Os06g0730900
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Structured Information
| Gene Name |
Os06g0730900 |
|---|---|
| Description |
Peptidase A22B, minor histocompatibility antigen H13 family protein |
| Version |
NM_001065194.1 GI:115470119 GeneID:4342150 |
| Length |
5264 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0730900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:32028350..32033613 |
| Sequence Coding Region |
32028475..32028609,32029880..32030038,32030120..32030231,32030907..32031026,32031167..32031318 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008399:32028350..32033613 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggccgccgccaccgccgcggtttttgcgctgttgatggcgtcggcgctcgctggggctgcggccggcggcgacatcgttcaccacgacgacgaggcccccaagattccaggatgctccaacgacttcatcctggtcaaagtgcaaagttgggtcaacggcaaagaggatgatgagtatgttggtgttggtgctcggtttggcccgcaaatagtgtccaaggagaaacatgcaaatcgaactagacttatgttggcagatcctattgattgttgcacttctccaaaagaaaaggtttctggagatattcttctagtccaaagagggaaatgcaagttcacgaaaaaagcaaagtttgcagaagctgctggtgcttctggtataataatcataaaccatgtccatgagctgtacaagatggtctgtgaaaagaatgaaacagatcttgatataaatatacctgcagttcttcttccaagagatgctggcttcgctttacatacggttcttaccagtggtaactcagtttctgtgcagcaatactctccagatcgtcctgtagttgatactgcagaggtattcctttggcttatggctgttggtactgtcctttgtgcatcatactggtccgcatggagtgctagagaagcactttgtgaacaagagaagctcctcaaggacggacgtgaagttttactaaatgttgagaatggaagttctagtggcatgatagatatcaatgtggcatcagccataatgtttgtagtggtcgcgtcatgcttcttaataatgctttacaagatgatgtcttcctggtttgtggagctactggtggtaattttttgcgtcggtggtgttgagggcctgcaaacatgcctagtggctctattatcaaggtggtttagagctgcttcagaatccttttttaaagtgccattctttggagctgtttcataccttactcttgcagtttccccattttgcattgtatttgctgttctttgggctgttcaccgtcatttcacctatgcctggattggacaagatatccttggtattgcactgataattactgttatccaaattgttagagtacctaacctcaaggtgggttcagttctcctcagctgtgccttcttttatgacatcttctgggtgtttgtctccaagagatggtttcatgagagcgtgatgatcgtggtagctcgtggtgacaagactgatgaagacggcgtccccatgttactaaaaattccacgaatgtttgatccatggggaggatacagcatcattggattcggtgacatccttctacctgggctgttagttgcatttgcattaagatatgattgggctgccaagaaaagcttgcaaactggttactttttgtggtcaatggtggcctatggttctggactccttattacatatgtcgccttgaaccttatggacggacatggccaacctgcacttctctacatagtgcccttcacacttggtgcgctgatatcacttgggtggaaaagaggagaactgtggaacctatggtccaaaggggagccagagagagtatgccctcatcacatgcatatgcagcctcagccgaagacgcccccactagtccagtag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAATAAVFALLMASALAGAAAGGDIVHHDDEAPKIPGCSNDFI LVKVQSWVNGKEDDEYVGVGARFGPQIVSKEKHANRTRLMLADPIDCCTSPKEKVSGD ILLVQRGKCKFTKKAKFAEAAGASGIIIINHVHELYKMVCEKNETDLDINIPAVLLPR DAGFALHTVLTSGNSVSVQQYSPDRPVVDTAEVFLWLMAVGTVLCASYWSAWSAREAL CEQEKLLKDGREVLLNVENGSSSGMIDINVASAIMFVVVASCFLIMLYKMMSSWFVEL LVVIFCVGGVEGLQTCLVALLSRWFRAASESFFKVPFFGAVSYLTLAVSPFCIVFAVL WAVHRHFTYAWIGQDILGIALIITVIQIVRVPNLKVGSVLLSCAFFYDIFWVFVSKRW FHESVMIVVARGDKTDEDGVPMLLKIPRMFDPWGGYSIIGFGDILLPGLLVAFALRYD WAAKKSLQTGYFLWSMVAYGSGLLITYVALNLMDGHGQPALLYIVPFTLGALISLGWK RGELWNLWSKGEPERVCPHHMHMQPQPKTPPLVQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>126..260#1531..1689#1771..1882#2558..2677#2818..2969#3053..3235#3492..3526#3631..3787#3882..3935#4056..4148#4239..4381#4493..4563#4710..4793#4877..5007#aggggcagggactagagtgcaaattaagctgggtgtgggtgtgggtctgggtctgggtggaagaggaaaaggatctgtgtgtgatcgacacgacagatcggcatcggcgggcagggtagagtgagatggccgccgccaccgccgcggtttttgcgctgttgatggcgtcggcgctcgctggggctgcggccggcggcgacatcgttcaccacgacgacgaggcccccaagattccaggatgctccaacgacttcatcctggttgggctgctttccaattcctctttctctttcttcctctctggattccattcacccaccgccaccgaccttagcaatttcagtgaggactctagggtaggctgcggtcagcctgcttcctaatcctaccctagtactgtaccctattgctctgcttcactcaggttcatagctagagctaatctggagtatttcttaactgacccgactgttgaaccagttacacagtagcaatctcaagctacatatgcatcttggcatcactggatacgcattctaccaccacgacttattgcatccaacccggttctacttctaatccactggttcattatgtgtaaatttgcctgtattccacttgctcctatatttttttttggtttctgtgatcatcttaccaagctgtctacatctctaggcgcaatcagtttcttgttggtaaaaattaacatggaccttattaattcagtttcatacagataaccatgcctacaaaatgatagactaacaggaaacagaatgcgtgctagtactacagactaaagactaaccatcattctaggtcgtgcagcataaatacacaaaacataaccatagcctattgagactctttgtggctgtgcaatgtggatattgaagttgttgatggagtgatgtggcagcaagcaaggcatatagtacactccctagaaattagatcactaatgttccgagcaggccatcaagttaccatcagaggttacacaacaccgctctctttcgctgcaaggcgaatggaggggactggtaggcagtatgtaccttggacaagttggaagttcatggagatgaattcatgttgaaattgttggtgatatgacatccttgcatgtgcacgcaaaagacaatgcaacatagcttcctgcaccacagtcgtgtgttgcaactcacaagtgaaataatagcgaaaacacaaagtgcaccgcatagtgttagagtatcaatacccatactctaactaaaaatattttaaaacgcacaactcatgttctaggaggagctcacggctctcactgccatttggcctatatctagttctctgcaccacatgtccttttgaattgaatcaatttctgtattaagtctcaattaattccagtagttcgtgtgttgcacaccacctgtattagtcctgtacaatgtgaaacataaattatgttgtacttgcataattttcttttctggtcagtactctctctgatcattttgtcttctgtcccattaaattaaggtcaaagtgcaaagttgggtcaacggcaaagaggatgatgagtatgttggtgttggtgctcggtttggcccgcaaatagtgtccaaggagaaacatgcaaatcgaactagacttatgttggcagatcctattgattgttgcacttctccaaaagaaaaggtttctcttctggaataagttacagttattttcattctccctctcttttgtatctttgtgattgcatcctccactttataggtttctggagatattcttctagtccaaagagggaaatgcaagttcacgaaaaaagcaaagtttgcagaagctgctggtgcttctggtataataatcataaaccatgtccatggtatgttatctttctatctgtaagttatgatctttcttggtgtacgatgttacatatgattcttgctatgttccttcggtaactcctcatgtaactattaaggtgtacccttgtttgtgggaattatttgaggtgtatccttgtttgtcagaacttagaatgactcataatttcccatcccttgcatttatcacctttttattgccacaaagttcaattttcctatctaacatgactctaggattttctgaaagctctcatgcaactattgtttcccataccttgcgcataacacttttttttttgcttccactaagctcattttatctttctaactgagtttggcccttatggtatgtacctatctatgcgttgcactttctaattgcgaatgttcatgtatgcacttttattttttattactattgatttcacattcttgtttttgttctttgatcacattaagtgtagaatgtggtggcatccagtatttagttttttatattacccccaccccaaaacctcttctcttgcttgtttgttttgaaagtgcctatttatggttatgagcaattgagcacatgcatttatatttgaagtcctctgttacaaattacatttgttgactaatataaaaggttcacctgtgaattatgtgatgcttctatctcgcagagctgtacaagatggtctgtgaaaagaatgaaacagatcttgatataaatatacctgcagttcttcttccaagagatgctggcttcgctttacatacggttcttaccagtggtaactcaggtaattcgttaactcactgtgggcacctatacttccattttcatgcgagagaatgttttttttaattctctttggcatggaatctggctatttgttcaatctaaaatatcttagtgacttaaccatgtatcttcccttagtttctgtgcagcaatactctccagatcgtcctgtagttgatactgcagaggtattcctttggcttatggctgttggtactgtcctttgtgcatcatactggtccgcatggagtgctagagaagcactttgtgaacaagagaagctcctcaaggttctgatccgttaatgccatgacacttagctttcacctattctacctgtaatggaggactgacaaatgcactaattgtaaaggacggacgtgaagttttactaaatgttgagaatggaagttctagtggcatgatagatatcaatgtggcatcagccataatgtttgtagtggtcgcgtcatgcttcttaataatgctttacaagatgatgtcttcctggtttgtggagctactggtggtaattttttgcgtcggtggtgttgaggtgtggtttcatctgactttactttcctttcagtaacttaaaaagtttctgctgcttaaacagtaaatagtatcagttcctctttgtctttattaatagtacaagtactgttgttaagtgactaggtaggatagtcagtgaatactgcagtgaaactaatattgttttgccagcttgttatgcaaactgccgcttaagcaacctcgctgctttttcttccttaaactaatgctgttgtttatatttgcatatgcagggcctgcaaacatgcctagtggctctattatcaaggtatagtgaagctgcgtcagagtttatttgaatcaagaatttgttcttaactcctcagctgatgaattttattattactgactgaaagtgattgaatcttccaggtggtttagagctgcttcagaatccttttttaaagtgccattctttggagctgtttcataccttactcttgcagtttccccattttgcattgtatttgctgttctttgggctgttcaccgtcatttcacctatgcctggattggacaagatatccttgtgcgtgcaactagctgtagacctgtagtattttaaatgagttctaatgtaaccaactgctacatcaattgacatcagggctttgtattgtcagggtattgcactgataattactgttatccaaattgttagagtacctaacctcaaggtaatctagctgctcttgacttttgactttctacatgatggatgttaagctccattgcaagttttcattttactttagcgtggttgttcaagttatctttgtaactgaggccatgaacaggtgggttcagttctcctcagctgtgccttcttttatgacatcttctgggtgtttgtctccaagagatggtttcatgagagcgtgatgatcgtggtaagttttgtggaaatttattctagacttctggtaattggtgatctcattgtttaagctaagttggttatgctggtgtgcttctcaaaggtagctcgtggtgacaagactgatgaagacggcgtccccatgttactaaaaattccacgaatgtttgatccatggggaggatacagcatcattggattcggtgacatccttctacctgggctgttagttgcatttgcattaaggttagtctcgcaaagaaaaagaaaaggtctattcttacatgtggatacaagcaagcatgttagagatatgactgctaacagtattttttcaaaatattaatctttttccagatatgattgggctgccaagaaaagcttgcaaactggttactttttgtggtcaatggtggcctatggttctggtaagttacagcgctggtccacgcaactattacttgagacaaaaaaaagaggcatttatctgtgcatccgtcttatttaagctattgtattaaagctattatgtgctgtgaggaattaatttgctgaactttttgcccacatcaaggactccttattacatatgtcgccttgaaccttatggacggacatggccaacctgcacttctctacatagtgcccttcacacttggtaattaactacctaacctatctctccccctggagcctaat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|
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