Os07g0672500

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Structured Information

Gene Name	Os07g0672500
Description	SMAD/FHA domain containing protein
Version	NM_001067137.1 GI:115474006 GeneID:4344250
Length	11643 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os07g0672500, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 7
Location	Chromosome 7:29083803..29095445
Sequence Coding Region	29083963..29084106,29084189..29084348,29084441..29084568,29086249..29086365,29086466..29086597 ,29086722..29086899,29087254..29087425,29088189..29088310,29088463..29088554 ,29089068..29089110,29089333..29089393,29090104..29090252,29090396..29090466 ,29090542..29090712,29090793..29090861,29091164..29091265,29091345..29091434 ,29091797..29091875,29091975..29092074,29092175..29092250,29092452..29092631 ,29093167..29093289,29093371..29093454,29093805..29093989,29094076..29094214 ,29094322..29094381,29094663..29094767,29095069..29095182
Expression	GEO Profiles:Os07g0672500
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008400:29083803..29095445 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008400:29083803..29095445 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atggtggatacgcggcggagcgccgcggcgaagcggcgggcgtcgtcggaggaggcggcatcgccggcgacggatggggctgcggcgggggcgggggcggcggggagttccacgcctcggaggcggtcggggaagcgggcgaaggcggaggcgacggtagggactcccgcggcgaaggcggggggagcagacgcgacggcggcggcggcgatagatgtgatcgatagctcggtggaaaacctgcacggtgtggcgaggcccacgggcgccgtaccggcgtcgtcaacggtgtccaactctggagtgaagaagaaaaggacaaagtatataaatgttccatcagcggaagaactctcactctggaaggcaaggcaggcggtggcgaacgggcgtgctgaggcttggggaagactgatttctcaatcttccgagtctccttcagtacctatttatactactcattttacggttggccatggtggaaattatgatttgaggctgacagagtcatttcctggatcacttatttgcaaattgaagcatgttaagaggggtgctgctcttgagatttacgtatctaaagctgtccatgtaaatgggaaggtattagataagactgctaaggtcacattggttggaggcgatgaagttatttttagttcacttgggagacatgcttatatatttcagcaacttccagaggaaagatcaagcacatcaacattttcggccacatgtgcttttcagcaagggcaatatccagttaccaaaggtacattggatgtatcatctaaaggagccaagctatcagtaatgccctttaactttggaaatggccgccctccgttggttcctcatgatacagagatagtcagcagtttatgtaaaacaatggaggaacagagccagcttgcttctgaagaaaatttacaggttgctcaacatcaactgttgaaagaggatctgaagaaggtggtcgttaatgcaagtgatatatcagattcatttgatagttttccatattatctgagtgagaataccaaaaatgctctcctgtcttcagcgtatgtaaacttatgttgcaaggaatccatcaaatggacaaaacatatatcttctctttgccaacgggtattattgtctggtccagctggatctgagatataccaagaatcattagtgaaggctcttaccaaacactttggtgctaagctgctcattatagatccttcgttgctggcgagtggacagtcttcaaagtcgaaggaatctgagtcgtacaaaaaaggagatagggtgagatacattggttcagtacaatcaacagggattatccttgagggacaaagagctccagattatggctcacaaggtgaagttaggcttccttttgaggaaaatgaatcctcgaaagttggagtcagatttgataaaaagattcctggtggcattgatcttggaggcaattgcgaggttgaccgtggtttcttttgtccagttgattctctttgcctcgatggcccaggatgggaagatagagctaaacatccatttgatgtaatatacgagtttgcttccgaagaaagtcagcatggtcctctgatactatttttgaaggatgttgagaaaatgtgtggaaacagttactcctatcatggcttaaagaataagattgaaagtttcccagctggtgtttttattgttgggtcccagatccatactgacagtcggaaagacaagtcaaacagtggctctcctttcctttcaaaattcccatacagccaagcaatactcgacctcaccttccaggatagctttggtcgggtgaatgataaaaacaaagaggctctgaagatagcgaagcatctgactaaactcttcccaaataaagtgacaatacaaacaccgcaggatgaattggaactctcacagtggaaacagctattagaccgtgatgttgaaattctgaaggcaaaagctaacacgtcaaagatccagtcgttcttaacccgcaatggtctggaatgtgctgacatagagacatcagcatgtgttaaagatcgaatccttacaaatgaatgcgtcgataaagtcgttggttatgctttgagtcatcaatttaaacatagcacaatcccaactcgtgaaaatgatggattacttgccctttctggtgaaagccttaagcatggagttgagctgttggatagcatgcaaagtgaccctaaaaagaagagcacaaaaaaatcacttaaggatgtaacgacagagaatgaattcgaaaaacggcttcttggtgatgtgatccctccagatgagataggtgttacctttgaggacattggagcactagaaaatgtcaaggaaactttgaaggaactagtgatgcttccgttgcaaaggcccgaattgttctccaaaggacaacttatgaagccatgtaagggaatattgctttttggcccacctggtacggggaagaccatgcttgctaaagctgttgcaacagaggctggcgccaattttatcaacatatcaatgtctagtattgcttcaaagtggtttggcgagggtgagaaatatgtcaaagctgtgttttcacttgcaagcaaaattgctcctagtgtcatttttgtggatgaggttgatggcatgctgggtagaagggagaacccaggggaacatgaagctatgcgcaagatgaaaaatgagtttatggtaaattgggatggtctgagaacaaaagataaagaacgcgtattagtacttgctgccaccaatagaccatttgatcttgatgaagctgttgttaggaggctccccaggaggttgatggtgaatttgccagatgcatccaatagaaaaaagattcttagcgtaatactggccaaagaagatttggctgatgatgtagatctggaagctctggctaacttgactgatggttattcaggcagtgatatgaagaatctgtgtgtaactgctgcacattgccccataagggagatccttgaaagagagaagaaggagagagcatcagcagaagcagaaaataaaccattacctccccctcgttctagcagtgatgttcgttccctaagaatgaacgatttcaaacatgcacatgagcaggtatgtgcaagtataacatctgattcgagaaatatgactgagcttattcagtggaacgatctatatggagaaggcgggtccaggaagaagacttctctaagctacttcatgtag</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MVDTRRSAAAKRRASSEEAASPATDGAAAGAGAAGSSTPRRRSG KRAKAEATVGTPAAKAGGADATAAAAIDVIDSSVENLHGVARPTGAVPASSTVSNSGV KKKRTKYINVPSAEELSLWKARQAVANGRAEAWGRLISQSSESPSVPIYTTHFTVGHG GNYDLRLTESFPGSLICKLKHVKRGAALEIYVSKAVHVNGKVLDKTAKVTLVGGDEVI FSSLGRHAYIFQQLPEERSSTSTFSATCAFQQGQYPVTKGTLDVSSKGAKLSVMPFNF GNGRPPLVPHDTEIVSSLCKTMEEQSQLASEENLQVAQHQLLKEDLKKVVVNASDISD SFDSFPYYLSENTKNALLSSAYVNLCCKESIKWTKHISSLCQRVLLSGPAGSEIYQES LVKALTKHFGAKLLIIDPSLLASGQSSKSKESESYKKGDRVRYIGSVQSTGIILEGQR APDYGSQGEVRLPFEENESSKVGVRFDKKIPGGIDLGGNCEVDRGFFCPVDSLCLDGP GWEDRAKHPFDVIYEFASEESQHGPLILFLKDVEKMCGNSYSYHGLKNKIESFPAGVF IVGSQIHTDSRKDKSNSGSPFLSKFPYSQAILDLTFQDSFGRVNDKNKEALKIAKHLT KLFPNKVTIQTPQDELELSQWKQLLDRDVEILKAKANTSKIQSFLTRNGLECADIETS ACVKDRILTNECVDKVVGYALSHQFKHSTIPTRENDGLLALSGESLKHGVELLDSMQS DPKKKSTKKSLKDVTTENEFEKRLLGDVIPPDEIGVTFEDIGALENVKETLKELVMLP LQRPELFSKGQLMKPCKGILLFGPPGTGKTMLAKAVATEAGANFINISMSSIASKWFG EGEKYVKAVFSLASKIAPSVIFVDEVDGMLGRRENPGEHEAMRKMKNEFMVNWDGLRT KDKERVLVLAATNRPFDLDEAVVRRLPRRLMVNLPDASNRKKILSVILAKEDLADDVD LEALANLTDGYSGSDMKNLCVTAAHCPIREILEREKKERASAEAENKPLPPPRSSSDV RSLRMNDFKHAHEQVCASITSDSRNMTELIQWNDLYGEGGSRKKTSLSYFM</aaseq>
Gene Sequence	<dnaseqindica>161..304#387..546#639..766#2447..2563#2664..2795#2920..3097#3452..3623#4387..4508#4661..4752#5266..5308#5531..5591#6302..6450#6594..6664#6740..6910#6991..7059#7362..7463#7543..7632#7995..8073#8173..8272#8373..8448#8650..8829#9365..9487#9569..9652#10003..10187#10274..10412#10520..10579#10861..10965#11267..11380#gcgttccttaaacggaaaagaggggagaaccccaagcctcttcttctctccgtggtatcgtctcggctcggcgcgcgaaattacggttcggtccctcgcggcggccgccttccttcctcctcttccctttgcgtgcgcgcgtcgccgatccgggggagcgatggtggatacgcggcggagcgccgcggcgaagcggcgggcgtcgtcggaggaggcggcatcgccggcgacggatggggctgcggcgggggcgggggcggcggggagttccacgcctcggaggcggtcggggaagcgggcgaaggtccgttgcatgtgttcacgcggggtggaatttgaggggttttatctgattttttttgtgttggttttggtgtgtacggtaggcggaggcgacggtagggactcccgcggcgaaggcggggggagcagacgcgacggcggcggcggcgatagatgtgatcgatagctcggtggaaaacctgcacggtgtggcgaggcccacgggcgccgtaccggcgtcgtcaacggtgtccaactctggaggttgggttttccggcttttggggtgtattaggattgatttagttcaggggagatatgtttctgattgatttgggcttgtttcgattcttcagtgaagaagaaaaggacaaagtatataaatgttccatcagcggaagaactctcactctggaaggcaaggcaggcggtggcgaacgggcgtgctgaggcttggggaagactgatttctcaatcttccgaggttcggtgatcaacttccaatcggttgaaacaatatgttctgaaatttcctattgtgttcactaagatcattccattgatagacaatgaggtgctacagtaatagcagatttcaggaaacagagtaattttttgtttcgaaggtttttttgtagaacctggatttgtgttgtggtctttaaggactaaggactaaatcacgcattctgcagaaaaaagaagtacaaacccctcaattccgagtggcataacttctgtccttagttcttagtggtatacattttgtatattttatctgatcttggaccaagacgaaacaaaagttaacaagtttacataggttggggtgaaaatatacaagagcatttgggaattgggattaggttgtgtatgttcagcatttcattatttcaaaggtttgaatggatgctgatggagggttattggcaagagagaatccactcagtgccactgagttttccccacttctacaatttaccactgactttgtcaagttgaataatatgccatcgtgttttcccgaacgtctactgagtgccatcgctgtccataagccgttagttagacatctgttagagctgtaaaaagacctatttgcccctgttctctttgagccaagcttcttccacacagtcagcgactcgccgccaacgttgtcctggcacgggggcgcgaagccgtcctcgttgcagcacccgttcacgtagtcacactcgtccaccaccctgacaacgacagaccgtccattcacggcggcggcgacgacgacgcggatcctcccgttgcagcggcggcagcgtgcgccaccaccgccgtcgtcgaggcacagccacccagacccggagtacagctcgacgaccagctccatgttccggcggaagcacatatgcagcgtcgggatcgccggcgcatgtccgataccggctgtgagccacatgaaccgcgggtagcgcttgccgacgacgcagcagtccgggcttcccttggggcaccgggcacctcgtctcgtttccgtggagtaggcatagccgctgccgccggcgtggcagctgccagcagcagagatgccatgccgccatggataatgggggaggcagaaagcaagcacatgacctgcaagaggagagcacagctagtagcacatgacctgagcgagtgggttggtcgtgatttatggatcgatccagaccttaacccatggattgaatccattccaacccgaaaaatcacgccaccattcggagactcgggcggctggccttccatcgatgggagtcggcgctgccacacactgggcagatcaaatggggattgcacggctagggtcttcagtcaaagtgctaaggtaagggtattttagtcattaagaaaaaaatcaatacactaaacggatgcatcctaacggcctgtggatggcgatggcacttagtagatgtttgggaaaacacgatggcatattattcaacttgacaaagtcagtggtagattgtagaagtgggaaaaactcagtggcactaagtggattctctctattggcaaagggtgcctgcctcttgagaatttgagagaacaccagcctcatttacttctatagtgttaatttgcaccatggagtccttttgtctttgctcatgattgtgttcatctttgtcctttccagtctccttcagtacctatttatactactcattttacggttggccatggtggaaattatgatttgaggctgacagagtcatttcctggatcacttatttgcaaattgaagcatgttaaggtatagttgcacattcttttttctaaattttgacttacgtgttttcatcttgccttttttttttgagtttcttactcaatttttgacctgtttgtaccagaggggtgctgctcttgagatttacgtatctaaagctgtccatgtaaatgggaaggtattagataagactgctaaggtcacattggttggaggcgatgaagttatttttagttcacttgggagacatgcttatgtatcctttcatcaccaactacccttgcataagtgttgcttgtactggcatctgttccactaatgtaattgattgttcagaaaagtattaatgttgtatatgaagctccttaacatgttcgcagatatttcagcaacttccagaggaaagatcaagcacatcaacattttcggccacatgtgcttttcagcaagggcaatatccagttaccaaaggtacattggatgtatcatctaaaggagccaagctatcagtaatgccctttaactttggaaatggccgccctccgttggttcctcatggtgaggctattttataacagtttttgttccccctcttaaccctgtaaactttttgagggctcatagtatatgtattccatccatttatttgtaaggcatatctggaccaggcacatggatgtagggattataaaatcagaaaaattgcagatgggaacataatgttcctatgttgatgctttgcacataagttcttagtccgtggcatgattttagtaataaatgcatatagagggaaggtgaatgagttcaatagtctgattacaagaattgcatgcacatgtactttgaaatgagcttggacttttgacaaaaactacatgcctcatattattttgttttcaacttcaatagatacagagatagtcagcagtttatgtaaaacaatggaggaacagagccagcttgcttctgaagaaaatttacaggttgctcaacatcaactgttgaaagaggatctgaagaaggtggtcgttaatgcaagtgatatatcagattcatttgatagttttccatattatctgaggtatgcgctagctgcttaacctacaaagttgcagtaatttggtctgcaaatgaatgccaatttggaacttaatttagagaagctaatgtaagataaatgaatgttgcttttttgatgacacaaaaggtgcatttagtccctataaatcttgatccaccaatgttttgcttttattatgcaaagcctcggtaaggtataggataatctcctaagttcaatatcgttggcattgtgcattatattgccctttatttttctcttgtatatgccacttttatcactgaaaattctgagtgatctctatgcggataatttgccctagtttgtttaattgtgtaacatcataaggtgtagcaggacaccagatatggttgacttcattccattagtcttatctggttatgtcttcactatagctctcaatgacatcaagtactaggatagtgttatccatgtatgtttctgttgtttatttacttcacagtgatgacattctctatcttgacattgaattatatgtgtattcttttgctatggacaccggttgcacctctcttttctggattcatttttgagccagtaagtagacaggtgatggcaagaagaatgggttaactggtcataatgcaatagcactgagtagttctaagttctaataagaccttataactgaagtactaatctgcctgtttcttagttaatgttgagtgcttagtctcatgtggttaagaactatcttttaatgggacctaaccttttgcagtgagaataccaaaaatgctctcctgtcttcagcgtatgtaaacttatgttgcaaggaatccatcaaatggacaaaacatatatcttctctttgccaacgggtattattgtctggtccagctggtaagcttatcgctgaatgtaaattaactgctcaattagtaatttttaagagagtccatttttcactctaaaagaaaattgttgctggcatttactaattttttaaaatgctatgcatggattgttgactaaaataattggcatttttaaaggatctgagatataccaagaatcattagtgaaggctcttaccaaacactttggtgctaagctgctcattatagatccttcgttgctggcgagtgtaagcttcttaaccataaccatggtctctttctctagagaaagtgtgcgtactgtttaatgtgcgctgatgttattcaaatgagccatcacagttttctgacaagaacacacacccaagtcatactgatgtatttcctcttacattctgctgtagtattttgtgctacactgcttaatttttattcaaatcttgattcttcagataatgtccacaacttcatagcaaaattatcaaccttgctactaccgtatgcaaatacatccagaagttctagcttttgctaatatcgcaataactgaatttccttatggcctgtctttttaaatgttgatcttttagataactttttaaatgttgatttgtaaattggattttgcatatataatttttctagtataattctgtgcctgcttaaatacttatagacaaaatgtttgcctaagcatgtagggacatacactattgcttgaattaatatggttcttggatatatttcatttttcttttcagggacagtcttcaaagtcgaaggaatctgagtcgtacaaaaaaggtaagactatgcatgtactattagttatatgcacagactcactgagtagtgactgctttggtcgctatgtatgcctagtttaagtagaaaatcattgagttgagtatggtgaccttaaatttgtccgtgcagtaaagtttgcaggagattgtagttccttttttcagaatatttatgatgataataaaaccacaacgtcaatgcttctgatggttttttcaggagatagggtgagatacattggttcagtacaatcaacagggattatccttgagggacaaaggtgaggcatattaagatagattattggctttctaatgttctctgttgaaatcggtgcctcattatgggaagcagtttccatttctgtgttcacctaaagtacattttgtcatgtgacagtaccaaaagagtgaggagtttagatagacaagttactactgtagtgctaatctggaaacatttttaaagggtgctacaataaatggttcccagtaggttatgtcttgcataaacataagctttctgaagtattcaagcgacgtcactgttatttcagttcttgtggcaattttgtgttccaaacgtacccagaaaagcagatcttacgtagtaatcatgacaataatctctagctccattttttttgtgaacattgcatgtgatattataatgaacttactgtatattcttaggttatatagttggtattgatatgccgcaggctctttttttttttaacaaacgaccctgattggttttagtttcggatcatcagtccggcatgtgatcaatgatggtgtgtgagggttgaactacgtgtttttttccctgaattatctgttatctccctttgtttacaaatgccatcttaatgttaccatttgcatcttttacttgcaatcacctcggggccttttttcctgtaaacaatcttttggtgtcatcatctgcatccgctgatcggtttatgccaaatgatacgatctgcagagctccagattatggctcacaaggtgaagttaggcttccttttgaggaaaatgaatcctcgaaagttggagtcagatttgataaaaagattcctggtggcattgatcttggaggcaattgcgaggttgaccgtggtttcttttgtccaggtgagcctgtttgctcttgtgctcctatgccttaaataatttatacctatatcatacatagattctgtaatttggcatttattactatatttgatataatgtaaatttgaaattcacttgtttatgtttccttgtatctccagttgattctctttgcctcgatggcccaggatgggaagatagagctaaacatccatttgatgtaatatacgaggtgtgtgcagtcctttttggctatgtttgttggtgttccaattcttctctttttacttactggttctttctacagtttgcttccgaagaaagtcagcatggtcctctgatactatttttgaaggatgttgagaaaatgtgtggaaacagttactcctatcatggcttaaagaataagattgaaagtttcccagctggtgtttttattgttgggtcccagatccatactgacagtcggaaagacaaggtactgctgcttgtaagaatcattataactagtataattttacttgtttccatctagctaacaatttttttttcatacagtcaaacagtggctctcctttcctttcaaaattcccatacagccaagcaatactcgacctcaccttccaggtgtgtttttctagttttactgaagtatcttgcaattgatgtttgtgtacattaagccaaatcctgttcttctacagttgtgctcatattcttgtgaatttctttggttaccccatggttaacttaggatataatagttataacagtatgcagaagatgtctgatgttccttattgcaatggtcactagttactagtaacacagcattctcaacttccttttcattgttgaagtacaggttatttcttatctgaattattgtgattgaactccacttgttacaatctgatgaattaatgcaggatagctttggtcgggtgaatgataaaaacaaagaggctctgaagatagcgaagcatctgactaaactcttcccaaataaagtgacaatacaaacaccgcaggtgtgtcatttgtgttattatagggcgacatttactttcaggcactgcctctttcaagttttaactctgagaaatacaggatgaattggaactctcacagtggaaacagctattagaccgtgatgttgaaattctgaaggcaaaagctaacacgtcaaagatccagtcggtaagtatcgatggtgtagacaactttgtacatatatatgtatatttaattagctgtctgtttagttattgttattctgttatgtttatggccttacgggtccaggtgtgtttaatactgaaattatatttgatccgtaaaggcttttcaaaagtgctaccatgtatgtacccttcaatttccagataattgtttggttacaagcccccttggtttaagaatcatgcatgttgcatatctatgacacgagattcacttgataactgaaaaagtgaaaataatttcacacctgccaactccttatgctgtttcttacttaatatttctgattccattgtatgtatttctgcaactggatgtagttcttaacccgcaatggtctggaatgtgctgacatagagacatcagcatgtgttaaagatcgaatccttacaaatgaatgtgagtacagtcctacatttgtaatcctgcataattttgttctgtggcataattgatctgctcttcttattttcttattttgctctgttttgttttcaggcgtcgataaagtcgttggttatgctttgagtcatcaatttaaacatagcacaatcccaactcgtgaaaatgatggattacttgccctttctggtgaaaggtatgctctctaaccctgtaatattttacattgttgtgtaagaaagattaacttctggtctatctcatgtctgctttactgaaaatttctatatttgcagccttaagcatggagttgagctgttggatagcatgcaaagtgaccctaaaaagaagagcacaaaaaaatcacttaaggtaacttctattctttaaccgtttagatcgccaaatatatgttatgactagactggcaactggcagcctggcccaacttcttgtttgtatcctgactgttctagagttttgcaagcaaacagtaatgacatgatttttgggctttggggctattcatgttaactgtgcttacagcttacatacacccactgttatttttaggatgtaacgacagagaatgaattcgaaaaacggcttcttggtgatgtgatccctccagatgagataggtgttacctttgaggacattggagcactagaaaatgtcaaggaaactttgaaggaactagtgatgcttccgttgcaaaggcccgaattgttctccaaaggacaacttatgaaggtagctcaagcttcataacttttatttagtacccttcagttcctctgcactctgtgtgatctttcttcagtcttccgtatcacttgtagaaatttgatgttctgatttttctgtttacccctttcaagtaaatatctcctgcttcgcttatatatccatgcgggcttgctgagtgggtacttaatgtagagcagtggccttctgtccagctatgctttgaccattaactctgttgccttgtgattctattgtttgcccattaactctactgttctgtgcttttgagattcaactattttttccattagcactaatttttattccagctttcatgttgggagtattttgtatcatgtagcctagtaggctccccacgcatcaattattgattcatgtgccccctaaccctttaaaaaaaaccctgcaaactaaatgtagcatgctaattatcatggtctgttttttttatttggtctcttgtttcttttttccacttgtttcacaaacatagttctgatcaccatttattcaccagccatgtaagggaatattgctttttggcccacctggtacggggaagaccatgcttgctaaagctgttgcaacagaggctggcgccaattttatcaacatatcaatgtctagtattgcttcaaaggtactccctttatagagctatgcagagttccagattgttcacatcttgaatactccttttgctgatatctgattctgacagtggtttggcgagggtgagaaatatgtcaaagctgtgttttcacttgcaagcaaaattgctcctagtgtcatttttgtggatgaggtcagtcaacaaa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External Link(s)	NCBI Gene:Os07g0672500, RefSeq:Os07g0672500