Os08g0110700
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Structured Information
| Gene Name |
Os08g0110700 |
|---|---|
| Description |
DDHD domain containing protein |
| Version |
NM_001067357.1 GI:115474450 GeneID:4344482 |
| Length |
10308 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0110700, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:560002..570309 |
| Sequence Coding Region |
560401..560644,560731..560777,561386..561486,561570..561618,561779..561841 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:560002..570309 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008401:560002..570309 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggagtcccccgcggcgcgtggcgccctcggggacgacgcgtcgggggcgtccacgagccaggcggcccccggggccgtggatggcggcgcgtcgccggactcgctgcggaacacgccctccaacatcgcgaggctggaggacgccatcgagcactgcgccgctcgccgcaagtacctcgcccgcaccaagagcccctccgacggcgaggatgtccgctggtacttctgcaagctgcccctcgccgacaaagcgctctctgcttcagttccacggacagagatagtgggaaaaggggactacttccggttcagcatgagagactctcttgcattggaggcgtccttcttggagagggaggaagctctgcttgcatactggtggagagagtacgccgagtgcagcgaagggccaaaaggttccttagttgcagctgatgcttcggattctaaaagtctgtataaggtggaggaagaacgggttggggttcctgtgaaaggcggactttatgaggtcgatttaatgagacgtcattgcttccctgtgtactggaatggggagaacaggcgtgtcttgaggggccactggtttgctcgcaaaggagggcttgattggatccccttgcgtgaagatgtttctgaacaacttgagctagcatataattgtcaggtatggcatcgccgtaaatttcaaccttcaggcttatttgcagcacgtgttgatctccaaggaagcaccccggacttgcatgctctttttactggagaggatgatacctgggaagcttggctggtctttgatactggtcctaagctaggtggcaacacaatcaaattaaggcgtgggttttcatcttctggatcagcgaagcctacacaggatgagttgcgtcagcaaaaagaagaggaaatggatgattactgttctcaggttccagttggtcatctagtatttatggttcatggcattggccagaggttggagaaagctaatcttgttgatgatgttgttgatttccgccgtgtaactgctaatttagctgaaagatacttaactccttatcaaagaagtacccagagggttctgtttattccttgtcagtggagaaagagcctaaagctcagtggtgaacaatcggttgagaaaatcactttggatggagttaaaggtcttcgtgtagcattaggtgccacagttcatgatgttctgtattacatgagtcctatatactgtcagcacataattgactcggtctcaaaccagttgaaccagttgtacacaaagtttatcaagagaaatcctggttatagtggaaaggtttcaatatatgggcactcgttaggaagtgttctatcttatgacatactttgccaccaagaatcttcttctgcaccatttccagtagattatatgaatatggaagtttcttctgatgaaggtcacatagcaaaatcgcctgacacagttactgcacatgaatcagtcatgaaggagcaagatacatcttccatttctgggcattcttgtgctgataatgtaaatgatgtagttgatgaagggagcaccagaactggcacttcatgtacagaggacaccaccctcccaacatgtgcacttgaaaattcaccgaaacttaccacagatgcactacctacagcagtagatggagaacaaattgaagtcgaaaaacaggtcgacaatcataaaattgcatgcagtgaagaaggggacaattcatctgtaagagcaaaagacattgacagttgtatcatttcaagatctgctgagggagtccatgcggatgtccctgacaaagatacattgatatcatcattgaaagaagaggtggaacgccttaaagctagattagcacaacttgaacaacataatgatttggtgactgaaagcagtgctgagtctcatcaaggtaaaagtgccactcatgcagtgaacctatcatcaggcaaaaaccgcatagggcaaggaagcacgagtgagtcctacacaccacacatcagatacactaaactaaattttaaggttgacacattctatgctgttggatcccccttaggagttttcttgtccctgcggaatgttcgcattggtattggcagggggcaagattattggcaaaatgagaacatagttgaagagatgccatgctgccgtcagatgttcaacatttttcatccctttgatcctgtagcatacaggattgaaccacttgtatgtgaagattacataagcaagcgccctgtaattgtaccctaccatagagggggaaagaggatacatgtaggagtgcaggaattcactgaagatattgctgcaaggtctcaagctgttgctcgccagttcaagtcactgaaggttaaagcagtagctgctttgctatcactgagcagaaatgacacggacgaggacgttgacagcaataatgagaaagagaagtcatatggttacatgatgatggaaaggctgacaggttcaccagatggtcggattgaccatgtacttcaggagaaaacatttcaacacccatacttatctgccctgggatctcataccaattattggcgagatcatgatactgctcttttcattctcaaacatctgtaccgtgatatacctgaagaacctccaactgatgatcctgaaaggatgcctattcgactgttttatgtgagggatccaattgctgaagagactcccttgacgttttcagataattcattagttaaggaattctcaagaaaagtgagaacttattcaagaaaatctgagaacgattcaagctgtgaatcttcctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MESPAARGALGDDASGASTSQAAPGAVDGGASPDSLRNTPSNIA RLEDAIEHCAARRKYLARTKSPSDGEDVRWYFCKLPLADKALSASVPRTEIVGKGDYF RFSMRDSLALEASFLEREEALLAYWWREYAECSEGPKGSLVAADASDSKSLYKVEEER VGVPVKGGLYEVDLMRRHCFPVYWNGENRRVLRGHWFARKGGLDWIPLREDVSEQLEL AYNCQVWHRRKFQPSGLFAARVDLQGSTPDLHALFTGEDDTWEAWLVFDTGPKLGGNT IKLRRGFSSSGSAKPTQDELRQQKEEEMDDYCSQVPVGHLVFMVHGIGQRLEKANLVD DVVDFRRVTANLAERYLTPYQRSTQRVLFIPCQWRKSLKLSGEQSVEKITLDGVKGLR VALGATVHDVLYYMSPIYCQHIIDSVSNQLNQLYTKFIKRNPGYSGKVSIYGHSLGSV LSYDILCHQESSSAPFPVDYMNMEVSSDEGHIAKSPDTVTAHESVMKEQDTSSISGHS CADNVNDVVDEGSTRTGTSCTEDTTLPTCALENSPKLTTDALPTAVDGEQIEVEKQVD NHKIACSEEGDNSSVRAKDIDSCIISRSAEGVHADVPDKDTLISSLKEEVERLKARLA QLEQHNDLVTESSAESHQGKSATHAVNLSSGKNRIGQGSTSESYTPHIRYTKLNFKVD TFYAVGSPLGVFLSLRNVRIGIGRGQDYWQNENIVEEMPCCRQMFNIFHPFDPVAYRI EPLVCEDYISKRPVIVPYHRGGKRIHVGVQEFTEDIAARSQAVARQFKSLKVKAVAAL LSLSRNDTDEDVDSNNEKEKSYGYMMMERLTGSPDGRIDHVLQEKTFQHPYLSALGSH TNYWRDHDTALFILKHLYRDIPEEPPTDDPERMPIRLFYVRDPIAEETPLTFSDNSLV KEFSRKVRTYSRKSENDSSCESS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>9666..9909#9533..9579#8824..8924#8692..8740#8469..8531#8268..8361#8039..8141#7172..7244#6979..7091#6814..6895#6050..6577#5883..5948#4658..4807#3772..3942#3154..3204#2225..2362#2069..2140#1572..1727#1124..1282#783..883#134..386#agcagagttgagttttggagaagaaggaaccatctggattcccctcgcgaacggcacattcccttcccttcccacccacggcgaggcgcgggccccacctcgccgcctcctccgttgccggcgatcccggcacatggagtcccccgcggcgcgtggcgccctcggggacgacgcgtcgggggcgtccacgagccaggcggcccccggggccgtggatggcggcgcgtcgccggactcgctgcggaacacgccctccaacatcgcgaggctggaggacgccatcgagcactgcgccgctcgccgcaagtacctcgcccgcaccaagagcccctccgacggcgaggatgtccgctggtacttctgcaagctgcccctcgccgacaaaggtgcgtgcatccgctcacctctcagactcgtctgcttcggaatgctacacccagtgccaccaatttaaccgtccgattcagtcactcgtggttaatcagcggtagctagaatgtaggtttgatgtgtgagactgttgctgatttgaatctactaattgatagggtagtgtggtttagacaagtgttcacatgcatgcgctattgaattcgctgattgaactcgccattcgaagcaatgctcatttacattagattcatatttgaccgtggcatgtcttcatacttcagaactgctgtgctcaattaaattgatcatcggtttggactttaaacttatgaagcgtgtgataaatgtcttactgatcttatgttttgtgcaattcgctgttgatgcagcgctctctgcttcagttccacggacagagatagtgggaaaaggggactacttccggttcagcatgagagactctcttgcattggaggcgtccttcttggaggttctctctttaacaccattgtcaattgcttagtgtttactcattttagtcatttatatggtaagactggactgtagtaacagtaatagaaacaatccgcttgaaaagcgatattactagacaatctagttccaagagagctgtactagtccctctacaatataagggggattatatcctctctcactctttttaaaccacttaacttcaggatcacaatactggtttactggtttgtagagggaggaagctctgcttgcatactggtggagagagtacgccgagtgcagcgaagggccaaaaggttccttagttgcagctgatgcttcggattctaaaagtctgtataaggtggaggaagaacgggttggggttcctgtgaaaggcggactttatgaggtttgtattttttgtcttgtagtttgttcacaactggattcacgacgcatgagttttgttagttattcgccgaagcaaagctatttatacatatttacattcttcttgttattttttagtggacactgtacttgttattgttgatctagtagaagtaagattgtggactaagtgaatttttttagctctgtcacacacctgtaatactgtataacttttctgttcttttttactactagcatgctagatattgaatatgtctttgttataagaacatacactgttgcaggtcgatttaatgagacgtcattgcttccctgtgtactggaatggggagaacaggcgtgtcttgaggggccactggtttgctcgcaaaggagggcttgattggatccccttgcgtgaagatgtttctgaacaacttgagctagcatataattgtcaggtaaaaagatgccatgagaatattattcgctatcatctttcttgtactattagaaagccatttcatggaatgccaatttgctatcactacaaatacacttgttctagaaaaagataccacactttcttctccagtcgaatactgtaaatgcattcaatgagatgaagataatcatcacttgaatttagctatgtatgccatggtatgatctgcggtgtggatataccatcttttgcttttatcatgttcttgagttagttttggttcctatcatactcccctctttgatttccatgcccataaagcagttgaacatcctgttttgttgtaaaaaaaaataggtatggcatcgccgtaaatttcaaccttcaggcttatttgcagcacgtgttgatctccaaggaagcaccccggtatgtgatatactgttgtaacagcatgacttgctcagaaaagagagaatggcaacttaggacaaggctgaataatctgtgcaggacttgcatgctctttttactggagaggatgatacctgggaagcttggctggtctttgatactggtcctaagctaggtggcaacacaatcaaattaaggcgtgggttttcatcttctggatcagcgaagcctacacaggtcagctgccctgttgaatgttgatgcttttgccatgtttcagtattttattttttgtacctactattttcatctgttgtgcatgaatgactgagagaatgtacaaattgaggttggatcttgattcttttacaaacactaaatgggaacttctgtgtggactgcaatagagctatagaggcatgattgaaaactaattgcagccatatcctattgagaatttaatctgatagtgctatcttgctactcctgaggtaaactgtacaaagtcaatatgtaacatcattttttacaaccagctgaaggccaacaatgtgacaaactattctagcacgttattgcattatttttttgcatttaaaaaaaaaatcaaatggtaccctcgtgctgttttttttgtgagaaacatttggtaaataattgaattagttaggagttgaacttgcttggtactcaatagtttttgcttctaattttgaagtgcaatatagagtggcggagccatgtacaaaactgtgggatcagcttgaccccacagcttttttgcaaacacccttgtgagtctctctttttacatgtaagtccattgaaatttataaaaatgaccccactattatatgatgcaacggtatttgaccccacagggtaaaagttctggctccgccagctattacgagtctagattgagaacttgtaaacttttatgttctttctgctgtctgcctttaaccatgttattctacattcactttttgcttggtacaaattgttgtctgatttttttttgtcaggatgagttgcgtcagcaaaaagaagaggaaatggatgattactgttctcaggtatttgttgttttaggcattatggcatttgctctcttcctcggtggctagaaatgggactgaaatcattgagatacttcgaaagctatagtctttgcattattatgtttccagcaaaagatccagataaacatgtctattaaaggaaagcattcctggtattttgttccagttatatgaatttcacattgcatttgttggcgcccttcatgttaccaaagttccagttaaatatacaatcaagaatgttaacaggtggttgaagtacatgcatggcaaacaaaagggatgcaaacattatgcactggacatgatgcatacacagctgtacagaactgtgcttgaatagagtactatattctgattatttgaattgcctggccttatcaacccatcttacatctatgaatatgattttaacatttgcatcaatgcaacaaaaccaatgaacccaaacacacacacctcatccccacacacaaaataaacatttatgtacataaaagttctcatccataatctacaaggttggcaaattgattatttgttgtggttgtctcttggtaggttccagttggtcatctagtatttatggttcatggcattggccagaggttggagaaagctaatcttgttgatgatgttgttgatttccgccgtgtaactgctaatttagctgaaagatacttaactccttatcaaagaagtacccagagggttctgtttattccttgtcaggtaagaactcaaagttactcatgccatagactcattttggttgaaatgtatgtcattcttgtgcctcatttcagataagaaaaatacttgttcttgctttagcatgataaagcaagcctttaactccatattcaggcatgctgagttgacatatgcttggtcttgttttgaactactttaccatacgttacaaccacattaacttgacagtctttacttttgaatggtgaccattgagcaaaagcgagagatgcaaatggtagttttgaattttggccattgatcaggaaagtgagatatatttattactatcagaaaagtgagttgacatatgcttggtctcgttttgaactactttaccatacgctataaccacaataacttgacagtctttattttgaatggtggccattgaacaaaagcgagagatgcaaattgtagttttgaattttggtcattgatcagaaaagtgagatatattttactatcaaatgctcacgggcaccacaatttatttgtacacttgtgcacacatgtcatgatctttattgcatctgaactcagttgttaagttagccagaaatttcttttatgtatctagttataataaaagcatgtttttcagattaaaataccatcatatggcacctggcatctagctgcatctccataattaccggcaacttgagtttttaaccctgatgttttattgcagtggagaaagagcctaaagctcagtggtgaacaatcggttgagaaaatcactttggatggagttaaaggtcttcgtgtagcattaggtgccacagttcatgat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