Os08g0485400

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os08g0485400

Description

Similar to 2-nitropropane dioxygenase-like protein

Version

NM_001068622.1 GI:115476981 GeneID:4345877

Length

8135 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os08g0485400, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 8

Location

Chromosome 8:24076165..24084299

Sequence Coding Region

24076209..24076343,24076455..24076667,24078309..24078404,24078667..24078812,24078926..24079145
,24083184..24083216

Expression

GEO Profiles:Os08g0485400

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008401:24076165..24084299 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

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Protein Sequence

<aaseq>MGWKGILGFDHGVVQAPLGPDISGPELAAAVANAGGIGLLRLPD WPAPDRVRDLIRRTRSLTERPFGAAIVLAFPHEENLRVVLEEKLAVLQVYWGEFPRER VDEAHLAGVKVLHQVGSFEEAAKAKEAGVDGIIVQGCEAGGHVIGQEGLLPLLPRVVD LVSDTDISVIAAGGIVDGRGYAAALALGAQGVCLGTRFLTTEESFAHPLYKKRLIEIN CTGYTNVFGRARWPGAPQRVLKTTFYDQWKNLPEQETEENQPIIGHTIIHGVGYSSVR WYCS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>45..179#291..503#2145..2240#2503..2648#2762..2981#7020..7052#gcggcctccacctcctcccccgcgcgcttacttggatcggcgagatggggtggaagggcatcctggggttcgaccacggcgttgtgcaggcgccgctcgggcccgacatctccggcccggagctcgccgccgccgtcgccaacgccggcggcatcggcctcctccgcctccccgactgggtaccccccaccccacccctctatctgttcccttttcccttggggctcttcttcacagctagtactagtattattctgttcgattttttttttctgattcgctcactgcagccggcgccggatcgcgtgagggatctgatacggaggacgaggagcctgacggagaggccgttcggggcggccattgtgctggccttcccgcacgaggagaacctacgggtggtgctggaggagaagctcgccgtgctgcaggtttactggggagagttcccgagggagcgagtcgatgaggcgcacctcgccggtgttaaggtgttgcatcaggtgagattttcacatgccattgtctgttcaattagcttctatcagtgcttttgccagtggggtagctagagcttcgctagttagtacttcctccattccataaattaggtttacttttagcttctatttgttccaaaataagtttatttttgagtaatcattgtatcggagtttatgaaagtagtaaacaattgtattggggtagataaagtaggcaataattgcattgagatttgataaagtagcggtatttcagtccttttggtttgtattggtatgtgtgggatgggtgaggtgaaaaattaacttatattttgggacagaaggagtatatttgttatgctattgtggttacttatcagggaggttataatagctgctagctagaacttcgctaattagtagtatttcttaattgttatgccagtgccattgtttgtggttacttattattagggaggttgtagttataatgactgctgaatagaccatttgttcccaatatgttgtaaatgattggtgaatcttttgaagatattcttatgtttaacgttgttgcgaatcaggagtgcttcagtactccactctggatcatgttggtcttgtttgctcaaaatgctaactgataagcaaccaatttgccaacgctgaaaggagaaaaaccatttcattttatctagagtagaggaaaaatcatcgatggtaaactggtcaatggctggagatagttaccaacaaattgttaatagtcaaagcatgtgttggaagtcggaacagtagatgccagacaacaaaaagacagcactcatgacaaaaacaatgattgtctaagataacggtataacacgcaaaagatgatcacaaagagcacatgagacaagccatgaattagctaatgcaggtcggttagtccaaacctcaggctcttttggcttggtcatgaggataattttgtagcacagctaatacaagctgaatttactttggctgttgattaatgaaagttctctttcctcgcaaaaaaaaaacaaaaaaaaacagaccacatgaattaccggaaactgctcctaactgttacatgcccacatatgactatatgagccacagtgccacactatattggctcctttcactatcattccttggcttggcttaagtagaaatataggaacaagtgaacactgttagtgttagtacgatttatctgttatagagcattcaggcgttgatactcttcttttggtgcaaagaaagatgtaacaagcaccactgcaaaaaacttttttgtaacaaccctccctccagaagaaccgcacagcttagcccaaccgacgggcgggcccatttacacatacaattccacttatactttcgtcctcgcttcgtgtaaaagggttaacccggaagtgatatggttggagggaagaggccttataagttggttccaccattgctaaactaacaaggtggtactaaacaagcgcacacagctctcatgggccgcacatgcctcatcctaattgggccaggatgtcacatttttgcactttgtgatgatgatacacgaactctttcctgtatacgtcttcacatttgttcagttgattatgaactttgcaatatcccttgttatttgcgtaggttggtagctttgaggaggcagcgaaagctaaggaagctggtgtagatgggatcattgttcaaggctgtgaagcaggggggcatgtgattggtcaggtaagccagtgttttgtagttttggtttgttaaaagtctcaggcagcctttcaagaagcttcttggtcaacttcaggagtgttcatgcatgcatttagaatgtacagtatgcctcgaatctatataaaaggctaaagatttagcttagggcccctgttgtggtgccatctctaaagcataacatacctccctagcttgtcgccatataattatattcatgagatttcttctccaatgccttttttgttgtggggaaaaacaggaaggactgttacctttgctgcccagagtggtggatctagtttcagatactgacatttcagttatcgccgctggtggaattgtagatggccgtggctatgctgctgcattggcacttggtgctcagggcgtttgcttaggaactaggtattcttgcaatcttttctctgcacgagtttctcgatagtccatctgcaatcttttctttgcttaggaactcatagtctgattttcacattactagttccatgaacattcaggttcttgaccactgaagaaagttttgcacatcccttgtataagaaaaggctaatcgagattaattgcacgggctataccaatgtgtttgggcgtgctagatggcctggtgctccccaacgtgtcctgaaaacaaccttctatgatcagtggaagaatctcccagaacaagaaacagaggaaaatcaacctatcataggccacactatcatccatggtgtggtaagtattcggttatttcttttcgttgaatttgtcctcctttatttataagttgcaatcatttttgttatgggcttatggcctttttttctggcttattttgctatctggtataaagtatttcaatgccttcagttccaacatgatacttcatctagacacaatcaaaatcagctcaggcttttaatatgggcaaatagaacctcagtagtctagttcccaatgagaacatgaaggctttgctgctgtaagttcgcaacaaacacttttggttaatatgaatgctatagatgaagttttctcctccctagtctaaaaacagtgtaccacaggattacaggaatttcataggaaaacaatgaattccaatgggaccaagttttatgagtagcagtttagctcagcagttaacaaaaacaaaatagactaagctcacaagacatatcttgccctgaataacagtttgcaagacattccaaactgcgaagttcagacaaacagatttgaaatggttattgtagttcaggattctatttccttgagggagtattacccatttcaacaaggttttatatttgccttcttaccttctgtttttctaagatagagcaccgctacttgtctcttaggacatctggatatggtagggtagcccttaattaattgcttcgcttttggccaaaatggtactgcttgctgttttctaataccgatagacatctacagtggtggcctgtcaattcttctagataaagctttgtatttttacaataggacttccataactgtacagattcaaccatttttagtacatacaaaaaccaacttcaaataccagaattataacgaataaatttaccagaaatataataaatattttctagattagtttgatccaacatctcaaaaaagtcctattataatctcatacttgtctaacaaatagttaattttcatagttatgagccttcatattggctgttatggagatctttagattaaattgtaagtcgtctagcaatgtaaattatttcgatcaaatcatcagattcataaacatgatgaaaacattaacttcttcatgataaggtaataaatgtagatattatttaaaatttatattcttgaagatatactcttggtcattaaaaaatgattcttgatatgcggtagtctaatattattcttgattagattgttgcaattatagctaaggcaaatacgatgtaatatgaatactaagtatgcacaaatttaactaaagaagtaaaatattatctaaaacagaaacaaaatatttgttaacttgacaatctcacattgttccggtgctaaaaaggacacataatgtatgatgttgttaaagaccattacaaatatatggaattactcatggaactcttaacatgcacctagctagctactacccgaaagtaggcatgatccggttgtccgatggttaaactccattggccaggctcttcttatatagggcattatacgcaacacaaaaaaggaactaccttccaagatagtagaaggcatttttgctacgaagtgtagcaaagtcaaggctcgatgggatcatctaggtggaattgcaatagccacgactctaaactaatatggaatctccgatgtcgtttacagatactctattctgtccatccatcatgtactgtgcaaaccattagggatgttatgggcatgttgcctttaacaacctatcggacatgtactggcaggtgacaagcagctcaacctttcatgatccacccactcccacacactgacatcgtcgtcatcgagctctatcagctgcttgtgcatctgatcaacattcatggtagtaagtatgcacgggtaacgtttcatcttctctttcaaattattccttgagacaatagcctaagcaacaatagtgataggcttgccacggtacca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External Link(s)

NCBI Gene:Os08g0485400, RefSeq:Os08g0485400