Os07g0530100

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os07g0530100

Description

Tyrosyl-DNA phosphodiesterase family protein

Version

NM_001066379.1 GI:115472490 GeneID:4343446

Length

9951 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os07g0530100, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 7

Location

Chromosome 7:21399664..21409614

Sequence Coding Region

21399928..21400001,21400086..21400227,21400314..21400391,21400527..21400617,21400709..21400762
,21402828..21402931,21403228..21403377,21403871..21404005,21404746..21404835
,21405533..21405790,21405868..21405944,21406863..21406923,21407424..21407642
,21408673..21408945,21409051..21409242,21409500..21409517

Expression

GEO Profiles:Os07g0530100

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

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Protein Sequence

<aaseq>MTSSSRVRVGNLVPLNEGNASSSNGSVSSIPIYLGANVVGRNHL VVVDKRVSRKHLSLHASADGSIEAVVEGPNPIIVRSEGQRRKVCAQERVKIAHDDVLE LIPGEYFVKYLNVGDNHKSSTSMGSSDFKKGKRLCEDDTVVIKRNRQIMEDEALARSL QKSFAEESSTISGLGCDQMLSSLDSAGFSERNNERIHSVDYLKDVLSLTFRLMRVQGL PSWTNTSSVTIQDVIQGEVLLAVLSNYMVDMEWLLTACPSLRKVRHVLVIHGEDGASV ELLKKVKPANWILHKPPLPISFGTHHSKAMLLVYPQGIRVVVHTANLIHVDWNNKTQG LWMQDFPWKDAKDVNRSVSFENDLVDYLSAIKWPEFRVNLPVVGDVNINAAFFRKFDY KSSSVRLIGSVPGYHVGPNIKKWGHMKLRSVLEGCTFEQQFCKAPMIYQFSSLGSLDE KWMSEFAFSLSAGKSDNGSPLGIGKPLIVWPTVEDVRTSIEGYAAGSCIPSPQKNVEK DFLRKYWARWKADHVGRCRAMPHIKTFTRYNGQDIAWFLLTSANLSKAAWGALQKNNT QLMIRSYELGVLFLPKTHQSVPQFSCTGKNNSNLNNLAPGKEIKTKLVTLCWKSDEEK EQSTEIIRLPVPYQLPPKPYGTEDVPWSWDKRYTKKDVYGSVWPRHG</aaseq>

Gene Sequence

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cctgggagagattagatatttctattactaatttgtacgagcacaggatattttctttcttgttggtacgaatcgtgtgccttgtctgcttccgatcgtgatgtttatgcctccatcctcttttacagagtagt</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os07g0530100, RefSeq:Os07g0530100