Os07g0484300

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Structured Information

Gene Name	Os07g0484300
Description	Zinc finger, RING-type domain containing protein
Version	NM_001066184.1 GI:115472100 GeneID:4343241
Length	11094 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os07g0484300, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 7
Location	Chromosome 7:18404377..18415470
Sequence Coding Region	18404676..18404735,18404823..18405183,18408486..18408692,18409375..18409442,18409528..18409665 ,18409754..18409911,18410466..18410571,18410792..18410888,18412440..18412561 ,18412639..18412725,18413570..18413647,18415038..18415268
Expression	GEO Profiles:Os07g0484300
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008400:18404377..18415470 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008400:18404377..18415470 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atggcggcggtgaacagcctctacgtcgccgcggcatccaccgcggccagcgccgcggcgctgcagtggtgggcggggtccctcctcgacggggatgccgacgcggcgggcgggggaggaggaggaggaggaggggactggctcggcacggtgctgggctcgcacgtgaccgtcgcgctcctggcgaatctggcggcgcacgtgttcctcgtcctcatcctctccctcaagacactattttttgttcaattaacctcttctgagactagaaaggtgttggaacacatcattaactatgtgctttacaagggaacttttctcccactggttgtgcctcctaattctcaacaaataatcctttggtcaagttggttgggccttctttgttccctgaagatgtttcaatcattggctagagaacgccttgaacagctcaatgcttcaccatcagcgactccatcaaaatactttcgtgtatattctgcactattgctggttctatcggctgatgtactatggataaagctttgtgttgggttctgcaagtcgtgtaattctcaactattttggcttatgttttttgagccacttagtattggctttgagacactgcagtcaatcatggtgcatggatttcagttgtttgacatatggcaacgacatcaaatggacagtggtgtggactatcttgatttccaaaaaacttataagcaagcagcaggatctttttctgagtggagaggcagactagtcagaaattttggttttgtcattgacttgataagcttattgatgtcacttggtcattactcaatgatcttctggctccgtggtatggcgtttcatctggttgacgctgttctcctattgaacttgcgcgctcttatagcttcattttggaagcggataaaaacttatgccaagttacgaaaggcacttagttcactcgacggagcacttccagatgctacatatgatgaaatctgtgcatacgacgatgagtgtgccatctgtaggggaccaatggctcgagctaaaaagttatcctgcaaccatctatttcatctagcttgcttgcgatcatggttggaccaaggattaatggatggttactcatgtccaacttgtcgaagacctctctttctgtcatctcaaggtcacacaagatctacagcagaggtaggaaacgtccagttaattgcagaacaacttaatgcggggttgaatcagcagagggttcctggtcatgaacatcctattgaacatcagaatcctgcagatgctgtttggagaggtgctggtcttgattctagctgggcaccaccatggtcgagccctgggatggacaatcccagttcttccagcgccgtgacatcagtggggcttagtggagttcagatgatgatgaggcagttgacttcagtgactgataattatgggcatccagatgccacctggagtctatggcctgagccagttgcaggatcttcggttgttccatcctcttcctcgaggcctgatggtgcttcagctgctggcttgcggttccgaggcactgcaagacccgcgaatggtagcatgtcggaggttctctccatggtagatagagtacgagaagttttaccccatatccctgacgagctaattattgaggatctgatgagaacaaataatataaacgctactgtaaataatcttctgctgatgcaataa</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MAAVNSLYVAAASTAASAAALQWWAGSLLDGDADAAGGGGGGGG GDWLGTVLGSHVTVALLANLAAHVFLVLILSLKTLFFVQLTSSETRKVLEHIINYVLY KGTFLPLVVPPNSQQIILWSSWLGLLCSLKMFQSLARERLEQLNASPSATPSKYFRVY SALLLVLSADVLWIKLCVGFCKSCNSQLFWLMFFEPLSIGFETLQSIMVHGFQLFDIW QRHQMDSGVDYLDFQKTYKQAAGSFSEWRGRLVRNFGFVIDLISLLMSLGHYSMIFWL RGMAFHLVDAVLLLNLRALIASFWKRIKTYAKLRKALSSLDGALPDATYDEICAYDDE CAICRGPMARAKKLSCNHLFHLACLRSWLDQGLMDGYSCPTCRRPLFLSSQGHTRSTA EVGNVQLIAEQLNAGLNQQRVPGHEHPIEHQNPADAVWRGAGLDSSWAPPWSSPGMDN PSSSSAVTSVGLSGVQMMMRQLTSVTDNYGHPDATWSLWPEPVAGSSVVPSSSSRPDG ASAAGLRFRGTARPANGSMSEVLSMVDRVREVLPHIPDELIIEDLMRTNNINATVNNL LLMQ</aaseq>
Gene Sequence	<dnaseqindica>10736..10795#10288..10648#6779..6985#6029..6096#5806..5943#5560..5717#4900..5005#4583..4679#2910..3031#2746..2832#1824..1901#203..433#tcttcctcccctcaatccccccttttctcacggcgtcgcggcccccccgaaataaagccgtcgtcgacacctcccccgagccgcaagcaaccccgcgattcccccgcatcgccggcgaatcggcggcggcgacgacgaggacgacgaggaggccatagggttgtggaggaggggtgggggacctgtcttcgatgcgcggcgcatggcggcggtgaacagcctctacgtcgccgcggcatccaccgcggccagcgccgcggcgctgcagtggtgggcggggtccctcctcgacggggatgccgacgcggcgggcgggggaggaggaggaggaggaggggactggctcggcacggtgctgggctcgcacgtgaccgtcgcgctcctggcgaatctggcggcgcacgtgttcctcgtcctcatcctctccctcaaggtgagcaatcggtcgatcgggaatgggatgggggttgggattgttgctgctcagggccacgcggtcattcgcttagattgtgctgtttggggaaaaaaaaacttttgtcggttgaccacttgtcagtaataataatataagcaataataatatatgcaagctgatagttgggaagatggaggtgttttttctgcccaaatttgttgattcaaatttgctgcccaatttgttggtttaatttgcgtgctgaagatatgtttgatgtttaggtagaaataaacttaatttgtttagttagaatggacgtgttttccttcattaaatcagctaatgacattttgtttccatgttgtttttggaatcatcaagtgtgtgagataatggagtgatttagtaggaatattgtgctttagctgattgcgaagaaccacatgttctcaggagttgcatttcagttgagtagatgcttatctaaactatggtagttggaacatatggggaagtagcaatgccaatagcaactatacaacaacatgcttgaatacaggcttgaacaccgcgattctgaagtctgaactggatatttgtacgtagtatttttgttgctcgatgctagaggatttctgttatgtggtatttttgttgctcgatgctagaggatttttgttacgttaagcggttctgaaatctgaactggatatttgtatgtggtacttttgttgttcgatgctagaggatttctgttacgtctctgaatggctgttatatggctttgatagagcaagagctaagctgacagtgtgtgacttggttcgttgcgatttccttctagactcatttttgtgcatgtggtttaatattcatgtaagaacttgtattgatacatccacttcttgattcatgtcgtaaactggctgtacttaattatttttacttccataggaatctttaaaaggagcattagagtttgacccaattttgtagttcaatcaaagcattttgtctgttggaaaagctcgtcctccatgtatgcatacagtttgcattgcaaacatgataactatgttatataaaaacactatttcatagaggaagctaaacttctagtctgctatcctagtttagattcttagtgacttatatatgagagaaaggatggttcatactattacaaagccaggtgtccaggtgacctttttgaaggcacaaggcagggcattgttcttcctccattgttccaatccatgatttagcggaaaccattttacctgagcatccagatttcttttaatgatttttagtaaagaggatgttgcagcttagcttatatttaacgtatgcatatcatattagcaatagtggcgttaatgttgttttttcttttatgcagacactattttttgttcaattaacctcttctgagactagaaaggtgttggaacacatcattaactatgtgctttacaaggtaagcgctctatccatctctctctctgtgtgcgcatgcgctccccttttctcctgactttctgctgataagctcgtagtcttcaacacaagagacttgctctaaaatgatgtttgcaatatatgctttagtgaatttaaagcagcttgatagtgagttcttttaaattagataatatgcagtcttacactttgttcaataactatcagccataatacatgtacaatctaatttagatctaatcctatctccttgagaatcttagcacaagtccaatacgtggatactctgatctttcatagatataagggtttttggagggatgtgatgcatcctagtactacgaatctagacatggagtctgtccagattcgtagtactaggatgtgtcacatccccccaaaaacccttatattttgggatggagggagtagaagtttccatgcccttttgtagaagtgaagactacgatttacaagttggaaaagtaaaccgggagatttgatcgtataccctcctttaaatcaaaagttgaggatttagcctcctatgccattgacatgtggggtcatcaacctaacttgtgggccaggagggtacatcctcaatttcaatcttaaggccatgttcggttaatccccaggagggagggattggaggggatttattccacacctattgtggtgtggaattattacacctcaaacccctccaatccccttcaaccccttccaaaccgaacaagccctaagggaggatgtatgatcaatttacagttatttatttatgttcttgttgttgcctgccatgtgaagaaatgccaatgatctctctcgtattccagggaacttttctcccactggttgtgcctcctaattctcaacaaataatcctttggtcaagttggttgggccttctttgttccctgaaggtaatgttttagaacttcaagtcttcaactagttaagattatacccttacattaactaaaatttctcgtacatccagatgtttcaatcattggctagagaacgccttgaacagctcaatgcttcaccatcagcgactccatcaaaatactttcgtgtatattctgcactattgctggttctatcggctgatgtactatggtaatattccctggttagtctgcattttactgttttttgtttagaaatattatttacacataattttttctttgcttaggtgttgggtacacttaaatttattttgattttgtagatgtcagagatgcatgatgtcacttactcacttccaacatgaaattattgtcccttacaatttcttgcaacttgcaacttctgttataaacttactctgtccggtcaaattatttgtcatttagagatgcacttgatagtgcagtggcaaggggtgtgtggtttcaaccctaagatcccttgttcaatccccaacactctcacaatttcttcttaaaaaaagtttggagggacatctctcactccaaatctcgtttatttggtcctgcaacggcttggctactctagctttccaacccaagatactgctaggtttgccaattggtggtcaagaacagtaaggggtttacctgataatgagaaggaagggctaaactctttagggcccctttgaattggaggaaaaacataggaattttggaggatttcaatcctataggaaaatctcctatgaagccctttgaaacaaaggattgaatcatatccaatcctttaaaattcctatggaatggacaatcctatagagattttggaggaaatttagcaagagcttcaacctcttggtaactttctttgagtctatctctctcatccaattcctgcgtttttcctgtggttcaatcaaacggtcattcctgtgtttttcctaagttttgcaatcctctgttttacacttacattcctatcagaatcctacgtttttcctattcctacgttttctcaatcctgcaatcctatcagaatcctacgttaatcatcttggttgcttgggaaatttggaagcacaggaacaattgtgtttttaatggtgccaccccatgcttggttgatgtcctccaagccatcgctaatgagggtgctctttggtgcctagcaggagctgctaggcttcgtgatctctttactagggctgtgctgctaatgcactagtttgttttacttcctttgggtgtgtggtgttctattgtacccttggtggcgggtgtcggagtctttctctaacaccgtccaccttttctcctttttcttaatgaaatgatatgcagatctcctgcgtgttctaaaaaaaatatttgtcatttaggacaagatttggtcaaacttttaaaattctgaccatcaataatttcttaaatgcttagtttaaaaaagaaaacaaatgatatacatagatttgcctcaaaaagtactttcataatatcatgaacttattagactttataaatttattcacataaaattgtattcggaattttaaaagtttgtccaaatctggtcctaaaacgacaaatatttttgaccagagggagtataatggaatgagttgtattgatgcttgagtttaccacatttccttttgttatggtgtccttgacacaactgtagcatgtaatacttttaaaagctcacacttaattgattgtctatcttctccaggataaagctttgtgttgggttctgcaagtcgtgtaattctcaactattttggcttatgttttttgagccacttagtattggctttgagacactgcaggtacttcaacccagattgtgggaagtttctcctccttatcttttcttaatttataacgatcttgcattatcaaagaaatctgcattgcatttaatgttcaaaggaggtggtgcttataaatgccaactagagatgttaaaaatattatgagcatttacctgcat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External Link(s)	NCBI Gene:Os07g0484300, RefSeq:Os07g0484300