Os08g0439100
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Structured Information
| Gene Name |
Os08g0439100 |
|---|---|
| Description |
Pleckstrin homology-type domain containing protein |
| Version |
NM_001068432.1 GI:115476601 GeneID:4345676 |
| Length |
15110 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0439100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:21425645..21440754 |
| Sequence Coding Region |
21425693..21425965,21426932..21427006,21427172..21427225,21427312..21427377,21428463..21428521 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:21425645..21440754 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008401:21425645..21440754 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggccacgatcaccttgaagccgccggcgacggcggcggcggcgggaggggaggtgtccgaggtggagctctcggaggcgggatcgccggatgtcggcagccagagcagcgggagcggtgggagcgggcggagcacggcggggtcctccgggtgggtgtaccacctcggcgtgaactccatcggccacgagtaccgccacctccggttcctcgtcatccgcggcaagacggtggccatgtacaagcgcgacccgagcaagaaccccggaatccaacctatccgaaagggtgttgtaagtcacactcttatggtggaggagcttggtcgccggattactagccatggggaactgtatgtcttgcggttttacaatcggttggatcaaacaaagaaaggagagattgcatgtggggaccccggtgaagctaggaaatgggttgaagcatttgagcaggcaaaacagcaggctgattatgacctgatgacgagaggggttagttggaatagatcccagaatgaaaacgagcttaatcttgatgggcatcgaccacgtgtaaggagatatgcacaaggcttggggaaacttgtacgaattggtaaagggccagaaaagctcttgcggcagtcttcaaatcttcaaagccatgagataattaatacaaactttggaggcgattctggagatgcattcgaagcacacgaatggagatatgttcgaacatttaatggtataagaatttttgaagatattgcaaacacaaagggtggaaaaggggtacttcttaagtctgttggtgtggttggggcgaatcctgatactgtatttgcagtggttctcagctctgataagcataagcgatatgagtgggatatgctgactgccgatttggaattggtagaaacaattgatggatactatgacgtggtttatggaacctatgaacctagatatttaagctggtggaaaacaaagaaggattttgttttttccagacaatggtttcgtggacaagatggggcatataccattttgcagattcctgcttgtcacaagaacaaacctccaaggcatggctacgagcgtacaaaaatcaattcctcaacatgggaactaagaaggttgaacccaccaggatcatcaactccgaaatgccttgttactcatatgttggaaatgagcccaagtttttgggatagatggaagagaagacataacgagaattttgacagaagtattgcttttgctttgctcagccaagtagcaggtctaagagaatactttgcagcaaatccagctttgacatctgatttgccttcaacagtagtgaagcccaaacagtctgattctttgatcatccagagtgaactggaagattctgaacttaatgatgaattctatgatgcacttgctagaggcgaatcctttgaagatgaggatagtgatgacgatgatgatatgattcctaaggctggaaaagtgaagttcaagaatatttcatgggctatcgcaggtcttgctatgaaaccgactaaagcttcggttgagaagagtgaattggttacaaattcaactccggtaactattgattcaaaccatttccatggcacccttcgacgagcgaaaagtgagaatgacccaaactcttggagtgagcctggtggagagaagttcatgataagaggaaagacttacctgacagattacactaaggttgttggaggtgatccccttctaaagcttattgctgtcgattggtttaaggctgatgagcgttttgattcagttgccttacaccccaagagcctcgttcagtcagaagctgcaaagaagattcccttcatactggtcataaacttgcaggttccagcgaagccaaactataacttggtcatgtactacgcagcagaaaggcccgtgaataaagattctctgttgggaagattcattgatggaaccgatgcgttccgagatgccagatttaaacttataccaagcattgttgagggttattggatggtaaaacgtgcagttggaacaaaagcttgtcttctgggaaaagcagtaacatgcaattaccttcgccaggataactttctagagatagatgttgacattggttcttcatccgttgcacggagcattattggtctagtcctgggatatgtcacaggccttgttgttgatcttgctattctaattgaggcaaaggaagagaaagagctgcctgaatacattcttggcacagttcgcctaaatcgtgcgaatcccgactctgcagtacccatctaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MATITLKPPATAAAAGGEVSEVELSEAGSPDVGSQSSGSGGSGR STAGSSGWVYHLGVNSIGHEYRHLRFLVIRGKTVAMYKRDPSKNPGIQPIRKGVVSHT LMVEELGRRITSHGELYVLRFYNRLDQTKKGEIACGDPGEARKWVEAFEQAKQQADYD LMTRGVSWNRSQNENELNLDGHRPRVRRYAQGLGKLVRIGKGPEKLLRQSSNLQSHEI INTNFGGDSGDAFEAHEWRYVRTFNGIRIFEDIANTKGGKGVLLKSVGVVGANPDTVF AVVLSSDKHKRYEWDMLTADLELVETIDGYYDVVYGTYEPRYLSWWKTKKDFVFSRQW FRGQDGAYTILQIPACHKNKPPRHGYERTKINSSTWELRRLNPPGSSTPKCLVTHMLE MSPSFWDRWKRRHNENFDRSIAFALLSQVAGLREYFAANPALTSDLPSTVVKPKQSDS LIIQSELEDSELNDEFYDALARGESFEDEDSDDDDDMIPKAGKVKFKNISWAIAGLAM KPTKASVEKSELVTNSTPVTIDSNHFHGTLRRAKSENDPNSWSEPGGEKFMIRGKTYL TDYTKVVGGDPLLKLIAVDWFKADERFDSVALHPKSLVQSEAAKKIPFILVINLQVPA KPNYNLVMYYAAERPVNKDSLLGRFIDGTDAFRDARFKLIPSIVEGYWMVKRAVGTKA CLLGKAVTCNYLRQDNFLEIDVDIGSSSVARSIIGLVLGYVTGLVVDLAILIEAKEEK ELPEYILGTVRLNRANPDSAVPI</aaseq> |
| Gene Sequence |
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