Os08g0566400
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Structured Information
| Gene Name |
Os08g0566400 |
|---|---|
| Description |
Ribokinase family protein |
| Version |
NM_001069076.1 GI:115477890 GeneID:4346357 |
| Length |
5396 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0566400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:28458575..28463970 |
| Sequence Coding Region |
28458624..28458764,28458871..28459038,28459110..28459184,28459265..28459317,28459806..28459956 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:28458575..28463970 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008401:28458575..28463970 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgacgatggtacgcatcatcggcccaagtccagctcaatcctcctcaccaacaccaagacgaccacgacctcctcgccctcgccgccgcccaccgaccatggcctccgccgccgcttcttcctccaaacctcccgtcgtgcttggctgcggcgccgtctccgcggactacctcgccaccgtcgcctccttccccaaccccgacgacaagatccgaagcctaacgctcaaggtccagggaggcggcaacactggcaatgccttgaccgccgctgctcgtttgggccttcgcccaaggatcatatccaaggtatccaatgacccacaaggaagaaatattctcaaggagctgcaagatgatggggtcgacacctctcatatcctggttgcagaggaggggaattcacctttcacctatataattgttgacaaccagacgaaaactcgtacttgtattcacactcctggttatcctcctatggtccctgaagagctcacacaagaaaacttgtttgccgctttagacggtgctgacattgtatattttgatgtcagattgcatgaaactgctttactagttgctgaagaggcaagccaaagaaaacttcctattttgattgatgccgaacggaagagggatggattggacgagcttctcaatttcgcatcttatgttgtatgctctgcaaaatttcctcaggcttggacaggagcctcatcaacaccggttgctttggtgtccatgcttttaagattgcctaatatcaagtttattattgtaacccttggagaaaagggatgcttgatgcttgaaagaagcacaacagatgcttctgaggcagaggaaatagatgtagagagtcttctggaatcactagagaagaaagaagttttgagttcaagcatgccaaaatgcatcgcctccaagtcaaatttgagaataagtgcagatggaataggatccatcagtggcagattacttttaggcactgccgaaattataccctctgaagagctcatagatacaactggtgcgggtgatgcatttatcggagcagttctctacggtttatgctctggcatgccgcctgagaagatgctgccttttgcagctcaagtggctgcttgcgggtgcaggggtttaggggctcggactgctcttccccatcgcacagatccccgcctggttgcctattga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MTMVRIIGPSPAQSSSPTPRRPRPPRPRRRPPTMASAAASSSKP PVVLGCGAVSADYLATVASFPNPDDKIRSLTLKVQGGGNTGNALTAAARLGLRPRIIS KVSNDPQGRNILKELQDDGVDTSHILVAEEGNSPFTYIIVDNQTKTRTCIHTPGYPPM VPEELTQENLFAALDGADIVYFDVRLHETALLVAEEASQRKLPILIDAERKRDGLDEL LNFASYVVCSAKFPQAWTGASSTPVALVSMLLRLPNIKFIIVTLGEKGCLMLERSTTD ASEAEEIDVESLLESLEKKEVLSSSMPKCIASKSNLRISADGIGSISGRLLLGTAEII PSEELIDTTGAGDAFIGAVLYGLCSGMPPEKMLPFAAQVAACGCRGLGARTALPHRTD PRLVAY</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>50..190#297..464#536..610#691..743#1232..1382#1824..1934#2783..2909#3404..3504#3829..3967#4375..4427#4939..5016#ccctctatctgagtcagctgcatctcatctgcattccttcctcgtggcgatgacgatggtacgcatcatcggcccaagtccagctcaatcctcctcaccaacaccaagacgaccacgacctcctcgccctcgccgccgcccaccgaccatggcctccgccgccgcttcttcctccaaacctcccgtcgtggtacgcctctcctctcctcttcactccctcgattcgctccccgcctctctctctctctctctctctctctctctcatctgcacgcatcacacccacaccctcacagcttggctgcggcgccgtctccgcggactacctcgccaccgtcgcctccttccccaaccccgacgacaagatccgaagcctaacgctcaaggtccagggaggcggcaacactggcaatgccttgaccgccgctgctcgtttgggccttcgcccaaggatcatatccaaggtactacccacttcacttgctcctccttcaattcaattattactcctatttacgaaagcctgcactaccaggtatccaatgacccacaaggaagaaatattctcaaggagctgcaagatgatggggtcgacacctctcatatcctggtactaattactttaacttactatgccttttcttcttttctaccagtaataattatcatggatgccgcatcaattttcaggttgcagaggaggggaattcacctttcacctatataattgttgacaaccagacgtaactcactcattttctacctactctacatgtttattagatatatatatgtcctcatgtttgtacaactagctaagtacccatgtgttgcaattgcaacgcaactttaaacttgacaagttctacataatccttttaagagatcatatatactccattcccaactaagcataacattcctaaaagaagcaacatatgcaaatctttcttctaaacagatgccccttgacttattttaagtgaagtacacccttttggtcacttgcttaccaatggatatgcatttacagtttattcattggtatgatacaatgtacatatcactttggttcacgtcctgctgttaaaagtgtcccctttttttatctcttttttaaaaataatcttaccgttcatttcacaaatcggatggtcatacaaaagtggcactctaattcttaaaatattcagcctgttattactactgtttaattccctctttctttcaggaaaactcgtacttgtattcacactcctggttatcctcctatggtccctgaagagctcacacaagaaaacttgtttgccgctttagacggtgctgacattgtatattttgatgtcagattgcatgaaactgctttactagttgctgaagaggtaatattttcctggcacaaaattttatcttcttatagaggatcttgcaaatataaatgcctactctctgtttttaatattttttttgggtaggggcactcaaatttcccatttgcgtttagtggaaactattagagttcttagaacatgaattgtcacttactaaaagtttattccagttctatacaacttaatgggcaactgataccatacataggaatgttttttttcctattcggaattccactctttctacatgtatgtctgggaatatcactatgaataggaaagctgccatgtccaattcgttaatatataacatatgcagtgtcaatgccatgtgtaagccttttttctacacacctgtagcatttttttgttttggtcaagggtacgcctagtagtgagattgagctttgtttgaggaacaatccagtgcaggcaagccaaagaaaacttcctattttgattgatgccgaacggaagagggatggattggacgagcttctcaatttcgcatcttatgttgtatgctctgcaaaatttcctcaggtaactaattctattgcataagggtttaaccattaagccctgtctgtattcagcaagaaaagttcgctttaatgtgcattatttttctcctgaaaagttatcttaagctatttttctcgtttaaaactggtaagtgtgtacgtttggcattgccttgtgtcatccgactaatcacgattagtcatgattaatcgttctgatcggcatcagtagcttgattatgcactccgacacgattagcttgatcagaaaactagttgtccgactaatcaccgaccaaacgcgattactcgtccggttatgctatggacgactagtaagaagctaccaagccatgcttgatgcttggattccttgctttcttaacactttacacacatttattatagtatgtttgcatggcatagtactaaatcacagatttactaccatatatagaaaaaaatcgttataatgtagagttatacttaactacttatactatacacattctgggtaccaggacgactagacaccgactagcaatcgactaaccggacctgatcaacgactaatcgcgattagtcgtctgattgttgcccttacaaaactaactttaacttactatttgaaaacaggctagtcaagaatttgtatcttcactttatttccccatgattctggccttagttcttttggaacatgaagggacacttaatgtcactaccatggttccaatgaatggtgatggcatgtaaagttttgtgttcagaggctgagtttgatattacgggaaactgtgtcttggtatctcagattgctactttctagtatttcttaatgacgtttttttaatgtgaataatgcaggcttggacaggagcctcatcaacaccggttgctttggtgtccatgcttttaagattgcctaatatcaagtttattattgtaacccttggagaaaagggatgcttgatgcttgaaagaagcacaacaggtgagtttaccgtactgctgcatgccaattctagcgaagctttatagaaaaaacatggactgtcatgtaggaaatcactgtatgaacagagcccagcaacatggtgcactggtctcaccatccgcataaccagaaaattagagatatgaggtttacttatttattgagtgctaaacgataatatcagaggtagatattagaaagggtcattaggaagttatttaaaggagacttggcatcttctgaattagcaagcaagagattattctggtatttccctttatctccgtgccccttccattctctagctgcgctgtcacaacagttcttggccgaggaagcccaggtcctaaccaactaccaagcatagttatccattgtgctcgattgggagacatgacatggacacctgagatatccattttacttgaaaagaatttatgtttctctccgttatttttacagaaaactataacatgctgctcaacttgcagatgcttctgaggcagaggaaatagatgtagagagtcttctggaatcactagagaagaaagaagttttgagttcaagcatgccaaaatgcatcgcctccaaggtatggcatctcttggatgtgctttctgcttggacttgaatctgcattatttggtccatgctatcttgcgacttaaagatccatggttacacaacaggggataaagttatctaatgtaaatgccccctcctcttttcctctttttattttttgtgggtttgtgggggtgttggggtttagtttaactaattgctggggtgtgtgtatctgctatcttttgtaagttagtgacagggtttccagttttttctattcacatttacattttcttttcaactttatatgtcccttatctagttgtttctgcttcttttattgttttagtcaaatttgagaataagtgcagatggaataggatccatcagtggcagattacttttaggcactgccgaaattataccctctgaagagctcatagatacaactggtgcgggtgatgcatttatcggagcagttctctacggtcagtatgtaatttccaactttttcatgctaaaaatagctggttttatgctacttaactgtagcttttgttagtggaccaagtaaattttgttctgtgaaatcagttgttgtcaacttagcagtggtatgtttcatctgtcatatttaaaagttatccggtatccaccaaagttgttaatgatgtgttcgcataacgttctatagcctcaaaatacaagcagtcgcaatacacgactaatgttgagcgcatggcctttgggggtggataaccccccacgaaaaacatattgtaatttggactgtaaacgttgcttctcttttgttgattatgactgcggtaataggttttggcctatcattatgtgaggtggcatgagctgatttgttgtctgttttgtggtttaggtttatgctctggcatgccgcctgagaagatgctgccttttgcagctcaagtggtaagataactctatagtattgcactcgagtactgcagttagttgggaattttctgctaagcacaaccacttattaccacataccacagcaatactatcatctaagctgctctagggcacacacaggaggctcacctaaacgcactgttactagaacacagcccagaagttgctactaaatgattatgttcctttttctttgtataacagtataagtaaaaaaaatatagaggggaaattgcagccagtaattgcattggtatcgagattgccgtttataggtggatgtgtgtacctataaaactgagaagtgggtaaactggcaaatgatttatataaagtaaattgcgttcatggtacacgaacttatatggtgggtgcaaataggtacaacaacttgcaaattgtttattccggtacaataacttggttagttcgtgcaaacct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