Os08g0175300

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os08g0175300

Description

PolI-like DNA polymerase

Version

NM_001067647.1 GI:115475030 GeneID:4344789

Length

9708 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os08g0175300, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 8

Location

Chromosome 8:4390053..4399760

Sequence Coding Region

4390495..4390656,4390883..4390972,4391050..4391262,4391437..4391529,4392090..4392284
,4392365..4392457,4393271..4393366,4393903..4394332,4394771..4395438
,4397421..4397618,4398037..4398754,4399383..4399528

Expression

GEO Profiles:Os08g0175300

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

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Protein Sequence

<aaseq>MAVAPPLPPAPARQLRRWKGSSPRPPPWLSSPFRRTRYLSRPAF AAGGRQDYSPSSGMGVSKTGAFRLGLYGNLNVQSSVQEWVDETKRLFFLRTTNSVRNN ITNGTTPLRVGNLRHDPSEDIRSSNYPSLYNQRERGPSNSIVNRHVDTDLAKHRVMYQ SAHAVPAPFSVVNNDIKPLNMLDGSKEEIPWHDSVTMESSLPKVSKSEKTLVVDKAIP DKKEHKRITRKVTPNFPDKASLSTESKNARKLLATIYDKVLVVDNVESARSVVKLLTT KYKGFIHACDTEVANIDVKEETPVGHGEVICFSICSGNSDGEADFGNGKTCIWVDVLD GGRDVLMEFAPFFEDPFIKKVWHNYSFDIHVIENCGIKVAGFHADTMHLARLWDSSRR TDGGYSLEGLTNDYRVMDAVLKDIPKTGKVSMKTIFGRKKVRKDGSEGKTISIEPVEK LQREDRELWICYSSLDSMSTLKLYESLKNKLEAKEWIFDDCPRGTMYDFYEEYWRPFG ALLVKMETEGVLVDRAYLSEIEKAAVTERELAADKFRKWASKHCPDAKYMNVNSDNQI RQLFFGGIENRNKRGETWPQSKTFKVPNDEGIATEGKKTPKSRTIKLFTIVEDLKIDM FTPTGWPSVSGDVLRSLAGKIPTDHIYKIDDGQEFDEDGSSLELPEQDIEDTSPYGTA YEAFGGGKKGREACHAIAALCEVFSIDKLISGFIVPLQGDRISCKEGRIHCSLNINTE TGRLSARTPNLQNQPALEKDRYKIRHAFVAAPGNTLIVADYGQLELRILAHLTNCKSM LEAFKAGGDFHSRTAMNMYQHVRDAVEEKKVLLEWHPQPGQDKPPVPLLKDAFGAERR KAKMLNFSIAYGKTAVGLSWDWKVSVREARDTLKLWYRDRKEVSAWQKKQKAFALEKC EVYTLLGRSRQFPNMTHAGPGQKGHVERAAINAPVQGSAADVAMCAMLEIERNARLKE LGWRLLLQVHDEVILEGPTESAEEAKTIVVECMSKPFYGTNILKVDLAVDAKYAKSWY AAK</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>9105..9266#8789..8878#8499..8711#8232..8324#7477..7671#7304..7396#6395..6490#5429..5858#4323..4990#2143..2340#1007..1724#233..378#gccgcttaaaccctggtcccccttgtctcccaaaccctctctccttcccctcgcttccgcctccggccgccgccgccgccgccgcgaggccaccgcctgctgctgcagcggcctacccttgcgtcggtgcaagacggcgccctgcggcttcggttgcggggtgggtggtggcgttgcgggaggaggaggagggaggcgggcggggtccaagctgaggcggctcgtgaggtccatggcggtggcgccgccgctgccgccggcaccggcgcggcagctacggcggtggaaggggtcttcgccgcggccgccgccgtggctgtcctctcccttccgccgcacccgctacttgtcgcgcccggccttcgccgcgggaggaaggtagccgtactgtttatttgtgtgtattgcataagcctttttctttgctagtagttgttaagatgttccgtagtgcctaattcgtgatgaaaaataatacttcctccgtttcacaatgtaagtcattatagtatttcccacgttcatattgatgttaataaatctagataaatatatatgtctatattcattaacattaatatgaatgtgggaaatgctagaatgacttacattgtgaaacggagggagtaaatgatgttttggttaatggatgggtgtatgcatatttttcgcatgttctaatgtgatgatttatctagactgtgtaggacttcggatatgtctcctcatttgagctagtgtcgattagcattccttaatccttatatatatttttattttgttttaagagatctaagcattccttatgtagtcacattccacttcttatagccatacaattattactacagaagtacgaattgcccgataatagtaatctgccaaagagtaactaggttctactgtcactatcctgaatgccgcgcttttgccttattacttgatgatttcacattgcttgggatcttgggtgcttctgaactttgcaaatggttctcgttggcaggcaagattattctcctagttcaggcatgggggttagcaaaaccggtgctttcaggcttggattgtatggcaacttaaatgtacaaagtagtgtgcaagaatgggttgatgaaaccaagaggttatttttcctcaggaccacaaacagtgtcagaaacaacatcactaatggcactactcctctgcgggttggaaatctgcgtcatgatccctcagaagatatcaggagttcaaactatccttccttgtataatcaaagagaaagaggaccatctaattcaattgtaaatagacatgtcgatacagatttggctaagcatcgtgtgatgtatcagtcagcacatgctgtgcctgccccattcagtgttgttaataatgatatcaaaccactgaacatgcttgatggctccaaggaggaaattccttggcacgattccgttacgatggaatcttctctgcctaaagtttccaagtcagagaaaactttggtggttgataaagctatcccagacaaaaaggagcacaaacgcattacaaggaaggtgacgccaaatttcccggacaaagcttccttgtccactgagtcaaaaaatgcacggaagttgcttgctaccatctatgacaaagttttggttgtcgacaatgttgagtcagctaggagtgttgttaaattgcttactacaaagtacaaaggctttattcatgcatgtgacacggaggtatttcgccaaaccctgcttgagttctatcatcggtatatcagttttggctatgttatttaggttttccctcataattgtgagagtatcaataagaagtatatttctgataggtgatactatagtatcttgtttggtcatcaattattgctgacctcaagtgtttgttgttagattgtgcctttttttccctatgtatcttctctgaaaatgtaagttgcagagtttacaggagatgtcatgaagaatgtaaaatattaaatgctaatgctaattattggtttcttctagttacatggtttgacatgctcatagtctacttctgtggtagcaagctttgctcagaattatttacagttttattgcgtatcaagctccaaacatacattctaatttaggatagtacaatattatacaggtggcaaatattgatgtcaaagaagagacaccagttggtcacggagaagtaatatgctttagcatctgttcaggaaattctgatggggaggctgattttggaaatggtaaaacatgcatatgggtggatgtgctagatggtggaagggatgttctaatggagtttgctcctttctttgaggacccatttatcaaaaaggttcacttcgattcctcatttatcttggagtaaatttattgtggttatcttctccctttatgtgttggatgaaatgtattagtgccatagttccttttccctcttctattactactataattacattacttcttttagattaggccttagttgcagcaaactgcactaaacaccatttcctatcactcgtaaacttatgctaaacattgaaaataactagatatagttcactattttataattatgcatttcacctgattgtcagcaccataaagttgtgggtttataaccaaaaaatgaaaaacaaaatcctacctggctacctgctaaaccctacccaagagtgataatgtaaatggactaccttaagattgctgttttagacagacccttctgtgctctgacatactgtctttatatgttccatttttccctgcctagaaaaaattcctgtgcgttgcaacgagtgaaggcaacttgcaaataactgaacaaaattaactgtttaaactcggctgtagctaccggtccatcacctaatgaactatgaaatcatgtgggtatgatcgatgaatataattgtaacaaaaaaatgacatcatttctaacatggtgatggtgtttagttttgaagttatggagtgtatttctttcgtgcaatagcgcatgtgtgcttgcgtcgaccaacatgagtcaggtcataaaaaatcttggtatggtagtctatttgatttgtaggaggcttggagtaaatcttagttaatagtgaggacttggactacactaagggaagagccgaaagacacatggtagattgataccgtgtagaaggattgatgtgacatgtgactcattagtggtgtaccaggtccaaaaagtcatgaataaaatatttataaaaatgggaagagatggagaaaaaacatctatttttgaaaatcacaagggaacaactttcacctcagccactgttcacgcgggaactgttcatcaccagagaggtgaagagcttcatggctagcttgggacagtagacccatctgatctaagtaggccatgaattcacgatcggtcaatgcagccacagccggcccaggtagggtcagcaggaaaaagacctggctgggtggagctagaattccctcactcgtgtactgctgtactgaaaaagggcggacgtgcgctgtgtacaaagagtcaaagactaatgcggtaactgagtagaggatggacgaaaattttgagtacaaaatcatcttcaatttttataatataataggtaaagattgaatagattcacattttcgtacccgagccccatatttcctactacttcgcttagaaaaaagaaacatgttttagacattgacacagtccccaaaatacaactttgacaacttatttatgttatagtatatttgtagtatcaattgtatgaccctataaaattgtaatattatgatattctggtcacaaaaactatgttctattacaaaatgctaaaagaacccaatatagttctaatattgtggaagtattttttgagaaaaatctacaagtacaattttcatgtgtccaatctaattagttaaaagatattgataagaacatttttaaagtttgacttcaaacatgtccaaaacgagatgtttttttgtgactggagggggtagtaattttggtgacaaatatacacatatgagtttcatataccaagattaaatattttgaagatattgatggtcaaagttctgattgttcaacttaatgtatgtccaaaacggcatgttttcgtgactggagcccagagggagtatgaaattaatatgctaattagtagattcagtcttcaatcaatctttgaactgtgcagttcggaataaaactacagattggtcattacccatcaattattattatactacgtatttgtttcttcttggcttgtctgaagtgatctgttctttctcctcatcatgtaggtttggcataactatagttttgatatccatgtcattgagaactgtggaatcaaggttgctggatttcatgctgatacgatgcatcttgcacgcctgtgggattcttccaggagaactgatggtggatattcacttgaaggactaacaaatgattacagagtcatggatgctgttctaaaggacatacctaaaactgggaaggtgtcaatgaaaactatctttggccggaaaaaggttagaaaagatggatctgaagggaaaaccatatctatcgagccagtcgaaaagttacaaagggaggatagagagttgtggatttgctattcctcactagattcaatgagtacattgaagctttatgaaagcttgaaaaacaagcttgaagcaaaggaatggattttcgatgattgtcctagaggaacaatgtatgatttctacgaagagtattggcgtccctttggtgctcttcttgtaaagatggaaacagagggagtgcttgttgaccgtgcatacctttcggagattgagaaagct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External Link(s)

NCBI Gene:Os08g0175300, RefSeq:Os08g0175300