Os08g0402800
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Structured Information
| Gene Name |
Os08g0402800 |
|---|---|
| Description |
Protein of unknown function DUF6, transmembrane domain containing protein |
| Version |
NM_001068296.1 GI:115476329 GeneID:4345517 |
| Length |
5458 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0402800, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:19310070..19315527 |
| Sequence Coding Region |
19310264..19310348,19311117..19311268,19311550..19311708,19311903..19312131,19312308..19312424 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:19310070..19315527 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggacatcaccggcgcgggcgctatgggaggaggatccacggccgccaccgccgccgcggcggcgggggccgggtggaagacgccggtgtcgatggtgctggtgcagctgttcatcacggggcagatcctgctgtccaaggtgtccatcggcggtggcatgttgatcttcgtgctgcttgcgtacaacagcttcttcgccgtcgtcttcctcctccccttcgcgctcatcttcgagagaggcaagtggagggacatggattggggtgcattcggatggatctttctcaatgcgttcattgggtactctgtgccaatgagcctctactactatggcctcaaggataccacatcatcctattccgttatctttcttaatataactcccctgttcaccttcatcctctcacttatgttcaggttggaggcattcaaacttagaagcatacctggagtactgaaaatagcgagcatactgctttccattggagggacaatgcttataagcctttacaaaggcaagtcattgcatctctgggattctatcatacaacaccaaaatgaacacaagtcagcaaccaatcagctaagaggaacaattctattggttggcagcagcttcacctttgcttgctggtttcttattcagtcaaagattctcaaagtgtatccatacaaatattggtcgtccatggtgacatgcttggttggagtatttcaaaccgcattggtcggaatcatattaaggagagacaagagtgcatgggagctaggatggaatctcaaccttgttaccatcgtgtacacgggggcacttgcaacagccgggaaatatatattgaattcatgggcaataactaagcgaggcccaacctatcccacaatgttcagtccattatcagtcgtcttcactgttgtgttggattcagtccttctaggaaatgatattacaattggaagtcttctaggcacagcattggtgattgtcgggctctacctttttctctgggccaaagcacgagaaatacctaagaagtcaacatag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDITGAGAMGGGSTAATAAAAAGAGWKTPVSMVLVQLFITGQIL LSKVSIGGGMLIFVLLAYNSFFAVVFLLPFALIFERGKWRDMDWGAFGWIFLNAFIGY SVPMSLYYYGLKDTTSSYSVIFLNITPLFTFILSLMFRLEAFKLRSIPGVLKIASILL SIGGTMLISLYKGKSLHLWDSIIQHQNEHKSATNQLRGTILLVGSSFTFACWFLIQSK ILKVYPYKYWSSMVTCLVGVFQTALVGIILRRDKSAWELGWNLNLVTIVYTGALATAG KYILNSWAITKRGPTYPTMFSPLSVVFTVVLDSVLLGNDITIGSLLGTALVIVGLYLF LWAKAREIPKKST</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>5180..5264#4260..4411#3820..3978#3397..3625#3104..3220#970..1032#156..394#ttcgtgcaacgcggttaagttagttgttgttgcgatccatagatagagctaaacccctaactagtaactacccagagagaactgataaggccagtgtcgagctagccagctgacggccgccacagtttgcttgatcaaggctgatcgatcgatcgatggacatcaccggcgcgggcgctatgggaggaggatccacggccgccaccgccgccgcggcggcgggggccgggtggaagacgccggtgtcgatggtgctggtgcagctgttcatcacggggcagatcctgctgtccaaggtgtccatcggcggtggcatgttgatcttcgtgctgcttgcgtacaacagcttcttcgccgtcgtcttcctcctccccttcgcgctcatcttcgagaggttttaatcttctccggtttttatttgtgtgtgttttaaagaaattttacgtttcttaataaagtacctcgaggtacctaaatattacactaaatattacctaaatccgaaggtatcaaattttacaccagaaaatatgtacatcctgataatttctcaggatgatgaaattatccgtgtttttatgatcagcttgccgtgaatatttgcagatttcgcatcttcagaatatttttttctcttcggacaaacattttacaaaactaggatatcggaatgagataatttatggtcatccattagtgactcttttctaaatttattgaaaaatcattttgtaatgtcaataattataaaatgtatgtctagtttaagttgcgaatcaattgattcaataatgaataacaccacatgtatacttctgatcgaataaatggataaccctggaattaatcacccgctaagaatactgaatgtgattgtaattaagaaaagtaattagcagcggctgtatgcattctaaaatcgggtttcatggtgaaaatttaatatgctgctaatttggttttgtgtagaggcaagtggagggacatggattggggtgcattcggatggatctttctcaatgcgttcattgggtatgtacgacatgtgtatctgaaccttcaaattcagtcaaactgtccataattatacttattatttaggaacaagtccaaataacccctaaacttggaactgaagttcgtttagcaccctaaactttaaaaccggacattcaacccccctaaactttataataccgtttatataacccctaagatggttttgcatagtagggtttttatctaatttatatataagttggatgagtttgatcacatatcatactctttggagtaaaattttgacttaaatatttatttttctacttatgagctctcacttacaaacaagtacgtacatgataatagtatgatattactgaataagaataaattgatgagttgcaactgatgatatgcaaatgtgttatattacttatttaaaattgttcgtttaagcttccaaaatatacaaaaccatcatccaaaaccaccttagggggtgatatggatggtatggcaaagttcggggggttggataactgattttaaagtttagggtgctagacggatttccgtctaaagtttatggatgtatttggactttttcctattatttatttattgtgtgtgttgattcgatcgatagtacatgaagatccattcgttgacacgtctcacctctattattactcttcctatcgttttttcataaaaagagagtatggtttgaatactattcgtaacagtgagttaacgtcgaaaaatacctgtcctttgtacggcttgtaggttgcaactcacctacgtgagagaaaattgtaaaatataccaataagctagctgtgtagaccagacaattttagataattagttatttggaggatttttttaaaaaaaaataattggtttgagactactgaggaagcaccgcagcatgatattaatatatgatgatatttcaaaaacatgcatgattgtataaatatgccagctccacctcctaacaactctagatatgaaattttctccaatgcaacgatagcaaacccaagtaaattgggagggagaaggataaatttacactaacttagcattagaacagagtgctcacttcttggttcttaacttcatcacttcccttatggaaaagattgatttcacttgtccttccagttccaggtctgtgttggacttcggattgccctctatttccatctaaccatgtgcattcagacaggcttttgcacataggattcaattttacagaacaattatgtaacactaaaagcatatataaatttttagatttttgtttgtttccctctgtctgtgcatccaggcagcctattgcacatgtaattcatctttgcaaaaccattatgtaacacaaaagcatatattttaaagcagaggttgataatattcttgattatatatactctgatatttctctcaaaatagttctggcaaagcacagaagaaaataattacacatttattaacattaaaatgttttgactatacaccttctgattttggttgtattcgctccttcttaaaatagttaccttactacaaatgttactatattttaaaacagagggagtacacaagcacataatttgttagaaggatttgttgcacaaagctgcaaactctagatatgtgcttcaacaacaaaaatgaactcataaatctgctaagagcttccttagaaggataacagcataaactttgatgaaagatttttttttcaaaaacaatgatacaaatatagaccattagtctgttcagagttgttgtgataaataaaaacttagcctccaataataagatatttatttactgataatagtagcaatttggtgaaagactctactgcatatagagccacctttatttaaaataaatagaaaaggcaaagatgaagacattgccttatttattgatagagaaggggaaataacatcaacccaagcaaggataaacactaaaaaaccatcaatttgattatactcaataaccaatttcttgatggctatttattacttcctgagacaaattatttttagtttttcttctgacatgccaaaatatgcaggtactctgtgccaatgagcctctactactatggcctcaaggataccacatcatcctattccgttatctttcttaatataactcccctgttcaccttcatcctctcacttatgttcaggtaagagtctcactcaactagttgttgtatacgatgtactacttggtaactataggttccaacaacaacagttccatatcatgcaaaaaaaaaaaaagtcatacgggtaaaattcaaatcgtgtcgcaaaattaatgttccatctcattgaaacatatgtatgaacatgattataggttggaggcattcaaacttagaagcatacctggagtactgaaaatagcgagcatactgctttccattggagggacaatgcttataagcctttacaaaggcaagtcattgcatctctgggattctatcatacaacaccaaaatgaacacaagtcagcaaccaatcagctaagaggaacaattctattggttggcagcagcttcacctttgcttgctggtttcttattcaggtaatcataaacattgcttctaataaagtatatatatttagggtaatttttacttctttgagaaggtattttctagtgtaaaactcggtaccttgagttacttaatttcttaatgcccataaaaattctcatatatctatatattacagtaaattttatccccatacaatgacatcttataactattgtcacagtcaaagattctcaaagtgtatccatacaaatattggtcgtccatggtgacatgcttggttggagtatttcaaaccgcattggtcggaatcatattaaggagagacaagagtgcatgggagctaggatggaatctcaaccttgttaccatcgtgtacacggtataccttcaaccttcctaacccttgaaattaatttagtgagctagaacaataaatatattttataaaataagtttttttttctcggtgttcagtgatgcttaaaataagaaatccatttgcaaagaacattttgttttctgttttttggtgtccactaaaacttgaattgtattaactaacaagtttagagttatggtattattttgggaaagatgaaattttagggaatgcgtaggggactgtcttagggatttgacatgaaaaatattttggtgtagggggcacttgcaacagccgggaaatatatattgaattcatgggcaataactaagcgaggcccaacctatcccacaatgttcagtccattatcagtcgtcttcactgttgtgttggattcagtccttctaggaaatgatattacaattggaaggtcagttgctttcatttgtgtctatcatgcatgtttaatgttgcaaaaggaaaatatatttgatcagttaatgtggcaaatgtaatcctttgccaaactgaataagactaagtttacatagcaaaaggaaagtaaaccttggaaatttcttatgcatatttccaagaaatattatacataataatcagtacaaacaacggcaaaatggagaatcaaagaagtcggtgatgtgaatagtgcaagcactttcaacaattgcagcttgtccttttcaattcacttttacgtttacaaaaattgtgaagcacacaaaagatactagtataacatagatgactcttggaataatttcacacaaccacatgtgttatggtgcaagttatgaaaaaccacaagagtttaggactgcacataaccacaacaattatggtattaatgatttacaaaaccaaactcttacacaaatttagccattcttatgtgaactattccaccaatgat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|
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