Os06g0662000

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os06g0662000

Description

Similar to Vacuolar H+-ATPase subunit A (Fragment)

Version

NM_001064815.1 GI:115469361 GeneID:4341751

Length

6529 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os06g0662000, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 6

Location

Chromosome 6:28163322..28169850

Sequence Coding Region

28163626..28163740,28163837..28163925,28164957..28165035,28165143..28165240,28165503..28165607
,28165686..28165772,28165873..28166067,28166545..28166651,28167214..28167409
,28167520..28167621,28167755..28167826,28167907..28167963,28168059..28168160
,28168293..28168330,28168424..28168535,28168627..28168683,28168777..28168832
,28168938..28169064,28169636..28169704

Expression

GEO Profiles:Os06g0662000

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

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Protein Sequence

<aaseq>MSYDRVTTFEDSEKESEYGYVRKVSGPVVVADGMGGAAMYELVR VGNDNLIGEIIRLEGDSATIQVYEETAGLMVNDPVLRTRKPLSVELGPGILGNIFDGI QRPLKTIAIKSGDVYIPRGVSVPALDKDQLWDFEPKKLGVGDAITGGDLYATVFENTL MKHHVALPPGSMGKISYIAPAGQYSLQDTVLELEFQGIKKQFTMLQTWPVRSPRPVSS KLAADTPLLTGQRVLDALFPSVLGGTCAIPGAFGCGKTVISQALSKYSNSEAVVYVGC GERGNEMAEVLMDFPQLTMTLPDGREESVMKRTTLVANTSNMPVAAREASIYTGITIA EYFRDMGYNVSMMADSTSRWAEALREISGRLAEMPADSGYPAYLAARLASFYERAGKV KCLGSPDRTGSVTIVGAVSPPGGDFSDPVTSATLSIVQVFWGLDKKLAQRKHFPSVNW LISYSKYSKALESFYEKFDQDFIDIRTKAREVLQREDDLNEIVQLVGKDALAESDKIT LETAKLLREDYLAQNAFTPYDKFCPFYKSVWMMRNIIHFNTLANQAVERAANADGQKI TYSVIKHRMGDLFYRLVSQKFEDPAEGEDVLVAKFQKLYDDLTTGFRNLEDEAR</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>6111..6225#5926..6014#4816..4894#4611..4708#4244..4348#4079..4165#3784..3978#3200..3306#2442..2637#2230..2331#2025..2096#1888..1944#1691..1792#1521..1558#1316..1427#1168..1224#1019..1074#787..913#147..215#cgtcttccattccagcccagatcgagcgagagagccgtctccctcttcgcttctcctctcccccccgtgatctgaccgccggcgacgaccccctcccaccacccgccgccgccgccgcgcccccgcccccgccggcgacgaccaccatgtcgtacgatcgcgtcacgaccttcgaggactcggagaaggagagcgagtacggctacgtccgcaaggttccctcacccctcatcgtcttccttcctcttccccatgttggattggatcggtcactctcgtgcgtagatgcggcggcctctgcttcggattcggcttgttccggatcggtggagttttagctgtgagtctctgtggattttagtgctggtctcgaatccccgatcgcgagagtgtgggtggcactgctgctgactggggaatcgtcaggcgatgcgactgtgccgagagcctcggactcgggtggtgtttggatcgagttgaattgatgcgagattaggttgataggacggttgaatttaggtttctactggtgttcggatcacgctggctagactgcgtggatcgacgtttgatgcgttaacttccaaactcatatgcgggacactattgtgatggggttggttagtgaaccatccccgatgtggagatgcgctattatccttgggagtttagcccgtttggataatatgttgattgtctactattggcacatgatccatcatttcatccctcttttttttttttgtattgaacgaattgtttcgccttcatattgcattcttctaggtttctggacctgtggtcgtggctgatggaatgggtggtgctgccatgtatgaacttgtccgagttggtaatgataacctcattggggaaattattcgtcttgagggtgattcagccaccattcaaggtataggacggtgaaattctacctcacatatttgtggtgccttttccccacatgacatgtacaatataaatttcaccaattttttcttgtgattaccgtttgcagtttatgaggaaacagctgggttgatggtcaatgatccagtgttgagaacaagaaaggtgtgatgcattgttaaattctatgtgcatttcacatatggttttcttacccttttcatttcttttataacacattgttgctattttcatcagcctctttcagttgaattgggacctggtatccttggaaatatctttgatggaatccaggtgagacaaatgtaataatcggacatttattaggctgatatgaggactttatgctgactacatgaccttttttcctttctacactttgcagcgccctctaaaaactattgctataaagtctggagatgtgtacataccacgtggtgtttcagtccctgctcttgacaaagatcagttgtgggattttgagccaaagaagctaggtattgtgcctgctaacctgttataaaatctgagcatgtctcttttcaagttttatcctgtacatagataaattacattggtcatttgaataggtgttggagatgccatcactggtggagatctatatgctgtaagttaacaagacagttcccttttttacaagttattatcttgtgttattgctagcgatcttctgcaatctgcagatccctgatgatgttaatctttttatgtgtctttgtgttgcctaactgcctcacagactgtgtttgagaatacgctgatgaaacatcatgttgcccttcctcctggttctatggggaaaattagttacattgcaccagctggccagtatagcttgcaggttagtatgtgttacttaaagctgcttcttctgtgcctcatttttttttctgcttaactttatgtgatgtcctaatcataatgctctgtacacaggatacagttctggaactggaattccagggcatcaaaaagcaatttactatgctccaggcaaagtgctttccctttcattaaatccgtatttaccgagtttatgtatatctgaatgtcatcatatttattctctgcagacatggcctgtccggtcaccaaggcctgtttcatcaaagcttgctgctgacacgcctcttctaacaggacaggtacacgaagcttgctactcccagctccttcataatgtgttattttattagtgtcaaaatttaatgaagtgatgctttcctgtcctgttctatcatattttgccgtgtctcatatcctgtgaactgttttcagcgtgtacttgatgcactatttccctcagttcttggaggaacttgtgctattcctggagcatttggttgtggaaaaactgtcattagtcaggcactttcaaaggtattttcactattcctctctatttgataactgctagcattgcccatgggcattagccttttaaaatgactgaattctgtgcctttcctgactgaaaatatcttatgcagtactccaattctgaagctgtggtttatgtgggctgcggggaaagaggaaacgagatggctgaggtccttatggacttcccacaattgacaatgacattgcctgatggacgtgaagagtctgtcatgaaaagaactacacttgttgctaacacatccaacatgcctgttgctgctcgtgaagcctccatttatacaggtaatacatatatactgattactgatgtttttaatttcgcattccactagtatagtactacatgaatgtgtttcgatcttctgaagttcattttctctagaagaaagtgttgctttgttggagactatagctatctcaatacatcagaccatggatttctgcaggcttgtccttagccatttgtgatctatgagctaattttggaataactaaggttgcattgacaaatacatctatgcatgttccataattgttcagtagaacattgaggatcacatctttatgttatccatggcctttattatttattgaggatatacacatattcctgttagccatgacctgtattacttactaactgttctgttgcagttcagtttatgagttatgacggatggtaactaacttgctagcactagatcttttagtgaatgaacatcatcaaagtggtacaatatgtgtagtttcttgtagaacactaaaaggagtccttgcttagttatgctttatgcctgatgttttctttatcaacaaaacaatcatatttttttctgcccaccaggaattacaattgctgaatacttccgtgacatgggctataatgtcagtatgatggctgattctacttctcggtgggctgaagctttgcgtgagatttcaggacgtctggtatgatgcttcctttcgagttgctattttacctttttggcctgtatttttgtaacttatattgacttctcaatgctgtgctgtgacatgaatgagaattctttctaatgtatcattatccactatttgtatttggggtttaattttttcaggattattgtttattttctttccgttcagtagcttattttattactaatttcattaatagctgactgtaccctccaacatcaagaatactagtgcaatggggatatattaatgtgttgaacagaagtaaaatctgttactagtacatcatgcatgaaacatttacatggaagttatcatatacgtctgatgcatcgtgcttgaaatatttactatgcagttatcttactaggaaattatttggagtcgaaagtgctctcgctagctagttactgctttactctgcactaatatgaatttgaaactgatgatttgatcaatttccaggctgaaatgcctgcggatagtggttaccctgcatatttggctgcacgtttggcatccttttacgaacgtgctggtaaggtgaaatgtctcggcagtccagatcggacaggcagtgtcacaattgttggtgctgtctctccacctggaggtgatttttcagatcctgttacctctgcaactcttagtattgtgcaggtaaggaaactgctagattaatccaacctttgaattaaattttcaaacctttctaactgcatgttcattgtttgataatcttaactcctctcaattgcaggtcttttggggattggataagaagctggctcaaagaaagcatttcccatctgtcaattggctcatctcttactcaaaatactcaaaggttattcctaacttccctatgatgtcaatacaattaaaatcgccattttacactaacatactatatcctgtactgtaggctctggaatccttctatgagaagtttgatcaagatttcattgatattagaacaaaagctcgtgaagtgttacagagagaggacgatctaaatgaaattgtccaggtattttttttcaccttgtgcaaggatgatctgttccctagatttagtcgtagaagcaatagtttgaacttggaccacttaaacatggtgtttttgttttccaaggtcctcctttttggtctttcacaatatttgttttcttcattagatttggagtttctcaaactattcaatttgtattttattgatatttgttgacccttcttgctttgtgtaatattattgtggcaccatttggcctaatatcttcaccaaatttcagcttgttggtaaagatgcactggcagaatctgataagattacattggaaacagccaagctactaagggaagattacttggcacagaatgcatttaccccgtgagtcataccctagttttttctgatttaatacagatttattggttgtctctattttaatgattaaccattttctttagtctgatcatctctatataatgaaacagatatgacaagttctgtccattctacaagtctgtttggatgatgcgcaacattattcatttcaatacattagcaaatcaggtaaatctaacgtgtttttaccactcctttcgtccttgaaccttaaattactcaagcaactttgatttgaaatttgaagtatgaacctgtgaagaatgttttctatagcattagtaagattgatcttgttttgaagttttttattgcttatgacaattttctttttaccaatgtggattgaaatattgttgtttttttgctacatgatctaggagcttattggattaattatttgatgtttcttgcatggaactgataaatataccgtgctttactcctatcatgaactgtgttgtgatatatgtcttaaatatcaatgagccatgctcattatctttaggaggctagccctaaacaaaaaacattaaagcactaaccctgggtattggcaccaatcgcacagatcctcagccaaacagaattctcacattaaaagttgattaaaaataatggcttcgcttacttaaccccagttctgttgcattcttgcatccactctcactagctcccttggttggcttcgatgctagtgtgctaatgcctaagggttcaccatgacattgtgttcatatgtccacctcaactgagtcagcaagggcaagttaaaaggatttgggtttaagggaaccatttttgctcaaattcctctggttgaatgaaagtgtgtgacttctttatttttttctttttttttggcaattggtgcacaaactactaggtgctagggctaagtgtaaactcgaaaagctttggctagacttgcaacgggctgaagtttatataatgattatgtcaataagaaaagttaccaagcaaatacttgatatttattcacctagttttagagaaggtatgtagcaagtagcaatatcctttagttaattgtgatgtatgaactttcttgtaagactcatctgatatctgcactattttcttttgctggaaagaaacttatagtattcataagtgaatgtagcttgtttgaatccatcataccttaacaaattgtatgtttctgtcttgtcttgtaggctgtggagcgtgcagctaatgctgatggacaaaaaataacatacagtgtcataaagcatcgtatgggtgatctattttatcgcctagtgtaagtatttcagttccatacctcaaatggtgaccatttgattggttttattttcattggtaatcctgtttgctgaatacttcactcttgcaacagatctcaaaagtttgaggaccctgcagagggtgaagatgtcctagtcgcaaaattccagaaattgtatgatgacctcacaaccggattccgcaacctagaagatgaagctaggtgaagtgctgtaaattgaggatcacattcgtgtaaacaataaaatatcaccagatattcgaagcgagttggggcaatttattttgcttcgcgtgaggttgtagatgtgaattacgtttcagaatcatcatattttccttctgcatcgacactgctgctgctttttgtagcttcctgtttgacctccggtgctcgatgaaggcattctttttggtgtacaattatttatattgtaagatacctgtgcacatgttgatagttgaataagcacgatgaccatctacttgaacatcatatatttttctccc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os06g0662000, RefSeq:Os06g0662000