Os07g0160100
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Structured Information
| Gene Name |
Os07g0160100 |
|---|---|
| Description |
YABBY protein (OsYAB1) (Filamentous flower protein 1) |
| Version |
NM_001065472.1 GI:115470676 GeneID:4342449 |
| Length |
7469 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os07g0160100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:3253840..3261308 |
| Sequence Coding Region |
3254059..3254127,3257061..3257180,3257382..3257505,3257978..3258026,3259993..3260068 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008400:3253840..3261308 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgtcggtccagtttacatcggagcatgtttgctatgtcaactgcaactattgcaacactatccttgtggtgaatgtgccaaacaattgttcctacaacattgtgactgttagatgtgggcattgcacaatggtgctctccatggatcttgctccttttcaccaagcacgcactgttcaagatcaccaggtacagaacagaggatttcaaggtaataactttggaagctatgacatagcttccagaaatcagaggacatcgacagccatgtacccaatgccaaccagtcagcagcaagtgtcacctatacgtccccctgagaaaagacagcgtgtcccatctgcatacaacagattcatcaaggaggagatacagaggattaaaaccagcaatcctgagattagccacagggaggcattcagtgctgctgcaaagaactgggctcatcttccccggctccattttggcctcagcgtcgccgacggcggcggcggcggcggcagcaactaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSVQFTSEHVCYVNCNYCNTILVVNVPNNCSYNIVTVRCGHCTM VLSMDLAPFHQARTVQDHQVQNRGFQGNNFGSYDIASRNQRTSTAMYPMPTSQQQVSP IRPPEKRQRVPSAYNRFIKEEIQRIKTSNPEISHREAFSAAAKNWAHLPRLHFGLSVA DGGGGGGSN</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>220..288#3222..3341#3543..3666#4139..4187#6154..6229#6984..7055#tagacagccaaaagggtcaagaggaaattgggtttgtgctctccccaaaatcctccatatatagtgcacaggaggcatcattctgttcatacatatctctcccttgcttgctttgctcctggatatatagctagcttctttctttcttcctctctccctgtgtggcacgcgcctccaatcgatctcttcggtgagtagacgcatcgagatcggggggaaatgtcggtccagtttacatcggagcatgtttgctatgtcaactgcaactattgcaacactatccttgtggtatcgtcttcctccctcatctctttctctctctagctctctctctctctctcatatcttgtgtatttctgttctaatttgaggtgtttgccggatctatatggggagttcaatttttttgtatatttttttgaaggggctaatgcgtgcatgctgtagtccatgcatagaggtagcctaagctaggggaaaataagcaccctaatcaagtatgctagctacttgtttactaaactaattgcactttgttttgtcctggataagtttgtaattttatatttctggagagttctccagtacatcgaaatccagcaatccggtctttttgcataaacttccatgtacatggtaacagaaatgcacagattttctttatggcaaacataaaatcatataaatagaaggatattgcaaacatactttgtactatttcttttcatcttctccaacttttcaagaaaaaaaaatccatatcttccacccaagggtgtcatttttgtatctccttgaaacaagactgtttctctctgacttgatccaccttgtacggttttaatttatttttacagaagggataaactcttcttggttttggatgagaaccaacatatttgtatatatcctatagcggtgcattatccagatccaacactatttgattatattctttcgctcatcaggcaaaatatcttgtacaaaatggtaattttccttggaaagaatgcttgatttgctcatagagaaaaaaaaaagtattgtccccgacatacatagtttttcgacgcatggggtcatacacatttttggaaggaacatgtacataagataatattatctgagagctttctcatgtatggatctactatactaccacaaaaagaaagaaataatttcaggtcaaattaaacttttagatgcgtgcaggtgattaaagctagcatctttaaccattaattattgcctctctagctttagctagctgctccatgcgataataccccagtgtctgtactgtgctgcacacttggagctattcctctgattattggctgtgccctgagtgtgcccacctctccaaaaccgaaattttttatgaataaacaaattttaattaacaaaaaaggctttaagctgctgcctgttgctaccacatcctgcagctttgtctctcattctgcacatgtgcagaaagaagtggatctgcctgtcatgtcattttcctctttgttgatgtttgcgcaggtgggtctcttctacatactctctctagctagctagtagtagtagctatattgtgtgtgtgtgagtatgcaatatatatgcatgcgtctcttagtatgtgttgtgctgaaagagaggagagtgtgacatgaacttttaactgtaaaagaagtgtgacatgaacttttaactgtaaagatgcctcctcttttttcatgctttttttttggaaaggatgattgtactgttcacacgaccaaatctaacttacctaagtatagatctcagtcatctgcacatagatttctctatctcaatctcaagatctgtctctctgctgtgtctctctcttcctgtttgtttgtgtgtgtgtgtctgactgatgagatgaatctagggagatattcttctttagacctgattgagatgtcatgtctctgcctcctggaggccttgagtgtgtgagatgcatcatgcattgcatggtagtaagagaaaacatgcatatatggctcaagcttctccaggcaaagagctagctaagctctcaaaagggagacacacttgggaaaaggtgttatttgtgcatgatggccaaataggactcaaaagacgatatggatatgagacatggtgcaacttttgacattcctagctactagctagctactttgtcatcacacatatatattgactacatacacatatatattgactacatacacacatacacatatatattgtgaaacggtacgtagcctagtggttgcagtgacctgagtaacaccccaaggttctgagttcaaatatccatagaagtgaattttagattgggttatattatggatggctaagttctctgtgtgataggctaagttcctaatttaaaacgggttatttgtgcttgataggctaagtttttatccaattggatatagaggccgggtaaaaaaatacacttctctaaaaacacacacacatgcattggcatttgacaattaatatatatggatatatacttcaattaatcttgtagctgcaaggctactattttttttccagcagcatggtcatctactcacctcttatttgcagtgcatgactgaacactgttgcagagaacacattgaattatttgaagagagaccagacggtagcatacgttgatatacatgttcaggccaatgctgatacatatagctagcaagctagctagcatagcattttagcattatttgcttggattcttgtggatcgatctgcgataaataattttatgaacagttatatcttataccactatttaagaatccaatgaatttggacgaagggactagggagtcaattaattaggaccaggaggtaaacaataatactgtgtgcttgtgtggtaactctaccagacttattaattggagctacatattccatgtatatatatatgtcatgaaatcctatttttttctgttttacgtttctgatagaattacccctatatatttttattaataagtttgttatgcatataataaatcacagtgttctgagagaggaaacgaaaaaaatgtaaatggatagatattataggaaaatataagagattgtgttttactcaatcaaaaaaaaaatcagaaatgtggtacatgtaaataccgaaatacgtaccgtaccttactcatgaactgagtactgttgcttctatatgtgtgcaggtgaatgtgccaaacaattgttcctacaacattgtgactgttagatgtgggcattgcacaatggtgctctccatggatcttgctccttttcaccaagcacgcactgttcaagatcaccaggtttaaaaactgaaataatggtttgaaatttcagttcaaaactgtagccgaagaatctcttgcatatatatcagctatatcttattttttatgaaacaaaacaaatgaaatattaatttctgtacgtatgtaaaaaaaagaattaatattaattatttactacgtacagtggaatggtcacatctaaatttgtttatttaggtacagaacagaggatttcaaggtaataactttggaagctatgacatagcttccagaaatcagaggacatcgacagccatgtacccaatgccaaccagtcagcagcaagtgtcacctatacgtcgtatgcacaattaattttctcatgattttatttcattgatctactaaattatggggtttattttttatttctctatataagcatgcatgcaaaatgggtatatataatatagttaaaggttatatttactgttctaggcttctaatgtataatcaaaatatattatagtaatcaagttcatgcatgagctatatatgaacctgatcacactgaattccagtaaacattagttttttccccgtatacgcatggagctgtgttagatttcccaaatgatcaatctataggtattaacacacacacacacacacacacacacatacatacacacacacacaatacatatattatcagcttgcataatttattaaattgccttgttcttctgtattcacattatagctagttttatgtattatatatatgcttgtataatagatttaaaatattggtccttttttcttctttacagcccctgagaaaagacagcgtgtcccatctgcatacaacagattcatcaagtgagatttcaagccacacatgcttgcttgaataagtatattttgacaccaaattaaataatagtataaggtgctaaatatatattgataaagaaccataaatagtcgaagtgcaggtacaaactaatccccacttcaaccttttggggaatatgcatgagttcctaagacagattaattatatttctttctatctaccgcagtgtgcaatcaaaaagctccatacactactatatactcgaccctcaggtcgattgtggacacacacacaaaaaaaaaagagtaaaacctgaatataatgattgggtgtttgggggaggggggggggatatttgaactccgacaatgattaatttgtgggcacttcgtaattatatattattatgtctaggctactacttccttttgcgctcctttaatttgtacacataatctagttagggcttgttcgctttcccttcccatggggattcaaaaggggatggggtgtggaagtaatccccgaaatcccttcaatctccatgggcatgggattaaccgaacaaacccttagtgaagtgatcattttggaccacaagttctgttggtaaattttgtggaaatgtactttacaaagttttatgatcggtcgttgtttggtcattggattttggaactttttgctactagattttttttgaagtttatacttttggaataattattcttattgctaggattttgtccggtgaattc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