Os08g0485600
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Structured Information
| Gene Name |
Os08g0485600 |
|---|---|
| Description |
Methyl-CpG binding domain containing protein |
| Version |
NM_001068624.1 GI:115476985 GeneID:4345879 |
| Length |
8244 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0485600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:24090878..24099121 |
| Sequence Coding Region |
24091029..24091693,24093273..24093414,24093489..24094733,24095942..24096076 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:24090878..24099121 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008401:24090878..24099121 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggagacggaggtgttccccgtggttgacctccgcgtgctcacgcagtccgatctggacgagctcgccgccgcctccgcccacgccgtggacccgcggagcagctgccccgaccgcgccgtcttcaacgagagcgccggctcgcgtaagcagaccttctcccgcgtccgcttcgtccccgccgccgccgccgccgctgccgccgcctccgcctccgccgccgccgccgccaagctgcccaggggcaacgacaaggaggacagcttcatcgcctaccacctccgccgcctcttcgcgcccgacgacccctccctcatcgagaacccctcctttccccaaacccaaaccctagctcggtcgccgtctcccgaccccgaccagttgaccaccaactccaggggggtctccgttgatctggtgagcctctcacggcttgccgacccgtacgacgcggagctcgggaagcggactgccaggatgaccacggaggaggagctcatgggcttcatctctagcctcgcgggtcagtgggtgaaccagaggatgcggaggaagttagttgatgcgtccttcttcggggatcacctccccagcgggtggaggctgcagcttgggatcgagcggaaggaccgcaaggcctgggtgaactgcttcagttatgtgagccccaagggacagagttttgctacttgccaagaggtttctgcatacctcatgtcacttcttgggtatccggagttcaaaacggataatattgagtatggtagcacacaacaacatggcttgtgtgctgacgatggtgttaatgttttaggtgttcaacaccaaattggtacaagtatggacagtcaaagtaatttgccagttgcttctgctactttttatagtcattcaagagatcaagacgaaacggttgcagatgatataaattcttatgaatgtcaacaatgcaatttaacttttcatggtcagagtgcctatgcgcatcacctgatcacttttcacaaagtgagttctaagaggcgtaagagtaacaaggttagcaaatttggtgagccagtgataggcaaagatgggaaatttgaatgcccagtatgtaacaagacgtttgaggaacagtcacggtactttggtcacattggatcccatgcaaagtatcaggggctgactcctgaagcattcctacaaaccttttcaggaaaggttggtaacaattcttttgcaggtttgtcatctagccttcaagtattggtcggatcaccacaactgaatgagaagactactgcttgtgaagcacgatcgcagcatcacgattgttcaactaaacatggaggcaatagtacaagaggtatagacctttttaactcaaatcatcctgctaacttcaatgggcataatcaatcttggtgtagatctgatgaaattcctcccaccacagaagctcaaagcacatggacttatagaaataatgagatgaactgtgctgatagaactgttccgagaacagtacctcagcccaatgatcacgaggattgcagggttagtggctttgctgaagcaactaattttaatgatcaagcaggaagacaccaaggttttagacctttctcctttggaactaccaaccattgtcaaggccagataattgatcatgcagtagctgcttccaagcatgctgaggttaataatagtatgaaatcaagagatgtcaacctcaattcacgcctgaacacaatatcctttcctattgcaactgcaaacaatgaaacatcgactgcccttaatgacgtgaatcggtcatgcattactggaaaaggttttagtggaagtttcagtaacaatgatggtgctgcatctatcgtgttgcccagttctggattaaacaataaaatttctagctccctcggtgtagctgacagatcatctattgctgccagatccttcaatgctggttatgtttatgaaaatggcgcttctgaagctaacaatattggcaacaaaaacaataccatggtgtatcaaacaagtttggccatgcgtccactctctcctggcaaacaaagcagcggcgttgcttcgagaaggacagccgctgtggtgtccgagcggcatggaggccaagttgtgagacacccacggactgcttcatcagtttacatgcctgagcaaggtcctggatggttgtga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>METEVFPVVDLRVLTQSDLDELAAASAHAVDPRSSCPDRAVFNE SAGSRKQTFSRVRFVPAAAAAAAAASASAAAAAKLPRGNDKEDSFIAYHLRRLFAPDD PSLIENPSFPQTQTLARSPSPDPDQLTTNSRGVSVDLVSLSRLADPYDAELGKRTARM TTEEELMGFISSLAGQWVNQRMRRKLVDASFFGDHLPSGWRLQLGIERKDRKAWVNCF SYVSPKGQSFATCQEVSAYLMSLLGYPEFKTDNIEYGSTQQHGLCADDGVNVLGVQHQ IGTSMDSQSNLPVASATFYSHSRDQDETVADDINSYECQQCNLTFHGQSAYAHHLITF HKVSSKRRKSNKVSKFGEPVIGKDGKFECPVCNKTFEEQSRYFGHIGSHAKYQGLTPE AFLQTFSGKVGNNSFAGLSSSLQVLVGSPQLNEKTTACEARSQHHDCSTKHGGNSTRG IDLFNSNHPANFNGHNQSWCRSDEIPPTTEAQSTWTYRNNEMNCADRTVPRTVPQPND HEDCRVSGFAEATNFNDQAGRHQGFRPFSFGTTNHCQGQIIDHAVAASKHAEVNNSMK SRDVNLNSRLNTISFPIATANNETSTALNDVNRSCITGKGFSGSFSNNDGAASIVLPS SGLNNKISSSLGVADRSSIAARSFNAGYVYENGASEANNIGNKNNTMVYQTSLAMRPL SPGKQSSGVASRRTAAVVSERHGGQVVRHPRTASSVYMPEQGPGWL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>152..816#2396..2537#2612..3856#5065..5199#tggagccccaactacgccgccagcccgccatctcatcccccggcgagcgacacggtcgcatcccacctgagctccgaccgccgcagcggcggtcgcctcgccggagcagaagccgcgcgtgggggggaaggcggaggaggggaggggttcaatggagacggaggtgttccccgtggttgacctccgcgtgctcacgcagtccgatctggacgagctcgccgccgcctccgcccacgccgtggacccgcggagcagctgccccgaccgcgccgtcttcaacgagagcgccggctcgcgtaagcagaccttctcccgcgtccgcttcgtccccgccgccgccgccgccgctgccgccgcctccgcctccgccgccgccgccgccaagctgcccaggggcaacgacaaggaggacagcttcatcgcctaccacctccgccgcctcttcgcgcccgacgacccctccctcatcgagaacccctcctttccccaaacccaaaccctagctcggtcgccgtctcccgaccccgaccagttgaccaccaactccaggggggtctccgttgatctggtgagcctctcacggcttgccgacccgtacgacgcggagctcgggaagcggactgccaggatgaccacggaggaggagctcatgggcttcatctctagcctcgcgggtcagtgggtgaaccagaggatgcggaggaagttagttgatgcgtccttcttcggggatcacctccccagcgggtggaggctgcagcttgggatcgagcggaaggaccgcaaggcctgggtgaactgcttcagttatgtgaggtgagcctcatcatcctttccttgcaaatgctgcaatgctatgggatccgttgttggtaactggaatgggggttataacttgcaataagctagagggctggatgcttgctatgatgtttagagatgcggtaatgtgtgactatagatgcaaaggatgtgtggtggatttggtttgtgaagattgttttatactcttttagtgtagtcaactgttgctaatcaatcatgcacaagtttatcagatcagttcttggtagttttgaatgattgatttttttttcaacatggccttcttgctgtcattatgtggattgcctattttccatggaagaataaatcttatttgttaacaatattattatgcaaacatacaataactgaatacccccaggacgagctgtttcatgacgagggggatgctatggctggacattatggtatagtatatatagtagtggtgtcggtatgacaaggcctcaggattagcatgtgctgcagcaattggagaatcatagtagacaaatagatattctactccttatttctccattagagtttcctagttttgtcattggagtcctagtagtattagatactagtttgtttcctttgccttatctagaggcacctcaatatacaaaggtagcctagtactggattatgccttgagcaataagaaatatctaaaggggattgacccaaaagcccagtcatttcaatgacatactagttaaatgataatgctgaataatctggggggcaaagacaagacttttgcctaccatagtataagagcagcgtggagcggtattgctttaagataatgagttttgttttattcctttgatatttgcttttccgcacttcatttgatctgtagttttaaggcatgcatgttatgcgattgcagcagcattatttagcaatggcttgattgatgcttactactacctccgtttcaggttataagactttctagaatctagaaagtcttataatatgaaacagaggaagtatatgataggttaaacataaagatagatttgtatggcgcatatcatatctcaagtatataacataacacatgtatgtgtaaatttgcttctcctgccgagttctcactgatacacaggtcctaatccaacctgtcaatgagaaccagtggataaagtgaattaaggacatggcatggtgtctaaaatgtctaaaataaacagtaattttcatttgctttatttaactgcaatgcctatttgaagtagtgcctagagcacatgagcatttcaatcattatctcgaatgttcctcagaactcaggtgttccaccatatatgctcagatttatcatctgtcgtagatgaataattttgttgtaataacagtaaagatcacttctcatcactataagttcgaaagtatctgttaagataacaaattcctatttatctgcttcacctttatctatcatgtgtgctactcatcagcgaacatatgttgtggatggctgcatcatttcagcgcaataattttgttcgtcacatttttcccctgtactaaatgggcatgttgtactttccagccccaagggacagagttttgctacttgccaagaggtttctgcatacctcatgtcacttcttgggtatccggagttcaaaacggataatattgagtatggtagcacacaacaacatggcttgtgtgctgacgatggtgttaatgtaagttgaaagtgtatgtcactttatcttgtgaacttgagtttgtctagtttaatttttggagtttgtggcaggttttaggtgttcaacaccaaattggtacaagtatggacagtcaaagtaatttgccagttgcttctgctactttttatagtcattcaagagatcaagacgaaacggttgcagatgatataaattcttatgaatgtcaacaatgcaatttaacttttcatggtcagagtgcctatgcgcatcacctgatcacttttcacaaagtgagttctaagaggcgtaagagtaacaaggttagcaaatttggtgagccagtgataggcaaagatgggaaatttgaatgcccagtatgtaacaagacgtttgaggaacagtcacggtactttggtcacattggatcccatgcaaagtatcaggggctgactcctgaagcattcctacaaaccttttcaggaaaggttggtaacaattcttttgcaggtttgtcatctagccttcaagtattggtcggatcaccacaactgaatgagaagactactgcttgtgaagcacgatcgcagcatcacgattgttcaactaaacatggaggcaatagtacaagaggtatagacctttttaactcaaatcatcctgctaacttcaatgggcataatcaatcttggtgtagatctgatgaaattcctcccaccacagaagctcaaagcacatggacttatagaaataatgagatgaactgtgctgatagaactgttccgagaacagtacctcagcccaatgatcacgaggattgcagggttagtggctttgctgaagcaactaattttaatgatcaagcaggaagacaccaaggttttagacctttctcctttggaactaccaaccattgtcaaggccagataattgatcatgcagtagctgcttccaagcatgctgaggttaataatagtatgaaatcaagagatgtcaacctcaattcacgcctgaacacaatatcctttcctattgcaactgcaaacaatgaaacatcgactgcccttaatgacgtgaatcggtcatgcattactggaaaaggttttagtggaagtttcagtaacaatgatggtgctgcatctatcgtgttgcccagttctggattaaacaataaaatttctagctccctcggtgtagctgacagatcatctattgctgccagatccttcaatgctggttatgtttatgaaaatggcgcttctgaagctaacaatattggcaacaaaaacaataccatggtgtatcaaacaagtttggccatgcgtccactctctcctgtaagtaacatggattgcttcacgttttgttcagtgcatttaaaaatagcaattgacatctattgatgcttataataataacatggatagcatagaaaacaaaacaagtaactaagctagattttctgttgatgcttataataatatcttgactggcaatgtcactgaaaggagtctacccagtgtaattgcaactccagtcacatagggcctaatatttcaagccataattcacttcctaaatcaagcacactagcgaccagtaacttaagcaaggggagtgatgtcaactggaaagttgttttaaaaatcatattaatccatttgttaaaaaaataactaatactccctcgtttaaggttataagacgttttgactttggtcgaaatcaaactactctaagtttttctaagtttgactaactctatagacaaaagtagtagtaatatttacaacactagcatagtttcattaaacctataattgaataaattttcataatatatttatgttgggttaaatacattactacttttttctacaaaattagtcaaacttagagtagtttgactttgaccaaagtcaaaaatgtcttactacctgaaacggagggagtacttaattaatcttgcgctagccatcgcttcgttttgtgcgcactcccgacctcagccctgtagcggctcgacgctagcattgtccatatgaggtaaataatagggaaaattccatctataccacaaagattttaccagtaccaaataataccaccagattttttctccttgttgtttaaaaaaaaaggatttttcctccttccaaaaataccacaaacttcacggagaaccgacagagtaagtagatgaaactgccctcacatctctcgttctctcatctctttaagtgatagggttggcaatctctgctcagcgatagggattgaatagtttcattaaacatataataattgaataatctctgcatcgcgtctgggacgaaggagatcgccactggtctggcccgcgtggaggcacttttctgcttatgccgccgcggtgttgtgtccgggcaggagaccccactggtcc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