Os07g0177100

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os07g0177100

Description

Armadillo-like helical domain containing protein

Version

NM_001065559.1 GI:115470850 GeneID:4342544

Length

8019 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os07g0177100, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 7

Location

Chromosome 7:4109656..4117674

Sequence Coding Region

4109906..4109983,4110422..4110484,4110567..4110621,4111046..4111143,4112259..4112417
,4112518..4112577,4113436..4113624,4113749..4113802,4113959..4114045
,4114149..4114881,4115282..4115730

Expression

GEO Profiles:Os07g0177100

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008400:4109656..4117674 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggcgaaggtcgctgtcggccagtgggtaccccatgtggaggccttcgtcgacgtctcccggcccccggcccaacactctgccagtgtggatgccctttctgccttggtgaataaggacaagctgactctctttgttttggtgtcaaagatggagatgtacttgacgacgactgaccacattgttagatccagaggaatcttgcttcttggggaaatattgtgtcgaatttcatttaaacagttagatgttaatgctatttcaacattgtcagacttctttatatcaagattgtcagattggcaagcacttcgaggagcacttgttggatgtttggccttgttgcacagaaaacgaactgttggtagtatcatcattgctgatgtcaaaagacttctcgagactttcttgcagaatgttcaagtccagtcacttgcagctgctgaccgcaagctatgctttcaaattctgaactacatactggatcactaccctgaggctgtcaaaacaatgggtgatgagcttctgtacggaatgtgtgaagcaattgatgaagaaaaggacccggaatgcttgaagctttcatttaatttggtcgaagctgtcatgaagctatttccagatccatctggtttggcagcacaatatgcaagcgaagtttttgagattctgagtaaatattatccgatctacttcacacatggagtgggtgatgatttagatgctacaagggatgatctttctaaggcactaatgcatgccttttgttcaaccccatactttgagccatttgcaattcctttgcttctagataaactttcttcctctcttccattagccaagcttgattctttaaaatatctggataattgcatccgctgctatggtgcagacagaatgggtagacatgtaatcactatttggtttaagttgaaagaagtgatatttagcctgtccatagaccaaattttatcaacctcaggggctaaagacatggagaagaataagaatgaaatagtatcagaagctctcacttgtttgaagacagctattattcaaatgggtccttcagatgaagatcgtttgatcaatttaattttactggatgaggacattgtaagtagcatccattctgtggcaagtgaagaagcctctggtttgacttcattgcaaaacccgattcaactgcatgcccttggaagtgtcatttctattcttgctgaatcatctgcatatttctgcactagagttcttcaagcgcattttgcacgcttggtagatagtttggaaatctcagctggtcgtgaatctcagcacttgaataattgcagtggaccatcttctggtgctattaactatggtgcactctatttatctgtccaaatgctttcatcctgtcgagaggtggccttgacatataaagaggaattttctccaattaaatcagcaaaggagtcttggtggcttatcttagagaaaaaattggactcactaatccatattcttcaatcattactaaccattgattctcaatttgtccagtcagcagacaggcaagaatatgttttgtgtgctgtgaagggtttgataatccttgcaactttcccggaaccccgtttacctctatcggctagtgcatatgaggatgttctgctgacgcttacttcagtaattatgagcaagtatgaaaatatgcatttgtggagattatcattgaaagcattgaccaccattggctcgtctattgtggagtttcatgcttctcaaaaggaaaatatttataacaaagttgttgacaagattagttctctggatgagccttgtcgaacttcaatacccctcaacctaagacttgaagcatgtttcgaagttggtacttcaggttcaaactgcatgttaaggattgctaaatctcttgaagaagctgttgtcggcaatatttctgaggcaactgaacatagctcttgttttcatagctcttgcatgtcccatttttataagcaactgaacaaaatattttgttga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAKVAVGQWVPHVEAFVDVSRPPAQHSASVDALSALVNKDKLTL FVLVSKMEMYLTTTDHIVRSRGILLLGEILCRISFKQLDVNAISTLSDFFISRLSDWQ ALRGALVGCLALLHRKRTVGSIIIADVKRLLETFLQNVQVQSLAAADRKLCFQILNYI LDHYPEAVKTMGDELLYGMCEAIDEEKDPECLKLSFNLVEAVMKLFPDPSGLAAQYAS EVFEILSKYYPIYFTHGVGDDLDATRDDLSKALMHAFCSTPYFEPFAIPLLLDKLSSS LPLAKLDSLKYLDNCIRCYGADRMGRHVITIWFKLKEVIFSLSIDQILSTSGAKDMEK NKNEIVSEALTCLKTAIIQMGPSDEDRLINLILLDEDIVSSIHSVASEEASGLTSLQN PIQLHALGSVISILAESSAYFCTRVLQAHFARLVDSLEISAGRESQHLNNCSGPSSGA INYGALYLSVQMLSSCREVALTYKEEFSPIKSAKESWWLILEKKLDSLIHILQSLLTI DSQFVQSADRQEYVLCAVKGLIILATFPEPRLPLSASAYEDVLLTLTSVIMSKYENMH LWRLSLKALTTIGSSIVEFHASQKENIYNKVVDKISSLDEPCRTSIPLNLRLEACFEV GTSGSNCMLRIAKSLEEAVVGNISEATEHSSCFHSSCMSHFYKQLNKIFC</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>251..328#767..829#912..966#1391..1488#2604..2762#2863..2922#3781..3969#4094..4147#4304..4390#4494..5226#5627..6075#aaaaagaaaaccatctcgcgccgcctcgcccctcccctccccctccgccgtcgccgtcgccgtcgccgccgccgccgcgccgcctccccccttcccgggggcgcctccactccaccacctgccgctcgaccgccccgcgcctcgtctccacgaccctccccgtccttcgcgcactccgcagtagcaaaaaccctaaacccctgggtggcacgaagcttgtacgcggcttcggcggcgggcagcggcggcaatggcgaaggtcgctgtcggccagtgggtaccccatgtggaggccttcgtcgacgtctcccggcccccggcccaacacgtgcgcttccccttctccaatccccttctcccctctccttgattggattctgaatgcgtgcagctttgcttcaaattcgttttctctttgaataatctgggtagaattatcttcactatgagtttttttggggggcaatttccatcgttggtggcaagtcctggattccgcggccgaaattctagcacttcttttgttagggaagtggtatttcagctctcactctgaaaaaaagaagttggtattgaagtgtaatactgtaatatggtagtattgataataagtctctggttaacacattggatggatgctgctgctgacttgcttgaaatttggaatgcaatgcgattcattgttggactagtttgttgttgattataatgtttttttttacggaattgttgattataatgttgtaatgatgtgcgtgcacaacagtctgccagtgtggatgccctttctgccttggtgaataaggacaagctgactctctttgttttggtatgtcccagcctcatataccgtacatcgagttagggaaggtagttgtttttcagtgtgcctcattggtgattttgttcaggtgtcaaagatggagatgtacttgacgacgactgaccacattgttagatccagaggttaccttttctctttgctttgttttgctatattccaagttcgatttgccttatttttgtgagaagcgatcaactaatgaaagtaaaagcttgaacctttctgtggggtagattagggatatggtcaccagtttcttgttatagttacttagcattgttggcacagttctagtcttctagaagatgcagaagacaatctcttctctttgtgaagattatcacagatctctacttatatacaaatactgaaaatgggggaaaagcatttcactttactagaatctatgatccatttgcgaaaatgtgaattatttccaatcattattctcttgttgtgtgaccggccaaacttctcttgcttggtgacttgtagatttcagtcgaacctcatattgtttgtcaacaatctactttttttttgcaggaatcttgcttcttggggaaatattgtgtcgaatttcatttaaacagttagatgttaatgctatttcaacattgtcagacttctttatatcaagattggtaagtgtaataatgtgaatcatagttatttcctttcaaactactgttctcagctcctgtaacttcagtacttcactatagaaagaaattcaatgtgttactttatgttgattggcatttggtgtatgatcacagcttctcaaacaagtagatcaacagttctttttacttgattaactcagtaatatgaccttctgttgttattattgtctctttgtcaaatgtcgaatgagatcaaacacctgggggatagggacgtaaaattaatgaagcaaaatagaagagatttgctgaatttgtggtgcgatgctttcttgggaaaattaagcatggaaatatatatttttatttgcttacatttgctttctctccacatttaaacaagcaaacatccacatctttaattccaacttctcaacccttgatgtgaatcatcaccatcatagatttccagcaattaattctaaatgtactgttgaatatgactagctgaactgcaaggcaccatgctatatttattcaaatgactgagttctggtcactgctaggttctaatgtgtgcctatgattatttttgtgtacgccacatataacagaacagtcagaattgtgttctaatcattgttgagcattgcatgctgagtgaaaaagggaacatggttttaactagtatcatagcctcattggagaaatgggattgaatttcattatttgacatctctagaaactgacgactttaaaagttgttagcaaacaaagatttgtctaggctttttatttgattaaagacgaaaaaggttaaactaggtgtctgagcttggttctagattaggcactctttagtcgtttagtttgcctagattggacctaagtgtcatttgtaaagaatattctccttgtgaattgctttggatagtttagaagttcttatttttcacatttttattttttatgtgatgaaaacattgtgtggagcaaattggtgagctcaacatctgaatatctgataactcctgttatactgtatttattgtctcatgctaaaaattatatttatattatggtgccatccttttattatcataacagtaatcatacttatttttacatatcagtcagattggcaagcacttcgaggagcacttgttggatgtttggccttgttgcacagaaaacgaactgttggtagtatcatcattgctgatgtcaaaagacttctcgagactttcttgcagaatgttcaagtccagtcacttgcagctgctgaccgcaaggtttatgtgattatttatttttgttgcagagatgcttaaacaagaatttatcctagtcgaatccattgacaattttttatcctttttattctctatccagctatgctttcaaattctgaactacatactggatcactaccctgaggctgtcaaaacaatggtatggtactaagtcagtatctggacaacagtagatcactgcatcatgctgaaattatcttagcctagttgttattataacagaaacgacagtgccttttatcaatcctatctgtgcatagactatctaataatgatagcagcagcacagctttgcacttcctttgctttaatatgctatgttttattgttgtgattattccgcggtatgttggcacttccctcatctggcaatcatatattatcttttttattccgaaatatttgactcttttggccaatcatgaaacatgctttggacaaaacatgacaatccaataatactgcaagcataaacaacaaggtatttaagagtcatatgggtagttttgaagtatacgtgggtatggggaagtgccagctattcaagggtggaaataaaatcattattatgagcctctgacatgaaggctcagtttgtattgaactgtcgttttggtcacttgccctagatgcttggtccgttcttttggttttgtttggtcattagacttttaagcgtgcattgtattttccgactcttggggtgggattgtttttcccccttgcattcttcttctcttattaatgaaatgatgtgcaattctcttgcgtgtttgagaaaaaaaggtttgtatttcactgtcagcgtgtactttatgttccttagaattttgaatgtatagtattctcatttatgaattctgaggttttgacatggagccatggaggcacagtttccttttcactatcaatctgttagtaagtttatagtccacttcaattttcggaaagatgagtacaaaccaatacaagttcaattggtatcatgaatttctagggtgatgagcttctgtacggaatgtgtgaagcaattgatgaagaaaaggacccggaatgcttgaagctttcatttaatttggtcgaagctgtcatgaagctatttccagatccatctggtttggcagcacaatatgcaagcgaagtttttgagattctgagtaaatattatccgatctacttcacacatgtatgtcgattgaccgttttgacttttaaggcattttcatgtgctttattgttctattaatagctgttctcagcctttctttcttcaaagcagcatactgattgtgcattgtttgtgtatgtagggagtgggtgatgatttagatgctacaagggatgatctttctaaggcactaatggtatgaatatagacatataatatttcgctgatttgagagtgtttgatctttgtggtatttgttacccctagattctcttgtcatgctaattaatgatgaagtaaggcttcctattattgtattttgttggctaacaatctgtttaaatctatacagcatgccttttgttcaaccccatactttgagccatttgcaattcctttgcttctagataaactttcttcctctcttccattagccaaggttagtagctaaacttactgcattacatatgcttcaacaacctatgaaagagaaatcctgtccgtgtatttttgctgaagtatccgcctttattttcttacagcttgattctttaaaatatctggataattgcatccgctgctatggtgcagacagaatgggtagacatgtaatcactatttggtttaagttgaaagaagtgatatttagcctgtccatagaccaaattttatcaacctcaggggctaaagacatggagaagaataagaatgaaatagtatcagaagctctcacttgtttgaagacagctattattcaaatgggtccttcagatgaagatcgtttgatcaatttaattttactggatgaggacattgtaagtagcatccattctgtggcaagtgaagaagcctctggtttgacttcattgcaaaacccgattcaactgcatgcccttggaagtgtcatttctattcttgct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External Link(s)

NCBI Gene:Os07g0177100, RefSeq:Os07g0177100