Os08g0495300

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os08g0495300

Description

Conserved hypothetical protein

Version

NM_001068666.1 GI:115477069 GeneID:4345922

Length

8578 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os08g0495300, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 8

Location

Chromosome 8:24540294..24548871

Sequence Coding Region

24540294..24540373,24540564..24540632,24542347..24542434,24543664..24543880,24544162..24544307
,24544378..24544416,24547814..24547896,24548862..24548871

Expression

GEO Profiles:Os08g0495300

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008401:24540294..24548871 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgccaccggttcgcacgtacggccggcgccagcgccggcgccgcggcagccgtctcagtcctactcgctcgtgcgcaccatcatgtcaggaggaggaggaggaccatgtggttgagactgcatctgcacaaacgcatgccgatccgccgtatgcaaaggaggggcatgtgccatcttccatcactgctacttcctcatcctctcagcaagcagatgcagtagatcaggacaccgaggatttggcacttaaactcaaagatgttttgcactaccagccaatttgtgagaaccatatttggtactatcatctcaatttcactgcaaagactaaagaagctgatggtttagactctactagtgacaatctgttctttgtggaagtcaaacgtatgggaataggaaattatgaagaaatgttggtcagctgtttctgcatggttaatcctgataatggtaaaccatgtaaaggttgtaccaacaatggaactgttgacatgaagcaccctgacactgatgaatactttgctggccacttggatgcatatttgccttttggatgttttggaaagtggagcgactctaatgacgatgataaatacgtgaaagctagggaggccaagttaaggcatatgtacgagaagacctcaataatgatggtggtgagtggtgaatctgtcactatccactaccactcacaactaccatgtgggtccctcaaaaagccaatttga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MPPVRTYGRRQRRRRGSRLSPTRSCAPSCQEEEEDHVVETASAQ THADPPYAKEGHVPSSITATSSSSQQADAVDQDTEDLALKLKDVLHYQPICENHIWYY HLNFTAKTKEADGLDSTSDNLFFVEVKRMGIGNYEEMLVSCFCMVNPDNGKPCKGCTN NGTVDMKHPDTDEYFAGHLDAYLPFGCFGKWSDSNDDDKYVKAREAKLRHMYEKTSIM MVVSGESVTIHYHSQLPCGSLKKPI</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..80#271..339#2054..2141#3371..3587#3869..4014#4085..4123#7521..7603#8569..8578#atgccaccggttcgcacgtacggccggcgccagcgccggcgccgcggcagccgtctcagtcctactcgctcgtgcgcaccgtatgtcgtccgcctctctcgattatttgctttctgtttggttcggaacgatccagtcgaatccgaatcgttttgtttatctgttgcttggattggattgaagttacgtatatagaccatcccatcctgattttgttttctttggtgacaatttcttcactcatcttcgcttgaaattgttacacttcagatcatgtcaggaggaggaggaggaccatgtggttgagactgcatctgcacaaacgcatgccgatccgccgtatgaccaccgcagtccctctcccttatcattctttttgtgttgctgatctagtccaagggtatacttaggtctttttctgttgctgtcttgctgatctagtcgaaggttatacataggccaaatggttatgaagggttggattcttggatggttagggagagagggctctcgtattgatccctatgtatttcagtcggatatagttaccagaagatttttgtcctacaccaatccctatgtatttcagtcggatatagttaccagaagatttttgacctacaccaatttttctgtacaaagctaggaaattctttttttttcttgtggggctctatcaattcaatgtcgaattataaatgctataggtttttcagacattttattccttaatatacagtcgttttgtggggcaatgaattccattgtatatgtggcctttttctttctgatgcatgagagtagcttcagtggccgttttcgtacaggagattagttaatttatttttacttacacagctgttttcgtacaggagattagttaatttatttttacttacacagctcatgttcaacatttgcagctgtatcatgccaatttgtatttaacttgttgcttgtgatatccacctcttgcaagttatgctgctatcatataatttaatttctttttctatgcttagttgaactcacttttaggacccaactgcattttctacattcctaagcactgtttttcactaataatgaatgttactccctccgtcccattttacagggtgtgatatatttttttataagaccaagaaaactggtcgtgaggaaaacaaatactctcttacccctaattaatcgcaagcatgcaacaacttcccacggcatgcagaattgattctgttggtaatgcggatttgatttgcgcaactaattagttcttcccatcttcccaaagcattcaacggcgcatgcgaaaggataatttcgggaaaaatcacaataaaagatcatgcaccctctgttttgggacgacatagaaaaaaaaatgtgcgccctctaatctgcggcggagggagtacgagtgacaactgttttcactagtttttctagaatctgattatggtggtttgttgtttctcaatctgatctaaatcatggacttagcttcaatttgtaggaactgcttttatgaatttatagttatgcatgatttgccatgctaccaaattgaaatgacaccattacagttaggcatgcaaaatttgttttgacactgtaaattgtgtattgggtaagtgtgatgttctacatttcagcccattagtaagttaatttgtataatattccctggtatcatgtggattagccacttatgtagagttcttctcaaatatggtaataggccagtaagaataccagagatatgcaacagaaaaaaacggtcattgaatggacagctggcatctgtgagcctatttatgttttctgtgcctgttagtatgctttcttgttgacaaacctgattcgttggcttttaactgtgccaaaaaaaaatccgtttatgcctgcaaaatgtatcgcaaaatatttcctattttagatagatagttccttcaactttgtcatctcacggtggtaatatgcctatggtttttatgtctcctaagataataataaattcttcttctactcatttagcttgcttgttccatgtcaggtatgcaaaggaggggcatgtgccatcttccatcactgctacttcctcatcctctcagcaagcagatgcagtagatcaggacaccgaggtctggccaccatctgcaagctgcctttcctcatctccggcatcacgcgtttgggctcgacatgtgaaagattggggacgcatattttacatcagggttgatcttcagggatctttccacacatatcctaatgtgggtgggccatttcaaagctcacaggaaactgacaaggctattgatcgctatcttgaggaccattgggatccaaaaatgtaaagttcctcaactgctatttagattttttattatttcatttcttttgtttgatgtgtatgcttgcagctgattatattcaaacaaggctacatggctgatggtataatagtataggtgatggaacataatgcagttttaaaagtatgaatcatgaaaacgacgaatggcctttagttaaactacatataagttgacacattgattagaagaagtacaagcatatgttagtttttaaaattcttgttttgagagtaattaaagttaatggaaaattttacgactgtacttctgtgggagttgctgaaatattgcacaagtcattagcatagctgagaattatgaagtgcatatagatgttatggcaccgctttgtttgtagctatatttttgttttaattgtaatttatatgattggttaacttgccctcagcagtaaagaaaaaaaagatttacaaacaataggttccaaacgagctggggatctagaatgacagaagggatttcttagaaaaatgccgtgggaacaggcttgtaaacagtcatttcattcttttgtttcggtttttgttaccaccgtaatctattttagagggtcacttgggtgcttttgatgcaagctaggactgataacattgaatgagttcttggtattattttgtgttctccattttttttggaagtacaatctactaatcgtatcggatgctctgatttaaactaggcgcatggggccagatgataatgtctctacaatggataaggttatacggcgatgcctttactggcctgatggcagaattaagaggcatacaaaatcatcttcgactagggcagccaataagagaatgcaccaattcatccaagcattagtcgacaagtataatgatgatcacaatcttttgggggttttctctctctctcttatctcattctctgtccttctgctttggttgcactgtcttatttatcttattatgtaggattgcctatctgatccatcctttttattttaggatttggcacttaaactcaaagatgttttgcactaccagccaatttgtgagaaccatatttggtactatcatctcaatttcactgcaaagactaaagaagctgatggtttagactctactagtgacaatctgttctttgtggaagtcaaacgtatgggaataggaaattatgaagaaatgttggtcagctgtttctgcatggttaatcctgataatggtatagagtacttctatcctaataaagtactgttaaattactgttggtctcgctgcctttgcgatatatacttgtaaatgtttttttgttcataatgtagtactgtactataattttactttatttaattatctttttgtttccccttgtgccatttcattcattatcaatatccatttcatcgcacatgtgttatttatcttcaattatttgattactattgggtgcgtgtgtctggttgattacttggcaattaactgtccttttcttttgaaattaaggtaaaccatgtaaaggttgtaccaacaatggaactgttgacatgaagcaccctgacactgatgaatactttgctggccacttggatgcatatttgccttttggatgttttggaaagtggagcgactctaatgacgatgataaatacgtatgttgattttgtctgttggcaaccttaccattattgttctcgagcatgagtttcccctcttttacaggtgaaagctagggaggccaagttaaggcatatgtacgaggtaatgtcatgcttttttttttaagggagagaggagagggggggggagataatgtgatgtttttgtgcgggatggtaccgtccacgaatggaatgttcattaactgttactccctccatcctaaatataagggattttgattggatgtgatatatcatagtataatgaatctgaatctgtacatgaagcatgtccagatttattgtattaggatacgtgacatctaaccaaaatcctttatatttagggacggagagagtagtaactccttgtgtatttgttgtcttcaaggcattgattatgatacacttgttacgaagagagtattcacactccctccgggtgtgactattgtggaagactaaaaattaagggatggaggaactactcactccatttgggtgaaacgtcgcaacacgtgcagaatgtcggtatctatgaaacacaatgtcgatcggtatctaaaatatgatacgtctgctatgtatatatctctaatgtccttggtttgcatgggttatatccgttggcgtgcagctcactgtgatgagatttgcatgccttgctgaatttggatgtttggagataattaatttctgtggactgaatgcctgcactacacctgtttgcgcatgatcaccgtaggctacttcatactgtaattccagccaatccaagttaggacctactttgcttatttacttgggtcatttgtctggtgatagcactaagtaaaactcgtagcatactaacctttcatagcggactaagcggcgaacgtcaacacacgtttaacaactacaatcactaccgcctataatcagcatgttcgcttgcccgattgaacgccaagtattagtcgccctaccctgttcatgttttgctgcctcgcagtacactccgaacttttcaactctcaaactatgtctccacctataacataacaatttagtactgtatgagatatattctagtactatgaatttagattagaatatgtctcgtctggtactgagttacaatattatgagacggagtatcaatgtcggtattagattacaatattatgggacgaagagagtatcaatgtcgtaccaccaacttttcaagtcccaaactagttccacataaactccgatatggatatattgatacgacataccccaatacgttttattttttacaaacatggatacatgatacgcctatacataatataatgaataaaattagtaatgggattctacatggagtgccttaaattctaagaagtggtagataattggaccgagatgtctttgcagcgagtgcggcccaccttgttggaccggaacttgatttctaccatcgtgcggcccatcctagttgggccagaacttgatcgcaacgaacatgtggctcgtcatgctgggccggaatgtgacggcacgcgcgtcatttgcccgccaaaatagggaaaaaaaaaaagagacacaggactaattcatcagttgatgcgttgcattattgcatacttgcatttgaattttgaggataagctcttctttagaatggagatctttttaaaaaaatatatattatagaaattgaattaatcctcctaaagttcctataagatttctacattcaaagaagttttatgcagacaacttattttcagtgttgcgacctgaaaacctgaacgattgaagatgcaaaattcatacttatttcttctgcgatcacatctacatcgatcaccagcaattaatccattgctgttttgacaacacgatgcatatgctcccaaatgtaggtaacccttggttgagcccacaccattagcaccacacacatgtcagtgcttccgctgttgcctttgcctaccagtcacgactcacgagtgctggtacagctacaagccatgcttaattaccttccaattaattttttgttctaaactctgatattttgtttgtcagaaaccaattttttctccgcatactgtgatagcactaatttttagtatctgttcttcagagttcagacaagcacaaactaacgataacatctttgcatactgctcaatgctcaccagtcaccttctctcttcccataattaacgaaaatatcctgggattaagtactggaagtgtgtgatcagtgaaatgcttgtgagtatcgttggataaattggactgattcttctactcgtagcacgtatactagcatcgttgtcgatgtaggccaaggaaagacaatcgggcaaagaaattgagactctaattatagggtacgtgtgcaggagcagttatgcatcactgaccccagtgtcattttcctaagtttttatctgcaacattgcaggctactagcttagacacctgtccttcattgtccagccacatgagcgccaatcttgacaaaataaaacatatccatccaaggaagctgatttaatttgctggaaatgctaagtatggacggaagtttcctaatagaatctatctttgatattccctatagttaagtttatttttgttagagcatttactgctttgtggtgtggtaaataaggactatacaatttacaatgttgtaataagtaatggcagcttacatcatatgatgcaggctgggctttttattctatcataagacaaaaaaactaatcttgcacttgttatccacggtgcccaagtgatggtgcccagtgctgcactgccctaatagcatgaactacgcataactatgataagctcaagtagcatcttccagttctgggttcgattatccgtttgagcgttttaggctagattaaaacggtcattttgtggcccttttataaaatcaggcatgttaagaatcgatgaataatgggtgagtcctcgtgtgggcagtggcggacccagaaaaaatacactgtgtatgcccattctagtgatcactctactatatatttttttaaagaaaatacctaattctgatggaagaattttggcggattttggttgatttttcaaatttctattcaaatgtggtccatattcatgaaaaatctataaaagtcagaacaatcaatcccatgttcttcttttccccgcaccgtttctcttcatctagtcatttcctctttccctgatttgatttattgacgattacgagatctccagacaaaccgtgatcattgttatattctattttctgagaggattccatttttatgtccagtgccaacccggcacacccctaggtccgcccctacgtgtgggacaggatccttaaagcacatgttaagaacatatatacagggaatgagttcacatgtaggtgtaagggtccgtggcttttcttaatcagtttgattaaagcttcttcctctatactctttaaaacttctccctctataccctttcagaagacctcaataatgatggtggtgagtggtgaatctgtcactatccactaccactcacaactaccatgtgggtccctcaaaaagtgaggcaggtggacttttgtcctttcctcaaccttaagtcaccaaatggcgaaaatttcttttgaagtgtggtaaaaatgataacaaatatgtaatatgctcttaagattttacaatgagaataactttactttaatttttgaggctttaatgtggttctcttgtttaaattttgttgtaacgcacgggcattcacatagttttaataaaacgttatgggacgattttttttctgctggttaaattttttatgataaggtgaacgtcgatgaaattcagacagtttgtacaaaactgatcactcaaagactgtgatcaggagttcgagatagcgtaacaagaaatcttcttgatacacctgtaaaaaacctaaaaactatcagaatgaaattaaatatatgcataacaagtcaaaaactggaggttggcccatcggtcactgccatgataaattggttgcaccttctgacccgtatctattactgcaactcaccaagttgcccatctttttaacctatctcgtattacgtactacacatcactacatcagcaagcagaagtgacaccagctaggttgttttacccactaactcccaatcatagcctgccaaagtttgcaaagaaattattagcacatatttgttgaatgctttaatttgcttggatacttctttaattctgttcaaggttgttggcttgctcgctcaattagatactacaccacatctagaattggctagacatgtagcaactactttgctaattgtgtgtgcaatgcaatatagcattaggccatttgtggaaggctacacatggtgcttgattaattggcgtgtgaaagcaaaagattggttttatgatgttggttaaggatacaatgggatgcaatcatccattttttggatgcatatgcgttgcaattgtgacgttcaatgaatcttatggataccttttattttcataggccaatttga</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os08g0495300, RefSeq:Os08g0495300