Os07g0205200
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Structured Information
| Gene Name |
Os07g0205200 |
|---|---|
| Description |
Similar to Transcription initiation factor TFIID subunit 5 (Transcription initiation factor TFIID 100 kDa subunit) (TAF(II)100) (TAFII-100) (TAFII100) |
| Version |
NM_001065682.1 GI:115471096 GeneID:4342682 |
| Length |
6317 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os07g0205200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:5693505..5699821 |
| Sequence Coding Region |
5696641..5696680,5697030..5697194,5697294..5697370,5697649..5697765,5697900..5698165 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008400:5693505..5699821 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008400:5693505..5699821 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>VWDMSKIGQPSKASCSQGENGPSQIERVSTSDEARKSCTLFQGH SGPVYSAMFSPIGDFLLSSSADSTIRLWNTKLNANLVCYKGHNYPVWDVQFSPVGHYF ASASHDRTARIWSMDKIQPLRIMAGHLSDVDCVQWHVNCNYIATGSSDKTVRLWDVQT GECIRMFIGHRSMVLSLAMSPDGRYMASGDEDGTIMMWDISSGRCVSPLVGHNSCVWS LAYSCEGALLASGSADCTVKLWDVASSTKTLKMDDTKGGSANRLRMLKALPTKSTPVY TLQFSRRNLLFAAGAPSLGS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>3137..3176#3526..3690#3790..3866#4145..4261#4396..4661#5630..5725#5804..5879#5977..6030#aagaagctggaaagcatcctttctcctttacatttggaagttagtgactcagcttttccacattgcactaccctattttgaatgaagacttattttttgtttatttgattctatctcctcaaagtttacaaattatggcttatccttctaaatattgtaatttcagcaaatggaagtggctcgatctttaaggcagaataaattcagaattaagctatgtgaggttgtataccatttccaaatcccctttcatttcaaccctgtaccatgtactattttttggggcagcatttcatgatagccactgtaatttcttgattgctgcaaaattgcttttctggaaatataatcagctgtcccaattaaagtttctgtctttttttattgcagtattcatatgaattgcttctccagtatctccacaaaacacaagctcttgtggtgcttggaataatcaatgaacgcatagattttcaaggtaagtttccccaatctgttatgactcatgattagtgacctaaatgttcatcctgcatttgctccttgtgagttatctgaatcttctgttccaactttcctttacaatattgatagtatcccctgggcagtctccattaatcattgatgactcggatgctgttgttctgattggaactagcaaggacttgacaaaacagataaatcagaaggaggtgcattggggggtatgttctgtaccagtctggtggtttcccaattctcatcatttattttatcaatagttaaggatacagcctaaacgaattgaaattatatagatcgatcagttaatatttaatgggattctagccgtttttattatttgttcactatgctcagacattttatttttgtgatttaaattctgtaatgcagatacttgaagattcacttgaagaacgtatggagaaggcaatttcagattctgataaaactgaaatagaaagcaaggatgcagacacagaagacaacaaggcaagaaactgttttgtagtatgccagtcttttttttcattttgcttcctatgccctcggtcattgaaacacaagctttccttttttttagtgcgtgcgattctgttagcaacttgtgatttttatggttgctttattataaaaacagtactttctgatgtgcactggctgtcagctgtatatgatatcaatgtttcattgatttgttccactatgtaattctgcattctcctttgttcagtgctcccgtaaatgctagcaggcagactggttagaacctagcacctgggaaggctaggcagctgcatagggggaactatgttcctcactcaccattgatgtttcttagccttctcatttcactcttttcttatttttgctacagaaaagatcctcagaaggtggaaagcagggtggctcacataaaaagatcaaaaaggacaagtttgtaggaaccacagggaaaaacatgaaatctgaaactagcatggtttctatagcaccacgagttaaaccagagctaacgcttccaatgacgtacgtcgtacaatacatctttaatcacttcaaattttcttttgagaagtccaatttggtcatctaattttgaatattgtctggtttgtgacctaaggttaaaaagttctcctgaaatgattcaggattttaggttatgataaaattataacttcctctgcatccatttcctggtccgtggttgggaagaaggcaaccacatgttttttaaattcatgtggccattgtttcatttttcctgcagactgccccttttgaaacgcaggattaaaaaacttaggaatatggaaaacaaaggaattttgtaggttgattggaccgtaggaaaaacatagcaatgggcttggattataagagtaaattgggtttcttatctacttatacacatcttaccctcactaattgaatagacaagtggccatgagctactagatttgccttgatccaacgcgagataacaaaaacatgagcttggaatggatgttaaatttcctatgttttcctctagatttgtaggaacaggaaaatctcctgtgattttcctttcctcattcctacaaatcaaaggcatgaacaatgatcttccctataggatttcaattcctttgttttttctccaattcaaaggggcctgcatattctatgcaccaacatattgcttcctcatccacactgttcaaatgatttggttatcccatgtccacctgccaatatgttattgcttagatgttgtttaaccgtagaatatttgagctgttcaaaagcacttttgtaagacattaacaaaaccaaagattatatttcctttgccttccaaactatcatcacgacatggccattaaggctctgttcgcaaaaacaggttcccaacccaaacagtacgcacagaaaacggagcggtccattagcacgtgattaattaagtatttgctatttttttttcaaaaatggatcaatatgatttttttaagcaactttcgtatagaaactttttctaaaaaaaccaccgtttaacagtttgaaaagcgtgcgtgtggaaaacgagagtagggtgttgggaaccagctcttgcaaacagagcctaagcccactgataagattttctatagtgatgtttttttcttatattaagttgtaataatttctttgtacacatgtttacttttatttgttggacatctttgttgactcatcagccttacctttatctgtaagaatctgatagacgtttactgattattttttttcaggtctgttgaagttgagcagtcaattcttgaggacttgcgaaaccgtgcacaattgaatagcttgtcattgccatctgttagcttctatacattccttaatacacataatgggtaaacttaactatggatcaatgcctgacaatttttattttcaatttttcctccttcagtttaatcattatatgtggaactcaggttaaattgctcatcgatttcgcatgatggttcattggtcgttggtggattcgctgattcatcagtgaaggctagtccttttaggtggcatcttcttattatgtgatttctgtattaattcgtaatagtaaaaagtgtaaaatctccttggtgttcactaggtttgggatatgtcaaagattggccagccttccaaagcatgttagttgttcttcactccttatttttgattatttgttctgctttgtgttatgctgaaacacttatataaatttgcgtctggtttatgtgactaattggctattgccttcttaaaaatactataatggtacattcatttgtatcattcgaagttccagttacaagtcctaagaagtatgatgtttttcagtcatacttgctggatgtactgatgcacttgtgtcattacagtatttgactctggaacctgttcagaaccttatgatagtcttagaacattaatcctcctagcatcaaagtcaattatgcaatgatggtatttactgattgaagaaactataattttcagcttgttcacaaggcgagaatggaccctcccagattgagcgggtatcgacatcagatgaagcgcgtaaatcctgtacattattccaaggtcattctggaccagtttattctgccatgtttagcccaattggggacttcctcttgtcatcatctgcagactcaacaagtaaagccttctcattgtgcttgttttgtatcattctcttccttgttactttattaattagaattcacaatttatctatatttttttgacttgctacagttcgcttatggaacaccaagttgaatgctaatcttgtttgctacaaaggacacaactaccctgtttgggatgtccaagtatgtgattaccagttcttttagtatattattagtgtggatacaaagctgttttcaatgccaaaaagaaaaaaggaagcatgggtttctgtgtgctccttatgaactattcctaactagtatttcatcgttagtactctccatgatggagtactaggtacttatatgtcctgtgaaaagctcactgtcaaattcttttggatgcaagttatctgattctgttattgtagtccttgtgctatgatagttgttgacactgttctgttttcttttggcagtttagtccagttggacattactttgctagtgcttcgcatgacaggactgctagaatctggtccatggataaaatccagcctttgagaataatggctgggcatttatctgatgttgatgtaagtgtactcatggttttggtcattttcttatatgggatcacttaatgttggaatatttccatacatgcttattctctaatttcctatattgatgtctgcatttttttaaaaaaaatacttttgcctgacagtgtgtgcaatggcatgtcaactgcaactacattgccactggctctagtgacaaaacagtaagactatgggatgttcaaacaggtgaatgtataaggatgtttattggccataggagtatggttttatcattggcaatgtctcctgatgggcgatacatggcctctggagatgaagatggaacaatcatgatgtgggatatatcttctggtcgttgtgtttcaccgctagtgggacataactcttgtgtgtggtcgcttgcttacaggtaatcatcatttgatgctggtcggctggtaaaaatataatatctatctagccgatttctttaatatgccaatagagtagtattatggaactacggcactacgctagttataggcttatagcatggcttggcaaactggctagtgcatatgtagcaggactgagttttggaaaatcaattggtttatttgaattgagtaagcatgatctatctatatacaagaaatcagctcatcgt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