Os08g0162100

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Structured Information

Gene Name	Os08g0162100
Description	Similar to CTV.2
Version	NM_001067590.1 GI:115474916 GeneID:4344728
Length	8681 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os08g0162100, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 8
Location	Chromosome 8:3666095..3674775
Sequence Coding Region	3666651..3666730,3666841..3667020,3667104..3667217,3667322..3667480,3668185..3668365 ,3668449..3668575,3668669..3668778,3668876..3669014,3669114..3669223 ,3669349..3669418,3669594..3669667,3669805..3669900,3670029..3670124 ,3670388..3670515,3670769..3671003,3671090..3671257,3671621..3671728 ,3671815..3671964,3672252..3672362,3672465..3672644,3672774..3672902 ,3673166..3673261,3673455..3673640,3673778..3673950,3674067..3674268
Expression	GEO Profiles:Os08g0162100
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008401:3666095..3674775 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008401:3666095..3674775 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atgtcgtcgcttagcagggagctggttttcctcatcctgcagttcctcgatgaggagaagttcaaggagacggtgcacaagttggagcaggagtcggccttctacttcaacatgaagcactttgaagacctggtgcagggaggggagtgggacgaggtggagaagtacctcagcgggttcaccaaggtggaggacaaccgctactccatgaaaatattcttcgagatccggaagcagaagtacctcgaagcccttgacaggcatgatcgagccaaggcggtggagatactcgtgaaggatctcaaggtgtttgcctcattcaatgaggagctgttcaaggagataacacagctgctgacgttggagaattttaggcaaaatgagcagctgtccaagtatggggacacaaagtcagctcggaatatcatgctcatggagctcaagaagcttattgaggcaaacccactgtttcgggacaagctgaatttcccaccatttaaagtttcaagactccgcacattaatcaatcaaagtcttaactggcaacatcagctatgcaagaatcccagaccaaaccctgacatcaagacactgtttaccgatcattcttgtgccgctcctaccaatggagcaagagctcctccccctgctaatgggcctcttgttggaccaatccctaagtcagctgcatttcctccaatgggtgctcatgcgccatttcaacctgtggtgtcaccatctccaaatgcaattgcgggttggatgacaaatgcgaacccctctttgccacatgctgcagtcgcacaaggaccacctggtcttgttcaacctccaaacacagcggcatttctaaaacatccaaggactccaacaagtgctcctgccattgattatcaatctgcggattctgaacatctgatgaaaagaatgcgtgtaggccaaccagatgaggtgtccttctctggtgcaagccaccctgccaacatttatactcaagatgaccttccaaaacaagttgttcgcaaccttaaccagggttcaaatgttatgagcctggatttccatcctgttcaacaaaccatccttctagttggaacaaatgttggtgacattgggatatgggaagttggctcacgagaaaggatagctcacaagacattcaaagtttgggatattagttcttgcaccttgcctttgcaggctgcactgatgaaagatgctgcaatatctgtcaatagatgcctgtggagtcctgatggaagtattttaggtgttgctttttcaaagcatattgttcagacgtatgcattcgtgctcaatggagaattgcggcagcaagcagagattgatgcccacattggtggggttaatgatattgccttctctcaccccaacaagaccctctcaattattacttgtggtgatgataaactaattaaggtatgggatgctcagacaggacaaaagcagtacacatttgaaggtcacgaagctccagtatattctgtttgccctcactacaaggagtcaattcagtttatattctctactgccatcgatgggaaaattaaggcatggttatatgactgtttgggctcaagggttgactatgatgctcctggacattggtgtactaccatggcttacagtgctgatggaacaaggctcttctcatgtggtactagcaaagatggtgattcacacttggttgagtggaatgagactgagggagctattaagaggacatacaatggtttcaggaagcgctcactgggtgttgtccagtttgatacaacaagaaaccgcttcttggctgctggagatgaattcgttgttaaattctgggatatggataacaccaacatacttacaacaacagattgtgacggtggactgcctgcgagcccacgcttgagattcaacagagaaggttcattgcttgctgttacagcaaatgaaaatggaataaaaatattagccaacactgatggacagcgtttgctaaggatgctagagagcagagcatatgagggctctcgagggccacctcaacaaattaataccaagcccccaattgtcaacacccttggttctgtttccaatgtgtctagtcctatggcagtgaattcggagagacctgatcgggcattgcccacagtgtcaatgagtggcctggcgcccatggatgttagcagaaccccagatgttaagccaagaattacagatgaatctgaaaaggttaaaacctggaagttggcagacattggtgactcaggacatctccgagcactgcgtatgccggatacatcagcaacttcaagcaaagttgtgcgtctgctgtatacaaataatggggttgcgcttttggctcttggctctaatgctgttcataagctgtggaaatggcaacgcactgataggaatcctaatggcaagtccactgcatctttcactcctcaaatgtggcaaccagcaaatgggattcttatggcaaatgacactagtgatggcaaccccgaagaagcaactgcctgcattgctctgtccaaaaatgattcctatgtgatgtctgcatccggtggcaaagtctcattgttcaacatgatgacattcaaggtcatgactactttcatggcacctccacctgctgcaactttccttgcattccaccctcaagacaataatatcattgctattggaatggaggactctaccattcaaatttataatgtccgtgttgacgaggttaaaagcaagcttaagggacattcaaaaaagatcactgggctggcattttcgcagtcaatgaatatgcttgtatcttcaggtgctgatgctcagctatgtgcttggagcattgatggttgggaaaagaagaaatcaagatatatccaatctccagcaaatcgttctggtgctttagttggtgatacaagggtgcagtttcacaatgaccaaacacatattttggtggttcatgagagccagttggcgatctatgatgcaaagctagagtgcttgcgctcgtggtccccaagagaagcactccctgctccaatttcaagtgcaatatactcatgtgatggtctcctcatctacgccggattttgtgatggtgcaattggagtcttcgaagcagagtctcttaggctgcgatgcaggatagcaccttctgcatacataccaccttccatgtctagtggtggaagtgtttaccccatggttgtcgctgcgcatcccttggagcctaaccagattgcggtcggcatgagcgatggtgctgttcatgtggtggagccgttggactcagacccaaagtggggagtggcgcctcctcaagacaatggaacccaccccacaatatcagcggctccggcagcagctaacaaaccagaagtctga</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MSSLSRELVFLILQFLDEEKFKETVHKLEQESAFYFNMKHFEDL VQGGEWDEVEKYLSGFTKVEDNRYSMKIFFEIRKQKYLEALDRHDRAKAVEILVKDLK VFASFNEELFKEITQLLTLENFRQNEQLSKYGDTKSARNIMLMELKKLIEANPLFRDK LNFPPFKVSRLRTLINQSLNWQHQLCKNPRPNPDIKTLFTDHSCAAPTNGARAPPPAN GPLVGPIPKSAAFPPMGAHAPFQPVVSPSPNAIAGWMTNANPSLPHAAVAQGPPGLVQ PPNTAAFLKHPRTPTSAPAIDYQSADSEHLMKRMRVGQPDEVSFSGASHPANIYTQDD LPKQVVRNLNQGSNVMSLDFHPVQQTILLVGTNVGDIGIWEVGSRERIAHKTFKVWDI SSCTLPLQAALMKDAAISVNRCLWSPDGSILGVAFSKHIVQTYAFVLNGELRQQAEID AHIGGVNDIAFSHPNKTLSIITCGDDKLIKVWDAQTGQKQYTFEGHEAPVYSVCPHYK ESIQFIFSTAIDGKIKAWLYDCLGSRVDYDAPGHWCTTMAYSADGTRLFSCGTSKDGD SHLVEWNETEGAIKRTYNGFRKRSLGVVQFDTTRNRFLAAGDEFVVKFWDMDNTNILT TTDCDGGLPASPRLRFNREGSLLAVTANENGIKILANTDGQRLLRMLESRAYEGSRGP PQQINTKPPIVNTLGSVSNVSSPMAVNSERPDRALPTVSMSGLAPMDVSRTPDVKPRI TDESEKVKTWKLADIGDSGHLRALRMPDTSATSSKVVRLLYTNNGVALLALGSNAVHK LWKWQRTDRNPNGKSTASFTPQMWQPANGILMANDTSDGNPEEATACIALSKNDSYVM SASGGKVSLFNMMTFKVMTTFMAPPPAATFLAFHPQDNNIIAIGMEDSTIQIYNVRVD EVKSKLKGHSKKITGLAFSQSMNMLVSSGADAQLCAWSIDGWEKKKSRYIQSPANRSG ALVGDTRVQFHNDQTHILVVHESQLAIYDAKLECLRSWSPREALPAPISSAIYSCDGL LIYAGFCDGAIGVFEAESLRLRCRIAPSAYIPPSMSSGGSVYPMVVAAHPLEPNQIAV GMSDGAVHVVEPLDSDPKWGVAPPQDNGTHPTISAAPAAANKPEV</aaseq>
Gene 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External Link(s)	NCBI Gene:Os08g0162100, RefSeq:Os08g0162100