Os08g0472600

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os08g0472600

Description

Similar to Alpha1,3-fucosyltransferase (Fragment)

Version

NM_001068555.1 GI:115476847 GeneID:4345809

Length

8157 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os08g0472600, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 8

Location

Chromosome 8:23361330..23369486

Sequence Coding Region

23361421..23361813,23363636..23363796,23364315..23364556,23365427..23365531,23365993..23366149
,23367107..23367334,23368771..23369026

Expression

GEO Profiles:Os08g0472600

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

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Protein Sequence

<aaseq>MKGSHSQSQAQAQSQAGRRRRCGWLLPLLVGAAFLAEIAFLGRL DMAKNAAAVESWTTSFYARSSAPARDGKAAVVVPGADADDAPPGGGEVVEEDDGDIRL CEERLEREDGVPHDRDFDKDPVLVGGAAKDWNKCSVGCEFGFSATKTPDATFGIAPDP TVESILRSMESSQYYSENNIAVARGRGYKIVMTTSLSSDVPVGYFSWAEYDIMAPVPP KTEEALAAAFISNCGARNFRLQALEMLESLDVKIDSYGSCHRNHDGKVDKVETLKRYK FSLAFENSNEEDYVTEKFFQSLVTGAIPVVIGAPNIQEFSPGEGAILHIKELDDVPSI AKTMKHIASNQEAFNQSLRWKYDGPSDSFKALIDMAAVHSSCRLCIHVATKIHEKEER TPKFMNRPCSCSSKRGKVYHLFVRERGRFKTESIFLRSDQLTMGALESAVLAKFRSLN HVPVWKDERPPSIRGGDELKVYKIYPIGLTQRQALYQFRFRDDADLDKYIKDHPCAKL EVIFV</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>92..484#2307..2467#2986..3227#4098..4202#4664..4820#5778..6005#7442..7697#acgaccaggtcgtctaacgactccgcccctcacccaccaccccacccatcgcctccgccaccggcgagaggaggcggagctgcgcgtggcgatgaaggggtcccactcgcagtcgcaggcccaggcccagtcccaggcgggccggcggcggcggtgcgggtggctgctgccgctcctcgtcggcgcggccttcctcgccgagatcgcgttcctcggccgcctcgacatggcgaagaacgccgccgcggtcgagagctggaccacctccttctacgcccgctcctccgcccccgcccgcgacgggaaggcagcggtcgtggtccccggcgcggacgcggacgacgcgcccccgggcggaggtgaggtggtggaggaggacgacggcgacatccggttgtgcgaggagcggcttgagagggaggacggcgtgccgcacgaccgcgacttcgacaaggatcccgtcctcgtcgggggcgccgctaaggtctcgtacctgttctcccgatccgcccctcctcgcgctcttccatttcagttcggagatccgcctccttgtgctcttgcatttgagttaggagagctacttttggactgctcagctcaacaggtcttctgcttagttggataacattacttagataactctagcacacggattgctcgtgcaaaaggtccggattatgcatctgacgtcgtatttgccattttagaattgcaattttttcccttgcatgctcaatttgaactaagatagagcactaacaaaacatcccttccatggtgcaagagtctctctcagcggaagactcaacgggggctcttgcacacacacacttgttagctagtgcatccttctatagtttgggggcttgggttgtttggggctttgggctggtgaggcttacgtgggatttcatgtttgcatgtgcatgttctgttatttgttctagcaacaaaagccaagtagccaaatcaacgagttaaagctcattaattctagtcgatgttctgttatctgtatgtcgctagcaatacttatataactctagctcgtgcatgtaaaggtccagattatgcatctacgccatacttgccattttggaattgcaaatttctcacttgcatgcttagttgcagattttacacaacatttcgacctacttgggggcactaacagaagtacagaacaccctttccactggtacaagagcctttgcacaccagacgtacacatccagtcccacacattagcaagcacatccttctgtagtttgggggcttcggctgtttgggccagcgaggctgctttgttatttttttgagcaaccaagggaattagctgagtccatgagtcaagcccattagttctattgtcaatagtataatatggaacacatttgttgcaccacaacaatgacagtaagatgatataagaaaacatatatgtcatttattttattagatagttttctgtcagttttgtttattagcaccccctaaaatttggtgacacgttcgtcactggcctctccaccaggttacatatggggcttccttaacatacatctgtaactagtagattatgaaaaatcttgactttgtgcttatagactccacagtcttctagccttcataccattatacgagttataaaagaaattgcatatttgtatctgttacaaacaaaatcatccaaagtgaaaaagaacaagtaacctcttatattaaacataaaccatgacacgaattggaggttatggactgttgggttggtcatgatatcctgacattattaccactcaatgattattaaattgggattataaatgctggaaattaggataccatggtttagcaaacttacgtgggcatcatttccatgggaatgaagggatgtggtagtgaatgtttggaaccagtattttttttttcaaatagtagatcagaatgcacatgatatcatgttggtttgattatgtcaggaggaaggagggggcagttctagtgtgttactcaacattccacaaacactttctaaatggtgtaaaaataaaatattgtgaaaattagatttagcaacagagaattcgaagatcttgccctcaagctttatgctcaactgcataccttaatgtaagcttatacctggtgctatacgcttgtgttggtgccatactgccatttgtgatgtgatgattgcagataatgatgattgttgtttgtaccattggtgccatcacttgtcattcatttagtgctttacttattctccatatatcgtgcttatgcattctttcccctctcaggattggaataaatgttctgtaggatgtgaatttgggttttcagctactaagacgcctgatgctacttttggaattgccccagatcctactgtagagagtatcctcagatcgatggagtcatctcagtattattcagagaacaacattgctgtggctcgagggtgggtaagaaccaagttaattctggttgggtgatttctctgcctatttaaatgatattttaaccttatttgttgtgttccacgtacactttggtagtttgtaaccatgtgtgacttcactttggtacataaactcagaactgttagatgttttcataatgtaagcaattttcatactggctctaagatccctactctgttatccatgttgagaagtcacacatggttaatagtcacacatggttgtaggttaatacttttatttgtaatattaagaaagtaaagagcgctatttggctactatattggcttcgtgctgatgctcaaacattctcacttaaaataaaatagtaaaatagtaattaaccagtattgtattgaatatgctattgttcttgtgaacctattaccatcatgtatccccagctacggaactattcattttaatcctcagtgtgatttattatttttagaagcataattctaatggactgagcaatcctgatgctctctcacaggagaggttacaaaattgtgatgacaacaagcctttcctcagatgtacctgttggctacttttcatgggctgaatatgatataatggcacctgtgcctccaaaaactgaagaagccctagctgcagcatttatttcaaactgtggtgcacgtaattttcgtttgcaagcccttgagatgcttgagagcttagatgtcaaaattgattcatatggtagttgccatcgtaatcatgatggcaaaggtacactttctcttccatatttcgagtgacatactttattaacttttgtgaaatttactcgtatatagttaatgagatatgttgccttatgcttccaagagtgtaatgagtggccagccacagcaaagtgttccacgtggcatggttttaattgttccaagcaatcaaaaatattgaataccatataaaactatcacaactgccaattcttgctgctatgtcaatatgctaattgtcaggtccatctcccttctgtttaactgagataattcctaactgggtatgtgaaaatcacatgacaaattttcttttctttttgattttatgaagcctttaaggataccgtgtttgatgatttagaatctacttttgtattaagcacactgatgacctccacattttatttatatgatcacaataatttcaacatcaatatttgcacataacctttttttaaatcttaataactattgctgggaaatgatgttgctgccagaagttggtatatagagtagcacatagtattattattagagcagcagcaaatgatgtttcaacctataaaagattaaaaaccaaagagctatcgttatgttcaactttgttaattaagattttatctatctctgcattaagttattcttccttggtccttctggctgcaaatataatttgttttggacattgatgcactgtccagggcaacattttttccttttcttatatcatattgtgttgttaaaatctgataaatgctttgcctacataaatgatgcttttatgattggactagtttgtatttctattgttgtactgcatatgttttgaggaaagaaatgttatgcgaactttatatgttgcctggtgcagttgataaagtggaaactttgaagcgctacaaatttagcttggcctttgagaattccaacgaggaagattatgttacagaaaagttttttcaatcgctggtaacaggtaattggataagctattaagcattcctgacccaaacccccagcccacacccacccatccacacaatttgcattggtaaattctcatccaacattggatccagagttagtataagctttatgcccatttgttagtcatctctctggggtggaatattgcacagacatggaaaatcatattatcgtgactctcaccaattgaaatatattatgaaagtactttcatgaagcaagtgaacaaatattgtgaaacagatcgattaggatcttccaaatcataaaccaaattgtcatatttgtgatgtacatatttcccatatctactgattaacattttatttctgttcaccatgaattttatttaattccaattccagcaattgattaaatttgaactctgtgaaatttagatttctaactggaatggaagtgattgaaaatttcatctgcgctgtgctacaggagctattccagttgtgattggtgctccaaacattcaagagttctctcctggagaaggcgcaatattacacattaaagagcttgatgatgttccttcaattgccaagacaatgaaacatattgcatcaaatcaggaagcctttaatcaatctttgaggtaaatgctcctgctttccctgttgacttcatgcctgagatagatttgtttctcattcactaatggtattgttggagcatcacgtgtacaccaatcatatttttggaacatctaatgatctccgcaaattcaagcataatcatggtgtatgtctgcatgtacactgaatttgcattaaaaagcaatcaccagttcagcattggaaatatatggagtcatgcttatcaatttttggcatagttcttttaaggaataagatgtaatgctgtattatacattattaacttgctatgatgttgctttcacccactcattttttcatttaccaagatcttgcaaacaagcattatcaaatatgtaacttgttgaggaacaaaattactctacaattaaagattttttctggaaatccatttctcaatcttaaaatgctattgcagcgatactctattgtaaacttgttggtaccaatcatgtgactctggcactctggaaaagcatgaaaccaccatcagaagctactggaattagtctttagtataactggctgtctaacatagattttaacttgctattgctgctttagatagattattcttatttatcttagaatgaagaaatagccaaattatagtactgccatgagactctactgggtgtattttctttttgtcttttttgtttcactctcccatatcttgtaaatctatttgttggaaccattattcaagacataattataaaaaaactgatgcagtttaggcttagagtaagttggcgtcctcattacctttgatttgcttgaaggtatccttgagtagttcaggggttccattcacgtgtagatgattctgctgataaaattactgtacagtttgtcaaagatcctttatcagccattattaggtcaccattttctgtgctgtgcatatctcattctatgttttgaatttgtagatggaagtatgatggcccatctgattctttcaaggcccttattgacatggcagcggttcattcatcatgtcgtctttgcatacatgtcgcgacgaagattcatgagaaagaggaaaggacaccaaaatttatgaatcgcccatgtagttgttcaagcaaaagaggaaaggtataccacttgtttgtcagagaaagagggcggttcaagacagagagcatttttctgaggtatggaattaattactgttatatttacctgtgttagatttgttatctgcagctgtcatgataaagagcaaaatatcaagggatttttttaaaaaaaatgttacaagggcagatgctcatcctatattatgtaatctcaactctaatgtccttattatctcagatagtcagatggtgcatttgtacctgactactgttatatttttatattataaggacttaagtgctagtttgaaaaaaataggtaaattccaccacaaagacagaaatataattgcatgtgagaatgatcttgcacatgcaatgatattttccaaccttctgttttttacgatggcaccgatgaatatggtgctactggtttagttgtcttgtgaatcacagtgctcctgatcatttttcaaagagggaattgcacattgggccatgtattatgaacaaagtttcactttggaccagggcataaacaatgttttcacatagggctaggaaatattacctttgttgcaggttagaccatcccatctctccaactctagagaggatgcctggttagttggcttctggtgctacagaagaagcaatcgtgagcttgtgcttgtactgccattgcgtatccaatttccacatccctcccgtggttcccctgctctaactcctctccagatcaaggcagctgcagttgggatgaccactgtccccacccttccatgagctattccttctaaatgggcttacccgtagttggcacaggaggagttctgccttgacagcgcccaagctcgctttccacctccgcctggctgccgcaaacttgatttcagtttcagcaatggctgcctttgccttggcatccctcgagctcgagcttcgctggctccaccattgccgtccctgcacttgaactctatttgtgttgtcccaagctcaggctctgttaatgtcgacttcctcacacccgcttccgacctccatctacctcatgccctcaccgctccaatggctgcccccttggagcaactcatcttactctgcatgcgcatgcactcttcatgccttgcagcagcagcaacaacagagggttcatggatgccgtgatggtgagatgcaggcaatgccaggccagccggtaagatgggtagcccagtgtgcaacaaatggaaaaaaaaaactttggtccaaagtttcattgtcctggtccaaagtgaaacttcggtaataatacctagcctattgccctattgtgcaatttgctctttttaaaaacatatataaaataacttctagctttgttacattataaacttggtgtctttactgcaactaatgctgcttgcaaattgaatagcttaaatatacaattgtttctaacttattttacctgattgttttcctgctagtctttttaaaacttgtgcctttcctatgcaatgcaggtcggaccaattaactatgggtgctttggagtctgctgtgcttgctaaatttagatcgctcaatcatgttcctgtgtggaaggatgaaagaccaccaagtattagaggtggggacgagttgaaggtatacaaaatttatccaatcggccttacacaacgacaggcattataccagttcagatttagagatgacgcagatcttgacaaatacattaaagatcatccatgtgcaaagcttgaagtgatttttgtataactatgctctagacattttcttttcttgcgcctttctctagttgaaaatatacaatgtgtagtttctgctgtacggtaagctagtctgctagtatgtcttatgtagtacttcctccgtttcataatgtaattcattcttgcatttctcacattcatattgatttaatgaatctagatagatatatatgtctagatttatcaacatcaatatgaatgtgggaaatgctagaatgacttacattgtgaaaaagagggagtagcaaccaattcatgctcacacagatctatctacaatcaaaagcacagccttgttaggcattgagatacatcgattgtaaattttcatcgacaggccagatgttttgtttttctcacttttttgggtaacagtcaacaagggattgacttgggacaatgaacgatattgctgtgatataatgtaatgtactatgttataactg</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os08g0472600, RefSeq:Os08g0472600