Os08g0223700

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Structured Information

Gene Name	Os08g0223700
Description	Zinc finger, LSD1-type domain containing protein
Version	NM_001067807.2 GI:297608172 GeneID:4344965
Length	21509 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os08g0223700, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 8
Location	Chromosome 8:7487658..7509166
Sequence Coding Region	7487658..7488266,7489359..7489424,7489558..7489731,7489820..7489950,7490073..7490149 ,7490328..7490411,7493232..7493428,7493536..7493613,7495160..7495292 ,7496957..7497017,7497208..7497289,7497490..7497618,7497857..7498000 ,7498449..7498551,7498732..7498860,7499292..7499390,7499474..7499832 ,7500496..7500576,7500983..7501053,7501712..7501805,7503039..7503136 ,7503553..7503688,7503776..7503882,7504320..7504407,7504518..7504635 ,7505353..7505382,7505585..7505673,7505972..7506049,7506184..7506302 ,7507163..7507216,7507607..7507709,7508480..7508608,7508692..7508800 ,7509135..7509166
Expression	GEO Profiles:Os08g0223700
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008401:7487658..7509166 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008401:7487658..7509166 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atggccggcggcggcggcggcggcggctccccctcgccggtagccgcctcggcggcccccgtgcaggtgcgctgcgccggatgccgcggcgtcctcgccgtggcccccggcatgaccgagttcatctgccccaagtgccgcatggcgcagcgcctcccccccgagctcatgcccccttccccgcccaaggcctcccctactccgccgcctcagccacagcctcatcctcagcttcagccgccgcctcctcctgctcctctccctcccccttcccgccgctccgcgccgcgagcgcagggcgtggaccccacgaagatccagctgccgtgcgcgcgctgcaaggccatcctcaatgtgccccatggcctcgctcgcttccgctgcccccagtgcgacgtcgacctcgccgtagacctctccaaactccgcaatttcctcgccacggccggtccaggcttcgcccctccgcttccgcttccgccgccgccaccaccgccgatgccgcccatcccgctgccgcacatgcccttcctcccgatgatgccacatgttccggtgccgatgccgccgatggcatcgcccgctgaattgcccgaggagattaatgaggttgcagttgatgttgagcgtgaggaagatgaaggtggtactgtcggggaaacttttatggattacaggcctcccaagctatctcttggtcttcctcatccagaccctgtggtagaaacttcatctttgtctgcagtgcaacctcctgaacctacatatgacttgactattatggatgaattggatgagaccaaggtgttatcttgcttacaaattgaaacgatagtgtatgcttctcagaggcacctttatcatctgcctactggtgctagagcaggtttctttattggcgatggagctggtgttggtaaaggccgaacgattgctggattgatctgggaaaattggaaacagggaaggcataaggcattgtggatttccattggttcagatctgaaatatgatgctcgcagagatttggatgatgttggtgcaaaatatgtggaaggccctgcttgggggagcttttggcagctgcagcttctgccagaatctcaagctcccccaaacagtccagattcttactcagatttgcatgctttaaataagctaccatattctaagatagactctaaggccgttggaatcacaactggagttatttttgtaacttatagcagcttgatagcatcctctgagaaaggccgttcccgtttgcagcaattgatagagtggtgtgggtctgagttcgatggtcttctggtgtttgatgaggtaaagaagactctgtgccacaaagcaaaaaatctgattcctgaggcagggagccagcccactcgaactggtaaagcagttcttgagatccaggaaatgttacctgaagctcgggtggtttactgctcagcaactggtgcatcagagcctcgaaatctgggttatatggttcgccttggtctctggggagatggaacatcatttcagaattttcagaaatttctaggtgctcttgagaaaggtggtgtgggtgctcttgaacttgttgctatggacatgaaagccaggggtatgtatgtttgcagaacgctaagttataagggtgctgcttttgctaccgtggaagctcctctagaggaaagaatgatgaatatgtataggaaagcagctgaattttgggccgagttgcgtgttgaactcctttcagcaattgaatattatgcagaagacaagggcaattcatctcagatttggcggttatactgggccagccatcagcgtttctttaggcatatgtgtatgtcggctaaagtacctgctgttgtgagattagtgaaagaagccttagcagaagaaaaatgtgtggtgattggtcttcaaagcactggagaagctcgaacagaggaagctatcagtaaatatggtgttgaaatggaagactttgtttctggtccaagggagttgcttcttaagctggtagatgacaattatcctttgcctccgaaacctgattgctttcaacaaggtgatgaaaaagttgcagaggttcagcgtaagcggcactatggacctgatgtatgctttaaaggacaagctaggaaactcgcaaaaatggaagatgaaagtgatgatggaactgatgaatattctctacctccaactaacgagttctcgcgactgcaccaacagcgaggactgcaacgcagcctaatctcccagtacacagtcgcaactcacaagcagcatcgcatcgttaattcatggattgatatcctcggcaaggaagaactccctgaggtcgccaaggactcgagcgtgacatcgggcaggtcccgcgtgttgagccgcgacgcgagtaggggctcacggaggagacagagaagctgcagcacaatggcggggtgcgatgtggcagcggacgcagtgaggaaggagttgagcatcagcggcgacggcggattggagagtgttgatgggaaggacaacaagcagcgagtgagggatccgacgctgctcgtcgatcgggctggctcggcgacggggagacgcgggggcggcggacttactctcatcggcaaggcggacccaggggatgggcttggcaacgatgatggatggttatcattcgagaaattctcttctagtattcacattttgatgcaatggggtttacctatcactagcatgagtatgcagagtcagaccatgaatcaacagagtctgaagaggaattcaatatgtgtcagatctgcaacactgaggaggtatgacactgcagtggaaagaaagtcgaatattttgcagattattcgttccttggatttgcctaacaatcctctagatgatatcattgatcagctaggtggtccttacaatgttgcagaaataactggacgtcgtggtatgctagtaagagcatcagatggaaaaggtgttgtttatcaaacacggaacaagaaagaagtagcattggatatgattaatattcatgaaaagcagcagttcatggatggagaaaagcttgttgcaataatatcagaagcaggatcagctggtgtttctctacatgctgatcgaagggcgaaaaatcagaggagaagagtacacataacacttgaacttccttggagtgcagaccgtgcaattcagcagtttgggagaacccatcgttccaatcaaaattctgcacctgaatatagagctggaccatcacttagtgctttcaactatgacagcacttatggaaagaaagccttgatgatgatgtacagaggaatactggaacaggatggtcttccagttttgccttcaggatgttctgaggatcaagctagcctccaaggattcatcactaaagcaaaagctgctttggtgtcagttggaattatcagggatgcgctaatgtgcaatggaaaaaatggaggaaagcttactgtcattcagaatgcacgaagtgaaggacagcttgattccggtattgttgacatcaaagcaaaaagtgttaaaatgaaagaatcaccgaagactgttcatgttgatagcttgtctggtgcttctacagtgttatttactttcacaatcgaccgtggatttacttgggagtcggcaaatgcaatacttgaagaaaggcagaaagatggagctggttattcagatgttggattttatgaatccagaagagaatggatgggtcgaaggcattacatgctagcatttgaaggctcaacagaaggaatgtacagagtaatccgtcctgctgttggagaagctttaagggaaatgcctttggttgaacttaaaagcaagtacaggaaggtttcatcaattgacaaaattggcaatggttggcaggaagagtatgatgcatcatccaagcagtgtatgcatggacccaaatgcaaacttggaagctattgtacagtaggcagaaggttacaggaaatcaatattttgggtggtctaatacttcctgtctggggcatagtagaaaaggccctagctaagcaggttcgacaaattcacaagaggatacgtgtcgctcgcttggagacaaatgataatgagcggattgttggacttatgattccaaattcagctgtggaatcagtattagaaggtctgcaatgggtgcaggatattgacgattga</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MAGGGGGGGSPSPVAASAAPVQVRCAGCRGVLAVAPGMTEFICP KCRMAQRLPPELMPPSPPKASPTPPPQPQPHPQLQPPPPPAPLPPPSRRSAPRAQGVD PTKIQLPCARCKAILNVPHGLARFRCPQCDVDLAVDLSKLRNFLATAGPGFAPPLPLP PPPPPPMPPIPLPHMPFLPMMPHVPVPMPPMASPAELPEEINEVAVDVEREEDEGGTV GETFMDYRPPKLSLGLPHPDPVVETSSLSAVQPPEPTYDLTIMDELDETKVLSCLQIE TIVYASQRHLYHLPTGARAGFFIGDGAGVGKGRTIAGLIWENWKQGRHKALWISIGSD LKYDARRDLDDVGAKYVEGPAWGSFWQLQLLPESQAPPNSPDSYSDLHALNKLPYSKI DSKAVGITTGVIFVTYSSLIASSEKGRSRLQQLIEWCGSEFDGLLVFDEVKKTLCHKA KNLIPEAGSQPTRTGKAVLEIQEMLPEARVVYCSATGASEPRNLGYMVRLGLWGDGTS FQNFQKFLGALEKGGVGALELVAMDMKARGMYVCRTLSYKGAAFATVEAPLEERMMNM YRKAAEFWAELRVELLSAIEYYAEDKGNSSQIWRLYWASHQRFFRHMCMSAKVPAVVR LVKEALAEEKCVVIGLQSTGEARTEEAISKYGVEMEDFVSGPRELLLKLVDDNYPLPP KPDCFQQGDEKVAEVQRKRHYGPDVCFKGQARKLAKMEDESDDGTDEYSLPPTNEFSR LHQQRGLQRSLISQYTVATHKQHRIVNSWIDILGKEELPEVAKDSSVTSGRSRVLSRD ASRGSRRRQRSCSTMAGCDVAADAVRKELSISGDGGLESVDGKDNKQRVRDPTLLVDR AGSATGRRGGGGLTLIGKADPGDGLGNDDGWLSFEKFSSSIHILMQWGLPITSMSMQS QTMNQQSLKRNSICVRSATLRRYDTAVERKSNILQIIRSLDLPNNPLDDIIDQLGGPY NVAEITGRRGMLVRASDGKGVVYQTRNKKEVALDMINIHEKQQFMDGEKLVAIISEAG SAGVSLHADRRAKNQRRRVHITLELPWSADRAIQQFGRTHRSNQNSAPEYRAGPSLSA FNYDSTYGKKALMMMYRGILEQDGLPVLPSGCSEDQASLQGFITKAKAALVSVGIIRD ALMCNGKNGGKLTVIQNARSEGQLDSGIVDIKAKSVKMKESPKTVHVDSLSGASTVLF TFTIDRGFTWESANAILEERQKDGAGYSDVGFYESRREWMGRRHYMLAFEGSTEGMYR VIRPAVGEALREMPLVELKSKYRKVSSIDKIGNGWQEEYDASSKQCMHGPKCKLGSYC TVGRRLQEINILGGLILPVWGIVEKALAKQVRQIHKRIRVARLETNDNERIVGLMIPN SAVESVLEGLQWVQDIDD</aaseq>
Gene 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External Link(s)	NCBI Gene:Os08g0223700, RefSeq:Os08g0223700