Os08g0534900
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
| Gene Name |
Os08g0534900 |
|---|---|
| Description |
ARM repeat fold domain containing protein |
| Version |
NM_001068886.1 GI:115477510 GeneID:4346150 |
| Length |
6117 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0534900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:26775992..26782108 |
| Sequence Coding Region |
26779722..26779973,26780072..26780178,26780487..26780619,26780728..26780922,26781472..26781825 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:26775992..26782108 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008401:26775992..26782108 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgtcggacagtgcgttgaaagatctgaatctagctcagtcagcagagctggagaaaaccaaggacagttctgccaagtcttgcatcaccaagcctgtcttgaatggcaacaaatgcaacaatacggaagaaaatgctccacctgtactccctgatgctgtgactaatgggtgtgaagctggaaatgcagatgttgagtatattgattctgagagtctgacagatcttgaagatgctggtgcaacccttagtactttagttgcaaggttggattcaaaagactgggttatgacatgtgaagctctaaataatgttcgtcagttggcaatatttcacaaggatagattgcaggaacttctagagcctctagttcctcttattgtgaaatctgtcaagaatccaaggagtgctgtctgtaaaaccgcactcatgacctgcgctgatattttcaaggcatacggtgacctaatggttgactcaattgatccactgttagtgcagctatttctgaaatcttcacaagataagcgttttgtctgtgaagctgctgaggcagccctcatatcgatgacaagctggatcgccccttctgctctgttgccaaaaatgcaaccttaccttaagaacaggaatccacgaattcgagcaaaagcatcaatgtgcttcagcaagagcgtcccaagcttgggtgtggagggaattaaagaatatggaatggataagcttgttcagatcgcagcaactcagcttagtgaccagcttcctgaatccagggaggctgctcgcaagctggctttggagctacaagcattctatgagaaatcccaagcttcgagttctggtgaagttgacgacgcacctgctacctcacctgatgctgatgctgatgctggtgctgaatcatgggaagctttctgccaatcaaagctttccccattaagtgcacaggcaatccttcgtgtcacctctacgacgaaagagggtgtggctgtgggtgtcacctctacccctccgaaagaaggcgtcactgttggttgctag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSDSALKDLNLAQSAELEKTKDSSAKSCITKPVLNGNKCNNTEE NAPPVLPDAVTNGCEAGNADVEYIDSESLTDLEDAGATLSTLVARLDSKDWVMTCEAL NNVRQLAIFHKDRLQELLEPLVPLIVKSVKNPRSAVCKTALMTCADIFKAYGDLMVDS IDPLLVQLFLKSSQDKRFVCEAAEAALISMTSWIAPSALLPKMQPYLKNRNPRIRAKA SMCFSKSVPSLGVEGIKEYGMDKLVQIAATQLSDQLPESREAARKLALELQAFYEKSQ ASSSGEVDDAPATSPDADADAGAESWEAFCQSKLSPLSAQAILRVTSTTKEGVAVGVT STPPKEGVTVGC</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>3731..3982#4081..4187#4496..4628#4737..4931#5481..5834#ctcccggccgtagaccatttcgttccgacgcgagtaattcctccccacgggcggcgactagggcggctagggttcgtcgggcgccgccgtgccggagatcgcctctcgccgccgacacccggatctccgccgccgccggtcgccccaggttatcccgctcccgcagtcaccatcccgtcttctccgccagtcgcctcacgcccggcctggacgccccggaatccattgtcggtctcgccccgccgactgccgttgacgccactggctgaaggtaataagccgctcacctctccctctccccctccccctgcgagctcatggatttaatccattcgctcgtgcgtgttctccgtacttgggtgaactaaacctagttcgtgttctccctacttaggtggagtaaaatagttgaacgtttgttctctgtacaacaactgtcacctatcttctcatttaggagcttcgatttatcctagaatgaacggaaccagcggttttggatgagttcagtactgtggtactcttgttctcgtggacgatttagaggagccactcctgttgagaagaattatatttcatagttccccgatggtaatgaatcactagagcccgtattttgctagtatatattgattaacttccacaaatgtgaaggataatcatggtgcatagtttttgtatgtcaagttttctcaatcaggtggcagctgtattgcttgctagtaaaaatgttgtgctgattggttgtttttaaaggcgatacgcagattggttgcttttcttagatgaaattctgattggttgctagacaagcagtttgcccttcaaatgctatggcccacctgcaaacgccctagagtgctttggtgctctaatctaaatgacctaggaaaggattaggatgctgttgcttaagttgtttgggctgcaatggatacaagttagttagggctggaaatgatgatctccattttcagaacatataaggctgggaatgggccttggcctgtcaccaggccttcaaatggagaatagacaaactatgtcgacttattagttgtgttttctcttgctcttcttttgtctgtaagtgttgggtgttctatttgtttttatacggaattaattgcacgcaaaaaaccgagtgctcacttctgcaacgttctaatggttgcgaccttgggtcgttctcccggtggactcgtaccaccaaatccgcaactgccgctgcacattaatcacttcctccttgatttttcaattttaaaattgaggcccccccacccccgtaaacgccaatcagatggatcggaattccttaattattgccgaattattatggaatcctatgggttgtttgtcgtacaaagccctttggaaacttcattttgctcagcggaggacatgtgctggttagttacatatggaattataagcaggaaatcagctgcattttgcattctcgttagtaagattttctttttatataaaaaagaacccatattaggaccgttatctcgttctcaccccacagattgcgtatcttctgcttcttcttcttcttttttttgctaaactgtgaaatcatcgagaaaatcccaaatttttaatatcatttttacagtttaagcttcaaaacctccaataacatgaatataaatgtttatccataagatttttttgttagttcatttgtttttttgtcgccttatcaatgatagttcaaatgattagagcttagcaatccttttttcaatttatactctcattttccacgtgtttcccgaattgctaaacggtgtaattttcttttaaaaatgttccacaggaatgctactttaaaattatattattttttattttagttaataattacttaatcatgcgcaaataagatacatcgttttttttcgggagaaatgggttagcagcaatgttgcaagctactacatccgttttagattataagctattttgactttgatcaaaattaatctactttaagtttaatcaagtttatacataaatatactaatatctacaacactaaattagtttcattaagcttataattgaatatattattatagtatatttgtattgcgttgaatatgtgactacttttctaaatttaatcaaatttgaaacaattttactttaatcaaagtcaaaatgacatataatctaaaatagagtgagtatctctgtagggtgtgtttggataataggaaatagggagtgagattgggattgaaaattgaatgaagagttaggattaaatgaaagagagagaatagatggttaggatttaaatatgtttttagtaggtgggaaatcatttccatatcctattagccaaacactggcctaagctaataccaacattcttcaggagctggatgcaaatttggcagaccaagtccaaaacacgacagccagcagcagcagcaggacaccaacgcgacgccaccacagtataactcgacgcccccactcgctctctcccccaacccaatgacagcatcagtattccagtagcagcggagagagagagggagcggccaaccaaaagcccaagccaagccaacgccgcgtcgcgtctcagccagccagcgaactccccccacctccggcggcccggcccggcccggccccgcctcgctccccggcatcaggtgatccccccatccccttccccgccccctcccctccccgcgcgcagcattcgcagatcgcatctggctcgctggccgcccgggccccgctctcgcttcgcgtgtgatgtgatgtgatgtgatctcttccccccatctctcgcggcgggattttctgggggattttggttttttttttttttgttttttcttctcgggatttatgggggttggatgggatgagatctcgctgccggacttagggatggagtacagctgaaatggcgccgtcggtgtagtgtgtgtgtgtgtgtgtggacagcgtgcggcggtgtgggggtagttgtgaattagcggtggtcgtggcggcggatttggaggggagatctagcccccgctcggtgcttcctaggtttgttttcctaggtcgtggacggaattgaggaggtactgattcggatgagggtgtcggtagaatacggcgttccggacgacttgctggttgctgcttgttgtttcgggttgttgagttgactgtagctgagttgctgatccagttcgttgtgaattatgcgctaatgcagtggtacttctccatgatgatgattttgcctttttgtttccccttactattacatgattcctcagtacaaatgagcaatcattcgctttgtttgctttggagtatggatattagtggcggtttaattattgtggtacacagtggtggaaggattgcagagttatatatatacctggtggaatttggattaacgagagctcaataacaaccacattgtggttgatttggtcacctatagtttcctatgagcatctgagggctgactaattgctggactttagaaattagaatagctgttgttgcttattgtatttacattgctgttgttatattgttcctatatggatttgtaggctacagctgtaccatattttaattgaaaatgctccaattacttgtcagatatgattcactagctgcatatgaaactttaggagaggtctgagttgtacatggccttatttttctacaatttctctgcacaggtgtgaatatgtcggacagtgcgttgaaagatctgaatctagctcagtcagcagagctggagaaaaccaaggacagttctgccaagtcttgcatcaccaagcctgtcttgaatggcaacaaatgcaacaatacggaagaaaatgctccacctgtactccctgatgctgtgactaatgggtgtgaagctggaaatgcagatgttgagtatattgattctgagagtctgacagatcttgaagatgctggtgcaacccttagtgtatgccaccagatgtttatattcatgatcttttttgtgcttggcatttttctgattggaccagccctaacatttgatcatttcttactgcttgatagactttagttgcaaggttggattcaaaagactgggttatgacatgtgaagctctaaataatgttcgtcagttggcaatatttcacaaggatagattgcaggaacttctgtaagttgcttaccttgttattcaatcaaaaggatctttgtttttgggcaaatgttacttatccatgcctgaagctatagaattacatcattctctgtatcttaatttttggatttgaattatagggaacctctagttcctcttatcatgaaatctgtctgaagaaattcattctgttttttttattggacccaggtttattctcttcgattgcttgtatctcaaaacactcaagaatccaaggagtgctgcctgtaaagctgcactcatgacctgttctaatcttaatttttggatttgaattacagagagcctctagttcctcttattgtgaaatctgtcaagaatccaaggagtgctgtctgtaaaaccgcactcatgacctgcgctgatattttcaaggcatacggtgacctaatggttgactcaattgatccactggtgtgtgtttctcagttctcaaacttccattcacaattacactagttctttttcctgtactaactacgctatttctcaaaacatcttttctgccaaatttgttctcagttagtgcagctatttctgaaatcttcacaagataagcgttttgtctgtgaagctgctgaggcagccctcatatcgatgacaagctggatcgccccttctgctctgttgccaaaaatgcaaccttaccttaagaacaggaatccacgaattcgagcaaaagcatcaatgtgcttcagcaagagcgtcccaagcttggtaagtgaaaatctcacctgaaatttattttaagcaaaccgcttttgttttgcctcaactgttatctgattatctcctaattaacctaggagaggccaaagacaaactcaacataggatttagctctcttttctcacattacaagtactcaatgaatatcttaattcgtggtcttgttggttggcttagagttaacacacagttttctcgaccttttttagtctatttagatatgcagatgcgggatgaggtttctgtattataagacagacctgtagcttttccaaaactatgggctagtgtgtttggtagagattctatatgccgagaataattagctgacaaatgatttttacctgtggccttttacttcgaggaacttcatctaccctaaattgcctggccattattagtagtgtgacggtatctggaatttttttttcttaattggcttttatgtagtttgtatatcaatggttccatgctctaaccaatgctgataacatcagttttagatgttttacttaaattgacctattttgtttccagggtgtggagggaattaaagaatatggaatggataagcttgttcagatcgcagcaactcagcttagtgaccagcttcctgaatccagggaggctgctcgcaagctggctttggagctacaagcattctatgagaaatcccaagcttcgagttctggtgaagttgacgacgcacctgctacctcacctgatgctgatgctgatgctggtgctgaatcatgggaagctttctgccaatcaaagctttccccattaagtgcacaggcaatccttcgtgtcacctctacgacgaaagagggtgtggctgtgggtgtcacctctacccctccgaaagaaggcgtcactgttggttgctagcatcaggaggtagtagatgcaatgaggttgtggtttttccatccgattcaccttttgctgtacatggttatggttgttctttctctacatccaatctgggattcgttcgttaagcatcggttcgagagttgaggtgtgacctgtgggtgttaatattggtgcgagatatacctgttatagttgaccgtatgatcttccttttctcccactgcttggtattgattggtcaggcgaattgtagaatttcttccactattcaatattactacacagtaatttttcc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
