Os08g0320000
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Structured Information
| Gene Name |
Os08g0320000 |
|---|---|
| Description |
Aminoacyl-tRNA synthetase, class Ib domain containing protein |
| Version |
NM_001188588.1 GI:297726306 GeneID:9271247 |
| Length |
5506 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0320000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:14007944..14013449 |
| Sequence Coding Region |
14011885..14012057,14012249..14012354,14012605..14012664,14013103..14013123 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:14007944..14013449 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atttattcatggcttaatttattgcaggctcaggtaaatttgaagataaaacaagcattttgccctcccaacgtggttgatgggaacccatgcttggagtacatcaagtatattgttttcccttggtttgaaatgtttgaggtggttcggaaggaagcaaatggcggtaacaagacatttacaaacatggatgaactcatcgatgattataagactggtgctttgcatcctgctgatgttaagccagctctagcaaaagcaataaaccaaatattgcagcctattcgtgaccacttcaataacaacagtgaagcaaagattctgcttaacactgttaagaagtacagagtaaccaactaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>IYSWLNLLQAQVNLKIKQAFCPPNVVDGNPCLEYIKYIVFPWFE MFEVVRKEANGGNKTFTNMDELIDDYKTGALHPADVKPALAKAINQILQPIRDHFNNN SEAKILLNTVKKYRVTN</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>3942..4114#4306..4411#4662..4721#5160..5180#gcccgccgcctcgcacatactacaggaaggaaggacacagccagcccacgcaggcccgccgccgccgccgacatggacccttcggcgccgtccggtagctccgccgacgcctcggcgtcctcctcttcttccgccgtagaggacctcgccccgggcatggcggccatgagcctccaagaccggttcgagttgctgcggggcatcggcgaggagtgtatccaggaggacgagctcatgaatctgctgcagaaaaagcccgtccccatctgctacgacggatttgagccctccggccgcatgcacattgcccaggttcggtgaatccgccgcctctcccccctttagatcgatctaattcccaggctcggtttgtggttgctgccctgtgcttatccttttttaaattgctgtgcaaactaaaacttacaatctttctttgtttgttttgccgatcgaattgttttaaaatatgttatctaaccctcataattccctcaattgttttatattttcaaactgtaataatattaccctttgtaacaccaaactaaaggaaaaatcagtttgccagacaccaaaatttgtaaagctattgggattatctgaatccaccgcgtagccaaacggaggctcaaggtctcaactatctgtgttgctacttatgttgcaacttgaactgaaatagttataagtttcttgtagaagaaatcgaatttcgcatcggctgcctagagactagagttcaattcatcatgggggaaattaaaaagtaccagcataaatttatcaggacaggtgaaatatagaatttttcttccaaagtttcaatcttcaatgcaattttttgaagggatatgcacatttgtactttgtagggtattattatcatcaaaatgtgctcctatgtggctaccgagttcatttagggtaaagtccatttttaggcctcaaacttccatcaaagttcatctttcaccttgaactataaaacagcctaaacttttgaaaccagacaaacttctcccatgattgtttttagttgtggttttatccatgttgagaatcacattgctatgctatattggttgctagcacggcattgcttcacatatcatatgctttatatccttcttccttgcatctccttctcttatcactacattgtgtgaggattgaagatttgggggggggggggggggggggtggatttccccgggaaatgtttggcatgttgagtcactataatattagcaactagaatagtttaacatatttttgttgttttagatgtggtaaaaaacaccattaaaatattagtcttgggacttgacccggtttttaaggtttggggttgaaaaatatatgggttcgtagttgaggttgaaaataggaatttagtgaaagttcaagggataaaaatggattttacctgataatttatgtggtacatgatgtttttctctggaatgctacttactgagaagttaacttggtctctacataaagattcaatggaattaccatgatttcacctagctggggagtggagatttgcactaatatgcttgctttaagttctctgtgcaaataaatttgaaatttgggttggatgtacctatagacctataaagtttgctttattcactgtatggaccagatgggtgaaactaagtttggtgcatatgttaatctgatatatgctagacggtgcgtgcattggtttggatagtaaacaactatgatggtgatatttttctaagaaccacgaccagagaagaagaatactctagttcactgttcctatactttgaggtttattcttgttccacaaattgaaaacatgctgcattacctcatctttggctacaacattcactacatgagcttgttgtgttcttcctcttctgccatgactcattgtgggctgttttttttagtgatgcatgaagcttagatgtgcaaaagttttaggcttacaatatttgaacaaatgattgttttgattgatcatcttgtatattgtcagggcattgtgaagacaatcaatgttaacaagatggtcagggctggatgcaaagtaaaaatttggatagcagactggtttgctcagctcaacaataagatggggggtgatctaaaaaaaatccagactgttggacggtacatgattgagatttggagagcagctggtatgaatcttgatggtgtggaattcttgtggtcctcagaagaaatcaataatcgtgcaaatgaatattggccacttgtaatggacattgcctgtaaaaataatgtcaaaagaataatgaggtaaccacatttggattgcatatgttcgtctaatggcttcttcacttccaaagcctgaagtgtaactgcaattttataacttgcaagtgagtatatatttttggctcacagatgttgtcagattatgggtcgaaatgattcggatgagttgacagctgcccaaatattctatccttgtatgcagtgtgctgatatatttttcttgaaggttagtaaatttatgctattgcacaccatgccttttgagaagtaccttgagtcacagtgtaaagagagcgtgtgtacatgaatctgtaatccagaatttcatataggcatgaagcttattctaattatcccttccttttgtaggcagacatttgccagttgggcatggaccaaaggaaggtcaatgtgctagccagggagtactgtaccgacatcaaaaggaaaaacaaaccgattattttgtcacatcgtatcctaatctgcccttgcatgttgattaaacctttatcttctgtaattaaacagcgcgggacacttttcttttggtctgtcaaattaattgggatgctaagccttctttctgaaaaaaaaaaaacattgtcaaaaattgtattactcccttaacgtgaattgcagacatgctccctggttttaaggagggccaggaaaagatgtcaaagagtgatccatcctcagccatttttatggaagatgacgaggttttcctgttattcaagtatcaatttctataacttctgaaccttgtgacacccactattgtaatataaaagaacatatttattacgcggtatgcctttcataacacaagtttaggcagcaagggctgtccaatagtagtgtatccttctgttttcagtgttggataactgctgaaagttcactaacttggatgaaagaaagtactaactgataagtgagataggaacaactaaaggtgaccccattgactatgctttgtgaaaaaaaaaaaactgtgcctttactcgggaccatcccaatctttgggcaagctagacccttcctaagaaatagtggaatgttttaagggtatttacctaggagaggtcatcatctaagtgctataattttatgttttttctggtgattttactttggttttagtttcctgatgcgggttgatagacacctatgttgttttgaatggctactatggcaaccttacatgctgatttgcagtttttcttttccttttgcttattctagtggataaataaaattctcatttactccctccttcccaaattgatcatcatatagtggaactcaaaatttctcaaattgatcatcatataaccgcatggacacggatttcatcataatacaattagtgcagcatgggagaatgtgagcatgctaatgtgtaattggcatggtgttttaatcgatgcatgtattgtgggagaatgtgtgcatgatgtcctgattgatgtgatttaaattatccttggtcttggtgtataaacatatatgatgatcaatttaggaagatgggagtatgtttctacaatttgctaattcttttctttttggtcttctatagcagcttctgttatgtacttgtaatcagagcatgtattcatcactacccaaactagttctaaatttattcatggcttaatttattgcaggctcaggtaaatttgaagataaaacaagcattttgccctcccaacgtggttgatgggaacccatgcttggagtacatcaagtatattgttttcccttggtttgaaatgtttgaggtggttcggaaggaagcaaatggcggtaacaagtaaatgttctgttctgagctacataacttggaatttttcctatttaccatcaattggctcaatcattaagttagttgcctatgccaccagtctgttaatcagagcacattaagttagtctattattgatcttctgacatgacaaggcaaagcatcgatgttaaacttttttgcatattgatgttaaacaggacatttacaaacatggatgaactcatcgatgattataagactggtgctttgcatcctgctgatgttaagccagctctagcaaaagcaataaaccaaatattgcaggtaaagtttcccacatttggctttctgttcaataatatggtgcctatttgttgtttgcttcatttgactattgtcattttctctagttttgatggattatttttattgatgtggtatcaatttcgcactagtgtattttgtattgacctgttttcattggataatgatgtggtgtttattatcaagaccttgcacggtatggttccaatagcttatcttgtcttaataatgttatcctttctattttcagcctattcgtgaccacttcaataacaacagtgaagcaaagattctgcttaacactgttaaggtatatttttttattatccatctctgactgttgtggttaaacttttatggtctttcttcacactgtaagatactgtagtaaccacttccatccatgccttttgcttgcactgtgcaatgcattgtcacaaatcgagtttaaaggcaatttatgatctgttcagtattgatatagcttaaattatgcattattgcattttcatgtcttaggagttttgtaag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|
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