Os07g0655300
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Structured Information
| Gene Name |
Os07g0655300 |
|---|---|
| Description |
TRAF-like domain containing protein |
| Version |
NM_001067030.1 GI:115473792 GeneID:4344139 |
| Length |
4910 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os07g0655300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:28205434..28210343 |
| Sequence Coding Region |
28205700..28206202,28207819..28208167,28208712..28208988,28209973..28210148 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008400:28205434..28210343 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgggcgctggccgggcttgccgcggcggcccctcctcctcctcccccgccgctgccgccgctgcggtggggcggccgttccctccgatcgccgcttcgtgccccttctcgtcgtcttcggcggcggctgcggcccccgcggcgccttccgagacggcgtcgacgtcggtgaccaagaccgtgaacgggtcgcaccacttcaagatcgccgggtacccgctggccaaggggatcggggtcgggaaatacatcgcctccgagtgcttcaccgtcggcggctacgactgggcgatctacttctaccccgacgggaagagccccgaggatggcgccgcctacgtctcgctcttcatagcgctcgccagcgagggcaccgacgtccgcgcgctcttcgagctcacgctcgtcgaccagagcggcaaggggcaggacaaggtgcacacccactttgggaggtcgctcgagggcgggccatataccctcaagtaccgggggagcatgtggggttacaagcgtttcttcaaacggtctgccttggaaacatcagattatcttaaagatgattgccttttggtgaattgtactgttggtgttgtccaatcacatactgaagggccaaagatatatacaataccagtgccaccatccaatatgtctcagcatattggccagctactgacggatggaaagagaactgatattacatttgaagttgatggagaggtgttccctgctcacaaggttgttcttgcagcccggtcaccagttttcagggcacagcttttcggtccaatgaaggataaaaacatgaagcgtataacgattgaggatatggaggcttcagtttttaaggccttactccattttatgtactgggatgagttgcctgatatcgaagagcttactggcctaaatacaacttgggtatccactttgatggctcagcatttacttgcagctgcggatcgttatgcattggagagactaaagttgctctgtgagctcaagctttgtgaagatgttgcaataaacacagttgcaaacactttggcactggctgaacagcaccactgttatcagctaaaaactgtttgcctgagatttgtggctttgcctgagaatttaaaagctgtcatgcaaaccgatgggtttgattatttgcagcaaagctgcccatccttgctgaccgagcttctggagtatgtggccaaggtaggggagcattcggtgagcccctgcttgtattcgaacgaagtccttgatggtggcgatgccaatggaagacgtgtgaaaccgcggatttaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGAGRACRGGPSSSSPAAAAAAVGRPFPPIAASCPFSSSSAAAA APAAPSETASTSVTKTVNGSHHFKIAGYPLAKGIGVGKYIASECFTVGGYDWAIYFYP DGKSPEDGAAYVSLFIALASEGTDVRALFELTLVDQSGKGQDKVHTHFGRSLEGGPYT LKYRGSMWGYKRFFKRSALETSDYLKDDCLLVNCTVGVVQSHTEGPKIYTIPVPPSNM SQHIGQLLTDGKRTDITFEVDGEVFPAHKVVLAARSPVFRAQLFGPMKDKNMKRITIE DMEASVFKALLHFMYWDELPDIEELTGLNTTWVSTLMAQHLLAAADRYALERLKLLCE LKLCEDVAINTVANTLALAEQHHCYQLKTVCLRFVALPENLKAVMQTDGFDYLQQSCP SLLTELLEYVAKVGEHSVSPCLYSNEVLDGGDANGRRVKPRI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>267..769#2386..2734#3279..3555#4540..4715#accaaaaagccaaaaccaaactccatcacctcctcctccgtctccttcccccaccatttctcccccaaatccgtctcctcctcctcccccacccaaatctcccacctccgccgtcgcggaatccgccgcgacgacctcccctcgatccgcccgatccgaccccggatcggatcccaccgtcgccgcccgcgcgcgtggtggttgggtgtgcggggtgtgcaaaccctaggtctccgatccggatcccccccccacccaccccgccgatgggcgctggccgggcttgccgcggcggcccctcctcctcctcccccgccgctgccgccgctgcggtggggcggccgttccctccgatcgccgcttcgtgccccttctcgtcgtcttcggcggcggctgcggcccccgcggcgccttccgagacggcgtcgacgtcggtgaccaagaccgtgaacgggtcgcaccacttcaagatcgccgggtacccgctggccaaggggatcggggtcgggaaatacatcgcctccgagtgcttcaccgtcggcggctacgactgggcgatctacttctaccccgacgggaagagccccgaggatggcgccgcctacgtctcgctcttcatagcgctcgccagcgagggcaccgacgtccgcgcgctcttcgagctcacgctcgtcgaccagagcggcaaggggcaggacaaggtgcacacccactttgggaggtcgctcgagggcgggccatataccctcaagtaccgggggagcatgtggtgagtagtcagtcccctttggctatgcgccctgacattttgatcaggttgcatgcgtagattgtgctgctatgcgaactagaatatgattgattgctatgtgaatcggctattttacatcttactcatgagtatctaggtttgctcgttgaagtcatgcgccttgtgaaatttgagttactttggtgtaggctgtagtatattacttcctccgtttcatattataagactttctagcattgcccacattcatatatatgttaatgaatatagacatatatgtgtgtctagattcattagcatctataggaatgtgggcaatgctagaaagtcttataacctgaaatggaggtagtaggtttttaagttgattcatgttaaggagttctactaacatggcaatttcttagtagcggattatttttagtttgtattattagcacaatttgtcatctttttagttatgtagacgaactgcttgaactatgatgtaattatgtaatgttactatttttttatggatcaaatggccacattatttgattgtagtgggttctgttcttgcacctttcgtggcaggacatcgctgggcatgtttctccttgttctggaactggagttgtcatgctgtgtgtatattatagctcatgttgatttgagtgctgttacatgtgggctcgttgctgtaggtttgagtgttttggattgatgttctcttactctgtattggaacatcatttgggttttcagtttgtaaacaaatagggtaggatgtggtggtacaaagttatgttgttggtacactgtcagtctccaaactcgttctagttgtttggttcaaaattcttgatggctgtggagtggttagaagcagcttagaattgatgtctcctaatgttttgaatggaagtgtttcagcatggaaatttgatttaatcgctcccctttccactttcatgttgattgatcacacttgtgagattctgggtatgtttatattgtttgttttctttgatgatttatctgatggtcttagaaagttagagtaagtactgtttgcatattattgttactttatgaataattgaaatgacttctctaaatctctatagaggtgtctctgctattatcttcatcatcagcaccattggtacctggaattgcttatgttgcaggatgcaataatcaaatggttgtgtttaagctagggattttttattttatgtgcttacgtttggcattaggggatgttattgtgtttctgcatgccatctaattataccaattagaggaattcctttcatgacttgtatttgacatttggggatgtagtgtgggcatgggttgacgtgggtaatccttcacccactctagttcaactaaatgaactaaatttcacttccctgtttaattgtacttcactcatgcaaacaaatactcctatcttccaatttcatgtatgctctgatttgtttgtgttttccctgtgctttcttcttactgttttactgcttttccttgtttagttcttggatatgaccacatgcatcttgcctgtatagtgtatattgttcagtagtgtttggaaatgacttaaagttctgtgcttcgtgcaggggttacaagcgtttcttcaaacggtctgccttggaaacatcagattatcttaaagatgattgccttttggtgaattgtactgttggtgttgtccaatcacatactgaagggccaaagatatatacaataccagtgccaccatccaatatgtctcagcatattggccagctactgacggatggaaagagaactgatattacatttgaagttgatggagaggtgttccctgctcacaaggttgttcttgcagcccggtcaccagttttcagggcacagcttttcggtccaatgaaggataaaaacatgaagcgtataacgattgaggatatggaggcttcagtttttaaggtttcactagctcacagtttattttgtttaatttattttccatattgtttattccacttgatttagttagtgccactgccatgtctttcagcttttctctgtgctatgatatttattaagtgataattaaaattgtagtcaggaataattcaaatataaattgttggaaaaatatttgaagttcgttttttattctgaacttaccaaagttactgcttatctctattatagtacctaacaaagcaaacaacaaggaacagaatgctgttcatatgctgttttattgtcactagtatagctactgttgtatgcgttttcaccatatttttgtgtactaatgcaatatagcattggcaagtgacaactgctttccgttctgattgttgctgctattgtatgcgttttcaaccataattttgtgcactgtgttggcaagtgacaactgcatatactgttgtagtggagttcatgttacttgatttgtgcttactagctttaaaatatttcatactcctgagattttgatgcacctcatttttcgcaggccttactccattttatgtactgggatgagttgcctgatatcgaagagcttactggcctaaatacaacttgggtatccactttgatggctcagcatttacttgcagctgcggatcgttatgcattggagagactaaagttgctctgtgagctcaagctttgtgaagatgttgcaataaacacagttgcaaacactttggcactggctgaacagcaccactgttatcagctaaaaactgtttgcctgagatttgtggctttgcctgagaatttaaaaggtaaacataatatttataatttatttgattgcaaactaatatcttgtagaaaaccagtagctcagtaagtttttttagtgatggtactattctagttgatatatatactcttttgcatacacaaagaacatccttttctaggttcagaaggtgtctccaaaaatgacatgtggcagttaattatttggtcgcactggaatatagagttaatgctagctaaatatgacagcaatagagattcctttgacacattcatgtcctatgagatcatgtaatgcaccttggctactcctgccggtgcaagtgggttgacccgcgaaccaacttataggctaagtaagtgggttgacccaagggttacacactaatttggactataagtgggtttgcagatcaactcacttgcacgcctactctaattgttatattgatttgatttaaactcccacatatgataaatatgtcaaatgctcaagagagcaagaaagtgtcacagaattttcacacaaccaccctgccagtcttgtatctgaacttcctgttgctttggggagtctgccattagtgaatcaaccataataaactgtttaccaccagtccttggctggttgtaggccatatcatttgcttgcgctcttgcagtttgcatctaatggttgctgtagatgtcccatgtataacatgtacatttgacctactagtatgtgttccactatggaattaccagcattcagaattggtagcttagggaactgatttgaagttagtaatgttctggtgtattctggttcttaaattctctgcaaactgatgttctggtactctagagacatgtacatgcctcgattgtttttttagttacactcaagtatcttgaatcaattgtttgtttattttactgtcatatcagctgtatgattgatcatacatcccagatagctaaatctgtcaacactcacttaactgtgttgttttcttgtgcagctgtcatgcaaaccgatgggtttgattatttgcagcaaagctgcccatccttgctgaccgagcttctggagtatgtggccaaggtaggggagcattcggtgagcccctgcttgtattcgaacgaagtccttgatggtggcgatgccaatggaagacgtgtgaaaccgcggatttaacggcagccctgataaaaacctagctggatttccttgtgttgtttccgtgtaaagtgttatagttctataacggcacttttctggtgccatattatatcatgcatgttgtagtgtcttgtgacttctatacctccccctatcgttgctactctggagctgagttgttgctaatatatgtgttctactgactagtgt</dnaseqindica> |
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