Os06g0649500
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Structured Information
| Gene Name |
Os06g0649500 |
|---|---|
| Description |
WD40-like domain containing protein |
| Version |
NM_001064752.1 GI:115469235 GeneID:4341679 |
| Length |
8716 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0649500, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:27406308..27415023 |
| Sequence Coding Region |
27406401..27406534,27407395..27407476,27408004..27408082,27408182..27408279,27408407..27408463 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008399:27406308..27415023 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008399:27406308..27415023 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggaggacgaggagatggagaagaaggtgcagcagtacctgcagcggaaggggttccgcctcaccgagctcgcgttgcaggaggagcgcaaccgcatctccacctcctccgtctccgacgtcgcgctcgccaggtcggaaaatgatccggcaagatactatgatggttatagtaaactaagaacatgggcatacagttctctcgatcagtacaagcatgaattactccgtgtcctttacccagtgtttatccattccttcatggatctagtggcagagggacatacacaggaagctcggtcctttttccacacgttccatgaagaccatgaactgatgcattctagggatctccagaaactggaaggcattctttctccttcacatttggaggaaatggaactggccagatctttaaggaaaaatcaattcagaattaagttatgtgagtattcatatgagttactcctccagtatctccagaaaacacaagctcttgtggttcttggaataataaatgaacgcacaacttttgacgtatcccctggtcagccatctttaatctctgatgacacggatgttgttgctctagttggaacaaagaaggatttggcaaaacaaataaatctgaaggaggtgcattgggggttgcttgaagattcagttgaagagcgcatggagaaaacacttttagaatcagataaaactgaagcagaaagcaaggatgcagatgccgaagataacaataagagaaaatcttcggaaggtggaaagcagggaggttctgttaaaaaggtcaaaaaagataagattgcaggagccacagggaaaaccaataaatctgaaacaagcatagtttcggtggcacctcgtgtgaaaccagagcttacacttccagtgattcctgttgaagtcgagcagtcaattcttgaggatttgcgaaaccgtgcacagttgaatagcctggcattgccatctgttagcttctacacattccttaatactcataatgggctaaattgctcatcaatttcacatgacggctctttggttgtgggtggattctctgactcatcagtgaaggtttgggatatgtcaaagattggccaaccgccgaaaacatctagtccacaaggagagaatggactttcccagggtgagcgcacatcagcatcagattatggaaaaagaccttatacattattccaaggtcattctggaccagtttattccgctgcatttagcccattcggagattttctcttgtcatcatcctcagactcaacaattcgactatggagtaccaagttgaatgctaatcttgtttgctacaaaggacacaactaccctgtttgggatgtacaatttagcccagttggtcattattttgctagcgcttctcatgacaggactgctagaatttggtcaatggataaaatccagcctttgcggataatggctggacatctctctgatgttgattgtgtgcagtggcatgttaactgtaactacattgccaccggctctagtgacaaaactgtaagattatgggatgttcaaactggtgaatgtatacggatgttcattggccataggagtatggttttatcattggctatgtctcctgatgggcgatacatggcctccggagatgaagatggaaccatcatgatgtgggatctctcttctggtcggtgcgtttcaccacttgggggacacagctcttgtgtgtggtcacttgcttacagttgtgaaggggcattgcttgcatctggatcagccgactgcactgtgaaactctgggatgttgcctccagcacgaaggtccttaagacagatgatacctcaactaaccggctgaggatgctcaaaactctccgtacaaaatcaactcctgtttatactctgcggttttctcggcgaaatcttttatttgcggctggtgctctctcacttggctcctaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEDEEMEKKVQQYLQRKGFRLTELALQEERNRISTSSVSDVALA RSENDPARYYDGYSKLRTWAYSSLDQYKHELLRVLYPVFIHSFMDLVAEGHTQEARSF FHTFHEDHELMHSRDLQKLEGILSPSHLEEMELARSLRKNQFRIKLCEYSYELLLQYL QKTQALVVLGIINERTTFDVSPGQPSLISDDTDVVALVGTKKDLAKQINLKEVHWGLL EDSVEERMEKTLLESDKTEAESKDADAEDNNKRKSSEGGKQGGSVKKVKKDKIAGATG KTNKSETSIVSVAPRVKPELTLPVIPVEVEQSILEDLRNRAQLNSLALPSVSFYTFLN THNGLNCSSISHDGSLVVGGFSDSSVKVWDMSKIGQPPKTSSPQGENGLSQGERTSAS DYGKRPYTLFQGHSGPVYSAAFSPFGDFLLSSSSDSTIRLWSTKLNANLVCYKGHNYP VWDVQFSPVGHYFASASHDRTARIWSMDKIQPLRIMAGHLSDVDCVQWHVNCNYIATG SSDKTVRLWDVQTGECIRMFIGHRSMVLSLAMSPDGRYMASGDEDGTIMMWDLSSGRC VSPLGGHSSCVWSLAYSCEGALLASGSADCTVKLWDVASSTKVLKTDDTSTNRLRMLK TLRTKSTPVYTLRFSRRNLLFAAGALSLGS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>94..227#1088..1169#1697..1775#1875..1972#2100..2156#2740..2827#2937..3046#3229..3330#3585..3736#4537..4647#4723..4790#4881..4922#5336..5500#5602..5678#6998..7114#7253..7518#8038..8133#8217..8283#8376..8429#gtctcgctgctctgagtcgcgtcgcgtctccctcccgcgcgacggatccgagagccctaaaccctagaactccctcgccctcgcgtcggcgccatggaggacgaggagatggagaagaaggtgcagcagtacctgcagcggaaggggttccgcctcaccgagctcgcgttgcaggaggagcgcaaccgcatctccacctcctccgtctccgacgtcgcgctcgccaggtacacctgctcgccgccgggccctttccaatctcctctcctctcctccgccagctagctgggcgagcccccctaactctgccccgttgcgactcggacctctcggatcgaggaaacctaggtagtggattttgtgcaattttgtccagctcgcttttgggcatcgaggtgccatatcacacgtgcccgtgattgggttgcgggtgcgagtttttccgcacgaggaaatagtttgcggcatttttggagagctaaaagttgcttgattgagggttgggaattgctttgtggacgtagcaatgagtaacaccaattttgaacgatgaactctctactggtaattcccatgatgataaggacatttcagggcagtatgcagcttatgcttgataatgggttaagtagtgtccgtagatggttctactgcacttatatctagattgtagttaatacctcaagtgattaaactgatttttgggtcactaagatgccactttataaccttttttttccagattacaataattaaaactaaattttcttgtcatatactgagaaaactttaatattatggaagtatgctttgttgataaatttagtcatactattttcatatattgaagaccagatatactagagaatatctctgttcataagtaatgtggtttgactgtatgtattatgcgacgtcaccttttgttttgattggagagagtaattcttccatcttttctgtctttttttgtcagcttccaatagttgtggcatccattatttcacaataattctggctatggtttatttttcttataatcctaccgactaatgccttttggttgcattatcttctgcaatgataggtcggaaaatgatccggcaagatactatgatggttatagtaaactaagaacatgggcatacagttctctcgatcagtacaaggtgtgctacacatacatagattggacttcaccttttgatcttgcagtacattttattgtgcttcacaatcaaacatcgttagctaaaattatgagtgatttctaactgtccatttgttacatagtctttctttaatgagtgatttcatgttatttatggataattactttcatgtttgcatgctagcttcagatggaacacttttaggattatattgtcataaaccaaagcttctagaattatactttattgcctgcatgctaacttctgatggagtactttcctagcaactctttgtgttctctgcatgcattcacaatatgggccattttacaaagctaaagtacctgtccagattcataactaaaatttgctatattttgggacagagtactatatcataaacactgaatatatttttgcctccgacggacatgttaatattagatttcaatttgtgcatatttctgttcttaaatttggttatatgtatactatgtttctgaattttcatcccttttttgtagcatgaattactccgtgtcctttacccagtgtttatccattccttcatggatctagtggcagagggacatacacaggaaggtattgttagttggcagatagattagataaaccctctttgtcatgtcatgttttcttttagtttattctgggcaatttctttccttgcgggccctgcagctcggtcctttttccacacgttccatgaagaccatgaactgatgcattctagggatctccagaaactggaaggcattctttctccttcacatttggaggtcaacacttttagttctcttacattgtaacattctgttcttattgaagatcttcatttatttatttggttgtatcttctcatgattcatacactgcgcttatcattctgcatgctgtatatttcaggaaatggaactggccagatctttaaggaaaaatcaattcagaattaagttatgtgaggttgtatccacataataatttgctgtatttccatttatctctttgaactttgattctgagttgacccttttaataatttaaccaatttatgaagacaaaacgttttgacagcttaatatttgttgttttgatgatatatccaggtgtttttgtttttttaccacccttttcaatttattggcttagcaatgttagagaccgagcacaaaattggcaccatttagtcagttagtcattacttactgttactcattgatcctgataggcagctaatgtcaaataaaaatatgattattttgatttgtattgactggaactagtggaccttttcttttcttttcgtttttgaactatccttgttataaggttacagcaagatcaagtttaatgttcttcctgagttaaagttttcacatttgatgttcttccaccatttgagataaaaaagtttaatgactttcctgagataaagctttcatattttgtctcccagatagcttttataatttcaaatttcttgtctgctgcaatgttatttaaaaaaaaacacatctcgtgatccaattattgaatttggttgcagtattcatatgagttactcctccagtatctccagaaaacacaagctcttgtggttcttggaataataaatgaacgcacaacttttgacggtaacattccccaatatcattcagattaataccctaatttctgtcatgcattttctcgtttacacttctcttgtctactgtgccacttatccctgttcaatattggcagtatcccctggtcagccatctttaatctctgatgacacggatgttgttgctctagttggaacaaagaaggatttggcaaaacaaataaatctgaaggaggtgcattggggggtatggtctgcatcagtcttgttgaccgctattgcctgttctatctatttgttgatgatttggattcaacagatcgaaacaatccacaccaatcagttatttgatgggattctatcattttcattgaacttttaactatgctcaggcattttatttttgtaaaattaaattctggtatgcagttgcttgaagattcagttgaagagcgcatggagaaaacacttttagaatcagataaaactgaagcagaaagcaaggatgcagatgccgaagataacaataaggtactctttatcgtatcgaagatttgttaagtttactacctatatcctcagccactgatagaagagccatctatttctttttgtttgggccaggctattagcagcttgttgtcttatacttccttaagcagtccatagaaaatatgcattgcttagctccactctgcatgttcctgtgcttcccagttttgagtccaaattgatgtttcttagtattttagcttcatatttttatcttcttatttttgctgcagagaaaatcttcggaaggtggaaagcagggaggttctgttaaaaaggtcaaaaaagataagattgcaggagccacagggaaaaccaataaatctgaaacaagcatagtttcggtggcacctcgtgtgaaaccagagcttacacttccagtgatgtacacttaaatcccttcatatctctcttaggaaaaatctagtttggtcgtttgactttgatatctagcctggtctctaacctaaagtttttaaaattctccatcctgtggatttttcaggacataataagttattttaaatggattcgtcattccaacttaggacaattttaattttaattttattttcttttttttttgcccgttgcgttttcctatctgtgatattctgattatgtttcccatttttatgccagtccatattaaccatgttttgcttcaattcatgcacctactattccatttgttttctttatgaatttctaatccaggacaaggccagaacttattcaaagctgtcctgtacatacactatggaccaacatatattgttcaacacaacatgcttcattacacatgctgctcaatgtttgttctgctagttttttctctctctaaaattacctggttaagccaactcaaatagtatggaaggtggaattgtatccaccggccaatttttattcgttagattgttgatgacgattatgtggacctgactctttgccagtttgcttaactgcagtacatttcaacacttcaaaattactttttgtaagacactgaacaaaggcatgttgccttttttgcttttcaagaaatcaacaaaattgaccatccaatcctcttagtcatgcaacttatttctaggtggctcatctatctacatttttatctgggaagaagtatttcaaccttgggttgtaagaatctgagatatatttatccttttatttcagtcctgttgaagtcgagcagtcaattcttgaggatttgcgaaaccgtgcacagttgaatagcctggcattgccatctgttagcttctacacattccttaatactcataatgggtaaatttctttgtggcttaatatctgacactgccaatttgcatccttttctctgatcattatctgtggacataggctaaattgctcatcaatttcacatgacggctctttggttgtgggtggattctctgac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|
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