Os06g0653000

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os06g0653000

Description

Similar to Glossy1 homolog (Fragment)

Version

NM_001064772.1 GI:115469275 GeneID:4341702

Length

7509 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os06g0653000, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 6

Location

Chromosome 6:27613611..27621119

Sequence Coding Region

27613723..27613783,27613957..27614185,27615838..27616076,27616931..27617150,27618748..27618869
,27619083..27619339,27619431..27619538,27620070..27620276,27620357..27620467
,27620554..27620883

Expression

GEO Profiles:Os06g0653000

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggccatctccatggcctctcccttgtcttcttggccttgggcattcttaggctcatacaagtatttgctgtacgggccggtggtggggaaggtggtgcaggagtggagggagcaagggaggttgccgctggggacgtcgtggtgcctccacctcatcctcctcctcgcgctccggtcgctcacctaccagctatggttctcctacggcaacatgctcttcttcacccgccgccgccgcgtcgtcgacgacggcgtcgacttccgccagatcgacaccgagtgggactgggataacatggtgatcatgcaaaccctaatcgcggcggtgctggtcaccagccgtgtcttccctgccacgtcggatctctcggcgtgggacctacgtgggtgggccatcgctgtggtgctgcacgtggccgtttcagagccggccttctactgggcccaccgggccctccatctgggcccactcttcagccggtaccactccttgcaccactccttccaagccacccaagctctcacagctgggttcgtgacgccattggagagcctgatcctgacgctggtggcgtgggccccacttgcaggggccttcatggcgggacacggctccgtgagcctggtctatggacacatcctcctcttcgactacctccggtccatggggtacagcaacgtcgaggtcatctcacacaagaccttccaggattttccctttctcagatacctcatctacacaccatcgtatcttagcctacaccacagggagaaggactccaatttctgcctgttcatgcctctctttgatgccctgggagggaccctcaaccccaagtcttggcagcttcagaaggaggttgacctaggaaagaaccatcgggtgccggactttgtgttcctggtgcacgtggtggacgtggtgtcgtcgatgcacgtgccattcgcgttccgagcgtgcagctcgctgccgttcgcgacgcacctcgtccttctcccgctctggcccatcgccttcggcttcatgctcctccagtggttctgctccaagaccttcactgtcagcttctataagctccgcggcttcctccaccagacctggagcgtgccccgctacggcttccagtatttcatcccttcggcgaagaagggcatcaatgagatgatcgagctcgcgatcctgagggcggacaagatgggcgtcaaagtgctcagccttgctgcactcaacaagaatgaggcgctcaatgggggtggcacgctgttcgtccgcaagcatcccgacctgcgggtgagggtggtgcacggcaacaccctgacggcggcggtgatcctcaacgagatccccggcgacgtcgcggaggtgttcctcaccggtgcgacgtcgaagctcggcagagccatcgctctctacctctgtaggaagaagatcagagtcttgatgctgacactgtcaacggagaggttcatgaatattcagagggaggcccctgcggagttccagcagtatctggtccaggtcaccaagtaccaggctgcacagaattgcaagacgtggatcgtggggaagtggctgtcgccgagggagcagcggtgggcgccggcggggacgcacttccaccagttcgtggtgccgccgatcatcgggttccggcgggactgcacgtacgggaagctcgccgcgatgaggctgccggaggacgtggaggggctggggacgtgcgagtacaccatgggccgcggcgtcgtgcacgcgtgccacgccggcggcgtcgtccacttcctggaggggtgggaccaccacgaggtcggcgccatcgacgtcgaccggatcgacgccgtctggaacgccgcgctcaggcacggcctcacgccggcgtga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAISMASPLSSWPWAFLGSYKYLLYGPVVGKVVQEWREQGRLPL GTSWCLHLILLLALRSLTYQLWFSYGNMLFFTRRRRVVDDGVDFRQIDTEWDWDNMVI MQTLIAAVLVTSRVFPATSDLSAWDLRGWAIAVVLHVAVSEPAFYWAHRALHLGPLFS RYHSLHHSFQATQALTAGFVTPLESLILTLVAWAPLAGAFMAGHGSVSLVYGHILLFD YLRSMGYSNVEVISHKTFQDFPFLRYLIYTPSYLSLHHREKDSNFCLFMPLFDALGGT LNPKSWQLQKEVDLGKNHRVPDFVFLVHVVDVVSSMHVPFAFRACSSLPFATHLVLLP LWPIAFGFMLLQWFCSKTFTVSFYKLRGFLHQTWSVPRYGFQYFIPSAKKGINEMIEL AILRADKMGVKVLSLAALNKNEALNGGGTLFVRKHPDLRVRVVHGNTLTAAVILNEIP GDVAEVFLTGATSKLGRAIALYLCRKKIRVLMLTLSTERFMNIQREAPAEFQQYLVQV TKYQAAQNCKTWIVGKWLSPREQRWAPAGTHFHQFVVPPIIGFRRDCTYGKLAAMRLP EDVEGLGTCEYTMGRGVVHACHAGGVVHFLEGWDHHEVGAIDVDRIDAVWNAALRHGL TPA</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>113..173#347..575#2228..2466#3321..3540#5138..5259#5473..5729#5821..5928#6460..6666#6747..6857#6944..7273#ataggtgggtgacagagagagagagatctctccattcttcccaacccagcagttctagctagctagctatctagttcatcatccccatccaccgagctcgatatccctggccatggccatctccatggcctctcccttgtcttcttggccttgggcattcttaggctcatacaaggcaagcacacttgatcaactgctgcttcaattctttgtatatatatacatatcattgcaacaaacaattagtatatatgtgatataatgatgaactgatcatgaattcatgatatgcattagcaatggctgtttggctaattgatggatggattgtggatgatatatatgcagtatttgctgtacgggccggtggtggggaaggtggtgcaggagtggagggagcaagggaggttgccgctggggacgtcgtggtgcctccacctcatcctcctcctcgcgctccggtcgctcacctaccagctatggttctcctacggcaacatgctcttcttcacccgccgccgccgcgtcgtcgacgacggcgtcgacttccgccagatcgacaccgagtgggactggtaattaataatagtagtagtagtaactttttttttacctccctctacttagttgattactgttctcgtttggctttttgtgatcgggtcatggttatgcgctatctaaaaggtaccgtagatgattctctgtgtaagtactttgggtctctgtttataaacagcagcataacttcagcttttaattcttctttgaagtcgatcggtagtatttactgctcatgtccaagacagtagtaattgcagatagattcctcctggctaggaagctaccagtacgaccaaatgtaatggatgacccgtttcatcatgctatgaacacgaagctggtgtttagattatggatgtaaagtttttggtgtgtcacatcagatattacatacggtgtcgcatgtggtattcaggtactaataaaaaaaactaattacataatccgttaataaactgcgagacaaatttattaaacctaattaatatattattagcaaatatttactgtaacaccgcattgtcaaatcatagagtaattaggcttaaaaattcgtctcgcaaattagtcgtaatctgtataattagttattttttagcctatatttaataattcatacatatgttcaaacgctcgatgtgacatgcgaaagtacgatgctgcctacaggccggctatgattaattggctagccgactcgcacatatctacagtttacatatatactttaaaccgctaggaataaatatataaatgttctattaacatctttttcatgtatttctctacgtcttatcgaccttaactcaaccaaaccaaacacaggcttaataaggtctgaagggaggaccagccaattaatgaaaattaagtttcggtttaatctattatactcatatagtagtatagttagctcctttttgggtttagatgtgccatgaggcccatgatatatatggtgtatcaaatcatgcatatatcccggtccatagcttaagaccatgaagtgttgaagaccgtatcacgattggaggttgggagtaaatgctcgcgcaataactccatctgcatttcggtggccgtgttggtctcgattgcgaagtgagcgagcgagtaccagtagcagcatgtcgtaacgtggtgccattcaaagcgcacgagatcacggacatgtggcacgaggattcaatggcaaatcatttatcaccatttgtaagagtggaaaataattaattattcatcgacacaccacaccactcttgcttttgctaatgcaccttgacaaaccataaaccatgtacaatttgctcctacctccatcacaaaatattactactatgtagaatgggtcaacagatctatatgaaatcttcgttcacaatcgttgttttagaatgagtcaaaatattcgttgttattctatctcaaaatattctagactacaaaactcaccatcattgtatcgttgttgtcggatctcctctagtggacgaagagagttcaacttgtctacgatggttgaatgccacttccatgctcttattatctcaaaaaatatatatgtaaatcatgtatgatattatcccattttgattgttatcattaatgtgatgtgagatatctttgagtctgtcatttaatttggatgatctttttttttcagggataacatggtgatcatgcaaaccctaatcgcggcggtgctggtcaccagccgtgtcttccctgccacgtcggatctctcggcgtgggacctacgtgggtgggccatcgctgtggtgctgcacgtggccgtttcagagccggccttctactgggcccaccgggccctccatctgggcccactcttcagccggtaccactccttgcaccactccttccaagccacccaagctctcacaggtaacaataataccctgaaattaaagttcttttcgtacagctccaactcctaaatataactccagaagttgagtctggagtggagttgtgaagaagagctctacccaactccactcttaattttggtggagctgaaactgtttggctgagctcagctatgccaaacagcccctaattttcatctacaaactttattaattactccctctatattttaatgtatgacgccgttgactttttaatccacgtttgatcactcgtcttattcaaaaattttatgcaaatataaaaatacttatatcatgcttaaagaacatttgatgataaatcaagtcataataaaataaattctaattatacaaattttttgaataagacgaaaggtcaaatgtttgtcaaaaaagtcaacggcgtcatacattaaaatacggagggagtacttattagcgtctaatttcgttttgggagtacctatacatctttcgaaatatttttatgattgtatcacacagatttttaatctttagattaaaatatgatagatataataaaaaataaaaagcaattaagaaacaccataatggacactaaattaccatatcctcaagaaaaagaccaaatccaatacaaaatttaaaatttatatgcgaagattcaaaaattacagtgtaacttacaaaagttacagtgtaagttttataaattacactgtaacttacaagagtacaagaaaatgcactgtaaatttgagtgagaaaatcgagtgagagataagaaaaaaatctttcgagtgagatatagcaaaatcgtttcgtttttaatgatgtgtttaattaactgcttgattaatgcagctgggttcgtgacgccattggagagcctgatcctgacgctggtggcgtgggccccacttgcaggggccttcatggcgggacacggctccgtgagcctggtctatggacacatcctcctcttcgactacctccggtccatggggtacagcaacgtcgaggtcatctcacacaagaccttccaggattttccctttctcagatacctcatctacacaccatcgtgagtcctctaatttacatactattcataatatcatccaaactgatccactatgttcccttacctcgctccactaatttatatttattcaaattaggccatatttgatttaaactactaaacagattgttgacaaattaaatatttcaaaaaataaatttaacagtagcttaaaacaagttgtctaaataataggcttcttttcttgaaaaaaatattttgtgaagtgcaaagcaaacaatttgttaaaatatatagtctggtgaataataagctaattaagataacaggacaaacatttttagtagaaatttagtacaatatgtgtgtagtgtgttgtgcgcattctacaccctttattttccataccatatactccgtatttaaaaacttaataggtaccatatgtacagtactttcaatacgaatccggtagggaaaaaacatacggtatatatttttcctttattttacatatgtacttcgtacttattagcagcgtattttcttaattaacaccatttaatgtcgcatgctcccgtgcacgcgtctggatagaggcctatatgtgtacagagcgacatgtccagtgcactatagtcgaaggcaccaagtcatatatctgtatgtggtgtcaccatgcaattaactcgaaaaagattgcacttagacagcacaaaaatataccaaaaactgccaaattaattgaagtgtcacgcccattggccaatgtggcgtccactgtcatgtgtcgaccttaattagttatattaaggcatctctggataaaacatataatttctgtttccaaaattgtcaacgaattaatcaagttgtcgcagtgatggcgaagttcttgcatttccaaaaaaggccttgcttgcatgagaaataaaaagattgatactatgaaacattgaagtaaatgaataatggactatcagattttgtaatattatctactcgagggtccaaacaagtgcatattgtaaggttcaaaagtttttttttttaaaaaaaaaaactaacgagcttatatatagaaatcataggagctaaggaagtgtgtccactatgcattttattactgtatgagagtcacattgttggagcatatatcactttccaatttggaatactcctatatatatatgtcgtggtcatctaaagcgaatgttatcgatcctgtcctggttaacgaatggatcaggtatcccttaaaccagtgactgcattaatagccaggtttgacgagaatggccatatgatttataaccctaatcattgctgctgcgtactggaaactgataatcaatgctcgtgataaactgatggagtac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External Link(s)

NCBI Gene:Os06g0653000, RefSeq:Os06g0653000