Os08g0245800

From RiceWiki
Revision as of 20:46, 22 July 2012 by 124.16.129.48 (talk)
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

Os08g0245800

Description

Conserved hypothetical protein

Version

NM_001188536.1 GI:297726202 GeneID:9266465

Length

8385 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os08g0245800, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 8

Location

Chromosome 8:8897864..8906248

Sequence Coding Region

8897864..8898007,8899188..8899431,8902493..8902566,8903381..8904174,8906197..8906248

Expression

GEO Profiles:Os08g0245800

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008401:8897864..8906248 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008401:8897864..8906248 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggcctataaagctagcccggtgaaggggatggagatgcgacacatccaagaaaattgtaccatctcgaaaggtcggttgatacggaggtgggcagctgaaggttttattgatgaaagagatgaaggtagcatctgggaaacaggggagagttattttaacgagcttaccatcaggcaattgattatgcgggagtttattgaggacaagactagcaacaatattgatctggaagatggtagtggattcgcagtgggctgcaaagttcatggtctggttcatgatttcattgtgtccttgtccagtcgagagaatatggtcacatctgatgcagagctaggatccatgcagcgtggtgtcattcggcgtctaaccataaaaaacgacttcagcagtatcccaaaagacagcacccagccgtcaggctcaggcaccatggatgtacaatccataaacagagcacttgcttccgctcaaaaagggaaaattagatcacttgcttttctcgggaattcgaggcttctctctgacgtcgttggattcaagcttttgagggtgttggatctggaagattgtaagagcttgggaaacgagcatgtccaaaagatccggagtttgtttctactgagatacctgggccttagagggaccggtgtcaccgagctccaagaagacattggagaactccatgagttgcagaccatagatgtgaggagaacccgcgtgaaacagttgcctgtatccgtgaatgagctaaagaaattggtgttcctcctgggagatggtttgcaagcacaggctggtatgacggctatgcaaaacctggaggaagtatcgacgatcgataaaaaaagttctatacccatgcatgcacaccgggatgcaccggttagccctccaatttgttcactccatggacggtgtttggatgacgggtggctcaggctacggttctggggtgcagccatgccgcgcctccgaaggctcaggctttacttgagggcgaatggacttcggcttcacggcaactatttcggaatgcgcgacttccgttccctcacgcgagtccatgtcaccgtcgactgtcgtgacgcgactgttgtggatgtggaggaagccgaggctgccatcacatcactagtgaaggataaccccaacgagcccagaaacaggaatggaggcggcggcgccagcatggctggcgccctcctcctgccacgtcggttcgcgtgcgccacggtgataggaggacggcgccagccactctggcgccccaaaaaggaccatttctgggataagtttttttag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAYKASPVKGMEMRHIQENCTISKGRLIRRWAAEGFIDERDEGS IWETGESYFNELTIRQLIMREFIEDKTSNNIDLEDGSGFAVGCKVHGLVHDFIVSLSS RENMVTSDAELGSMQRGVIRRLTIKNDFSSIPKDSTQPSGSGTMDVQSINRALASAQK GKIRSLAFLGNSRLLSDVVGFKLLRVLDLEDCKSLGNEHVQKIRSLFLLRYLGLRGTG VTELQEDIGELHELQTIDVRRTRVKQLPVSVNELKKLVFLLGDGLQAQAGMTAMQNLE EVSTIDKKSSIPMHAHRDAPVSPPICSLHGRCLDDGWLRLRFWGAAMPRLRRLRLYLR ANGLRLHGNYFGMRDFRSLTRVHVTVDCRDATVVDVEEAEAAITSLVKDNPNEPRNRN GGGGASMAGALLLPRRFACATVIGGRRQPLWRPKKDHFWDKFF</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>8242..8385#6818..7061#3683..3756#2075..2868#1..52#atggcctataaagctagcccggtgaaggggatggagatgcgacacatccaaggtactcctgccacggatgactttaattactccactcgaacctgtgtggcatcatgtaagagtgcgccattggtggcgtcgggcaacgcattcaagcgagctcgaccgcccaaattcaagttgatgggatctgaattcaaggcgaccctccccgctccttgacaacgccttctatggcccatgcccccaaatgccccccggctgatctccacgaatccccacgcctttcgaaacgtgcatctcatggaaaatgaggacaggatcacttggaaactaataaatcagaacaagtaaatggcagcgttggcctacaatgcacaattcctatgctcaagaaagtacaatttcaacgtcatcatctgaaaaccttgggcaccacgaaaatgcaagatcttcacatggttaatgattagacatgctctcaactaagggatagccaaacaactctctgtcccacctatgccaccgaacacaagagacggccctacaccttctagcggaatgtagatacataaggagagtatggggggcattagcagaatggataacatgtcatgacctaaaccccacccagtgggaatatgctacaatggtgtaggagtggtgggaggtaaccgcaaacatgagagaaatgccaaagcaagtagtccgcagcttaacattgctagtcaactgggagatttagaaggaaagaaatctgaagacctttcaatacaaggagttctcgatgattggactaatcgctaaaaacaaggagaaggccaaaacgtaggccctagtggggcctagaatgttagccgattggctgcctagttcctagccaaccttctggtcctaattgtacattctttcttgctcctttttctttccgtataatttcctcccgttctatccaattttgctcatcgattcatttaaaaaaaacaaaagtaagaacagatcaaaattgtactaaaatctccaacaaaatcactctgcaacttcacgccataatatttttttctctatgacactgtgaaagaaagggggattgataaactcatattcaaaatatgtgaaaatgaaataaaaaaggattgtgattcacatcaaaagatgcaagaaccaccctatgcattttttttattttactcaaactgttgatgtttctgcacaatttggtgcctagccagatttaaaaaggttgaattggatttttataccaatcctaccatttgtcgcattacagctgcattttgtatacaactataacaatcaacatgcatcgctataatttgaattcactacaatttcagtgacatgtgattcaagtccacttaatctgaatctactcaaaggataaaaagtgaccagaaagtgcagagatgaatagtgtccgttttatagtttatggattttttaccaaagtggcataatacttagattttaacaagtcagattgaatttgatgtaaaataattgttctgttcattcacaagaataattatatattgtggttgtgggagagcaatataattattcctatactgatactttcatcaattcattaggtacttcattgtaattgatgatatttggactacaacggcatggaaggctatcaaatgtgctttcgctgacaacaaaaatggaagcagaataataacaacggcgcaaatcgacaaagtatccagattatcttacaggcatcacactgatttggtcgttatgcttgggggtctcagtgaggaggagtagagaatattatttgacaacataatatcagccagtcaaagatatttgttgcctcattatcagttacatattggatttaatgcacataatgatatgctaggatgcacgcctttggccataaggattgcagctggtctgtcactgtcagcatatcctcctccttattcatatacttcagctttcaagcaatatcccctcttacaagggataaaaaggatgctgcacatcagttatgcttatctgtctttgccattgaagtcttgccttttgtacttgagtctctttccagaaaattgtaccatctcgaaaggtcggttgatacggaggtgggcagctgaaggttttattgatgaaagagatgaaggtagcatctgggaaacaggggagagttattttaacgagcttaccatcaggcaattgattatgcgggagtttattgaggacaagactagcaacaatattgatctggaagatggtagtggattcgcagtgggctgcaaagttcatggtctggttcatgatttcattgtgtccttgtccagtcgagagaatatggtcacatctgatgcagagctaggatccatgcagcgtggtgtcattcggcgtctaaccataaaaaacgacttcagcagtatcccaaaagacagcacccagccgtcaggctcaggcaccatggatgtacaatccataaacagagcacttgcttccgctcaaaaagggaaaattagatcacttgcttttctcgggaattcgaggcttctctctgacgtcgttggattcaagcttttgagggtgttggatctggaagattgtaagagcttgggaaacgagcatgtccaaaagatccggagtttgtttctactgagatacctgggccttagagggaccggtgtcaccgagctccaagaagacattggagaactccatgagttgcagaccatagatgtgaggagaacccgcgtgaaacagttgcctgtatccgtgaatgagctaaagaaattggtgttcctcctgggagatggtttgcaagcacaggctggtatgacggctatgcaaaacctggaggaagtatcgacgatcgatgtcagtgagagaagctcactcgacatggtctcagagctgctagttaagtcgaactaggaaggtagcccgcgcatacgagcgggcatgcaccgtacgtaggataaatttgagaaacttataaaggcggtataccagcgaattaatatctgcaatgttttaaaattatgtttttttcccatgaattttcttcgttagaattgcatgacgaatttaattgttatttataaaattatctattggagattaggattggtatcttacggtataaaaaatggtacctaagacatatgactcttgaggttccacagggaaagagagaaaacttaagttataaaagacattacatatacaaccatatataattaatggctctacccattttttagaaaaaaatgataattaatttattatttgacggcaaacattgattggtcatagctatggataattcctcataggaaattgtgattccatagtgaaagagaaaaaacttaagttataaaagacattacatacacaaaccatatataattaatggctctactgatttatatagaaaaattggtaattaatttattaaacataatatatgaccctcgagtttagaccattatttgtaaccattagatatgtagaagatctaacatattgtgtagagtccaactaagcaaattattcgtcttccctcaccatggatggtagacatgttaattcgtgtctccggcagcatgctcacatcatcatacttagaagaaaaaaaagtgcccttcatgtatatacatgtaactacctcatgcccctcttttcattaaagaaaaaaagttctatacccatgcatgcacaccgggatgcaccggttagccctccaatttgttcactccatggacggtatgttcctttgttctagtgattagataatttaataagtacaaataagtatttgaaatcaatttttattagtaaaatatccataaggactgatctgtagacaccctctgttcttcttcttttcttggtgtattagttggatttaagcaacgtgatataggtattttgggatataagttaatgtccaacttccaaaggattaaggtttcccaaccctcagcaccgaacacagcataagatcgtacatttatccttaaaagaagatcatatattttatcagggcattggaattaagtaaatagcatccacatatatgtcaagagatataattaagttggttgtgagtcaataggtccattgatgctataattaaggttaaggttagcggtttataagttattttgattttattaaaaaactaagttggatattttgatttgtaatgagaacttttaggattttttgcgtatggatgtgggtccaaaatataataattttattagcaattaaatatggttggtatagatattaaactattgatttaattaaaaaaaacacaatggttcaaacagatcataaattgaatatataatttaaaatttacagctattgaagattctttatttatttataaaacataccaagatcaatatgtatgagatatattatctatacctatatttgcaagtgtatgcaatctttgaaagtatgataaaattaacttactaatatagaagatattatatacccttaagccttaacttaattaccatcgaaaaaagggaggcgagcaaggaaaaaatcacacagactcttatcatgcgtatggatggaagcatgtatatgtgttgggcggactcgtaccgccagattgatcttaagttttttactaaagataaatctaatggtatctgatggtaaaaaaaatattaggtccatcagattaaataaaaccaatggttagatcttctcctttttccatagattttctaggaattaattagagcgttaggtgtcatctttgcactgtttcttggaatctcacgtggcagtttaggagctttttaggatgtttaatggacttttatataatagatagatatatctacgtgggtttgtgaaatttactccataatatatatttccatttttaatattttgtttttatttggttgcattgcaaagaaaaatagtatatattcaaagttaggaaagcgtttttcttatatatagatttgataggttcaccggtttaaaccatctatatacctaaatctaatggttttaatgtttgtttatatttgcttttcatgcaaagcacaatgttctatggtaaaatttagggaagtgtttcttttatatatagattaatgggttcaccggtttaaataatcgttaaaatatttttttagggacaatggttaaaatagttggttcaccgatcgatttaagtgaaaagcaaaggttagatgttttattataatattttttcatgttaaaattttcatctagaaataggaagagaaggattggaagaggggagaaagcatggcattgtattacgtacatacatacgtactgaggagagaaggggtgggttgtgggatttttttttataaagataaatataatagttgaaaatagtgagtctagcaatttattaaacaaatagcggatccaccgatttattagaacgccacgtagcggtttagaaacgttttgtaggatgccacatggtaattgaggagcgttcgtaggaagtttaatgaacttttagtatataatagaagatttttctttctaactaataaagcgtaaaaaatatgagaaggaagagttaatctaggaagagggtggtgtaataataataataatacatgaggtatattattattattttcatatatagtaggtagttgtatatgagatataagtacgtacgctgggtggggttaggtttgggtggttaactttttctataagataaatttaatggttgtaaataatgggtccatcaaatataatgaaatcaacggttatatattggagtggcatgtggcggcttaagagcgtttctaggatgccacgtggcgacttaggagtgttcatagaaagttttatggacttttagttaatatacagatctaataacgacgtaaaataatgtgtccatcgattctagtgaaaaccaatggttggacgtttctctaatttaagagtggcacacaacggttagaaacatttatatgatatttaatggattttaacgcgtttgatgtctatttgtgggggtattcttttctataaagataggttcaattttaattaggattggaaaaagaaaagaaaggaacaaacgaaaaaaaaaagtactaaacagatgcacgtactgcacagaggtggtggggccggtgggaggtttttggtttttaaaatagatctaacgatgtaaaataatgggtccaccgatttaaatgaaaatcgatggtcagatttctctattatattagagtgccacgtggcaatatgagagcgttttgagggagccacgtggcagcttgagagcgtttatagggagtttaatggacttttagtatataatagatataatagataaagatgggctgaggaagctgggattacagtggggtccaggagatggtgacagtaaaacatcctaaagttattatggaagtagtattgaaactttcattgacaacatcatcctcggcagaggtacacttaagtacctattcctttttgattgtccaattgctctacttgaaatactgctgttgcggtggggaggatataaaacacctgagttgagaattgtcttgcgtggtaacctcataagggtaccaggagaatttgtcgggatgagagaactcacccacctgcatatcagcgtttttgaggtgaacgaaagtgatttcgaagtcctcggaagaatgcctagtcttatcgttctcaatttgacttcggcgtcttccgcacaaaggatctgccacatagacatatatgatgatggatttcggagtctagaggtgttctggttcaggtgtttggatgacgggtggctcaggctacggttctggggtgcagccatgccgcgcctccgaaggctcaggctttacttgagggcgaatggacttcggcttcacggcaactatttcggaatgcgcgacttccgttccctcacgcgagtccatgtcaccgtcgactgtcgtgacgcgactgttgtggatgtggaggaagccgaggctgccatcacatcactagtgaaggataaccccaacgagcccgtactggagctcaccagaaaactggatttttcacattttggtccttttgaaaaacttatttcgcaaatagatccctacaaaaacttatcccaaaaatggtcctttttagggcgccagagtggctggcgccgtcgttcaacaggacggcgccagcctctttggcgccgtcccaccgccgacgtggcggggcgatgctgaggtggctagggggagtgcgccagagtggctggcgccccccccccccccgaaattttttatttttgttttatttgtttgatatttttttcacgcttagggacacacaagaaccaaccatagaaaaattgaactcaaatggacgtaatatgtgacatgtagaattttttctctcctctcttctctccgaactagtgcagaggagagagatgtgcaactttttaatttttattttatttttttgatatttttttcacacttaggaactcacaggaaccaaccacgtaaaaaataaactcaaacggacgaaatatgaaatatgtggcatgtggaattttccaaagctccaccgaaaaacttctctcctcgaaaacacaatcttgcaagcggaatttggaggttttaatatcgccgaacccggcaaagcgggggagaatcggatgtaacattttctgtagatgtccgtgcatatattatttgcctgattccgagtccgtatgagaaagttacgcctattttaatagatggcatattttgtccgtttcggtagagttttggaaaattctacatgtcacatattttgtccgtttgagtttattttttatacggttagttcctatgttctcctaagtgtgaaaaaaatatcaaaaaaatgaaataaaaataaaaaaattgcatctctatgtactgtttaacttatatatgttatttcatgtggttatattttgaattagattaagtaatttcatatagtggtagagtgcattatgtttagcatgctgatcaaagggttttactaaaggagttatggtctaattttagtgaaggtgcaaagtagactaagtggtatgctagatattttcagacttagctaagtggtagttcgagtttaaattttttttgtggttggttgtatcgtgatcctgagtgtaaaaaaacatccgaaaaaataaaataaaaatgacaccgttgcaactccatacagagaaacaggaatggaggcggcggcgccagcatggctggcgccctcctcctgccacgtcggttcgcgtgcgccacggtgataggaggacggcgccagccactctggcgccccaaaaaggaccatttctgggataagtttttttag</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os08g0245800, RefSeq:Os08g0245800