagttccagaatcatcaccatgtgagtctgttgaagatggccctagaattttagatccaatagtgaaaaagagaaccaccactcttgcaaaaaattttgtcagcacggatcctagttatctgcgaacactcagtcagacacatgctggctgggtctttggagcaatagcagagctcattgacaactctagagatgcagatgcatcaaggtatgcccatttcttcaaggttgtgtagccagagattgggtgctgttttttcttgagataatttttagggctgatttggcatttccggtattgtgctgtgctgcaacatgcgatctaattagttaagggtttctttactgattatagttacaaaatatttctattgtggcaaaacagtgaactaaagctctagactacaatcttccactatgccaaactaagttttctttattgtcttgttttacatctcttccagatgaatatg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