Os08g0100400
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Structured Information
| Gene Name |
Os08g0100400 |
|---|---|
| Description |
RINGv domain containing protein |
| Version |
NM_001188422.1 GI:297725974 GeneID:9272448 |
| Length |
7242 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0100400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:25273..32514 |
| Sequence Coding Region |
29876..30173,30263..30468,30563..31159,31713..32513 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:25273..32514 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008401:25273..32514 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>cagcagcaagggcaacagaggagccgtggaggtggcaggcgctgccggccgcgaagagaggaagcaacaatggcctctccgcctccgccgttagggtcagagacggcgatctccccggcgtacggcgaggaggaggaggaggaggaggaggagcagtgccgcatctgccgcgtccctgcggaggcggggcgccccctgcggcacccctgcgcctgccgtgggtccatccgcttcgtccacgacgactgcctcctccgatggctcgccacccgccgcacctcccactgcgaggtttgcaagcgcctcatctccacctgccctctctacgccgcgaatgctcctgcaaggctccccttgtccgagttcatgctcggcctcgccaacaagctcatgggctggttcttcctcctcctctccctcctcgccgccatgtacatctgggaattcgtcatgcccttcaccaccctctggatatggcgcctcgctcttgctaggagctttgctcgggtgcgccacctgctctccctccggatcttcgctcatgctcatggacatggcgcccccctctatggccttatgccttctcccgacgccgtcttcgcctgtgtttctatcagaagagcctttctccgggacctcccccacttcagggacctcaatccccttgccagatttgctgcccatgctcttgctccctttgcactctggattgctcgcctggaaactcgtctcgaccgaaggtttggaggcttggatagtttgcaagtcattgcgctacataccgttgaagcttccttgatggtggtacttcttgatgtgatgcttgcttgtgtttttggttttatccccttctcactggggcggataatcctattctgcacatcgtgcttcagttttggaaatatggatagagtccactcctacacttcaacatcttctatccttttagttggatatggatttatcttttcactgggtgtacttttcactgggtttcatactttcgaccagtactcgaggggagaacacctcacaattgcagttttcttcaaggtcttgaccaatggaatgtacagactattcagccctcttagaaggttgcctggtatacatgtaatggtccagatggcattgtctttcttgcgactgttcttcagagggatcataaatctagtcaccgttgccaatatttcagttaatctcattaatgtgattgcaatatggccgttgttctttggctggtcagttgatatctgtgcttcacaattgtttggtgaaacaatatatcagaagcttgaacttctatttgcctcatcttttgcttctactgctcttcattggctcattggatgcatctatttgatgttactctcaatattttccagtcctctttgtctggtattgggtccaggagttactattccctttgtccacttttctggagaagaaagcttgatacagctcttccgcgaaccattctacaaattttctttaaagctgctacctggtctttttgtcagtgctgtagatgttgctatggtcattcttgttcctgttcaaattgctggccaattggcacctaaggtgttcccattagatataacctactttgatcctcctactaagggatcagcattttggcaagcaccacggaactatgcagagttactttctggtgcccttcttctgaggtttctcatctgcaatacactcaaataccttcagcctggtccactattgcagaagttactgctgtattggtctgccaccactagacgtgttcttggtctgcttgatttattgattgcctggtctgctggagatggtgaatgcgaggatggaaatggttccacacgaaaattccaccatggtagcacttctgaagatgagtacaaaaggtaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>QQQGQQRSRGGGRRCRPRREEATMASPPPPLGSETAISPAYGEE EEEEEEEQCRICRVPAEAGRPLRHPCACRGSIRFVHDDCLLRWLATRRTSHCEVCKRL ISTCPLYAANAPARLPLSEFMLGLANKLMGWFFLLLSLLAAMYIWEFVMPFTTLWIWR LALARSFARVRHLLSLRIFAHAHGHGAPLYGLMPSPDAVFACVSIRRAFLRDLPHFRD LNPLARFAAHALAPFALWIARLETRLDRRFGGLDSLQVIALHTVEASLMVVLLDVMLA CVFGFIPFSLGRIILFCTSCFSFGNMDRVHSYTSTSSILLVGYGFIFSLGVLFTGFHT FDQYSRGEHLTIAVFFKVLTNGMYRLFSPLRRLPGIHVMVQMALSFLRLFFRGIINLV TVANISVNLINVIAIWPLFFGWSVDICASQLFGETIYQKLELLFASSFASTALHWLIG CIYLMLLSIFSSPLCLVLGPGVTIPFVHFSGEESLIQLFREPFYKFSLKLLPGLFVSA VDVAMVILVPVQIAGQLAPKVFPLDITYFDPPTKGSAFWQAPRNYAELLSGALLLRFL ICNTLKYLQPGPLLQKLLLYWSATTRRVLGLLDLLIAWSAGDGECEDGNGSTRKFHHG STSEDEYKR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>2342..2639#2047..2252#1356..1952#2..802#gcagcagcaagggcaacagaggagccgtggaggtggcaggcgctgccggccgcgaagagaggaagcaacaatggcctctccgcctccgccgttagggtcagagacggcgatctccccggcgtacggcgaggaggaggaggaggaggaggaggagcagtgccgcatctgccgcgtccctgcggaggcggggcgccccctgcggcacccctgcgcctgccgtgggtccatccgcttcgtccacgacgactgcctcctccgatggctcgccacccgccgcacctcccactgcgaggtttgcaagcgcctcatctccacctgccctctctacgccgcgaatgctcctgcaaggctccccttgtccgagttcatgctcggcctcgccaacaagctcatgggctggttcttcctcctcctctccctcctcgccgccatgtacatctgggaattcgtcatgcccttcaccaccctctggatatggcgcctcgctcttgctaggagctttgctcgggtgcgccacctgctctccctccggatcttcgctcatgctcatggacatggcgcccccctctatggccttatgccttctcccgacgccgtcttcgcctgtgtttctatcagaagagcctttctccgggacctcccccacttcagggacctcaatccccttgccagatttgctgcccatgctcttgctccctttgcactctggattgctcgcctggaaactcgtctcgaccgaaggtttggaggcttggatagtttgcaagtcattgcgctacataccgttgaagcttccttgatggtatatactatatctcttacttatatactccacttccttccattaattccatctcatctcatctcactatatgtagttatatatgctcgtttcttattataagctaatatagcagtcaaacacctatgctgttttaaatctattctgaaactacaatttattaccacacctacctataccatgttttttttgctgattttccaaagcttatggaccagggtattgccaggaatagcagtcatgattattcttatgggtttttctgtcctagtgtatgggatggtgctcacttctttttcacactgcagtagatcatgaggctgtccatctgattggctatatacaccggtggtactgtataggtgtaggatttcttcaggttatgataccaagcatacctaagcttgttattttaggtccttttttagttgttttgctattgaagttgttctaattctatgctggctttacctatggtttaatgaattcttccctttctttctttacttatttcctgaaaaattctaacaatatgttgtcttactcttatcaggtggtacttcttgatgtgatgcttgcttgtgtttttggttttatccccttctcactggggcggataatcctattctgcacatcgtgcttcagttttggaaatatggatagagtccactcctacacttcaacatcttctatccttttagttggatatggatttatcttttcactgggtgtacttttcactgggtttcatactttcgaccagtactcgaggggagaacacctcacaattgcagttttcttcaaggtcttgaccaatggaatgtacagactattcagccctcttagaaggttgcctggtatacatgtaatggtccagatggcattgtctttcttgcgactgttcttcagagggatcataaatctagtcaccgttgccaatatttcagttaatctcattaatgtgattgcaatatggccgttgttctttggctggtcagttgatatctgtgcttcacaattgtttggtgaaacaatatatcagaagcttgaacttctatttgcctcatcttttgcttctactgctcttcattggctcattggatgcatctatttgatgttactctcaatattttccagtcctctttgtctggtatctatcatctcaccatctcaattagcacgtgcggtatctatgatccaaaactattagtagcaagtgatgtcttatttttttctattattaggtattgggtccaggagttactattccctttgtccacttttctggagaagaaagcttgatacagctcttccgcgaaccattctacaaattttctttaaagctgctacctggtctttttgtcagtgctgtagatgttgctatggtcattcttgttcctgttcaaattgctggccaattggcacctaaggtgttcccattagatataacgtaagcattccactcatgtgcttcgttacaagatgtatctgccagtcttgggcaattctccacatttattttaatatcttgaattgcagctactttgatcctcctactaagggatcagcattttggcaagcaccacggaactatgcagagttactttctggtgcccttcttctgaggtttctcatctgcaatacactcaaataccttcagcctggtccactattgcagaagttactgctgtattggtctgccaccactagacgtgttcttggtctgcttgatttattgattgcctggtctgctggagatggtgaatgcgaggatggaaatggttccacacgaaaattccaccatggtagcacttctgaagatgagtacaaaaggtaacactactggcaccaccatgacactcaatgctctctctctctcctactctcttcctctctccaaatttgtggcttgatataggttagtgcctgtatgcttgctcattcaggaattttccatttagcctgattgcattcacttccatttcaatcagattcgcctattcgcgtacaccctccattttcattaagtgcacataactaggcaatggttcttttgtgggagtgaacaaaagtatcctccaatatatgtcgagcacgtaaaatgtggtaaagtttatctaggagttgtaagcatgctaagtatttagaaacaatatttcagtcaagactcaatagtgcaagtatttagaaacatagggagtataatactcacagtgtgcgtatatactcaaccctaaaataattgtatgatagttttataatgtatatcctaaatccatttgcattttaaatcaacatcgatggtggcatatttaagttacattgttctagctgcagtatctaatttaaactaagacctttccaaggatccaaattgaaaatatctatgatgcgatttatctgcatattatgcattcacctatttcgtgaaatattgcaagcatcattgccagttcttttagatttcctggtcagaatcttactcattctgcactattccatgacaaacagggagacatggactttaactgaagttaagcaatataagcatggtcgggatattttttgttactttctgcagttggtttcttattgttcactgtgtgcttagaggtacactgcacataactaggtttcacgatatcaataagtacagtttttagaggtaccaagtaggcaggggtgaagacagggagaggcggagggagtcctggcctctcccaatgatgcattatctgtttatgacctgctaattatctctctaattacgtgattagttgaagcactttggtgtaggcattcaagctttcaacactaactgtgtttgcatgcctaaacaaactaggagatatacgcctttttccatgataattagttgattactgcatcctgcactttgggtagatggtttttgcatgctcctacaccaagctaatacatggaaatgcaatggcattaatttaaacggcttggctgttctaatgccctcatatcgttgttaactgctaatatctatttctacattagcctcaattcatttacctcttcactttaatttagaatactaaaatatttaaaaataatatatgcagccaattataaataatagtcacggaaatattcttttgctatccacataaaatacttttattttacatgtattgtgatgcaattttttatggttcgatcattttcactcaatatatagctcaaattgacccccccctcaagagcaaatcctggcttcgccactgcacgaagggtatcttagttatattcatctttttgttctatgggtgaaaaaaatatgccctataaaagtgaatcgaggtacagatttaataaagagaaaggaatctatgattggaatgttaaaaggagatatggtgcttttatttttctcaagaggccatgctacatcttacactctcttatcgagcatacattatatgtgcttctctttcttcttgcgaacataataagcttcttatttttttcgatagctcgctcttgacagttcatcttactatgttgctggtaaggcttagatttctaatatgatttgtttatttctattttgaatttctttcttgaaaaattaattataccctgtttccttagtattcttgcagcctggtgggtggtgggtagtcagtagtgttggcatgtgttccatttgctccattttgcctttaaagggataatccatctcagtacctctcgccaaagtatgcgtctcatcataggacgtttatactttttttgttctatgtagtgtgtatttattcagcggtaacattttgacagtctgaccattcttttggttgaattgacagtctgatccttcattactaaagataatcatttgcagttttcagttggcatgcagatcaaatagatatcaaagaaagagtaaattgcactgttggcctctaattctctatgcttgcataagtcccagagctattgatcgctaaacctgcacaggtcccagaagtagaaagttgcatatcttatccttgaactcgtaaaactgaattaactaatattaaaataaggttttgctgtctgacttgttagcttgctattctcggctgcctggctactattttaccattcaaataatagttctcttttttcgttg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