Os05g0374500
| Gene Name |
Os05g0374500 |
|---|---|
| Description |
Tetratricopeptide-like helical domain containing protein |
| Version |
NM_001061908.1 GI:115463546 GeneID:4338606 |
| Length |
3259 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0374500, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:18052288..18055546 |
| Sequence Coding Region |
18052701..18054331,18054467..18054706,18055343..18055505 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:18052288..18055546 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>MDDRGNFVTGANSKAFTSVHGNMESTLPARMTKLNLGHGAPSNN NKDETAHQPPEVSGFGTNAATTFSSAQAASMPFTSIQTNVSFELKGNGGNLANEDIGN ITHSRSDNDQGYGPSSFVFSSGSNAVPPSEGYAEHALQEDIKKLNINREGASVGSTKV NGSSQFVFRSKAEAIPVFGAIPQPNVPESRAFSHSNHSSSFSTSGNDMPSFSFKTTNT ASDTIPGESCAVRQEPAWCSRESLFGIDYIKSAYRDKKEAHKNARKNKRPTKLKQHAQ PHHFASQETCTTGPDMDLAGDYSPMDCSPYSATVEQVAKEASVMSDQSVHIHDYGVSN QSSSCAEDLVSATEHLVIDADLPTCEDEGRIPNVDTSANSFASSFSSFDEEVTIPIAP QPSSSNMHDTANGKPKSAPAEVWDDAYRLNNQGQAYEENGYRTAHEIGEHATFQESSE DFSGLNFTFGASTSPQSSVSTQRRNTRRKVRTKSGQLPKPSVTQAYVQPKSSQDKKTM QFSPEKNKAGDSADEQSTRGASTSAALETCETWRTSGNQAYTNGHFATAEEYYTRGIN SVSGHDSSGYCSRALMLCYSNRAATRMSLGRMREALQDCLIATSIDPTFLKAKVRAAN CQLALGDLEDALRSYTACLTSSKTSGSDRKMLAEASDGLERVQVCYISAQGSL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>414..2044#2180..2419#3056..3218#tgtttggagggaacgtatccagtgaccatgcggataggactaatgatgtttcttctggtgctaataccaatccatctgatacattcaatgttactgatggcacaggtctgtgtcctgagaagataagtgatgttccctttcagcagaagggaagtggaggtagtagtcgtcaagccgaagcgtttgtctctgggagtacttctaatgagggcagtgttttttcctctgctgccaacagtgatgcttttgttccacctagtagtgttaataatttgcctccagagttgccatcatgtttgaatataggaggtggagttacacagtgcaaacaaagtgataattctggttatccatcagaggcatttgtatttggaagtgatgcttccttgagctcacactcttcaaaaaaggtaatggacgatcgtggcaattttgtcactggtgcaaattcaaaggcatttacctcagttcatggtaacatggagagcacacttccagccaggatgacaaaactgaacttaggccatggagccccatccaacaacaataaagatgaaactgctcaccagccaccagaagtatctggttttggaactaatgcagccacaaccttttcttctgcccaggcagcaagcatgccattcacaagcattcaaactaatgtatcctttgaactaaagggtaatggagggaacttggctaatgaggatattggaaacattacacattctagatcagataatgatcaaggttatgggcctagtagttttgttttcagtagtggtagcaatgccgtccctccttccgaaggatatgcagaacatgcattacaagaggacatcaagaaattaaacatcaatagggaaggggcttcagtcggatctactaaagtgaatggatcttcccaatttgtgttcagaagtaaagcagaagccattccagtatttggtgctattccccagcccaatgttccggagtcacgcgcattttcacattcaaatcattcatctagcttctctacttctggaaatgatatgccatctttcagtttcaaaactacaaatacagcaagtgatactattcctggtgaatcttgtgcagtcagacaagagccagcctggtgttcaagagagagcttatttggtattgactatataaaatcagcatatagagataaaaaggaagcgcataaaaacgcaaggaaaaataaaaggcccaccaagttaaagcagcatgctcaaccccatcactttgcttctcaagaaacatgcaccactgggccagacatggatttagcaggtgactactcaccaatggattgttctccttattcagctacagttgaacaggtagcaaaagaagcatcagtgatgtctgatcagtccgttcatatacatgattatggtgtctcaaaccagagctccagttgtgctgaagatctagtttctgcaactgagcacttggttattgatgcagatcttccaacatgcgaagatgaaggtagaattcccaatgtagacacatctgcgaacagctttgctagcagcttttctagttttgatgaagaagtaactatacctatcgcaccacaaccttcttcctccaatatgcatgacactgctaatggtaaacctaaatcagccccagctgaagtttgggatgatgcttataggctcaacaatcaagggcaagcctatgaagagaatggctacagaacagcgcacgagattggtgaacatgccactttccaagaaagctcagaagattttagtgggctgaactttaccttcggtgcttctacatctccccaaagctccgtgtcaacacaaagacgtaacactagaaggaaggtaagaactaagtctggtcaactgcctaagccttcagttactcaggcttatgtacagccaaaatcatcacaagacaaaaagaccatgcagttttcccctgaaaaaaataaagcaggggattcagcagatgagcagtcaacaagaggtgcatcaacttctgcagccttggagacttgtgaaacctggcgtacaaggtttgtatgaacacagtttaattctgtttgtctgttgttgtctttttcatgtcatatatatctttttacatggcattatgtgatcattcaaatttgattttgatataccatatcttttcattttattttggccagtggaaatcaagcctacacaaatggtcactttgctacagcggaggagtattatacccgtggaataaattctgtttccggtcatgattcttctggatactgttcccgtgcactgatgctttgctacagcaaccgtgcagctaccaggatgtctctcgggagaatgagagaagctcttcaggattgtttgattgctacatcaattgatcctacctttctcaaggctaaagttagagctgcaaagtaagaagttgctacagcaacccaactaattcttttaatgtttaaacgaaatagtatatcttattcagtgataacaaatcaattagtatgattgagaacttcatttgaacaaggtgcacttatatgttctttttctggtaagcaccctgcatagtggaatgtactgcttttatcatggaagatgatgcaatagatatctaaatacttttgtaatgcgcatacttgtaaaaccagagctgcatgttccaggtgtattagtactgtcttaattagaatattcaaatattcactatataactaatgtatgctttggagaaactgaactgtagtccactgatgtttttcccttgaaacatgtgcctttatgttgtactggattactctggagaggttattcactcttgttactttgattgaagataccaccttcataccttctaaggaattctaaggaatttgtaggctaattttattatgcatgtgtataacccatgctgttttgactatcactctgtcaggcccattagaactttgtctgggccatgggatttttctggattcctgtaggaattgagccgtttctgtgatgggactcattgatttagttatctaacttggtaccgtatatggatgcagctgtcaacttgcactcggggatcttgaagatgcattaaggagttacactgcctgtttaacgtccagtaagacttctggttctgacagaaaaatgctcgctgaggcttctgatggtcttgaaagagttcaggtgtgctatatttctgctcagggatcactttaagttctttattttgtgttaattactatccatgtgttttgttc</dnaseqindica> |
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