Os07g0408100
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Structured Information
| Gene Name |
Os07g0408100 |
|---|---|
| Description |
WD40-like domain containing protein |
| Version |
NM_001065970.1 GI:115471672 GeneID:4342993 |
| Length |
8170 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os07g0408100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:13336309..13344478 |
| Sequence Coding Region |
13336975..13337130,13337231..13337424,13339002..13339129,13339888..13340087,13340203..13340341 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008400:13336309..13344478 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgccgccgcagcagctggtgctcgcggcctcttccaccgacgccggcgttgccgcgtgggacctccgcacgggcgccgaggccatccgccaccgcacctgcgcctcccgcccccgcgctctcaccgtcgtcgccggccgcttcctcgccgcctcccaggcccccgccggcaactcagcacccatccactactaccactgggacaagccccaggtggccgtcaagagcttcccggttgagccgatacgcgcgctcatcgctgatccggaggggagctacctcatcggcggtgggatctctggcgacatattcttttgggaggtggctagtggggagttgcttgtccagtggcatgcacattatcgtgctgttaggtgccttgcactctatgactttttgcttatctcggggtctgaagacggtagcatcaaagtttgggatctcctcacgatgcttgatgagcaatcaagattggaggcaaagacacaacacatatacagctttaatcagcacgcacttcctgtaaccgatgttgcttgctgtcatggagcaattgctgtatcatcttcagaggatcacacctgtaaaatttggagtctatccgagggtagaatgctaagaagcatttcatttccttctattactgattcagtggcgttagacccaaggagtcatattttctacgctggtggtcgagatggaaagatatatgttactgctatgggaattgatgtcacctctcctagtagtgatgattcaactattaatggggctttggatgaccatagcaaggcagtaaccagcttagcatcgagtactgatggacttatattgatctctggatctgaggatggtaatgttcgagtttgggatacaagaactcagcaagtaatccgaaaattcaaacattcccaaggtccagtgacgaatgttctcttagtaacgcctaaacgagtaaatcttccaccactacaatcactacggaaagtttgctcagcaaatggaggatctgaatcacgggctgtaattgtgccccaacctgaaaatgatgtccaaatttttggaaacttcagttccgactttctggagcgctgcctggatgcacttcagcctggcagttcgtccagattgtttgaatctggggccagtgctctgtatggtgcaccaaaacaacagggtgtagaatggaggagtaaatacttggagttacaggacctctttgtgcgtgaggttcttgatcagatgccgtctccaaagaatacatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAPPQQLVLAASSTDAGVAAWDLRTGAEAIRHRTCASRPRALTV VAGRFLAASQAPAGNSAPIHYYHWDKPQVAVKSFPVEPIRALIADPEGSYLIGGGISG DIFFWEVASGELLVQWHAHYRAVRCLALYDFLLISGSEDGSIKVWDLLTMLDEQSRLE AKTQHIYSFNQHALPVTDVACCHGAIAVSSSEDHTCKIWSLSEGRMLRSISFPSITDS VALDPRSHIFYAGGRDGKIYVTAMGIDVTSPSSDDSTINGALDDHSKAVTSLASSTDG LILISGSEDGNVRVWDTRTQQVIRKFKHSQGPVTNVLLVTPKRVNLPPLQSLRKVCSA NGGSESRAVIVPQPENDVQIFGNFSSDFLERCLDALQPGSSSRLFESGASALYGAPKQ QGVEWRSKYLELQDLFVREVLDQMPSPKNT</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>7349..7504#7055..7248#5350..5477#4392..4591#4138..4276#3938..4065#373..486#72..281#gcagggccttctcccacgcggccgcgccatcacgtccgccgctccctgtcttccgtcccctccaacacaccatggcgccgccgcagcagctggtgctcgcggcctcttccaccgacgccggcgttgccgcgtgggacctccgcacgggcgccgaggccatccgccaccgcacctgcgcctcccgcccccgcgctctcaccgtcgtcgccggccgcttcctcgccgcctcccaggcccccgccggcaactcagcacccatccactactaccactgggacaaggtaaatcactcgaccttaacccacggtcctttaaactcacaaaaccctatctcggaggcggagcttcatgtcctttgttggtcccctgcagccccaggtggccgtcaagagcttcccggttgagccgatacgcgcgctcatcgctgatccggaggggagctacctcatcggcggtgggatctctggcgacatattcttttgggaggtcagagcatttgctattgatttcttcttctatggtaaaacactcgctagttttggggaacaaacagttgtcattgctgctttttgtgcactttgtgtactgtttcggaaggttatggtcgtgtttagttgttttggcaattttttttgacgtatacggacacacatttgaagtattaaacgtagactaataacaaaacaaattacatattctccctgtaaattgcgagatgaatctattaagtctaattaatctgtcattagcaaatgtttactgtagcaccacattgtcaaatcatggcgtaattatgctcaaaagattcatctcgtaatttacctgcaaactgtgtaattggtttttttcgtacacatttaatgctctatgcatgtgttcaaacatttgatgtgacggaaaagttggaagtttgaagggaactaaccacagcctatacacccatggttgtttaggtatattgagtaattttatttaatcatcagtttagttttcataaaaaaataacctttattgtacaataattcagtcttgtcgtactgtggtggttatgttggagatgcctgttctgtttgggcatttgaattttggcattcagtgagatgcaactatgctattttctgaagaacatacatatttgggaaactcgtgtagttcatacagggtgtgtttggttgcccggacacatgagagatgcagtgaatatcttgtttggttaggtgtgctcgcgatcgaggatgagcagatgcaattcggccccaagagccaggcctaagagatgcaggttttcacctttcgcttctcagccaggtctggctcatgtggccgcggatgcaagcgagcacgtgcgggtgcagacagtgcaagcagggcgcatccctcaccccatctcccatttgcatcgacttgcctcacctcccaagtcgcatcatcgttgccctcctcttctcgtcgtcatctagcccatccgctccttttctcgtttggattcggtgtctacgaccgtgcacacgccgaatacggcagccccaactgctcaggtgccagatctggccaatgcggcggctcgagcagcaaggcatgggctcaatgacgagggtgacgatggacctccaacttccaacatgcctctgctgctgtcctctgtcaccaagttcgtctcatcgtcgctgagcttttctccaccctcaacaagctcatcttctccccttctacctggagccggaggccactagcacttgtctgtcagatccggtgttgggctgctgatttgatggcagtgacacagcagccgtcgaatccaactgaggcagcgagctagcgactgtcgatacaaaccgagcagccggcgtttccactagaggccaccaagatgttgtggccactttcccattccctttccttttttgtttattcctttattcgttttgttgttttcataggctcatacagataaatagattcatatatgtatacatacagtaaaataatgaagtaaagatgctacagtatatagtagtaatttgtttcaagcaaaaataggatgatttttttggcatacaaattttattgcaactttgtgtttttaatctttttaaagaaagcagcctcaacatgcaagcaaaggggtaactgcactcaaaattcataggcaaaatttgctacaggacactcaaagtttgtgcaatttgctgtgagatatccaaagaacgtgtatcttcttgtcgacagactgcaaaaatgtggtaattagctgttcaacactcgagacattattttattatatttgataaaaacgcggagagagatttaaaaaggacaagtttgcccttgcctgctctttctccaccacggcgcgcgagcgcttcttgggccggcgaggcggcgccatgccacggatggcgatgaagtccacgaccatctcctccctggtgagcgcaacggagaagctcctgttcctcgcgatcaccggggacaacgcatgcgggtgcagcgtctgtcctcctcccgccgcagccgccttccccccccccccccccccggcgcagcttcgacgcattgggcgccacggtggcggagcggcgggtgcggaggttccatggccgcgacggtttgtcctcttcctcctgatgaggcacgccgcgcacagtgcggcgccatcgacgccatgcttctctgctgcgcgggtgggcacgtacgcgcatgcctctgctcgctctgccatgttgcgctctctgcccgcaccctcactgtcgctgccgtggacgcccacgccgtgtagcagcctgatgtcgagaaccggaaggtggactagcgggaggcggcgctagaagcggagatctcctgtccctgctccttttccttctccggcaacagggtgtgtggctgcttcaggggcgccgccccttcccccgcccaccgtctacctcctctgctgcgctcacccaccgccactccaccctttgccgctggcggcctcccaggctcgttgaagaagagaatagaagagaggagaagaaagaaaagagagctgaagcaggaagaagaacaatgtccaggggcattttggtactttctacgttctttctctcgacgttttcactggaaataataaaataatgcctcgggtgtccagtagctaattaccatatttttgcagtgtccataggaagatatacgttctttgagtgtctcacagtaaaggccacaaactttgagtgtcctatagcataatttgccaaattcatacaaccaaccaaacaaaatccctagcatacatgcattaatattcaactaaccaaacaacatcgcacacgatccagacataactgataatcaaacaaaccctgttgcatcaacttgcatgtggctagccaggctaaactccaccaggatggggcatacgggtcaggctaagggcatacaagcaaccaaacacacccatatagtgcatttacgcccggggcaatttttggtgttgctagtaaattgacctagacttataagcttatgacatgttatggatcttatgtttgcttcgctacttttccccctaaaatatgccttctgtttctgtttcaacttttctgtcaggcagcttcttagagttcagattttgcctaatctatttgtgctttcatacctttcttgaaattttgcacttttttcacctggtgtgcaagtacaatcatctgtgttgttttcttgtgttgaaatgttgcctctttatatttggtatctgtcttcacaggacacaaagtgtgctaaattctatctggtcctcttttagtgaattatattcctatttgtttgattttggcattttgcatagaaatttaacatttccactccatgttcctaattcatccagtaactctgtctttgataataaaattcgttctttcttacaccccattctctatggtggttgtgtgtgtaggtggctagtggggagttgcttgtccagtggcatgcacattatcgtgctgttaggtgccttgcactctatgactttttgcttatctcggggtctgaagacggtagcatcaaagtttgggatctcctcacgtatgtgattatggtaatactgaccacactgattgcttgtttggtttacttaatttgtgttgtttactgcaggatgcttgatgagcaatcaagattggaggcaaagacacaacacatatacagctttaatcagcacgcacttcctgtaaccgatgttgcttgctgtcatggagcaattgctgtatcatcttcagaggatcacacctgtaaagtatgcaatctacttgtactttgtctttgagctgtatattttgtagaattgtacttgactatatggtctagtcatttttattagcatttaactttttgttccccctctttcctagatttggagtctatccgagggtagaatgctaagaagcatttcatttccttctattactgattcagtggcgttagacccaaggagtcatattttctacgctggtggtcgagatggaaagatatatgttactgctatgggaattgatgtcacctctcctagtagtgatgattcaactattaatggggctttggatgaccataggtttgcctactccttgctttcattagcacctcttatttatcctgtgatgtaaacagcttcaatatacaagttagagtttgatatcttgtagtagtagagtggttataaacctatcttacctgttcatgctttaactttggttgtatccatcctagctcgaccagtttgtttttaatgaaaacattttttttttcatattgctgtggaaagtgattaattaatacgcctgaaaatgatttttgttgatgcaaattttcttgtctatttagttaatagctttagaaaacaaatgcatcttggagggcgcactgt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