Os07g0264100
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Structured Information
| Gene Name |
Os07g0264100 |
|---|---|
| Description |
D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, catalytic region domain containing protein |
| Version |
NM_001065865.1 GI:115471462 GeneID:4342880 |
| Length |
4538 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os07g0264100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:9385324..9389861 |
| Sequence Coding Region |
9385330..9385432,9386181..9386310,9386934..9387082,9387171..9387298,9388058..9388129 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008400:9385324..9389861 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggccgccgctgccagactcgtctccaccactctcgcgcgctcctcctcctccctcgccgccgccgcgcgccgccccgaccttctcgcctcctcgccgcgtggtttttcaagcatggcagattcaattcaaaggagcggctctggcgatattacgcgggttttattctgtggaccttattggcctgcttctaccagcttcaccaaggagtatttgcagagctatccatttattcaggttgatgaagtaggtctagaggaggtacctgatgttattcaaaattaccacttatgtgtagtgaaaaatcgacgtctagactcagataccattgccaaggcaagtcagatgaagatcattatgcaatatggtgttggattagaaggtgtcgatgtaaatgctgctacagaacacaagattaaagttgcacggatacctgggagtacaacaggaaatgcagtctcttgtgcagaaatggcaatctatcttactctgggtgtcctaaggaagcaaaaggtgatggatactgctgtgaaacgtaaggacctgggcattccagttggagatacaatatttggaaaatcagtccttatcttgggatttggagccattggagtagaaattgccaagaggctaagaccctttggagtaaaaattcttgctaccaaacgaaattggtcatctgatacattgccatgtgatatagatgaattggtcgataagaaaggtggaccagaagatatgtatgaatttgctggagaggctgacatagttataacatgcttgctattgacaaatgaaacagttggaattgtggatcataagttcctctctgcaatgaaaaagggatcatatctggtcaatattgctagaggacgtctactggactacgacgctgtgtttaatcacctgaaatcaggccatttaggtggtttgggcattgatgttgcttggacggaaccatatgatccagaggatccaattctgaagttctcaaatgttattataaccccacatattgctggagtcacggaatactcttacaggacgatggcaaaggttgttggtggtgttgccctgaagcttcattcaggggagccaatcactgaagtggaatttgtgaactaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAAARLVSTTLARSSSSLAAAARRPDLLASSPRGFSSMADSIQ RSGSGDITRVLFCGPYWPASTSFTKEYLQSYPFIQVDEVGLEEVPDVIQNYHLCVVKN RRLDSDTIAKASQMKIIMQYGVGLEGVDVNAATEHKIKVARIPGSTTGNAVSCAEMAI YLTLGVLRKQKVMDTAVKRKDLGIPVGDTIFGKSVLILGFGAIGVEIAKRLRPFGVKI LATKRNWSSDTLPCDIDELVDKKGGPEDMYEFAGEADIVITCLLLTNETVGIVDHKFL SAMKKGSYLVNIARGRLLDYDAVFNHLKSGHLGGLGIDVAWTEPYDPEDPILKFSNVI ITPHIAGVTEYSYRTMAKVVGGVALKLHSGEPITEVEFVN</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>7..109#858..987#1611..1759#1848..1975#2735..2806#2899..3013#3095..3198#3281..3322#3609..3821#4298..4366#accactatggccgccgctgccagactcgtctccaccactctcgcgcgctcctcctcctccctcgccgccgccgcgcgccgccccgaccttctcgcctcctcgccgcgtggtatgtctcctccctccctcctccctcttagccaacttccgccgtcgtcgcctctgtttgttccctgtggggtgtgggtggctgtttcccatggtgtttgcttcgtcttcggatagatggatttgtggatggtttgtttggggttgggggtgatgaaattggatgggttttgggggggaacagtcgggccagtgaatgatcagagggtggctttgccatttgggtatcatcccaagtagcatggcgagatgggaagggaaatccgtgtgtgctacaagagatcttgtgcaattggagactgaacatttcagttattcttgataatttctttggctccaaagtgatctatgtttgattggaatgaaggatttggtcagtgcagacagactagtttgtggcattgtgtcagtgacagtggtcaagcggccatggatggcatggcacgtttgaatcggatacacagagttgaacataaattaattgactaaatatatggccatatgggaatcctgggtccccgcagaaaaaaaagggaatcctatcgttttttttttcttctcagtaggtcaatcagaccttggataccctcatttcattgacttgattccactatcttggtgatcttgtcttttcttcaccaatactgcatccatcttttttttttgttgctctgtttgtctctgttcaattatttttgtatacacaacttttaacccttgttacaaatgtctttctcttttgattgcaggtttttcaagcatggcagattcaattcaaaggagcggctctggcgatattacgcgggttttattctgtggaccttattggcctgcttctaccagcttcaccaaggagtatttgcagagctatccatttattcaggctagttgctcttttttatatctaccttgcatccttgatgagcagtgaaattccgggattcatgtgaatttagctgatacatctatttttagtttggtgtggactaaaatagctttataactgatcttaaacttttttaactcacatctattcatcttctgttagctatcagaagttaagatctgtgtcactacacagattcagacaactctgtttacatatttagcgctcttgtaatatattgtttcattttgaaatcaagcatgtgatctacaataaatgaacggggatgggaacatatcacgtctagaggaggtaccttatgttattcaaaattaccacttttatgcaagagctccatattactcgactcggagttctggtatgatgttcactttggcaagttgttgttacatggaacagaacatgtatgtgatgcactggttgattgttctatcctccatttgaattattgtgaaaaaaattctgggatatttatatgcgaagtcatttgatgacaagtttatacatattgtcttgatgatatgatcttaattggagtcacatgttactatgtgcatctatgggtttatatctcaccataattgaatgcactttctcaggttgatgaagtaggtctagaggaggtacctgatgttattcaaaattaccacttatgtgtagtgaaaaatcgacgtctagactcagataccattgccaaggcaagtcagatgaagatcattatgcaatatggtgttggattagaaggtgattataagtctaggtttatcttgccattttgaaaatatagtggcacaactacctccttggatattgagcatacaactgttcgcaggtgtcgatgtaaatgctgctacagaacacaagattaaagttgcacggatacctgggagtacaacaggaaatgcagtctcttgtgcagaaatggcaatctatcttactctgggtgtcctaaggaagcaagtatgtttttaaaagatcaattttttttccgcttggatgtactctttatgttttatcttttctgaagcatttctcactaatactagaccatttttcagttgtttatgcagataaaatatctaaacatgtcaaactggcaagcatagtcatctgcacaacttaatttttgcataaccaacttaatttttacatgaaacgatttatgcaaaaatgaagcaagcaagcagataatcactctgcagcattaaaaccttggttgtaaaatgaaattttaattgttaatgttctatataaacaaagaaaaattataatgaccaatactatttaatttgagtttcaggcaccttatagtttggaaaacaaataaacaggagccttcatttcttgtataaagtatctagtttacctcctgtgatatttcctttttggaccaccctttgttattttgagtgatgacgaaaatttccactgccaatttaccaatacattgtcatgactgttaagatgccatgtgttttgagcctatattctcagtagtaagagaatatgcaaagctcccaaaatctggttaaacatgcacgatgactctattaagcatagcttttgttgatggggtttatatttatgcaggacatttatacagttctttatgatttagttcaccttattatatttaatcatttggtagctattgtataaatataatttattactttcttataatggttgctaatatttcggatgtgttttaccttgcagaaggtgatggatactgctgtgaaacgtaaggacctgggcattccagttggagatacaatatttggaaaatcagtatgctctttgtgtatgagttactttcttttttcactttacatggtgaaaattccatttgtttagtaatttgtatttattctacgacataggtccttatcttgggatttggagccattggagtagaaattgccaagaggctaagaccctttggagtaaaaattcttgctaccaaacgaaattggtcatctgatacattgccatgtggtgagctgcagtatttgcgtcactactcccagtcttttacagttgttgttttcctcctctcctaacatattgctagtgcagatatagatgaattggtcgataagaaaggtggaccagaagatatgtatgaatttgctggagaggctgacatagttataacatgcttgctattgacaaatgaaacagttaattcttctattggtgtatttctttatttcagctcgaaaacctctcttgaatttgattactaaataatgaaatttacaggttggaattgtggatcataagttcctctctgcaatgaaaaaggtatgtgcatgtaaccatatacttacaggttttttttcccaattccataatgactagttgatcctactcaacagtaaagtattgttctgtcatttattctagagtaaatttcacaaaatcacagattttggggcacccataacccaaaatcccagacattgtaatttgttctgtcagacgagcatatttttacacgaactattaactgcaatacaatactatgatgatgttggataataattttatactatattcaatcaaaaaaaataatgttgtagtattgcagggatcatatctggtcaatattgctagaggacgtctactggactacgacgctgtgtttaatcacctgaaatcaggccatttaggtggtttgggcattgatgttgcttggacggaaccatatgatccagaggatccaattctgaagttctcaaatgttattataaccccacatattgctggagtcacggaatactcttacaggacgatggcaaaggttcgcacttgtttctccgaattgaccatagctacttcactctcatctaattctcaacttctacagttattcattgtttgggcatagcttatcataacacaattagcattgcaattatagcacaaaacgaagccttccttttaatacatgtataaagttattaattttaacgtatcattcttcagttaagtaccaacatcccctcgagctctccatccatcgtttaggctttaacttttgtaaccctaaaactatatttagtaggaccttgaaccctttctgagctgtgcatgctatgtcattttactgcatagaattattttacctataaaagggatagtaaaaccatcaacaacaactccatgtgcatagtgcattgtcatataagttttagcaatcgtctgcagtataacatgacgccgccgatttatgttaccattttgttattgtcatgtttgctccaccttgtgatgcaggttgttggtggtgttgccctgaagcttcattcaggggagccaatcactgaagtggaatttgtgaactaagctcaggaaatgcgtggcacagatgtgccattattatggattgattcaaaaagatcaaaaataggtttgttgtagtgtcaaaattgctttgcccctaggtgaataattgatcattgaatcgcctatccttgcaaggatataataataagatgttgctctgtaatttgttatg</dnaseqindica> |
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