Os08g0295300
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Structured Information
| Gene Name |
Os08g0295300 |
|---|---|
| Description |
Similar to Threonyl-tRNA synthetase, cytoplasmic (EC 6.1.1.3) (Threonine--tRNA ligase) (ThrRS) |
| Version |
NM_001068010.1 GI:115475757 GeneID:4345200 |
| Length |
9581 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0295300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:11975902..11985482 |
| Sequence Coding Region |
11976088..11976183,11976397..11976468,11976718..11976789,11977796..11978017,11978096..11978188 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgctcgtctgcctccggcgacgaggcctctcgctcctccggcagcgcccgccccgccccttcccccctctcccgcgcccgcgcagcagcccaccccgcgtcgcctccctccgccccctctccgccgcggcgatgggggagaactccgccgccgccgccgggaaggggaaggaagcgaaggggaaggcgacgacctcggcctcggcctcggcaccgaacgtcgagcccgacgtggcctaccttgaggcggtgacgcagaagcggatccggcagttcgaggagatccaggccaagcaggccctcgagcgcctcaacatcggaggcgagcccatcaggataactttgccagatggtgcagtcaaggacggaaagaaatggatctcaacccctatggatattgctaaggagatatcaagtggattagcaaatagctgcttgatagctcaagtgaatggaacactgtgggatatgacgaggccactggaaggtgattgtgaattgaagttgttcaagtttgatagcaatgaagggcgtgacaccttctggcactcaagtgctcatattcttggagaatctcttgagagggcatatggctgcaagctgtgtattgggccatgtactacaagaggggagggtttctattatgatgcctactacaatgatctgacattgaatgagacacattttggtatcattgatgcccaagcacagaaagctgttgcggaaaaacaaccatttgaacgaattgaggtctccagggcagaggcccttgaaatgttcgcagaaaataaatttaaggttgaaatcattaatgagttgcctgaagacaagaccattacagtatacagatgtggtcctctagttgacctttgccgtgggccacacatccccaatacttcctttgttaaagcttttgcttgtcttaaggcatcatcgtcgtattggagagggaaagcagatcgagagagcctgcagagagtatatggaatttcttttcctgattctaaacgtctcaaggaatataaacatctgctagaagaggctaagaagcgtgatcataggctattaggacagacccaggatctcttctttttccatcaacttagtccaggaagctgcttcttccttccacatggtgctataatatacaacaaattgatggattttttgcgacagcaatacagagatagaggatatcaagaggttttgagcccaaatatttacaatatgcaactctgggaaacctctggacatgctgcaaactacaaggagaatatgtttgtttttgagattgagaaacaggaatttggtctcaagccaatgaattgtcctggccattgcctaatgtttgagcacagggttcgttcatacagagaattgcctctccggatggctgattttggagtccttcacaggaatgagcttagtggtgcacttacaggtttgacacgtgttagaagattccagcaggatgatgcccatattttttgcagagaaagccaaatcaaggacgaagttaaggctgttttggacttcatcaattatgtttacgagatatttggatttaaatatgaattggagctatcaacgagaccagaaaagtacttaggtgatattgaaacctggaacaaagcagagcaacagctgacagaagccttaaatgagtttggaaagccatggcagatcaatgaaggtgatggtgccttctatggtccaaaaattgatattggtgtgtttgatgccctcaagaggaaatttcagtgtgcaactctacagctcgattttcagctgcccctacgcttcaagctgacttactctgcagaggatgaagccaaacttgagaggcctgtgatgattcacagggcaatcctaggttctgttgaaaggatgtttgctattcttttggagcattacaatggtaaatggcccttgtggttgagtcctcgccaagccattgtttgctccatatcttccaattcagtggaatacgctaaacaggtccgtgctaggatacatgaagctggttttcatgtagccatcgatgagacagacaggacaatacagaagaaggtacgggaggctcaattagcccaattcaactacattcttgtcgttggtgcacaagaagcagagactggacaggtcagcgtcagggtaagggacaaagctgaactagccacagtgagcattgatgacatcatcacacgttttaaggaggaagtagcagcttacaaatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MLVCLRRRGLSLLRQRPPRPFPPLPRPRSSPPRVASLRPLSAAA MGENSAAAAGKGKEAKGKATTSASASAPNVEPDVAYLEAVTQKRIRQFEEIQAKQALE RLNIGGEPIRITLPDGAVKDGKKWISTPMDIAKEISSGLANSCLIAQVNGTLWDMTRP LEGDCELKLFKFDSNEGRDTFWHSSAHILGESLERAYGCKLCIGPCTTRGEGFYYDAY YNDLTLNETHFGIIDAQAQKAVAEKQPFERIEVSRAEALEMFAENKFKVEIINELPED KTITVYRCGPLVDLCRGPHIPNTSFVKAFACLKASSSYWRGKADRESLQRVYGISFPD SKRLKEYKHLLEEAKKRDHRLLGQTQDLFFFHQLSPGSCFFLPHGAIIYNKLMDFLRQ QYRDRGYQEVLSPNIYNMQLWETSGHAANYKENMFVFEIEKQEFGLKPMNCPGHCLMF EHRVRSYRELPLRMADFGVLHRNELSGALTGLTRVRRFQQDDAHIFCRESQIKDEVKA VLDFINYVYEIFGFKYELELSTRPEKYLGDIETWNKAEQQLTEALNEFGKPWQINEGD GAFYGPKIDIGVFDALKRKFQCATLQLDFQLPLRFKLTYSAEDEAKLERPVMIHRAIL GSVERMFAILLEHYNGKWPLWLSPRQAIVCSISSNSVEYAKQVRARIHEAGFHVAIDE TDRTIQKKVREAQLAQFNYILVVGAQEAETGQVSVRVRDKAELATVSIDDIITRFKEE VAAYK</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>9300..9395#9015..9086#8694..8765#7466..7687#7295..7387#6635..6727#5604..5690#5246..5278#5051..5145#3562..3646#3372..3458#3161..3257#2979..3067#2390..2479#2180..2307#1779..1854#1479..1568#1328..1387#925..1162#50..384#ctatctaccctaatccatccgccgccgccgccgccgccgccgccactttatgctcgtctgcctccggcgacgaggcctctcgctcctccggcagcgcccgccccgccccttcccccctctcccgcgcccgcgcagcagcccaccccgcgtcgcctccctccgccccctctccgccgcggcgatgggggagaactccgccgccgccgccgggaaggggaaggaagcgaaggggaaggcgacgacctcggcctcggcctcggcaccgaacgtcgagcccgacgtggcctaccttgaggcggtgacgcagaagcggatccggcagttcgaggagatccaggccaagcaggccctcgagcgcctcaacatcggaggcgagcccatcaggtgagccccgttctgcgattcgttgtgaatttgatgtagttaagaaactgggagggctttgattcggaaaccgtaatgcttgcggcgcgttatagatgaaaatggagttagatactacatggatggcagatgtctcaggcattgagatgtagatataggcatatagcacaccaagggaatatcctcgatagccatgctttgtgctgcataatttggagtcggattttgagtgttgggaatatttgaatgtcgatgcgacgacaaaatgggcgctgcgcaaactgcataataatgccataatgttattcaactttaacatccatctgtctttaataagaaaatagagacggcaagcatttcttctgcctaaatattctaatatagaaaacccttgattatatggtgcttaggtttccttttctcaatgtacctttgctagttacaatacaaatgtggcacactgtgacctgcaatgtgcagcacaatggcaatggcaattaattcttctcatgtgatttttttccctgcaactttcttcaggataactttgccagatggtgcagtcaaggacggaaagaaatggatctcaacccctatggatattgctaaggagatatcaagtggattagcaaatagctgcttgatagctcaagtgaatggaacactgtgggatatgacgaggccactggaaggtgattgtgaattgaagttgttcaagtttgatagcaatgaagggcgtgacaccttctggcactcaagtgctcatattcttggagaagtgagttaaagcttcataatttccttgtatcatgtttttttctttaagcaagttgtatggttgtctctttttcttttttgtttacacatcgagtgattttgcatgtctctctgctataagtccttttgaattcagtattttctaattgaagatgcacttttgcagtctcttgagagggcatatggctgcaagctgtgtattgggccatgtactacaagaggggaggtattgaattaatcaaaaatcgtgttcagtgcaagaaagataataagccctcttagtgattaacataatgtttctacttttacctgttaagggtttctattatgatgcctactacaatgatctgacattgaatgagacacattttggtatcattgatgcccaagcacagaaagctgttgcggtatgctcttattttgaactcattttaaagtttgtgtttacccttttttgtggacgctacttagcagttttactctttgacttatttgatattaatctgtcatgaagtgtgatatcgttattggattccatgattatgccatgttttctttgtaacgtaattggaatcatctatctgctaactcttggtttttaacccaacatggtgcaggaaaaacaaccatttgaacgaattgaggtctccagggcagaggcccttgaaatgttcgcagaaaataaatttaaggcaaaattcctgatttatgcttgttcttgatcttttcttgtactctaacagtcccattgtttcgcttattcatatgcttatccgaattgcttattaacaaacaaaaaaaatcatttgtgactaaaacgactcaaaagaaaatgctgtaaaataaactataatgaaagaaacaagaaaaaaattaaattaaattaagttctaaatttcaaaacttgacttataagcataagcataagcgaattaatgaggccctaaatatctatttctgcttatatcacatttgagattttattaaattttttatttgtttgaattgtgtttctaggttgaaatcattaatgagttgcctgaagacaagaccattacagtatacagatgtggtcctctagttgacctttgccgtgggccacacatccccaatacttcctttgttaaagcttttgcttgtcttaaggtaattctttggttgtcttaagcttttgcttgccaatatttttatggaactatccaatttgtacttgcatgtaaatatgtaggcatcatcgtcgtattggagagggaaagcagatcgagagagcctgcagagagtatatggaatttcttttcctgattctaaacgtctcaaggtatagcatatgattttggctattgttcagatatgggcgttcattaattaatgtggagtctgtttttgtgctatcatgtctgtgctactggacacaataatgtaccctctatgtttgcattttagacactagagtattaatatttcattgtgataagattggagttgatttggcaggaagtttagcgtgcactacatggcatgtaaattgcacaaaatatacaactatatctcaaaagtgtatctatgggctctgtgctttggtggaggttggggttgatttgcccaactgaacaacaattgtcattacagaagtatatggtttctttttattagtcagttattacgaatttcttcaattaatacatggttaggttcagacagtgcaacccttgtcagctattttacaagttactaattcctaagttcttttttatccatttgttttatcactggtacactatggttttcatatatgtttcctgctcaataatccataggaatataaacatctgctagaagaggctaagaagcgtgatcataggctattaggacagacccaggatctcttctttttccatcaacttaggtaactcaaggttttcggtttgactttttcatatcttaatttaccttggcttctattctgcctcaggatgtttgattcactttgactgtgcagtccaggaagctgcttcttccttccacatggtgctataatatacaacaaattgatggattttttgcgacagcaatacagagatagaggatatcaagaggtgggcattaatttgattggctggtcaatcttttgttcagattatgattagattactagatcatgggcatgcatttccactgtttctctctgttcatgatgtctgtattttcaggttttgagcccaaatatttacaatatgcaactctgggaaacctctggacatgctgcaaactacaaggagaatatgtttgtttttgaggtaagtctagtgtgcagaggatttgctctgtacatattatagattacattttggatgaattacgatctttattactgggtgcttgttggtcttattcttgcagattgagaaacaggaatttggtctcaagccaatgaattgtcctggccattgcctaatgtttgagcacagggttcgttcatacagaggtaaatctccttcataatggcatagttgtatcacaaaatgtatctcttttatcaagtgaaaattcctgctgtcaaagtaatcgcttcaaccttctgcctgtatgaactgtttttcttctatgatttaattctccctctatttctttgatattgtgcatgcacatttattatctagtggcttgtgctttctcattaaaattttcataaactgaaaatgtaggcagcaaaaacagttccttagttgtctggcaattaaactaggggtgggcataattaaccgtgacgaagaactgaacccgaaatgacccaaactggaatccagtaaaaatatcgggcttcagctctcaataactgaatttagtcctgttattttggttattaggctcgggtaattgagaaatcgaaacatatcaataagccttgtccagttcagcccaagagagaaaaccctaacttcccctcacctccccactcttaactccccagtccccacttctcctaccactaccccgactcctcccacacacggcaaacgctgctgttgccgccccgccctggctcccgcctgtgcccccacagcatgctgctgtctctgcaacactctgcctccgttgccgcaattccacgccatcaacagtggggaccaccttcaccagagatctcaaggaggctctcggtgctctgccacgccggagagctcaaggcggcggttgctggggaacactggtgtcgccaccgttgtgaacatgcggttccctgcccatggtcccctgatggcagcggattggtggacacgtctatgcccgctggctacatctcgtgctctttgctccaaattgtgttgatttgaacttcatctatgtagggtattgtgcatagatctaatttgtgttgatttctgttgattctgtggctgattttgggattatatgagttgattctgtggctgatttgagtattctatgatttctttttggatgtgtaaaacagcagttgtaatatcttggttagtttggtcacaaccggagaccgaactgaactagccgaaaccgaattcgtcagtattcatttttttttccaatgtgtttcggtctctattttcagatgaccgaacttttcaaaac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|
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