Os06g0622500
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Structured Information
| Gene Name |
Os06g0622500 |
|---|---|
| Description |
Tetratricopeptide-like helical domain containing protein |
| Version |
NM_001064634.2 GI:297606190 GeneID:4341553 |
| Length |
11013 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0622500, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:25900530..25911542 |
| Sequence Coding Region |
25900530..25900577,25900864..25900917,25901486..25901545,25902339..25902620,25902973..25903192 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008399:25900530..25911542 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggtggaccgcgtccacggcagcctccgcctcttcatgcaccgcaacgccgtcttcctctgcgagcgcctctgcgcccagttccccgccgagacaaatgtccagttgctagcgacttgctaccttcacaacaaccagccatatgctgcataccacatcttgaaaggcttcttcaatacttttccaaaatataaggaatgcatgttccaagtggtgcaacagggcactaccttcttggagtacactggcagagtggaagctgcagctgagcaatttgtacaagctctgactcttgatcctcttctatgggcagcatacgaggaattgtgcatactaggtgttgctgaagatgcaaatgaatgtttcagtgaagcaacagctctacgtcttcagcaggaactcacatccacatcaaatgtggaaaagtcaaactttgttaatgaaaatcggtttctatcttccaatgtgtcagcaagttttggtgatagtcctaagcaaattaaacagctgcatgctaacaccactgcagaagtatctggttatcctcatgtaaagtcaactgcattgcatatgcagaacggtgcaccatctaatttatcacagtttgacactccatcgccaacttcaacgcaggcttctggcattgctccaccaccactctttcggaatatgcatgcttatcagaatacagcaggtggcaatgctccttccaaaccaaaggttaatgctccgaacctgacactccgaagaaaatacatcgatgaagcaggcctaaagaaggtttctggaaggctgtttaatcagagtagtgattcagttcctcgaagaagtgcaagactttctagagatacaacaataaactcaaactcaaatatctctcaatttggagggaatggaacagatcactcgtcaggaaacaggtaccacgttgttgatgaaatgtggacagataatgtaacttcaacttcgtcttctacaagtatagttgatggaagatatcccgagcaagagaaatctgaacgagttctgtcacaggactccaaattagctattggtatcagggagctaatggcactcttgcggacactaggggaagggtataggctttcttgcttgtttaagtgtcaggaagcattggaagtatatagaaagctcccagaggcacaatttaatactggatgggttctttgccaggttgggaagacatattttgaactcgtcaattatttagaagccgatcatttttttgagttagcgcatcgactatcaccatgcacgttggagggaatggacatttactccactgttctttatcatttgaatgaggaaatgcggctaagttaccttgctcaagatcttgtttctattgatcgactatctccccaagcatggtgtgctgtgggaaattgctttgccttgaggaaagatcatgagactgccttgaagaattttcaacgtgctgtacagcttgactcaagagttgcatacgctcacacgctatgcggtcacgagtattctgcattggaggattatgagaacagtataaaactataccgctctgcacttcaggtagatgaaagacactacaatgcctggtatggccttggagtggtgtaccttcgccaggaaaagtttgagtttgctgagcatcatttcagaagggcattccagataaatccttgctcttctgttcttatgtgctatcttgggatggccttgcatgctttaaagaggaatgaggaagccttggaaatgatggagaacgctatatttgctgataagaagaatccactccccaagtatcaaaaggctttaatccttctaggcctacaaaaataccctgatgctctggatgagttggaacggctaaaggaaattgcacctcatgaaagtagtatgtatgcactgatgggaaagatttacaagcaacttaacattcttgacaaggctgtattttgctttggcattgccctggatttgaaacctcctgctgctgacgttgctataatcaagtcaaaagaaatggagaaggcacaaggatggattgcttcagtgagtcagctttgttccactctaaaaggccagagcaatcatcacgatggcggccggctcgcaattattgctcatgaagtcaggcagaaagcgttgtcgtcgacaaaacaattagcgatctaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MVDRVHGSLRLFMHRNAVFLCERLCAQFPAETNVQLLATCYLHN NQPYAAYHILKGFFNTFPKYKECMFQVVQQGTTFLEYTGRVEAAAEQFVQALTLDPLL WAAYEELCILGVAEDANECFSEATALRLQQELTSTSNVEKSNFVNENRFLSSNVSASF GDSPKQIKQLHANTTAEVSGYPHVKSTALHMQNGAPSNLSQFDTPSPTSTQASGIAPP PLFRNMHAYQNTAGGNAPSKPKVNAPNLTLRRKYIDEAGLKKVSGRLFNQSSDSVPRR SARLSRDTTINSNSNISQFGGNGTDHSSGNRYHVVDEMWTDNVTSTSSSTSIVDGRYP EQEKSERVLSQDSKLAIGIRELMALLRTLGEGYRLSCLFKCQEALEVYRKLPEAQFNT GWVLCQVGKTYFELVNYLEADHFFELAHRLSPCTLEGMDIYSTVLYHLNEEMRLSYLA QDLVSIDRLSPQAWCAVGNCFALRKDHETALKNFQRAVQLDSRVAYAHTLCGHEYSAL EDYENSIKLYRSALQVDERHYNAWYGLGVVYLRQEKFEFAEHHFRRAFQINPCSSVLM CYLGMALHALKRNEEALEMMENAIFADKKNPLPKYQKALILLGLQKYPDALDELERLK EIAPHESSMYALMGKIYKQLNILDKAVFCFGIALDLKPPAADVAIIKSKEMEKAQGWI ASVSQLCSTLKGQSNHHDGGRLAIIAHEVRQKALSSTKQLAI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>10966..11013#10626..10679#9998..10057#8923..9204#8351..8570#8112..8231#7756..7832#7549..7668#6702..6767#6409..6623#5306..5438#4180..4326#3292..3587#2569..2666#2417..2452#2101..2137#1153..1225#1..93#atggtggaccgcgtccacggcagcctccgcctcttcatgcaccgcaacgccgtcttcctctgcgagcgcctctgcgcccagttccccgccgaggtatgcatgtgtttccctgggagtaagcgcggttcagatcgggtgcttggtcggggggtgggggcggcgatttggggtgcgggcgctcgcctgcgccgggggggtcgatttattggcattgtttaggttttagtgtttaggcgtgcgcctggagcttcagtggtgagatttgggccaagttcatgggaaggttgaatgagaagggcttcctctagctatttagccatttggggaagtggtttcagtaattcagtctgtagagaactagagctactgtaattggttgccatagggtttatggataatctgggtgccgaaagacttttatggcctaagataggatacgatttcactcttgcagtctgttttagtgatttggttgggaaatagctatggtgatgtgttacatcttattattttactgggtgtttagaacactagccattgtaagttgcaaaggctagattaattgtacgttaatactatgtagttagctacccatactaccatgctactccctccgtttcaaaatgtttgacaccgttgactttttagtacgtgtttgaccatttgtcttattcaaaaaatttaagtaattatttattattttcatatcatttgattcattgttaaatatacttttatgtacacatataattttacatatttcacaaatttttttaataagacgaacggtcaaatatgtgctaaaaagtcaacggtgtcaaacattttgaaacggagggagtatcttgcaacgtggactactggagtgtgtggatttagctgctttagcttttaacaattcgagtaggactatgtttgggcagaccaaatattacttttttcatgtgttcaattttcttttgtatatgactttaattgtttggcagttattgagatgaagctagatagtgagtaaactgaatccgatacttgtttgctgtaataagagtcttttcagttttctcatcgctgatagcgtgtagttttgttctcttagttcgtatatgaccaggatcacatgttgtactaaatgtatactactcatgtgcacagacaaatgtccagttgctagcgacttgctaccttcacaacaaccagccatatgctgcataccacatcttgaaaggtaataacatatgctcaccacgtgaccacttattattgtgtagaagtgaaatcacattatttaaaaatcaaagaaatgtgaatatagtatctgtccatctttttgggcacatttctatcctgttttgtgatttcagtatattttattctgtggtcgcaaagtgctttggtctttggagcgatttctgatttttatttctgatataacataaaggaaagaagctgccagagtcccggtacttgtttgctatgtcatgcttccgaatgaacctcttacgggaagctgaagaagccttgtgtcctgtcaatgaaccaaatattgaggtatatagcatgtttttaaacattatttgttcattgtgttcctgaaatatatttcatccaacgctcttaattttttcgtaagtgcttgaactcaagttttgttctggacaaggggtcgcatgatgtatcatttgttccatggtgtcttctggattccaaatcagaagtagaaaatgggatgtgcagcatgtttgattattcatgaattaagagttccaaaactggtgatataccatttgaaaacattaagattggttgcctgtcaatgaaatcgtatcaacaatgttatcaatgtgaaaacaagaagtgtatcatgtcttaaaagaaaatatgcatgtatgattaagtgatgtacacgagaaacattgtcactacaagttgatgttttgcttgcatagaaacgtctgcagacatcttttttttctttgggtgcatgacagcattttgaggttgtccactaactgtttgattccacacgggtgaagtaatgatgtggaaaaaaaatcagtttgcatctttgcttactgttatacttcctcccttttttgcaaggcttcttcaatacttttccaaaatataaggaatgcatgtgagtttattgcttttattccttgtttaccctcatttttgacataatacctcttaaattaatgcgaatgaactcactaaccatcagctctatatttcgaatttatttaagtacgggtagaatggtcatctactcatcttaacctctctttctcatggttttagactcttcttaatcttgtgccaacttgacaactcctaatatgacctataaatagaaactgagggattgttattttggtaacttatttcttatatgttgtttcgttcctttgtgcaggttccaagtggtgcaacagggcactaccttcttggagtaatttacaggtttaatattcatgtcataactcgtaactaaatctataatcacagcatatcttgatccattagttgtgtcagatagttcattgtatttaccacatctgcatgtaggtacactggcagagtggaagctgcagctgagcaatttgtacaagctctgactcttgatcctcttctatgggcagcatacgaggaattgtgcatactaggttggtgcgttaatacactatgagtgaagttttttagcacctccattcctagttttatacattagaattacatgcgtcaagtgttgcttcaccacaaagatttatttcctaaatgtctagtagtaggaaatgaaaagtacagtgttgatttttctgaagaagaacacgtcatccaaaatatgtgacttgcagtagaccttcaataggcctgttatgtgttttgcatcatagtagttttattctgtcattcattattagcttgatagatcaataaacaggcataatatttttagccattatgttcattactccctctgtcgattttttgaccaacaaatagtccaacaatatgcagaggctgcgatacagaattggtgtcattagattcacttttgaaagtactttcttgttatcatgattttcacatttagagaccttataaaaaaaacagggattagttcattgccatacatgcccattgatatgcctaatgttgatacattattatttttgcataccgttgcagttacactatggcccagtagtccttatattgaaggcctcatactcactaaatataaaagcaagcatataccatgtgtgtcactaattaactatcttgtaggtgttgctgaagatgcaaatgaatgtttcagtgaagcaacagctctacgtcttcagcaggaactcacatccacatcaaatgtggaaaagtcaaactttgttaatgaaaatcggtttctatcttccaatgtgtcagcaagttttggtgatagtcctaagcaaattaaacagctgcatgctaacaccactgcagaagtatctggttatcctcatgtaaagtcaactgcattgcatatgcagaacggtgcaccatctaatttatcacagtttgacactccatcgccaacttcaacgcaggtcagcaaaacttgtttggttcttcacccagtaggattaaccagatacaatcaattcgtactttgaggaattctccagaatctgcacatttggtttatctagatcctcttcttacctttgtttgcaagaaagatttggcatattgtcattattgtttctctgaatcacatgctttcagttgacctttttgcacatgaagagtaacaacttggtgttagacagcagctcttgaagtgcaacataccctttgtagtgcagttgtgcactttcttgatgtacttctcatttactctgactaggtgtaaaaaaatcaaaatcaaactaattacatgttatgagtaacaaaaatgtaaataatctgccaaatgttaaatcacaaggaaaaggaaagcgaaaaatcaaattatactcacagcaaagtttgtatcttttggttcactgttatatgcttcatggtggatatgatgatgagcagtgaaagagtgacagaagcatatagcacactttaaacaacatcacaatacagtgtaaagacatgtgatctatggttgcgctatcacaattttctatttaattaatttaatttttgcaggcttctggcattgctccaccaccactctttcggaatatgcatgcttatcagaatacagcaggtggcaatgctccttccaaaccaaaggttaatgctccgaacctgacactccgaagaaaatacatcgatgaagcaggcctaaagaaggttgttgtttcctcaactgaaagatactgtcttgcaacttctataatttctactgatctcttgagcttctaggtttctctcggtcgactgtcctctttcaataatttaaattgttagattaaacctctcggaaaatgatacgtgtttggagtaaaccacatacttgctgatcctctccagttgtgcatactagcattgcttgttaatgcattagtattcattggctcattgcatttacagcctaatacttcctggttgtatgagtctgtagagtttcagtcatggctgttctatcaggattcaggatgttgatcccttgcttctacctaactgcgtctgcattgcaaagtttgtgattgcggtcttctttttatttgttagtttgtattgcccattaattaagattcattgactatggatagttctgtttgacagtaccagactacccatcaagtttgtacc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| External Link(s) |
