Os08g0199300
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Structured Information
| Gene Name |
Os08g0199300 |
|---|---|
| Description |
Similar to YyaF/YCHF TRANSFAC/OBG family small GTpase plus RNA binding domain TGS (Fragment) |
| Version |
NM_001067741.1 GI:115475218 GeneID:4344894 |
| Length |
5092 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0199300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:5745741..5750832 |
| Sequence Coding Region |
5745847..5745933,5746838..5747005,5747088..5747211,5747425..5747516,5747601..5747699 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:5745741..5750832 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008401:5745741..5750832 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgccgcccaaggcgtccaagaaggacgccgcccccgccgagcgccccatcctcggccgcttctcctcccacctcaagatcgggatcgttgggttaccaaatgttggcaaatccactttctttaacatagtaacaaagctgtctatcccagctgagaacttccctttctgtaccatcgacccaaatgaggcacgggtatatgttccagatgagagatttgattggctttgtcaactttacaagccaaagagtgaggtgtctgcatatctagaaatcaatgacatagccgggcttgttagaggagcccatgctggggagggtttgggcaatgccttcctatcccatatacgcgctgttgatggaatttttcatgtattgagagcatttgaagacaaagaagttactcatattgatgattcagtggatcctgttagagatttggaaactattggtgaagagctgagactcaaggacattgagtttgtgcagaacaaaattgatgaccttgagaaatcaatgaagagaagcaatgataagcagctgaaactcgagcatgaattatgtgagaaggtcaaagcccatcttgaagatggaaaggatgtccgctttggagattggaaaagtgctgacattgagatcttgaataccttccagctacttacagctaagccagttgtctatttggtgaacatgagtgagaaggactaccagaggaaaaagaacaagttcctacctaagatacatgcctgggttcaggaacatggtggtgaaactattattccttttagctgtgcttttgaaaggttgctagcggatatgcccccggatgaagctgctaaatattgtgctgaaaaccagattgcaagtgtgatcccaaaaattatcaagactggttttgcagcaatccatcttatatactttttcactgctggccctgacgaggtaaagtgttggcagatcagacgtcaaactaaagcacctcaagctgctggtacaattcacactgattttgagagaggcttcatatgcgctgaggtaatgaagttcgacgatctaaaagaactgggtagtgaatctgctgtgaaggctgctggaaaatacaggcaggaagggaagacctacgtggtacaggacggggatatcatcttctttaaatttaacgtgtctggaggtggaaagaagtga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPPKASKKDAAPAERPILGRFSSHLKIGIVGLPNVGKSTFFNIV TKLSIPAENFPFCTIDPNEARVYVPDERFDWLCQLYKPKSEVSAYLEINDIAGLVRGA HAGEGLGNAFLSHIRAVDGIFHVLRAFEDKEVTHIDDSVDPVRDLETIGEELRLKDIE FVQNKIDDLEKSMKRSNDKQLKLEHELCEKVKAHLEDGKDVRFGDWKSADIEILNTFQ LLTAKPVVYLVNMSEKDYQRKKNKFLPKIHAWVQEHGGETIIPFSCAFERLLADMPPD EAAKYCAENQIASVIPKIIKTGFAAIHLIYFFTAGPDEVKCWQIRRQTKAPQAAGTIH TDFERGFICAEVMKFDDLKELGSESAVKAAGKYRQEGKTYVVQDGDIIFFKFNVSGGG KK</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>107..193#1098..1265#1348..1471#1685..1776#1861..1959#2083..2196#2797..2861#2949..3063#3475..3552#4109..4201#4551..4601#4691..4789#ccttcttcttccctcacccccttttcccaccaaaaaccctagcctccccctcctcttccagattcatcgccgccgcgccgccccgagcccagagtagccggcgacgatgccgcccaaggcgtccaagaaggacgccgcccccgccgagcgccccatcctcggccgcttctcctcccacctcaagatcgggatcgtacgcgccccttaattccccaccgctatatctctactctcctttgcttcgccgtcgacgcgacgaccgcgggtgcctgcccgggggccagtggatctcgcggctttgctgtcatgcgatgtggatagtagattgattgtagtttgtgcaggattcgcgtgtgcagcagctactacggtggatacatcggagcttagtgcttggggttgggggagatatgtgctttggttttcggggtagtagaacggagcgtgcgcccagctcgaggccgtgattttagtagggttttgtccccttggtggtcagtgtggggtttggttggtgcttaggtttttgattcatgttccgctgctttgtgcttatgtggatgtgatttgaatctaactttagtgggtaacccggtgttcttaatttggcgaagcattctatataagaacgatctacgccatatctttatgcatgaatgtttagacgatctcctgttacctttgtgtacttttttcctgctggaagcatgatagcccatggtagatacctgtacattcctattcattagttcttcccaattgatcgcctttggtggtgctaatagtgatagtatgatattgtcatattgctcaacacacctgctactgatgaatgattatgtataagcatttgcttttaacttgtataccatcacgggttcataatgcaatatttgttattggatttgttcattgtttcatcaatatttggatcagcaaatgatttgatcattagttattctgtgcagagatgcttttccaactttacagcgaagcatataattaccaataatcccatttttacccttttgatttatcctagttttctcatcagttataaagacttatgaatttctttgtatttattttctctgcaggttgggttaccaaatgttggcaaatccactttctttaacatagtaacaaagctgtctatcccagctgagaacttccctttctgtaccatcgacccaaatgaggcacgggtatatgttccagatgagagatttgattggctttgtcaactttacaagccaaagagtgaggtttgtttctttcctacactataatgtgcaacttcttttcttatgtttcaagacatatcatgtcttctgaatttctttgcaggtgtctgcatatctagaaatcaatgacatagccgggcttgttagaggagcccatgctggggagggtttgggcaatgccttcctatcccatatacgcgctgttgatggaatttttcatgtattgagtatgttcctgttacttatcattttgattggatcttgcatattgagtgtgtagtcatggacttgtgctattgtttcagtgtgaagcaaagtaaacgttgtgattgttctagtgaaagcattggtgctcagattcgaatcaattttctttgcttttttgtttaaccagtaatcacaaggtcatgcacttcatgaatgctgcttatgtttatcaggagcatttgaagacaaagaagttactcatattgatgattcagtggatcctgttagagatttggaaactattggtgaagagctgagactcaaggtttttatagggatgcttgatttgcacgtcagtaaatgctttggttaaaccttcttttaaatcctatcgcactttcttttgcaggacattgagtttgtgcagaacaaaattgatgaccttgagaaatcaatgaagagaagcaatgataagcagctgaaactcgagcatgaattatgtgagaaggtggggcacctgttacagccaacctctgtgttgctaaatttgtctgttagcagccttgcataatttcaaattgttattttcttgagtgagtggaagcttacttttggcttctcttcctaacaggtcaaagcccatcttgaagatggaaaggatgtccgctttggagattggaaaagtgctgacattgagatcttgaataccttccagctacttacagctaagccagttgtctatttggtacgtatttttgtcatctgtatgccagtttatttgagatgttataaagtagttttcatgatgaggtgttcagttgttctttgtgagatttcagttttgttattttcgtgcttctgcatttagagactcagtaataatgtcagtacgttgattcatggctatacatgcttttgaatttatacaatagtgcccatgaatagcgcatattgttttctattagcaagataaacttggaatagtgcaaaacttatcctgtggactttctgttgtgccctgtttgtctgtttcagtcttcctcctattatgtaatgtttattttgaggcatcaagcaatattctgaagcagtgaataatactttcttgttttatgtatgggaactctacctatatatcattttcagagcacacaatcaactataacccaaatagtcactaatcgtgtaattagctgtatacccacctaacctaacatggatattttagttgacctgtcagaaattgaaagggagatgctagtatgttacctttccttgcatatggtaatttttttttaataaaagtagagctatatattgtttaatgactgttttgtttttgcaggtgaacatgagtgagaaggactaccagaggaaaaagaacaagttcctacctaagatacatgcctggtattgttctctagtatatagtaactatttcttgaagggattaaggtgtaatggaaaataaggcaaactgttgttttttattttcagggttcaggaacatggtggtgaaactattattccttttagctgtgcttttgaaaggttgctagcggatatgcccccggatgaagctgctaaatattgtgctgaaaaccagattgcaaggcaagccatgtcacactcatataccattaaatgttctttatgtgtttagcttagttccaaaaaaaccaaaggtaaattgcttgatttggaatcaagcaaatcaagcaatactgtcacactcatatatgagtccttttacttggattttatttcctgagtgacgcaatagtgatgcctattttttggttgggtcactacgtgtctttgaggtgaattccatttggtcatactttctataagatacattatatgactatgattctataaacaccaatagaactatcaaaccagcaagagtctttttagttgcatgttgtttaccatatattgtagcttcttttttatatgattcaaaatttctgatctgtcattagttgcttgtccttaagcattctctattttttgctgcagtgtgatcccaaaaattatcaagactggttttgcagcaatccatcttatatactttttcactgctggccctgacgaggtatattttttctggtcatattatgcttatcttacactattacttgttgattttaatataatccatcttttacttcccatgttgctatatgacagtagcattgccctttaacaattgtgttgtgcaatttgctgcactttgttttaagtaatacgcagtactccctcctacaaaagttatacatattacttttaccaccatgaccaaggagaaattaaactcatcttgcatgtaacaaagataaggagtgtatgcacgcatgcaaccaatgagtattaagatggctcctcgggttttgatcaaacatttaatttacctatccatttaaatcttggatgcatacacactacaaataggaacaacttatttgggaaaactaaaatatgaaataggtctaattcttgtggatggagtactttctttagttcttattttttatgttcttaatagttcaaatgcaagcgatgtgaaaattttagttttatacattcttgtttaaatatatgtttgaaatacattttgctggattagtgacatagatggattttctgttcaggtaaagtgttggcagatcagacgtcaaactaaagcacctcaagctgctggtacaattcacactgattttgagagaggcttcatatgcgctgaggtactcatgcgatatactcaggcttcatatgagtagttagtatatgcatgctaatgtggttagatattattgcaaacaattgatctcatgtcactgttaagtagctggtctaattcactagttatactacctcattttgtacagttatccccaactccgcagtactcaatggacacattgatttagatgttttctgatgcgacttttctagtttgatatagttcttttatttgtaataattattctctttgttttatatatttggttgggcttgtctgtccagtagcattgttctttttagctttatgcacatttgaaacttatgtgaaatacatttttctgggattaggtaatgaagttcgacgatctaaaagaactgggtagtgaatctgctgtgaaggtatgcaaggcacctaacaaagttgatattgttcaagtgcctcttttcgatatatacttaatgaaaacgcccattattgcgaattgtaggctgctggaaaatacaggcaggaagggaagacctacgtggtacaggacggggatatcatcttctttaaatttaacgtgtctggaggtggaaagaagtgagtcaatgtttgaaggtgatagcgttccgacagagtggtgcattttactttaaacttctacacttagc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|
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