Os08g0451000
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Structured Information
| Gene Name |
Os08g0451000 |
|---|---|
| Description |
Sec34-like protein family protein |
| Version |
NM_001068479.1 GI:115476695 GeneID:4345726 |
| Length |
10620 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0451000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:22101825..22112444 |
| Sequence Coding Region |
22102069..22102146,22102244..22102327,22102868..22102966,22103111..22103155,22103237..22103311 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:22101825..22112444 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgacgacgccggagacgctgcccaactcggaggccgtctcccacgcctacaagttcgcctccacctgggagaagaacgcgccgctcacggagcagcagaatgccgcgatcgccgcgctctcccgcgccgtgtccgagcggccgttcccggccaacctggagaaaagtttagtgaaggatgggggtgtggttgtgccagaaaaagaggctgcattagaggagggtgcaatggatgcagtcttggtgaatacgcatcagttctacaaatggttttctgaactggaatcagctatgaaatctgagacggaagaaaagtatcgtctctacgagagtacattagaggaacgtgttaaaacatgtgatggtattcttcaacaagtggatgacacactgaacttatttgaagaactgcaatcgttgcatttgagtgttgccacaaagacaaaaactttgcacgatgcttgcgaccaacttttgttggagaaacaaaggctgattgagtttgcagaagcacttcgaagtaggttgaactactttgatgaattggaaaatgtctctactagcttttattctcaaactatgaacatcggaaatgaacaatttcttccacttttgaaacggctcgatgattgtatttcgtatgttgaaaataatccacaatatgctgaatctgcggtgtacttggttaagtttcgccaacttcagtctcgtgcattaggtatgattcggtcacatgtcctgtcaatacttaaagccgcttcatcccaggttcaagcggcgattcgaggtaatggttcagcaaaaaatgttgttacagagggtgtggaagcatcccttatctatgttcgcttcaaggcagctgctagtgagcttaaaccaatcttaggtgagattgaaagtagatcttctaggaaagaatacacgcagattctttcagaatgtcacagcttgttctgcgaacagaggttatacttgatacgaggcatggtgcagcaacgaatttctgaatttgctagaaaagaagctttgccttctctaacaagatctggatgtgcctatctgatggaggcatgccaatttgagcaccagctttttgctcactttttcccggcatctgcatcagatgtttcaagtattgctcctttaatggacccactgtgcacgtacttgtatgatactctgaggcctagactgatttatgagggaagcattgattctctgtgtgaactcgttgacattctgaaggtcgaagtgctaggggaacaactaagtagacgaggagaatcagtagctgggcttcgacccatattgcaaaggatacttgcagacgttcatgagcggttggccttttgtgctcggactcatattcgtgaggagattgcaaacttccgcccttctgatgaagatctggattatcctggaaagcttgagagatccgtagatgcaactacaagttctaatgttagtggcaactcggacatatatgtgacatggtatagaccactggagaaaacagtgtcttgtctgtcaaagctatatcaccgcttagaacctacagtttttactggattagcccaggaagctgtagaagtttgctccacatctcttcagaatgcaagcaaggtcattgcaaaaaaagcaactgcaatggatggacagcttttcctaattaagcaccttcttattttaagagaacagattgctccatttgatattgagttttctgtcacgcataaggagctggatttctcccatttgctggatcacttaagaaggatcctcagggggcaggtctcgttatttgattggtcaaggtcaacatcacttgctaggacgttttctccccgtgttctggagaaccaaattgatgccagaaaagaattggaaaaaagcctcaaatctacctgtgaagagtttataatgtccattacaaaattagtagtggatccaatgctttcttttgttactaaggtaacggctgtcaaagttgtactgtcctcgggtagccagggtcagaaattggattctgttctggctaaaccccttaagactcaagcatttgcttctcctgataaggttgcggagctggttcaaaaggttgggactgctattcagcaagatttacccaaagtaatgaccatgatgaggttgtatttgcaaaatccatctacgcggttgattttattcaaaccaatcaagacaaatatagttgaggctcatatacagctacactcccttctgaagtcagaatacacagctgacgaaatccaatcaattggtatgttgcctatacccgacctccagtctcagctcgacgctcttttgtaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MATTPETLPNSEAVSHAYKFASTWEKNAPLTEQQNAAIAALSRA VSERPFPANLEKSLVKDGGVVVPEKEAALEEGAMDAVLVNTHQFYKWFSELESAMKSE TEEKYRLYESTLEERVKTCDGILQQVDDTLNLFEELQSLHLSVATKTKTLHDACDQLL LEKQRLIEFAEALRSRLNYFDELENVSTSFYSQTMNIGNEQFLPLLKRLDDCISYVEN NPQYAESAVYLVKFRQLQSRALGMIRSHVLSILKAASSQVQAAIRGNGSAKNVVTEGV EASLIYVRFKAAASELKPILGEIESRSSRKEYTQILSECHSLFCEQRLYLIRGMVQQR ISEFARKEALPSLTRSGCAYLMEACQFEHQLFAHFFPASASDVSSIAPLMDPLCTYLY DTLRPRLIYEGSIDSLCELVDILKVEVLGEQLSRRGESVAGLRPILQRILADVHERLA FCARTHIREEIANFRPSDEDLDYPGKLERSVDATTSSNVSGNSDIYVTWYRPLEKTVS CLSKLYHRLEPTVFTGLAQEAVEVCSTSLQNASKVIAKKATAMDGQLFLIKHLLILRE QIAPFDIEFSVTHKELDFSHLLDHLRRILRGQVSLFDWSRSTSLARTFSPRVLENQID ARKELEKSLKSTCEEFIMSITKLVVDPMLSFVTKVTAVKVVLSSGSQGQKLDSVLAKP LKTQAFASPDKVAELVQKVGTAIQQDLPKVMTMMRLYLQNPSTRLILFKPIKTNIVEA HIQLHSLLKSEYTADEIQSIGMLPIPDLQSQLDALL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>245..322#420..503#1044..1142#1287..1331#1413..1487#1593..1688#2573..2650#3287..3372#3461..3527#3615..3677#3755..3856#3982..4086#4171..4263#4803..4891#5472..5691#6239..6322#6644..6760#6864..6896#7012..7098#7189..7251#8256..8372#8654..8746#9217..9342#9415..9515#10340..10469#agtctttctcctctttctctctctctcgcaagtctcgattactaccgggaaggccattcccagtgctccgaccgccgcgccaatcaaccgccgtcagccaccggacagccggccgccgccgccgcgcgtcccacttggcccgcatcgcaacgccaccaggggacgcgaccgccgcctccccacccctccggcaacgcccgcccggggccgcggccgcatcagccgcccgccgccggggacgcccatggcgacgacgccggagacgctgcccaactcggaggccgtctcccacgcctacaagttcgcctccacctgggagaaggtcggtttcctcgcttcgctgcgcgtcgggtgggtgtgtgatccagtggtagcactggtggatctgatctgatggacttgggctttcgctgctgcagaacgcgccgctcacggagcagcagaatgccgcgatcgccgcgctctcccgcgccgtgtccgagcggccgttcccggccaacctggtgaggcgccacatctcgggattgtgtgcgatggtttgatccataggccctgttgcttgcgatgactaaatgttgtgatctgatgctaccatggtttggtttagtttagtttgccgtgctatgctcgggatagactagcccgtcaattgtacttgaaggatttgagatatttcattagttgcaacacagcatacatactccatttggtagttcagcggtagcggttagtttggtttataattgacagtacatgagtcaggtgaatttgcagttctgtttcgttggtgatgtttctgtgccactattagctcactctccacaattcaatactctagctagtgctggatttgtgatgatgtttgatgtttcaattgggtatcaaatgggtttataagtgcgttgtttttatggtcttgttatgttatttcattggagggttgctttttttaatttgatagaaggctgtattttgaggtctatttcccttccggctttatattattgcttgacattaaaacatattgctgggtgttacatcaggagaaaagtttagtgaaggatgggggtgtggttgtgccagaaaaagaggctgcattagaggagggtgcaatggatgcagtcttggtgaatacgcatcaggttagtttcataatcttgttgatatatcacttgtatgattgatcagagaatttcggtattctatctattcaaccttaagttgtgtcaggatagaaggtaaactatttctgcaggttgagctaatacctttattacctcctgtagttctacaaatggttttctgaactggaatcagctatgaaatctgaggtttgtgcatgttcatttcttttgttagtgatggcaacttgtggtaaaacaatgattttacccctctagtttatttgacagacggaagaaaagtatcgtctctacgagagtacattagaggaacgtgttaaaacatgtgatggtattcttcaacaagtaggtttatgaacccttttgtttgttaatatttgcaaaatcttttaaggaacatggatgctcttatccttttcaatataacatatttaaaatatgtccattcaggtggatgacacactgaacttatttgaagaactgcaatcgttgcatttgagtgttgccacaaagacaaaaactttgcacgatgcttgcgaccaacttgtatgcacccttttctctaagattctaaatacttgcacttttgctattctttctgttatttttttggcattttgtcagattagttatttatagtgaaacttccactctaaaggactgttactctgccatgtgcacataaaccacttttaagaatgtattcaatattagtgaaacttaacagatcgcctgccttgtattgtgcagctttggtaaatttacaatatggcattttaggtgcccaaaggaaaaactcattggcctgtttgtcatcttggacctcatgttaatgatcttattagtgatatattttgtatagctcttatctactcttttagtttgaacagaattacaaaattctttgatgcagtttcaacacatatagatttaacattacaaaactgttgcattaataaaaacaaatcattctagtaatcttttgtttgtaggaactgtattatgatctacaagcatgcttcatttcatatacccctgtttgagataattttttgaccagattattgctaaggattatctactttaaaagcagggaaaaaggaaatattttgagaaataaacttaacaaacagcttagaacaagtgatctaagcaatgcagtagttttttttttggaaaacgtatttttcgaagcatgaagcaaataatccgtttcaacaatctggtgaataatctgaaaagaacagggcctaaatgaacacatgagttaccttttaactacccttttttgtgtagtattctcttagtttattcatgtcgtaaatgcaaatatatattctcattttgccatattgctggtccctcttccgtttttttaatgaagtgtttcagtcaatggactatcatttctaaattcgaatgtaatgcagttgttggagaaacaaaggctgattgagtttgcagaagcacttcgaagtaggttgaactactttgatgaattggaaaatgtaaggtttggcatccctagtttgtctattgagcattagattaataaatttgattaaattaatgcctctcctacaagttctacatctcacacaagcataatgaattctgccatacatctactttgaaatttaattgttgaacttatgtgaaaccttattcaaaatttccaacgttatctactacatcctaatgcttgcatccttgatcattttgttagttggagaggtcagcatggtctccgtggttcatttgttccagaaaatgtttattccatgtttcggaggatatatactttagatttgatcccaatggatgtcttagatctgaattttgagctgattcgtattgtcaccttgtggttagtgctaacttgtacatgatgatgagtggcttgtatttttgaagatcccactgtttgctactgttctagtatattctgtagctgcataatcttgaacatttctggccactaaccacacttattcaattctaccatccaagtacacaatgtatcctgatgatctcattcatacattatctgtaatgttgattacacaatctgttttttttaaaatcctattttttctctggttaacctgcttcatatggtttaaaatactgtctccattttgcaggtctctactagcttttattctcaaactatgaacatcggaaatgaacaatttcttccacttttgaaacggctcgatgattgtatttcgtaagtagtaatagacaatgctctgtgtgtagttttagggtgctgagatttaaggagttcatgctgtatcctgtttgggtgcttataggtatgttgaaaataatccacaatatgctgaatctgcggtgtacttggttaagtttcgccaacttcaggtaaaggtctacttgaattgaactacatggatagtcatcacaggttagatactttgacctgataattatatgcttcttttattgcagtctcgtgcattaggtatgattcggtcacatgtcctgtcaatacttaaagccgcttcatcccaggtgattttcagttgaactttggtaggtaaatgcgatatgactactaaataccagataatagcttgattttatttcaggttcaagcggcgattcgaggtaatggttcagcaaaaaatgttgttacagagggtgtggaagcatcccttatctatgttcgcttcaaggcagctgctagtgaggtataccttttcatcaaatgatctacagttatatagaaaggcttaaacaaactgtagctatgtgatctatataccagtaacacctcaaagttataactctgctgcctctggttcttgttttccagcttaaaccaatcttaggtgagattgaaagtagatcttctaggaaagaatacacgcagattctttcagaatgtcacagcttgttctgcgaacagaggttatacttggtaagatcaaacaattattggttttatattttccttttttggcatggacctgattatttcttatcacttgttatgcaactaaagatacgaggcatggtgcagcaacgaatttctgaatttgctagaaaagaagctttgccttctctaacaagatctggatgtgcctatctgatggaggtaactgcatgtttaatactttctagttttcttattttcatctgtgttgtaggtttctctttccatattcagaaagttacatcttacagttgtacacgatagcattctgtaatgtagaagaattgagcaacacattgtatatttagtttcctaatattacgtgctctgcttactcctcatgctgagtatgatgcacttatcattattatttttggcatatttattctaaagcattgaaagttcttgatttttagttttatacaactgaaagtctcggggttcacttattagtatctcaaggtcacccaattcctcattttaccatttccatccttttgaggccaatagaagttagttatgatggcttcccctcaacctgggactttcaatgtcataaaactgaattctgagcctttgacggcacataaccaattttatctaatctccagt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| External Link(s) |
