Os07g0492100

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Structured Information

Gene Name	Os07g0492100
Description	UvrD/REP helicase family protein
Version	NM_001066218.1 GI:115472168 GeneID:4343276
Length	13420 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os07g0492100, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 7
Location	Chromosome 7:18998375..19011794
Sequence Coding Region	18998869..18998958,18999174..18999235,18999359..18999419,18999542..18999604,18999816..18999866 ,19000150..19000243,19000433..19000593,19000826..19000882,19000958..19001044 ,19001117..19001188,19001671..19001709,19001800..19002003,19002944..19003021 ,19003546..19003596,19004162..19004228,19004372..19004472,19004557..19004673 ,19005761..19005844,19005918..19006046,19006122..19006247,19006359..19006433 ,19006551..19006684,19006769..19006874,19006957..19007013,19008124..19008310 ,19008981..19009144,19009241..19009282,19009866..19010090,19010275..19010424 ,19010780..19010953,19011341..19011730
Expression	GEO Profiles:Os07g0492100
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008400:18998375..19011794 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008400:18998375..19011794 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atgtcgcgctggaaggagaacgcctcccctctccccctccaccccggcggctcctcctccctcctcccccgcaagcgccctcccccatccccgccccctccgcagcccccgtgcccgccgccgcgccgcccgctcgccgacgtcaccggcaacgccctgcggcagcggggatccggagggggaggatgcgggtacgggtacagcacccccgccccgaaggcgcccaggccctcctgcaggttccttctcgacgacgacgaaggcatggacgaggcgttcctgcgggaggtggacgccatttgcgaggagcacgagcggtcctcggccaggaaggataaggaggccggcgaagcgccgccatcgatcccctccgaaccggagagcggagtgtctggagatgcattccggaaggaggagaatgccattggtgaggagggtgatgctcagcctttagccacgagccaggaagaaatggaggatgcggatgaagaagaaatctgtgaactgtggtttggtgatgattcacttccaccggccatttcaattgccacagggggtggagagtttgaggatgcattctggaacatcagtgacattactgaggaggtgcaccatacaggctcttctgccaagtgccaggaggatatggacggaaaaaatagcgatggtccttcagttccctcagtaatttgccatgaagagcgggaaggagagcttgtcgatgcattcttggaggatcttgatgctatccatcagggtgatgctaccaagggccaggaggagccacaggaaacggaactagaaattgaggaaaatgaagggtgtgttccaaagaagtactacgaatatttgcagtccctgaatgacaggcagagggaagctgcatgtagtgatgtgactattccactaatgatagttgctggtccaggaagtggaaagacatcaacaatggttggtcgggtgctcacactgctcaaagaggaatttccaccatcaaacattcttgctatgacattcacaactgctgctgcttctgaaatgcgggatcgaattgggacagtggtggggaaggcagttgccaaggagattgtaataagcacatttcactcattctgcttgcagctttgcaggacccatgctgaaaagctaggccgcacatctgaattcataatctatggaaatgggcagcagaggagggctgttattgaggcagagcgtctattggaaagtgacaaaaataatggtctaggagatgcaaataagaattgcgatggagatattaaaaattctttcaaggacaaagctaagaaatggcagaagtttgttacacaggcaaaagcttctggtaggactcccgaggagtatgaaaagaagggggatttgacaggagcttcaattcttcggcactacaatgaaatattaaggtcttgtaatgctcttgattaccatgattttattaattcatcgataacccttctcacaaagtttcctgaagtatacgacgagtgccgaaatacatggcaggcaatagtagttgatgagtttcaggatacaagtgctatgcaatattatcttttaaagacactagcatcccacaaccgcataactattgttggtgacgaagatcagtccatcttcagtttcaatggtgctgatgtctctggctttgattcatttcgtagagattttccaaatcacaaagaggtcagattgagcaagaactatcgctctacacgggcaattgttgaagcagcaacagctttaattcacaacaacactaaacggcaaagccacaaacttgctgagaccgacaatccctctgggaataagatcattgttaaggagtgccacagtgaagattcacaatgtgcatttgttattgacaagattattgaaaccacatctagttcagttgaaggatgtcattttggcaaaattgctgtcctatatcgcagacagatcactggcaaagcattccaggcgtcattccgcaacagaaaaattccttttaatattcatggtgtggctttctacaggaaaaaggttatcaaagcaattatggccatacttaaaactacattaccaggctgtgatgatgatgccccatggcatcaagccttcaaggccattcttcctggtgacaaggaagaaaaaaagaagattatacatcatattgaaaagatttcattggctagaaagtgtagcttcatatcggctgctactgacatcttcagtgcaaaggtctctggtaccttcaaaagggcccagattactcaaggaagaaaggttttatcagccttggatagcctatcaaaacttgttgaaagggaacaatcagtttcagtggtcatttcttctgctggagatatgctacctcagaaatacctacttgaaaagcgtgcgattgttgatgctgatgggggtaaattattaaatgaagataatgacatcagatcagtccttcagtttttaatggatgatgtgtctgacttcttatcaacacatttttctagttcagtggatacaagcaagactgaggagaaaggctgtgcttctacacttaaagcctttattgattatatctctttgagagaaactgaaaacttcagatcacgaaaggaggaaaataaaaactctatcacattaacaactatccaccagtcaaaaggtttagagtgggatgttgtgtttatcgtgcaggcaaatgattcagaaattcctttgttgcatgagtacaatggcactgtgaaagaagctggaagcacactggaggaggagagaaggctattctatgttgcaatgacacgagctcgaaagaaactgtacatcttacatgtcacggttgactctaatcgccagctgctgcaaccttcacgcttcctcagggagattcctgctcaccttcttgaggtacagggtgagggaactgtgagaagaactcctgaacagccggtgaacattccatttgatcaacctgaaggagatacatcagttgaaaggcctatggtggtacggaatgaaacttcacctttcccagaaatggatcagccatgtcttgctaatgatttcttgaagaggtttgaaattgaggatagagcaataatttcacatatatttcatcaatgggcgaagaaacaggcatttcaaaatccaaaaaggctgcttgataagattggttttgttattgatgaacgtttacgaggtaaaggatacaagcgcaaggatgtattgtgcaagctgaaatcattcttaagtggtgatgaagcgtttggttatgcacaatatgttatcaagtgggaacagattcctatcgacaagcggagccatttgatgagagagagacaggaacatttccaaaagcagaggatagagaactccatgggttcctcagaacctacacctaagcagatatcgtacctccggaacctggggtgcaccatcacacccacgtctcgcctgcacgcgtcgcatcttatcgagaagtacaaatctctatga</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MSRWKENASPLPLHPGGSSSLLPRKRPPPSPPPPQPPCPPPRRP LADVTGNALRQRGSGGGGCGYGYSTPAPKAPRPSCRFLLDDDEGMDEAFLREVDAICE EHERSSARKDKEAGEAPPSIPSEPESGVSGDAFRKEENAIGEEGDAQPLATSQEEMED ADEEEICELWFGDDSLPPAISIATGGGEFEDAFWNISDITEEVHHTGSSAKCQEDMDG KNSDGPSVPSVICHEEREGELVDAFLEDLDAIHQGDATKGQEEPQETELEIEENEGCV PKKYYEYLQSLNDRQREAACSDVTIPLMIVAGPGSGKTSTMVGRVLTLLKEEFPPSNI LAMTFTTAAASEMRDRIGTVVGKAVAKEIVISTFHSFCLQLCRTHAEKLGRTSEFIIY GNGQQRRAVIEAERLLESDKNNGLGDANKNCDGDIKNSFKDKAKKWQKFVTQAKASGR TPEEYEKKGDLTGASILRHYNEILRSCNALDYHDFINSSITLLTKFPEVYDECRNTWQ AIVVDEFQDTSAMQYYLLKTLASHNRITIVGDEDQSIFSFNGADVSGFDSFRRDFPNH KEVRLSKNYRSTRAIVEAATALIHNNTKRQSHKLAETDNPSGNKIIVKECHSEDSQCA FVIDKIIETTSSSVEGCHFGKIAVLYRRQITGKAFQASFRNRKIPFNIHGVAFYRKKV IKAIMAILKTTLPGCDDDAPWHQAFKAILPGDKEEKKKIIHHIEKISLARKCSFISAA TDIFSAKVSGTFKRAQITQGRKVLSALDSLSKLVEREQSVSVVISSAGDMLPQKYLLE KRAIVDADGGKLLNEDNDIRSVLQFLMDDVSDFLSTHFSSSVDTSKTEEKGCASTLKA FIDYISLRETENFRSRKEENKNSITLTTIHQSKGLEWDVVFIVQANDSEIPLLHEYNG TVKEAGSTLEEERRLFYVAMTRARKKLYILHVTVDSNRQLLQPSRFLREIPAHLLEVQ GEGTVRRTPEQPVNIPFDQPEGDTSVERPMVVRNETSPFPEMDQPCLANDFLKRFEIE DRAIISHIFHQWAKKQAFQNPKRLLDKIGFVIDERLRGKGYKRKDVLCKLKSFLSGDE AFGYAQYVIKWEQIPIDKRSHLMRERQEHFQKQRIENSMGSSEPTPKQISYLRNLGCT ITPTSRLHASHLIEKYKSL</aaseq>
Gene 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External Link(s)	NCBI Gene:Os07g0492100, RefSeq:Os07g0492100