Os08g0178100

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Structured Information

Gene Name	Os08g0178100
Description	Pep3/Vps18/deep orange domain containing protein
Version	NM_001067661.1 GI:115475058 GeneID:4344807
Length	9718 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os08g0178100, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 8
Location	Chromosome 8:4570025..4579742
Sequence Coding Region	4570089..4570271,4570355..4570568,4570684..4570823,4570929..4571024,4571426..4571493 ,4571889..4571990,4572839..4572977,4573105..4573245,4573330..4573449 ,4573588..4573644,4573747..4573806,4574213..4574320,4575181..4575341 ,4575800..4575878,4576476..4576538,4576704..4576837,4577193..4577298 ,4577591..4577779,4577942..4578169,4578375..4578530,4578838..4579002 ,4579099..4579215,4579292..4579468
Expression	GEO Profiles:Os08g0178100
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008401:4570025..4579742 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008401:4570025..4579742 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atggacgccgccgccgccgccttcgcccccggcgggcagctcttctccgtcgatcccctcgagcggcacgcggcgaggggccatggcgtggtcacctccatggctgccggcagcgacgtcatcgtcctcggcacctcccgcggatggctcgtccgccacgacttctccttcgaggacgcccatgatctcgacctcgggaccggccgctccggcgagcactccgtgcaccgcgtcttcctcgaccccggcgggaagcactgcgtcgccacggtggtccacccggggggcgccgagacgtactaccaccacgccaggtggccgcgccccaagctgctcccccgcctccgcaacgtcctcgtcaatgccgtcgcgtggaaccgccaaaccatcaccgaagcgtcgaccaaggaggtgatcctggggacagaggatgggcagatcttcgagattgcagtagacgaggccgacaagaaggagaagtatgtgaagtcgctctttacgctctctgagctgcaggagggcatcaagggcctgcagatggaaaccgccgtggttgggaacgccacaaggttctatgtgatggctgtcacaccaacacggttgtactcattcacgggcatcggttcattagaaactgtttttgctagctattctgatcgtgcgatacactttatggagctcccaggagatattccaaatagtgaattacatttctttatcaagcaaagaagggctaagcattttggatggctttctggagctggaatttaccatggtgaactgaattttggagctcaacacagctctacaagtggggatgagaactttgtcgaaaataaaggtttttttgactactcaaaattgggagaatctggtatcaagccaaggtcatttgcattgtctgaattccattttctgcttctcatcagggacaagattaaggtagtgaacagaatcagccagcaaatagtggaggaacttatagtcgatagttcaccagaagttacaaaaggaataattggactttgtagtgatgcatcaactgggcttttctatgcatacgatgaaaattctatattccagatttcatcatctgatgagggtcgtgatatgtggcaagtatacctggacatgaaagaatatgctacggcactgtcacattgtcgtaactccttccagagggaccaagtctatctagtgcaggctgatactgcattcaatacaaaagagtactatatagcagcttccttctatgcaaagatgaattatatcctatcatttgaggagatcagcttaaaatttatatctgttggtgagcaggatgctctcaggactttcttgttgagaaggcttgataacctaacgaaagatgacagaatgcagattacaatgatctcaacttgggctactgagctgtacttggacaagattaatcgcctcctgttggaagatggcacaggagccacgtcaaatgctgtagcagattctaaagactcggaatatcgttcaatagtaaatgaattccgtgcttttctaagtgatagcaaagatgtattagatgaggcaacaacaatgagactgttggaaagttatgggagagtggatgagctggtttattttgctggtttaaaggagcaacatgaaattgtggttcatcattacattcagcaaggagaagcaagaaaggcattggaagttcttcagcgacataatgttctagtagaccttgtgtataaatttgctccagatttaatcatgttagatgcttatgaaactgttgaatcatggatgatggcaagaaataagttgaatccagggaagcttataccggcaatgatgcgttatgtgagcgaaccacatgccaagaatgaaacacatgaagttatcaagtacttggaattctgtgtaaaagatttgaacaatgaggatcctggagtgcataatttgttgctctcactgtatgccaagaaggacgatgagtctcagcttttgcaattcttggacactaagtttggtaaaggacagacaaatggccctgagttcttttacgaccccaaatatgctctgcgtctatgtcttcaagagaagagaatgcgtgcttgtgttcgtatttacagcatgatgtccatgcatgaagaagctgttgcacttgcattaacggtggacttagagcttgcaaaagcagaagcagataaagttgaagatgatgaagaacttagaaagaagctgtggcttaaggttgcaaagcatgtcattgagcaagagaagggagtcaagagggagaacataaagaaagctatagaattcctatcagagactaacaacttgttgaagattgaggatatcctgccatttttcccagacttcgtattgatcgatgactttaaagaggaaatatgcaaatctctcaaggactatgacagccaaatcgatcagctgaaacaggagatggatgatgctactcgtggggcagacaacatcagaagtgatattggtgcccttgctcagagatacactgtaattgatcgtgaggaggaatgtggggtgtgcaagcgcaaaatattgactgctggaggactgcaccaggtaggaagaagctacacatctaccggacacatggcccccttttatgtgtttccttgtggacatgcctttcatgcgaattgtttgatcgcacatgtaactcgttgtaatagcagccaaacacaagctgaaaaaatactggacctccaaaagcggcttagcctaatggacaggaaagcagcaaaggaaaatggcggaaacatgaatggtgaatctattatcagtgcgacaccaattgacaagttgaggtcccagctggatgatgctgtagcgagcgagtgccccttctgcggcgatctgatgatcaaggagatttcattgcctttcattctccctgaagagtctgatgaaaaggcttcgtgggaaattaaaccgcaaccaacgggtcagaaaattcttccaatgaccatgtctatatga</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MDAAAAAFAPGGQLFSVDPLERHAARGHGVVTSMAAGSDVIVLG TSRGWLVRHDFSFEDAHDLDLGTGRSGEHSVHRVFLDPGGKHCVATVVHPGGAETYYH HARWPRPKLLPRLRNVLVNAVAWNRQTITEASTKEVILGTEDGQIFEIAVDEADKKEK YVKSLFTLSELQEGIKGLQMETAVVGNATRFYVMAVTPTRLYSFTGIGSLETVFASYS DRAIHFMELPGDIPNSELHFFIKQRRAKHFGWLSGAGIYHGELNFGAQHSSTSGDENF VENKGFFDYSKLGESGIKPRSFALSEFHFLLLIRDKIKVVNRISQQIVEELIVDSSPE VTKGIIGLCSDASTGLFYAYDENSIFQISSSDEGRDMWQVYLDMKEYATALSHCRNSF QRDQVYLVQADTAFNTKEYYIAASFYAKMNYILSFEEISLKFISVGEQDALRTFLLRR LDNLTKDDRMQITMISTWATELYLDKINRLLLEDGTGATSNAVADSKDSEYRSIVNEF RAFLSDSKDVLDEATTMRLLESYGRVDELVYFAGLKEQHEIVVHHYIQQGEARKALEV LQRHNVLVDLVYKFAPDLIMLDAYETVESWMMARNKLNPGKLIPAMMRYVSEPHAKNE THEVIKYLEFCVKDLNNEDPGVHNLLLSLYAKKDDESQLLQFLDTKFGKGQTNGPEFF YDPKYALRLCLQEKRMRACVRIYSMMSMHEEAVALALTVDLELAKAEADKVEDDEELR KKLWLKVAKHVIEQEKGVKRENIKKAIEFLSETNNLLKIEDILPFFPDFVLIDDFKEE ICKSLKDYDSQIDQLKQEMDDATRGADNIRSDIGALAQRYTVIDREEECGVCKRKILT AGGLHQVGRSYTSTGHMAPFYVFPCGHAFHANCLIAHVTRCNSSQTQAEKILDLQKRL SLMDRKAAKENGGNMNGESIISATPIDKLRSQLDDAVASECPFCGDLMIKEISLPFIL PEESDEKASWEIKPQPTGQKILPMTMSI</aaseq>
Gene 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External Link(s)	NCBI Gene:Os08g0178100, RefSeq:Os08g0178100