Os07g0524100
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Structured Information
| Gene Name |
Os07g0524100 |
|---|---|
| Description |
Thioredoxin domain 2 containing protein |
| Version |
NM_001066356.1 GI:115472444 GeneID:4343420 |
| Length |
6639 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os07g0524100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:21001164..21007802 |
| Sequence Coding Region |
21001398..21001438,21001771..21001861,21002474..21002568,21003203..21003260,21003803..21003987 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008400:21001164..21007802 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgatctcctccagtaagctcaagtccgtcgacttctacaggaaaattcctagggatttgaccgaggcatcactatctggggctggattgtccattgtagcagcactagctatggtgtttttgtttggaatggaactgagtaattacttagcagtcaatactagcacatctgtgattgttgataggagttcagatggggagttcttacggatagattttaacttaagctttcctgcactttcatgcgaatttgcatcagttgatgtcagtgatgttctgggaacaaacagattgaacataacgaaaactgttcgcaaatattcaattgatcggaatttagtgcctactggatccgagttccacccaggacctattcctacggtcagcaaacatggagatgatgttgaagaaaaccatgatgatggttcagttcccttgtcctctcgcaattttgatagctattcacaccagtatcctgttttggttgttaatttttatgccccctggtgttactggagcaatcgattgaaaccttcgtgggagaagactgcaaaaataatgagggagagatatgatcctgaaatggatggcagaatcattcttgccaaggttgactgcactgaagaaattgacttgtgtaggaggcaccatatacaaggttatccatccattcgcattttccgtaaagggagtgatcttaaggaaaaccagggtcaccatgatcatgaatcatactacggcgatcgtgatactgagagtttagtagcggcaatggaaacttatgttgcaaacatcccaaaagatgcccatgttctagctttggaggacaaatccaataagactgttgatcctgcaaaacgccctgctccattgaccagtggatgcagaatagaaggttttgtgcgggtaaaaaaggtccctgggagtgttgtaatctcagctcgatctggttcccactcctttgatccatcccagataaatgtttcccactatgtaacacagttctcttttggcaaaaggctatcggcaaagatgtttaatgaactgaaaagactaactccctatgttggtggccaccatgatagattagctggtcaatcctacattgttaagcatggtgatgtcaatgccaacgttactattgagcattacctgcaaattgtgaaaactgagcttgttacactgagatcatcaaaggaattgaaactggttgaggagtatgaatacacagcgcacagcagcttggtgcacagcttctatgttcctgttgtgaaattccattttgaaccttctcccatgcaggtcttggtaactgaacttccaaaatccttctcccatttcatcacaaatgtttgtgctatcattggaggagttttcacggttgctggaatactggattccatcttccacaacaccttgcggctggttaagaaggtcgagcttgggaagaacatttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MISSSKLKSVDFYRKIPRDLTEASLSGAGLSIVAALAMVFLFGM ELSNYLAVNTSTSVIVDRSSDGEFLRIDFNLSFPALSCEFASVDVSDVLGTNRLNITK TVRKYSIDRNLVPTGSEFHPGPIPTVSKHGDDVEENHDDGSVPLSSRNFDSYSHQYPV LVVNFYAPWCYWSNRLKPSWEKTAKIMRERYDPEMDGRIILAKVDCTEEIDLCRRHHI QGYPSIRIFRKGSDLKENQGHHDHESYYGDRDTESLVAAMETYVANIPKDAHVLALED KSNKTVDPAKRPAPLTSGCRIEGFVRVKKVPGSVVISARSGSHSFDPSQINVSHYVTQ FSFGKRLSAKMFNELKRLTPYVGGHHDRLAGQSYIVKHGDVNANVTIEHYLQIVKTEL VTLRSSKELKLVEEYEYTAHSSLVHSFYVPVVKFHFEPSPMQVLVTELPKSFSHFITN VCAIIGGVFTVAGILDSIFHNTLRLVKKVELGKNI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>235..275#608..698#1311..1405#2040..2097#2640..2824#3164..3221#3386..3426#3509..3583#4872..4928#5054..5120#5328..5474#5560..5784#5906..6067#6144..6221#6309..6386#attgcagttgcagttacaaccggcaaatctctcgcgaccctgcaccgtagcagcgtcgacgcgaggcggacagcctcttcttcctcctccctttccaccccccacagagatctcgcctctctcctcctccctttccctctccttccttccagatctctccacgcgccgccccgatctcttccccccacccccacctcgtcaccggcggggaggagggcccggccgccggcagccatgatctcctccagtaagctcaagtccgtcgacttctacaggtcccctccactcccgatctctctctctctctccctccattgcttgctatggtactccctgtgcgcgcgcgcgcgggggggatttcgacgcggtcctcggctgggggtgctggtccgggttcggattgggtgaattctcttgcctggctgttctggcgattgcagtagatggtttgtgatggttcgttgatgcaccgagaaaatcggggttgcgtgggcgtatgtggtggtattgaccattcgtgcggtcgttgcgagtagtgtaatgtctggtgtattttctactgagatgggtaatttggttgatgcgctttttcttttcgtgcttgcaggaaaattcctagggatttgaccgaggcatcactatctggggctggattgtccattgtagcagcactagctatggtgtttttgtttggaatggtcagttttcgttggattagcgattgcactgttatttttagatttcattttttcactctggttccagtctttagggaaacaaacaaaaaatggttggactgttcttctgttccatttggtgattgtagactgaaatttggtacagagccatactaaaatgatagagcatttatttatttatatgcagattagttgtcttctaccattccaactgctgtagtgtagctaatcgctatcgccggatcaatgtagagtctcgatttgcttgtttcatttgatgattgagaatagctcgtttttcctgatatctgtttcaattgactattagagcttcatgataggctagattcttaactgaacctattttggttgaatatttttgaccgaattatcaattggtccatccaaccttgaaagtggcagttaagtaatgtatatgcccaagtatattgtaattactccggaacatatgcataattttggctgttgcttgttaaggcttgcaatgtgctatacttttcactatgctgagctgattccttaatcaagctttagactagtttaaaggttcatttcaactgaaaagctaaatctgttcaattgttattgcaggaactgagtaattacttagcagtcaatactagcacatctgtgattgttgataggagttcagatggggagttcttacggatagattttaacttaaggtaaattctatggcacatgctgcacatctcaacaagtaataaggttagaatacaaaatgagaaccttcatgatcacatagataatactgctatcattatggttcatagaactaatgtcttcctaattctctaatctgctgatagtaattttatccctattgtgattaattttaatggaatactatatatgcaacagcaaagcacagcgttaattaatgtcaggcactcagtacattcttttcaatgtatttgtactcatttggtgcattgtggaaaaaaacatatgattctcagttaattcatttatcttcaaaggtcacctaattaccagatccaaccatttgtagtaatatgtttgtagaataattctgatgttgttcttttactcaacactttcaacccttggtctatatgaacctgagagccattgtttatacttgaaattgatgctttccagcaaacaaggactagtcaggcactgctcatttatttgtatgtgataatgcataggagggtatctacattagtctagctggttgcccattgttttctatggaatgacatcagcaaagctggactcaacttttccttgtttttccagtagatgctcacgatctggttctgtgatttacagctttcctgcactttcatgcgaatttgcatcagttgatgtcagtgatgttctgggaacagtaagattctaacttgacctcatgtactctgtttttgttcatctgccgtctagaatgaggatatcattgaaggacatgaagctcatcttgcgcgttccataaaaactattgttgactttattttcttgttaacttgccattacaaataactttccactagcttttaaaagtactccctccgtttcacaatgtaagtcattctatcatttcccatattcatattgatgttaatgaatctagacatatatatctatctagattcattaacaacaatatgaatgtggaaaatgctagaatgacttacattgtgaaacggaggaagtaagctctacatgtatattttacaccaatgttaaaaatacgaaatatgacaatttatcagtttttgtaaagttctgtgcatgtcaaaagaatgaaacctatcctaaattcctaactaactttctatctataagcatttcttgatcatatcttgccttttgtagctcgagtttttctccatgctggtttaaccttaaagtttctgttcaaaacacatgcagaacagattgaacataacgaaaactgttcgcaaatattcaattgatcggaatttagtgcctactggatccgagttccacccaggacctattcctacggtcagcaaacatggagatgatgttgaagaaaaccatgatgatggttcagttcccttgtcctctcgcaattttgatagctattcacaccagtaagtattcaaatatgtatttcaatatccacctatccgtaacacataacatatagcattttagcaattgtgcgtttcaataccatatcaacggtcaacctattattcatgtatgctgtcttctttctccttcacattcatggagaaatgtactttatattcatagctccaatcacttcaaccagattgtctatggcaaattggtgataatcttcacttttacctgcctcaagtatttttccttgaagtgccgttcggtatatctagttaatccctcttgtattgtttcggagcccaaatattgtttccactgattattatcatgcacttccttttcaggtatcctgttttggttgttaatttttatgccccctggtgttactggagcaatcgattggttagaattcatcttgttcctttgcatttagtgattttctagtatatgctactctatctgtaaggaaatgattagtaaattattgctggtaaagtaatgtaagtatggcacggcttattgaactaacaaatggagacatttctaattacttgatcttcctccagaaaccttcgtgggagaagactgcaaaaataatgagggagaggtacatactgtttctctttgtttgtgttttgtggttttaatgtgctgtttaatctataccatgttgttttttttttctgcagatatgatcctgaaatggatggcagaatcattcttgccaaggttgactgcactgaagaaattgacttgtgtaggaggttcgtctgtacttaattattattcatatccaaaacaaggacaaagcatatttaggctgcaacatgaactttacaaatccctttttgatccatgtaccaagagaaatttagttaattagtttttagagtaaagtccatcaccggtccctaaacttgtaccgctgtgtcatcccggtccctaaactcgcaaatcgatcattcaggtccttaaacttgttcgactgtatcatcccggtccctaaacttgcagatcactcgtttaggtcctccaacttgttcagttgtgtcaccccggtccctaaacaggacggtctaaaaactttataccaaaaaataattcataactttttcatgtgaactctaataaagacaaactttatatcaaaattgtagccctcgacgcgacctacaactttgtagttgaaaattttttgaattaaaactgtttagggtcccaaaatattgttgcatgtttatagattttgtaattttaattttaaaattacattttgggacaaaaaatgacttaaaataaaaaaattatcaactacaaagttgtagatcgcgtcgagggctacaagtttgatataaagtttgttttcattagagttcacatgaaaaagttatgaattatttttaaatataaagtctttagaccgtcctatttgacccagatgatattcaaatccaagtttagggactggggtgacacaactgaacaaattggaggacctatacgagtgatctacaagtttagggaccgggatgacacagtcgaacaagtttgaggacctgaacggtcgatttgcgagtttagggaccgggatgacacaacgatacaagtttagggaccggtgatggactttactctagtttttaatatccccaacaaagtgtcattattatgccacatctttcatgagctattcgtgtttgtgtcctcttatcctggttcagtggatgcttatgccttctggacttgtttgcatttggaatgattcaaaagcctttattccatagatcacaaccctaattgttactgaccatgtttttataagaaaatgagccattctgcttctgatgacactggtttctgtgtaatagtgccattgccattgatgcacatagtaacatttcaagctatgcgcattggatgtgaaccacaactcctcaatagaagccttaaattgttctcccactagttttacctaattatatgtgctcttgttatgcttgttcgtcattaaattaaggactacagttcattgttttaatttattaaatgcaggcaccatatacaaggttatccatccattcgcattttccgtaaagggagtgatcttaagtaagttcaagtaaatcttacagtcttccggatactctactgagagttaacctgtggcgcaagacttgtattattattatttttttgctcatgttccagaaacaaacaaattgacatttgtgcagggaaaaccagggtcaccatgatcatgaatcatactacggcgatcgtgatactgagagtttagtagcggtatgtatattctgttacccacttatttttcttgatgtactgcatgatatattcttcaccctaagctttagcttacctgtaaaaggtattgtccccattttcctagggagaacaaaaggctaactatcctttgcttgtaaatcactgactttgttcatggtcttgtcaaattgtggataaaattcctgacatttttttgggcctcaggcaatggaaacttatgttgcaaacatcccaaaagatgcccatgttctagctttggaggacaaatccaataagactgttgatcctgcaaaacgccctgctccattgaccagtggatgcagaatagaaggttttgtgcgggtaaaaaaggtaaatgaacttctgaggtgtaatagttgtagtgttgatgatgatctctatctgtggtatttgatttctggttcctctttatcaggtccctgggagtgttgtaatctcagctcgatctggttcccactcctttgatccatcccagataaatgtttcccactatgtaacacagttctcttttggcaaaaggctatcggcaaagatgtttaatgaactgaaaagactaactccctatgttggtggccaccatgatagattagctggtcaatcctacattgttaagcatggtgatgtcaatgccaacgttactgtaagtccctaaattttgctttgtttttgttatcaagatgattacagcaggcatgccttccagcactaaattttctggtttcttatggagtaacatagtttttgttttttgtcattcttagattgagcattacctgcaaattgtgaaaactgagcttgttacactgagatcatcaaaggaattgaaactggttgaggagtatgaatacacagcgcacagcagcttggtgcacagcttctatgttcctgttgtgaaattccattttgaaccttctcccatgcaggttggcatctcaccttttcttcgtttggttcataactgaaagaaaaactaattcttattttatcatcacttccaaggtcttggtaactgaacttccaaaatccttctcccatttcatcacaaatgtttgtgctatcattggaggagttttcacggtgagagcacacaccctttttttatcttttccttttctctgaatccatcaagtgtacatggctaatgaaatgacatgcgaattctaggttgctggaatactggattccatcttccacaacaccttgcggctggttaagaaggtcgagcttgggaagaacatttgaacaacaagattattcttcagaagcagcctcaagcttagtggttgcactagttttagtcattattttgttataccagggtaggaattcttaatatatcaagatgtgaaagagggtagtgggttggcagaggaggagaagttggggtcatgatatatagtaatagtaggtagggacctcactgttttgctaaacgacttcgtaagaacaataagacagtggatccttgttaactataccctacgttaattcgtcc</dnaseqindica> |
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