Os08g0107400
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Structured Information
| Gene Name |
Os08g0107400 |
|---|---|
| Description |
Similar to GDP-mannose transporter |
| Version |
NM_001067332.1 GI:115474400 GeneID:4344457 |
| Length |
5393 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0107400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:360169..365561 |
| Sequence Coding Region |
361069..361192,361618..361772,361940..362038,362230..362359,362947..363086 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:360169..365561 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgggctccaccagaactccttctatagccattcctgtggattcagatgcctctcctaggaaaaatacgccagagactgtaacaagtcctcttgtgaatggtgaaaagagtattttccgggatcaggttagaggatacagtgcacttgggagtcctttgaggagagaagttgggaacagatctataacaagatccttctgtattgacaacactgacttggaagatggtaaggctgaaaaagacagagataggccttcacatttcctcagtctcccaaagatacagaatcaggctcttctatctggtcttgcctattgcatatcatcctgcagcatgattttagttaataagtatatcttatctggctatggtttcagtgctggaatatttctgatgctttatcagaacattgtatctgtgactatagtgtccactctatcgctctctggtgttatcccaactgaaccactaacttggaagctaatcaaagtttggttgcctgtgaatatcatatttgtcggaatgctaattacaagcatgtttagtttgaagtacatcaatgttgcaatgctgactatattgaagaatgttgccaatgtattgactgcttctggggagacatacttctttaaaaagcagcatgacagacaagtttggatttctctcacgttgatgataatttcagcaattgcaggaggaataacagatttgtcttttaatgcaattggttatacttggcagatcttgaactgctttctaacggcatcatattcgcttacattacggcatgtaatggacagtgccaagcaagccaccaaatctgggaatttgaatgagttatcaatggttttactgaataatattctttcagtaccacttgggattatcctcgtgcttggtttcaatgaagtggagtacctttttgaaacgcctctcttaaggatgcccatgttttggatagtcattactgctagtggagttttggggcttgctatcagctttacttctatgtggtttcttcaccagtcaagtgcaacaacatataggtactga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGSTRTPSIAIPVDSDASPRKNTPETVTSPLVNGEKSIFRDQVR GYSALGSPLRREVGNRSITRSFCIDNTDLEDGKAEKDRDRPSHFLSLPKIQNQALLSG LAYCISSCSMILVNKYILSGYGFSAGIFLMLYQNIVSVTIVSTLSLSGVIPTEPLTWK LIKVWLPVNIIFVGMLITSMFSLKYINVAMLTILKNVANVLTASGETYFFKKQHDRQV WISLTLMIISAIAGGITDLSFNAIGYTWQILNCFLTASYSLTLRHVMDSAKQATKSGN LNELSMVLLNNILSVPLGIILVLGFNEVEYLFETPLLRMPMFWIVITASGVLGLAISF TSMWFLHQSSATTYRY</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>4370..4493#3790..3944#3524..3622#3203..3332#2476..2615#2132..2357#1663..1827#99..112#cccgagtcgtcgccgcctcgcaaaatttccgacgcctcctctcctctcctcctccgccgcgccattcttcgccgccgccgcccggctccggcggcgccatgggctccaccaggtcagcctccgatcgacctctctctctctcctcttcccctgtacggcaacaacttttgcggctcctgctccaggcttccagccccggtggtggcggctctcacctccgccgccgccgccgctcccttcgaagacgaggaggttgactaatgcggtttataactagctgggtttggattagggaactttttagtacgggaggtggttcgattgctctaatagagtttgtttcgtttcggggaagtgtttttttttttttggttgctgatccatttcggtgtggggagctacggatttcatcaggaatgtctcggtgcaatagctttctctctctctctccgggtttcatattttctgtaatttggaagcgtgtagggatggatggatatggaacctcagctagtttgtttctcctctttttttgtttttttttaactcctcccaagtctcaaactaacaaacaagcgggaatggcttgcatatgagaaatgtattgagatttgacagggttgcggctacacttgtctcatggtttgatcgcacagtattagtcatttggctgatgagagtataaacgagtgaatggcccatgtttaacaactttgttttgttagtaaatgggcgtgtggttaattactacctaatggctgatgtaacgaacttgtttcctttattggtagtagtagattctcactcttctgttgaccatagctattgatttggtttccactatcttgccaagagctcattcattgtttagagggtaggttcaatatttcccaaaatagaatgaaactaaatgtttgggaagtgaaacagtagtatgcgtgcctcaactcgcttgttttcaccaatttacccgtgtaccccacatgattgattaaatttagtaattcatacttcggttcaccataccgttattctgataatgcacttttgcagagttgagcatattagatgttcagcaaaatagctgtagcgtgtgtatgaggctggcggatgaatgtgatagccggactttatttggtcagtttgctcaatcgggataaccttggagttgcttcctagatcacagcacttcaatctgatagagaatttccatgtctcaaaaccatgagacatcctttacaagcaaatagttatttcatatgacagccatcgaatgcgctactgatgtttcaaaatcaagccggttgatgcctgtgcctctgtgggggttgggtttcaacaattgctttgaaaaaaaatgtgttatgcagcgatgataatttgattgtgtgaattaacagcacaagacctttttcatgttatttctagaacagaattttgactcttttgggaaatgcatatgcttgcaatttatccttctggacaaagcattcttaagtaccatatatttcatttgcttgctggatcatgaggtttgagttcactttgagatatttgatgagatgaaacccaatagaacatggcatgctgtatataaggaagagtcctacatatatcttacataattgaattattgctaatggcatcctttttatcttgtagaactccttctatagccattcctgtggattcagatgcctctcctaggaaaaatacgccagagactgtaacaagtcctcttgtgaatggtgaaaagagtattttccgggatcaggttagaggatacagtgcacttgggagtcctttgaggagagaagttgggaacaggcatgtaagcttcccttgaccaatgttcttttatccacttgttgccattgtattcaaagtataaagtggattttccatcaattacatgccctccatcccaacttacatataatgttttcgtttacatataaaaatattcttgttcggttcaacataatcatgtggtgtgacgattcagcaatgggaaaaaaaactgaaaataccatgtgaaaacattattcttgtctatttgaatgaaaatgttttggaagtatcgtggaatctaacacattatgttgtgttttctggatcatattttctccagatctataacaagatccttctgtattgacaacactgacttggaagatggtaaggctgaaaaagacagagataggccttcacatttcctcagtctcccaaagatacagaatcaggctcttctatctggtcttgcctattgcatatcatcctgcagcatgattttagttaataagtatatcttatctggctatggtttcagtgctggaatatttctgatgctttatcaggtatgttactttttttctgattgtttacctctcaaacaatatattacatttatttctgtgtcgtgcttctgctgcttgttgtacccattgataatctcttgatggtcttttgctgcagaacattgtatctgtgactatagtgtccactctatcgctctctggtgttatcccaactgaaccactaacttggaagctaatcaaagtttggttgcctgtgaatatcatatttgtcggaatgctaattacaagcatgtttaggtatgcaccagacattcagattgttttgatctgaacgctttttgggtgcaatttacattgttctgtagattctttgttttggttttagagcatggaacgtatgtgatttaaaaatgtttttatatttatctatgtattcatagggtacaatatgaacactgtgctatattgctagctttccactctaggaactatgcacaaagaaagaggacttacctgatgaacttgtaaatgtgcttattgtgagaataagtagtgatatttaataaacttttggcagtttaaaaagttaatgcagggaaactatttgtttgtcctgacattttgcgggcgttaatattcattatgaatatctgttgtggcttgccttacgtcttctctcgtgctgctattggtccattagttggtttggagagtggacgattaattactatctaagatttctgaacatttggaactgaaacttttcatataagaatctatcatggctcagcttgtaataaggatggtctgggttgaaattgcgcaactggcagtctcagacaaaaattacttccctcatttttaatgcattttgtaccttgcagtttgaagtacatcaatgttgcaatgctgactatattgaagaatgttgccaatgtattgactgcttctggggagacatacttctttaaaaagcagcatgacagacaagtttggatttctctcacgttgatggtatgtcacctctagaattcagtgatgtttgaactggacttaaatacttgctgggaatatttacttcgttgctgccagtagcatctagttgatttgtttctgaatattaaagtatagatgttcatgaaacactgtttagaaacaacagtgtattacctttcacgggctgactcacatatccctttttgtagataatttcagcaattgcaggaggaataacagatttgtcttttaatgcaattggttatacttggcagatcttgaactgctttctaacggcatcatattcggtattgtttttgttcattttaacaaaaacctgattacatatgcagcctattcttgaactgttattcccagttgtttcaaattcctaaaccatgatgtagccagttttcagtatattcatttctaaagtgctccacaattattttaactaatgaactgtttttctcagcttacattacggcatgtaatggacagtgccaagcaagccaccaaatctgggaatttgaatgagttatcaatggttttactgaataatattctttcagtaccacttgggattatcctcgtgcttggtttcaatgaagtggagtacctttttgaaacgtaagcaaacttcactcgtttgttctgatgtgaacccaatagacttggtttgttctgaggttcataacgtgaacctagtagactacatgggagctgtggaatctccatttatttcacaaaaaaacctctttcatgaaagttttctttctatgcttccttaggcatgtcaatggcaagttaatggtgtctaacagaatcggtaatggtaatgacctccacacatgtcaataaggcatgtctggacactagaaacaaaaaggtgatgtataggattaaataggttgtcaactagtaatgcatcggtacttaggatccttctgaattacatgcaaacctatcttcttgttgcagccacatctcctgacaaaaccagtatttacttaatctggtggcataatgtatttacaatgtgaatgaattttcaggcctctcttaaggatgcccatgttttggatagtcattactgctagtggagttttggggcttgctatcagctttacttctatgtggtttcttcaccagtcaagtgcaacaacatataggtactgaatgaattgtagtggctttttaaaaaatgtttatcttcatgtgctctgtcttcatgaatttctaatgtcaatattgctcctgatatagtcttgtgggctcccttaataagatccctctctctattgctggaatccttctcttcaaagtgcggacgagcatggagaattctttcagcattttgtttggtaggcttttttttaataacaagggaaaaggtactatgttatagatatcacattcactaataagattcatacccattatcgtgcaggtttattggcaggagtattcttcgccagagccaaattgcttaataactctcagtcctagtcgtaggccaagctttataggttatacaaggcagaattattctagtcagtcagattcagaacaggatgctcgctcgga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