Os05g0408200
| Gene Name |
Os05g0408200 |
|---|---|
| Description |
SBP domain containing protein |
| Version |
NM_001062057.1 GI:115463844 GeneID:4338766 |
| Length |
9167 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0408200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:19929980..19939146 |
| Sequence Coding Region |
19930214..19930863,19932361..19932533,19932967..19933220,19933323..19933397,19933489..19933596 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggacgcccccggcggcggcggcggcggcggcggcggcggaggtggggtggatgccggcgagcccgtctgggactgggggaacctcctcgacttcgccgtccatgacgacgactcgctggtcctcccgtggggggacgattcgattgggatcgaggccgatcccgccgaggcggcgctgctcccccctgccccgtcgccgcagccggcggaggcggaggcggaggccgcggggccggcgtcgctgccgtcgtctatgcaggcggagggaagcaagcggcgcgtgaggaagcgcgacccgcggctggtttgcccgaactacctcgccgggagggtgccgtgcgcgtgccccgagattgacgagatggcggccgccttggaggtcgaggacgtggccacagagttgctggcaggggcgcggaagaagccgaagggtgccggccgtggtagtggtgcggcagtcggcggaagtggtggaggggctagccgtgggacaccggccgagatgaagtgccaggtgcctggttgtgaggcggacatacgtgagctgaagggataccaccgccggcacagggtgtgtttgcgctgcgcgcacgccgccgctgtcatgcttgatggtgtccagaagcgctattgccagcagtgtggcaagtttcatatattactagatttcgatgaagataaaaggagttgtagaaggaaattggagcggcacaacaaaagaagacgaagaaaacctgattccaaaggcatattggagaaagatatagatgaccagttggatttttcagcagatggtagtggtgatggtgaactaagagaagagaacatagatgtcactaccagtgagacgcttgagactgttctgagcaataaggttttggacagggaaacacctgtgggttccgatgatgtgcttagttctccaacatgtgcacaacccagtttgcaaatcgaccaaagtaaaagcttagtgactttcgctgcttctgttgaagcctgccttggcactaaacaggaaaacaccaaacttaccaattctcctgtgcatgacacaaagagtacttactcatcctcgtgtcccacaggacgtgtatcattcaagttgtacgattggaatcctgctgaatttcctcgacgcttacgccaccaaatatttgagtggctttctagcatgcctgttgaactggagggctatattcgtcctggttgtacaattttaactgtatttgttgcaatgccacaacatatgtgggacaagttatccgaagacacaggaaatcttgtcaaaagcttggtaaatgctccaaatagtctcctgttgggtaaaggggccttctttatccatgtcaataatatgatatttcaagtattgaaagatggtgcaacattgaccagtaccagattagaggtacagtccccgaggattcactatgttcatccatcatggtttgaagcaggaaagcccatcgatcttattctttgtggaagttctcttgatcagcctaaattcaggtcacttgtgtcatttgatggactgtacttgaagcatgattgtcgccgtatactgtcacatgagacctttgattgtattggaagtggggaacatatacttgattctcaacatgaaatattccggataaatattaccacatcaaagctggatactcatggacccgcatttgtggaagtggaaaacatgtttgggctatcaaattttgttcctatccttgttggtagcaagcatttatgttctgaactagagcagatacatgatgctctgtgtggttcttcggacataagttctgatccttgtgagcttcgaggacttcgacagactgcaatgttgggattcctcatcgacattggatggctaataaggaagccatccatagatgaatttcaaaacctactgagtttagcaaatatccagagatggatatgcatgatgaaattcctgatacagaacgattttatcaatgttctggaaataatagtgaactcgttggacaacatcatagggtcagagcttctttctaacttggaaaagggtagactggaaaatcatgtaacagaatttcttgggtatgtaagcgaagctcgaaacattgttgataatagacctaaatatgacaagcagagacaggttgatacaagatgggcaggtgattatgctccaaaccagccaaagttgggcatttctgtgccacttgctgaaagtactggaaccagtggagaacatgatttgcactcaaccaatgcagcttctggagaggaggaaaatatgcctctagtgactaaagctctcccacacaggcaatgctgtcaccctgagactagtgctagatggcttaacgctgcctccattggtgcttttccaggtggtgccatgagaatgcgtcttgccaccactgtggtaattggtgctgtggtatgttttgcagcttgtgttgtccttttccacccacacagagtaggggtgcttgccgcgccagtaaagaggtacttgtctaggaactactcatcatag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDAPGGGGGGGGGGGGVDAGEPVWDWGNLLDFAVHDDDSLVLPW GDDSIGIEADPAEAALLPPAPSPQPAEAEAEAAGPASLPSSMQAEGSKRRVRKRDPRL VCPNYLAGRVPCACPEIDEMAAALEVEDVATELLAGARKKPKGAGRGSGAAVGGSGGG ASRGTPAEMKCQVPGCEADIRELKGYHRRHRVCLRCAHAAAVMLDGVQKRYCQQCGKF HILLDFDEDKRSCRRKLERHNKRRRRKPDSKGILEKDIDDQLDFSADGSGDGELREEN IDVTTSETLETVLSNKVLDRETPVGSDDVLSSPTCAQPSLQIDQSKSLVTFAASVEAC LGTKQENTKLTNSPVHDTKSTYSSSCPTGRVSFKLYDWNPAEFPRRLRHQIFEWLSSM PVELEGYIRPGCTILTVFVAMPQHMWDKLSEDTGNLVKSLVNAPNSLLLGKGAFFIHV NNMIFQVLKDGATLTSTRLEVQSPRIHYVHPSWFEAGKPIDLILCGSSLDQPKFRSLV SFDGLYLKHDCRRILSHETFDCIGSGEHILDSQHEIFRINITTSKLDTHGPAFVEVEN MFGLSNFVPILVGSKHLCSELEQIHDALCGSSDISSDPCELRGLRQTAMLGFLIDIGW LIRKPSIDEFQNLLSLANIQRWICMMKFLIQNDFINVLEIIVNSLDNIIGSELLSNLE KGRLENHVTEFLGYVSEARNIVDNRPKYDKQRQVDTRWAGDYAPNQPKLGISVPLAES TGTSGEHDLHSTNAASGEEENMPLVTKALPHRQCCHPETSARWLNAASIGAFPGGAMR MRLATTVVIGAVVCFAACVVLFHPHRVGVLAAPVKRYLSRNYSS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>235..884#2382..2554#2988..3241#3344..3418#3510..3617#3993..4110#4426..4561#6702..6876#7412..7939#8703..9014#gtcctagtcatcggacgccgcccacctacccgactacccgaggcagcctctctctcctccctcgcccaccaccacacgacacgagacgagaagactgattcattcgctcgcgtacacgcctaggcgctccgagaattcgtgagggaatcccgcatcgccggagccgatcggcggcgccgcgggcgggtggggggggggggttagggttagggttttgggggtggcccaccggggatggacgcccccggcggcggcggcggcggcggcggcggcggaggtggggtggatgccggcgagcccgtctgggactgggggaacctcctcgacttcgccgtccatgacgacgactcgctggtcctcccgtggggggacgattcgattgggatcgaggccgatcccgccgaggcggcgctgctcccccctgccccgtcgccgcagccggcggaggcggaggcggaggccgcggggccggcgtcgctgccgtcgtctatgcaggcggagggaagcaagcggcgcgtgaggaagcgcgacccgcggctggtttgcccgaactacctcgccgggagggtgccgtgcgcgtgccccgagattgacgagatggcggccgccttggaggtcgaggacgtggccacagagttgctggcaggggcgcggaagaagccgaagggtgccggccgtggtagtggtgcggcagtcggcggaagtggtggaggggctagccgtgggacaccggccgagatgaagtgccaggtgcctggttgtgaggcggacatacgtgagctgaagggataccaccgccggcacagggtgtgtttgcgctgcgcgcacgccgccgctgtcatgcttgatggtgtccagaagcgctattgccagcagtgtggcaagtaaggctccatttcctcattccaggctgctttatgaacttgtggaagatccattgggatcagtagcagtaggagggataattaagtgctttaacacttatacaatcattgttgctatatgatttggtgtttaatgcattataccttttctagaatatagtggctgttggatatgatatttggtcatttcatagaaaaaaaaacatttacacactcgagagtctaagtggagtgtttgctcaaattatgcatgacgattcatttaattaatttattctgagaatggttctttaggattggactgttctcaacatgtctttgtagcaatggtatctgatcgtccgattaaccgcgatcaatcatcctgaccggtcctctgacttctgatcagggacattaactcaatcagctcaatcagaatctgatgataaatcagcgattcatcatccgattatgctaggtaacaattaatttcagtaggagttttgggctgcatgcgaagttgggcctcagcagtattgtgccggcccattcccatagggtttaccggtttagtcccctagaagctgtcacaaataaaaactaacaagtaagcaaccatctaaccatcaaatatttcctttatgattgcttatactatgcactatatatacattatcgattagcctcgattaattggcctgattgacctgatcggtgccttggcgatcagggtcgatcagacgatcagataacattgctttgtagttttaactatattgaaatctaccaactttacattttcttagaatttttcgtttcctctgctaggctatattatgtggtgtacataatttgctgtatgactgtattaatatagttttgttcaattgagaagatgggttttctattttgtactttttcttgaggtaccaattacgggttgcttaactggtttttttctggggggtggggggtcaaaatattcaggtggagccttatgattggttggagctaacatataaatttacactagttccatttccatgcagaatcagtttgttactgatggatggtcgctaaactttctaaaaattgcatgccaagctcatttgcaataaagctaagtcttttatttccaaatcaaattcatatttaaagtttgattaatctcataaactaaggaacatcctgctttaatgcataaattttcttgtatgtttttgacatgacgtaaggtcactgatcaaacaaactgcaagcatggaagtacctctgtccttgtgcatctgtccacaacctgttggccacttgatatatttttgaaacattactttagcaattgttcaaaattctttgcctagctcgaggtactaacctaaacctctttgctgttgactatggttgtggcgatctaacagctgtcctgggctcctggctgtatatattgtttttctactagcagtttaatttttgtgtgctaacactattctctctcttaatatatttctgctgcaggtttcatatattactagatttcgatgaagataaaaggagttgtagaaggaaattggagcggcacaacaaaagaagacgaagaaaacctgattccaaaggcatattggagaaagatatagatgaccagttggatttttcagcagatggtagtggtgatggtgaactaagagaaggtagatatttcaaagaaaaccgcctttattttttaatatgtttgctctgttataagtttttctatttgaagttgaacacaaaaggttttagtgatgtatttagaccaactatgagtggtaaatttgacttggctgtttccagagcattttacgaaagaggtgctctggatattttttttgcctagcaaatatggcattcattgttttgatataacttcattggcaaggtttcatggaatatttgggatcatgagttctctgtttgtgatacctactcaaccgagcaaacccttgatctgatccagatacataattgactcttaacaagatgagcctgtttacttctgttgtctatgcattttctccagacatgctggaagttctctgctgtctagtctggaacatatttgttaaccaatcatttctttaacagagaacatagatgtcactaccagtgagacgcttgagactgttctgagcaataaggttttggacagggaaacacctgtgggttccgatgatgtgcttagttctccaacatgtgcacaacccagtttgcaaatcgaccaaagtaaaagcttagtgactttcgctgcttctgttgaagcctgccttggcactaaacaggaaaacaccaaacttaccaattctcctgtgcatgacacaaagagtacttactcatcctcggtaagcgcttctccttgtgtacatattattctgtaatatataattattttctgttcttgctctctctaaaggttattagtaatgttgtatcatccattgtagtgtcccacaggacgtgtatcattcaagttgtacgattggaatcctgctgaatttcctcgacgcttacgccaccaagtatataaccaggctctaagtttctcaatagcacgctgttttcatgcccaaaagattgttctgaactcaatgccatacgtaaaatatgcagatatttgagtggctttctagcatgcctgttgaactggagggctatattcgtcctggttgtacaattttaactgtatttgttgcaatgccacaacatatgtgggacaaggtatggatgcttgtactaaaatgccaaatcattacttagtccaaaggaggacatttttttggatgcatccaaatgaagacctaccaaatattggtctttcaattccatgtccatgttttacagttcaaacaattttgagctgctaatttttataccacatccagttcaaaatatatatctctatggtatgcaaatgtatttttaccacttatgaacaattacatagttgtggagtgtaatgagtgcccacttgtggcatgtaaagtgtaattagaatttcccacaaagtgaactgaatggacttgttgtatggaagtcaataatactattttttttcttttacaagatagcatttatatctgcatttctttacagttatccgaagacacaggaaatcttgtcaaaagcttggtaaatgctccaaatagtctcctgttgggtaaaggggccttctttatccatgtcaataatatgatatttcaagtattgaaaggtgtgtaccacatgtcctgtttttccatgacgtgataacaacataaccttcttgtttatacatcatatatttgtacttaagctgcattgttcctgcataagagacactatacagtagattgataccaatcatagcctcactactacaattactatctgcagtttcagtatcacttgcaaaatcaatattagttgcatacgctaaattcgatgcataattttgaacttgtatcatttaattgctagcttattatatcttttgtttttatgagataattaccttacctgattgagaatattaactgctgtacttcagatggtgcaacattgaccagtaccagattagaggtacagtccccgaggattcactatgttcatccatcatggtttgaagcaggaaagcccatcgatcttattctttgtggaagttctcttgatcagcctaaattcaggtatgacagttccttgtaccttctacctgtttctgctggttattcttctgtcaggatacattatgttcagtttagctatggtgatatattcatatcattacctgagagatactatatctcaacgcagatcctgtaggaataagtcttggtcttggtcttgtggtgctttttcttgctttttagctctaggacagcatctctactttcagtttggatgctctaggacagctaggacagcagtttgttgagatgctctaggacagtttgttgggatgctctaggacagcacccacttgccctagcatggctgctacaag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