Os08g0205900
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Structured Information
| Gene Name |
Os08g0205900 |
|---|---|
| Description |
Similar to Viroid RNA-binding protein (Fragment) |
| Version |
NM_001067772.1 GI:115475280 GeneID:4344928 |
| Length |
5690 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0205900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:6169110..6174799 |
| Sequence Coding Region |
6169321..6169395,6169498..6169613,6170003..6170081,6170178..6170268,6170353..6170431 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:6169110..6174799 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgatttgccgcagtctcctccttctcagatctaatgcggcctccaaggcaagcaacatagtaaaacatgtagctgccactggatgtttgccaaaatattcctcagaggcaccagccagatatttcagctctgaaccgtctcttcaggtcgactcgacagaagaaaatgggttcaaggggcatggcatgctggccccattcactgctggatggcagagcaccgatttgcatcctctggttattgacagatctgagggttcttacgtttatgatatcaatgggaagaagtacatagatgctcttgcaggattgtggtctacggcattgggtggtaatgagcctcgattgatcaaagctgcaactgatcaattgaacaaattacccttctaccactccttttggaaccgtactaccaaaccctcattggatcttgctaatgaaattctcagcatgttcactgcaagggaaatgggaaaaatattctttacaaatagtggttcagaagcaaatgattctcaggtaaagctagtttggtattataacaatgcattgggaagacctaacaagaagaaatttatcgcacgctcaaaatcatatcatggatcaacattagtgtcagccagtctatcaggtcttcctgctcttcaccaaaagtttgatctgccagctccttttgttctgcacacagattgccctcactactggcgcttccatcttcctgatgagacagaagaagaatttgcaactagacttgccaccaacctggagaatcttattctcaaagaaggaccagaaacaattgctgctttcattgctgaacctgtgatgggtgctggcggtgttatccctcctccaaagacatactttgagaagattcaagcagtcctcaagaagtatgacatcttattaatagcagatgaggtcattacagcatttggtagattgggaaccatgtttggatgtgatatgtatgacattaaaccagatcttgtctcaatagccaaggctctatcttctgcctacatgccaattggagctattcttgttagtccggaaataacagatgtaatttattcacagagcaacaagctcggttcttttgctcatggatttacatactcggggcatccagtttcctgtgctgtcgccatagaagcattgaagatttataaagaaaggaatatcatcgaacatgttcagaaaattgccccaaggttccaggagggaatcaaggccttctctggaagtccaattgtaggcgagatacgtggtttaggactgatacttgggactgaatttgtcgacaacaagtctccgaatgatccattccctgctgaatggggtgttggttcattgtttggtgccgagtgtgagaagcgcggaatgcttatcagggttgctggggataacattatgctttcgccaccgcttataatgactcctgatgaagttgaagaaattatttgcaaatatggtgatgccctgaaggccacagaggaaaggattgcagagctcaaagccaagaggggttag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MICRSLLLLRSNAASKASNIVKHVAATGCLPKYSSEAPARYFSS EPSLQVDSTEENGFKGHGMLAPFTAGWQSTDLHPLVIDRSEGSYVYDINGKKYIDALA GLWSTALGGNEPRLIKAATDQLNKLPFYHSFWNRTTKPSLDLANEILSMFTAREMGKI FFTNSGSEANDSQVKLVWYYNNALGRPNKKKFIARSKSYHGSTLVSASLSGLPALHQK FDLPAPFVLHTDCPHYWRFHLPDETEEEFATRLATNLENLILKEGPETIAAFIAEPVM GAGGVIPPPKTYFEKIQAVLKKYDILLIADEVITAFGRLGTMFGCDMYDIKPDLVSIA KALSSAYMPIGAILVSPEITDVIYSQSNKLGSFAHGFTYSGHPVSCAVAIEALKIYKE RNIIEHVQKIAPRFQEGIKAFSGSPIVGEIRGLGLILGTEFVDNKSPNDPFPAEWGVG SLFGAECEKRGMLIRVAGDNIMLSPPLIMTPDEVEEIICKYGDALKATEERIAELKAK RG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>5405..5479#5187..5302#4719..4797#4532..4622#4369..4447#4205..4292#3999..4082#3862..3909#3261..3335#3091..3167#2905..2993#2704..2742#2247..2320#1865..1957#1536..1633#1281..1353#1047..1131#819..940#99..146#acatccttttcatctcccacctcctcactcctcgtcagttcgtcacttgcttccaagaaccccgtgacaaggcgggaaggaatccgaatcgcagcgagatgatttgccgcagtctcctccttctcagatctaatgcggcctccaaggtgatgttgattaaattctgcatttcttggaggtttttactgcacctgcgtcactgcttgtaacaagaagtggaacggttttgatgtttccgtcttcttgttttttttgaatatttggaggtagtattgtatattttttgcactgtggaattgatttttgatccctataaaggctcaagaacaacagggtgttgctgttagtaagcactaagcagggttgggtgggtctgtttgattcgttttgcagccttagaaaggtgcagtcttttgttaatcgagaattggttaataattggagcagtcgtgtgtttgtgatttcatttattcttttttaatttgcctgctgcagatgttatgtttagtcagatttaagatgtttatgcttttttgagcaattatagagcaactctctaaaccctgctttcctgatcatttcgttgtgctgttatcagcaacttgccttcattctttgttttgtttaaaaaaaaaaccttgaatgtacagatttaagcagtaatggttttgctcaagattagagttttcttcaaaacagttgctctgagagtagctcgagtagtttgaagcgattttgaactcttaacattattctaaagtcagcatttcttacagctcatgtacctaaattctgcattcatctatttcctcacataggcaagcaacatagtaaaacatgtagctgccactggatgtttgccaaaatattcctcagaggcaccagccagatatttcagctctgaaccgtctcttcaggtcgactcgacagaagaaaatgggtatgttttatgtgcagaattatcacataattatgtgtatagacatatctagtctaaatttcttgttatctaccactgatgctgcaacattttttacctgtatcaggttcaaggggcatggcatgctggccccattcactgctggatggcagagcaccgatttgcatcctctggttattgacagatctgaggttctgcaatttggaattgtcttaaaatttttttccattgattctcagattatagcacaagatttagaacatgtagctttccatgttgacttctcttcataatgtggtggtttctagctttatcttatatcatattcaacgaattgcagggttcttacgtttatgatatcaatgggaagaagtacatagatgctcttgcaggattgtggtctacggcattgggtatgtgcaccagttcaagctgtattttcagatttttgtggtataccagagagttgttcctactttctagtaaaactcgtttcccgcatatgtagcaaatgtagtattgcatatatactaaactttgctattgtcctttgtatattgtcttgttttctttgcgtaattccctttgctttcaggtggtaatgagcctcgattgatcaaagctgcaactgatcaattgaacaaattacccttctaccactccttttggaaccgtactaccaaaccctcattggtaccttttttatctcactatctttacaggaatatagttaaaaccgtaggttgttgatgttatatttctaacagtgtgcttgttattttacttgataattcctagtttcaccatcttccaaataggaataaaatttgatgctacaattgattacatcacatttagtagttcccttgtttctgttaaaaattggtggtttctgaatcttgatgattatactgctaatttcaggatcttgctaatgaaattctcagcatgttcactgcaagggaaatgggaaaaatattctttacaaatagtggttcagaagcaaatgattctcaggtacaataattagtcaaaacaaataactatcattatttggagtttatactatacctgctctcattatgaacttttctgttcaagtttggttagtaaaaaattgcaaaaataaatgttgtgccacagaatataaaaacattgtggggttttatttactgaaaataaatagtgtatggtcccccagttgtgatattccacaaagtacaaaggtcagtcgtgatattcagaggattatggtggagtagaagtatggaagtattcagtattataacagtgttattctttacaggtaaagctagtttggtattataacaatgcattgggaagacctaacaagaagaaatttatcgcacgctcaaaatcgtacgattcattttactttacactttagccttttctcctaatgcaatagacgatttgttgatatgatttattttcatttatgattataattctcaattcattttgtcctgcatgtcagttgtatatttttacttgcagttctgtatataagtctttcacatgtcaataccagatgatggtgtcagtttatattatcatgctttttgtaatatttttgcgtcaaacttaacaacagatgaaatactctaagaattatttctaaatcaccgtccttgtatccaccagcattacctttcaatatcatttaagctccttaccttgattatttaagttctcgagccatttggatgttatacattcccagctattttatatttttacagatatcatggatcaacattagtgtcagccagtctatcagggtgagtaaatcatactccataacatcaatatttccttctgttagtccttaaatctatcaaataatattcatactagttacgaggtaattctataatcctaagtagatgctttcttctcttggtatatttagaataacttgctaattcctgcattgtttacagtcttcctgctcttcaccaaaagtttgatctgccagctccttttgttctgcacacagattgccctcactactggcgcttccatcttcctggtactcttgttgcagcatttttttaatttgtggggttgggggcttttattatcaccgcatgatattacactaatgaaatgattttactgtgatatagatgagacagaagaagaatttgcaactagacttgccaccaacctggagaatcttattctcaaagaaggaccagaaacagtgaggaatttttccttctgccatcagaaaataccatatcctatattttgttgaatatttctctgatgcatttcatatcctttttattttcagattgctgctttcattgctgaacctgtgatgggtgctggcggtgttatccctcctccaaagacatactttgagaaggtaaccagaatcacatgttagccccacagtccatacaaccttgatgcattttctgaattcaagaaacgtttattgcatgttgattgttgaacatattacatccatcatatcctcagttcagtttgtagtatttgccagatttttagctgactactgaagagaagttatttattctatgtccttaggattatattatttcaattaaacttggatgtaaaacagagaccttctgtgtttatcatttcccggtcagcccatgcactgttctgggaatgcataaaaaatgcattgatatttagatagaattttgttactataccgtctctaagatttcttacattttaaacaacttccaacacttacgtaaaaaacaagttgcaacaagaaggtagccctgattttcttttatgtagcttcattattattttcatggtgctgatgccaattatttgttctttccacataaaatatttagattattgtgctgcctctaataattttctgtgggtttgttctctaccaacagattcaagcagtcctcaagaagtatgacatcttattaatagcagatgaggtactcgaaagtttctctattagaaagaaagtctgaatggtagaatatttactttatgggaaaattagtacatcatcatccatttgtaggtcattacagcatttggtagattgggaaccatgtttggatgtgatatgtatgacattaaaccagatcttgtctcaatagccaaggtgagttcaggcttcaataacagcagagtgcttatctgataagacaagaactctcctctctcttttatttgtttgatgaaactgatagagattcgtttttctcatttcttttctcccatcaggctctatcttctgcctacatgccaattggagctattcttgttagtccggaaataacagatgtaatttattcacagagcaacaagctcggtaaagacaattccatgggatgaatttattttttgtgttgcttctgaattgacaagcaaaatcctgtttgttacaggttcttttgctcatggatttacatactcggggcatccagtttcctgtgctgtcgccatagaagcattgaagatttataagtaaaacacacttttcataataacacaaaatattaatattatgctgatgtgattgtctgatgaatccttcctaatttctattagagaaaggaatatcatcgaacatgttcagaaaattgccccaaggttccaggagggaatcaaggccttctctggaagtccaattgtaggcgaggtattatcatgtctaagtttcttgtaattttgtgagatttcaaagtcggatggatatttcttgttcaaacacataactgtctgctcctctacgcagatacgtggtttaggactgatacttgggactgaatttgtcgacaacaagtctccgaatgatccat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|
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