Os09g0101800
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Structured Information
| Gene Name |
Os09g0101800 |
|---|---|
| Description |
WD40-like domain containing protein |
| Version |
NM_001069086.1 GI:115477911 GeneID:4346367 |
| Length |
11129 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os09g0101800, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:232958..244086 |
| Sequence Coding Region |
233137..233279,233712..233827,235376..235720,236508..236636,239366..239584 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008402:232958..244086 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008402:232958..244086 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcggaggaggacggcgaccggttcatcgagatggtgtcggcggggacgctgtacctctccggcgaatgggagcgcaagtactggagctgctccaggggcaaggatcggtacccctacccggtgggttatcacgccgtccgccacttctccgggatatcctacaccatgcaaattcaccaaggacccagaggccctcttttccaggtcacatccacccaaggagattcatccactgggcccaccccggatattgcctggaagaacttccacaaaaagaccgctcctaaagtcagagactggcagaggaaaaggagcttccctcagaagattgatggcgttgagcttttcgggtttaaaaatgcatctgttcagaggctgcttcgtgaacttatagttcgttcgactggagcagtgcagctaaacttgcctcatccagttacttctgatgctaattcacctttaagccgtaaggttgaagctgaaatttctgatggaaatgaagtttgcatggacaagacgggtggacctgctaaacgaagtatgaggccaagccaggaggaagggactgctaaaagggttcactaccagaatatttccacttcaactgataagtgccataatgagttggatataattgctgatgaaggttcaaacgaagatgccactggttcaagatgcacgtcttcttcgctggaagacatgccttgcaactcaacacatactttggttgacgacaatttaggtgaatttgttgcagattcacctgaacaagttgctttatcttctagttcttatttaagctctcaaaagtctgacctagaatcagctgagagagaagtagctaagtctatgatgtctattttgcttccccaagctattccctttctaaacaaaactcacagaaagaagaagaaggttaagcataaaaagagagaagaaactatttcaactacaactgctttagctgaaaatccatctgctgatggttgccgaggtgtagttgtgtctacaagtacctgtgaaggaataaatataaaaacttctcaaacatattcccatgggcaatctctttgtgaaatggttaaagactgctgtggtaatgacgatggcatgattgatgagccaggccttaaatcagatgacatgaaagttgttgcagatagttttgaggatgatgagcagggttggtgtgacaataaatctaaatccatgggtgctcgctgtcatgatgatgatgcgtgctctaaggaaagtttgccgtatggtaacagggaagatcatgatggccactctgagtgtcagatggggatagatgatggcacaaacacacctgatgtggtatatgatcatgaaaaaggtcaatatgttttatctgaagcgctccttgcctgtctggaggaagaatttggtgcgaaggataattcctgccctgcaaactacaatcaaatcgatgttgggcggagacaaggtgagcagcactttgaggaccctagaagtgggattaacgatgactcatcaatttcggttggtatgtcagataagagcaacttgaggagtggattaattgatggttatgcacaagcttctgctaagagctggacaggaaattcaaggcatggagagtctttaacaaatttgttgcagagtccagttcattctaacgcacataacaatagtgagaaaatgggtggtaaatttgatgatactgagtttgttgacaaatttgttgcttttgacaaatatgggatgaaaagagtaaacactgttacagtgtggcctgttgatgttagaacaaaaacaggtaaaagaaatcaccctcttgaggagcaaaaagaatgtcaaactggatgcagaaatggcaatgagaacgcaatggtttccatcggttgtgggagttatgtttgtggtcgtgtacctcctaaggatgaagacaatgcttgccatgagcatgctcctcctgacgtcaaccatttaaatggtccattatgtagacacaaagaaacatcgccaagggtgtcaaatcttcatctagatcttatgggatgctatctgcatccaatgcctgtcttgtctatcgtcctaaacaccaaaaataacagcagcttactgatctatgtactctgtggccttctagagagctgtgaaagattcctttatgtgtatactatcgtccctaaggatcagcaagagacagcaccttattttgttggctacactcctcttctattgtcctccttggagcggtcatgtacaggaaatctcccatttgaaaggtctgggttgcagttcacacctgatggccagtttctggtcctccttggcagtatcagaatgccttattgcaggaagcaaatcattgattgttcttgctccttgtgcaagttggatcagtgtgaggataattatttgaaaattgtatctgtggatttgggttatgtttcactcttgaccaaactgatggcttatgggtcactgtcatgcattttaatctgtgaaccaaattacattgtaaccgttgaagatggaagaaacttgcatatctggatgatggctgctgggtggagaataatatctgaggagtatgtgattcctagttctggtaatgtgggtaattcaataatagagctcagaagaatgccaaaaagcagcactctcatcgttggtcatgatggcacaggaagctttagtttgtgggatatctccaagcgaacacttctggcaacttttacagctccaggaatcattgttttccagattcggccagtagtatcgtgtagtttgcaggaggatatcattcttgcttcggttagtgacatagagagaaggttaagagagattacagttactggtgtgtccagaaaagctgacaaggagtccattttgtcacctggaaaagatacagcaatttggattctgatttcgtctgcttcagtagcggagtatcaaagtgatcttcgagcaaaggaacataatgcacgatggaggctagctctgctggcaaataagactcttattatgggaactattttggatccaagggctactgcagtagatgtttgtggtaaccatggattcgctggaacacatggaggtctcttgtacgcatgggaattgtcttctgggagaaaacttgctggtacacaatgttttaacagtggacgagtctcgtgcgttgctgttgatgctaaatcaggtgtagtagcagtggccgacgatggatgccagctggtactttacagtcaaaataaggtgctgagcaatgcaagggcagaagggaacatgttcaggataaagtag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAEEDGDRFIEMVSAGTLYLSGEWERKYWSCSRGKDRYPYPVGY HAVRHFSGISYTMQIHQGPRGPLFQVTSTQGDSSTGPTPDIAWKNFHKKTAPKVRDWQ RKRSFPQKIDGVELFGFKNASVQRLLRELIVRSTGAVQLNLPHPVTSDANSPLSRKVE AEISDGNEVCMDKTGGPAKRSMRPSQEEGTAKRVHYQNISTSTDKCHNELDIIADEGS NEDATGSRCTSSSLEDMPCNSTHTLVDDNLGEFVADSPEQVALSSSSYLSSQKSDLES AEREVAKSMMSILLPQAIPFLNKTHRKKKKVKHKKREETISTTTALAENPSADGCRGV VVSTSTCEGINIKTSQTYSHGQSLCEMVKDCCGNDDGMIDEPGLKSDDMKVVADSFED DEQGWCDNKSKSMGARCHDDDACSKESLPYGNREDHDGHSECQMGIDDGTNTPDVVYD HEKGQYVLSEALLACLEEEFGAKDNSCPANYNQIDVGRRQGEQHFEDPRSGINDDSSI SVGMSDKSNLRSGLIDGYAQASAKSWTGNSRHGESLTNLLQSPVHSNAHNNSEKMGGK FDDTEFVDKFVAFDKYGMKRVNTVTVWPVDVRTKTGKRNHPLEEQKECQTGCRNGNEN AMVSIGCGSYVCGRVPPKDEDNACHEHAPPDVNHLNGPLCRHKETSPRVSNLHLDLMG CYLHPMPVLSIVLNTKNNSSLLIYVLCGLLESCERFLYVYTIVPKDQQETAPYFVGYT PLLLSSLERSCTGNLPFERSGLQFTPDGQFLVLLGSIRMPYCRKQIIDCSCSLCKLDQ CEDNYLKIVSVDLGYVSLLTKLMAYGSLSCILICEPNYIVTVEDGRNLHIWMMAAGWR IISEEYVIPSSGNVGNSIIELRRMPKSSTLIVGHDGTGSFSLWDISKRTLLATFTAPG IIVFQIRPVVSCSLQEDIILASVSDIERRLREITVTGVSRKADKESILSPGKDTAIWI LISSASVAEYQSDLRAKEHNARWRLALLANKTLIMGTILDPRATAVDVCGNHGFAGTH GGLLYAWELSSGRKLAGTQCFNSGRVSCVAVDAKSGVVAVADDGCQLVLYSQNKVLSN ARAEGNMFRIK</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>10808..10950#10260..10375#8367..8711#7451..7579#4503..4721#4331..4416#2980..4244#2447..2783#1225..1539#390..527#204..311#8..106#gagggcgatggcggaggaggacggcgaccggttcatcgagatggtgtcggcggggacgctgtacctctccggcgaatgggagcgcaagtactggagctgctccagggtagggtacttgtatctcttcctcccctttcctctctagggttttggttggttgtgttgctcgctgcgtctaatttgtttactcgctacggtacaagggcaaggatcggtacccctacccggtgggttatcacgccgtccgccacttctccgggatatcctacaccatgcaaattcaccaaggacccagaggccctcttttccaggtatagtatgcctatttcctacggagtcaaatcttccttcatgtccatgaaaatgaaaacaactttctcaatctgcaggtcacatccacccaaggagattcatccactgggcccaccccggatattgcctggaagaacttccacaaaaagaccgctcctaaagtcagagactggcagaggaaaaggagcttccctcagaagattgatggcgttgaggcaaatgccccttatttaccttggatataaataatctcattctcaatcatatcttaattatcttcatggatggtgcttcttcccatttttacctcacacgaaatcaattaatcatctttaaactgtgtttcttttttttgtacatacactgtaccacactcctttcttgccaaggataatcgtaaactggatatccttacaccaccactacaggaaacatgatccaagtgctgtcattcacttcacttttaatctattattatatctttgtacatgtactgatttctattaggtttgtaccaaagtggtttaccatactgctggcttggagttggagatacgattctgcaataaattgtgctgtttggaaaccttgtcgttgaacaataattacattatggtcaataaattaccagaggaaaaaaagagagggagagacatacatgcatgaacaagcagtttggtgctagcaaatggagctacaactcaagtaccttggcatgtatacatcagtctttcgattggaaccaaaatacttgttccaacaagaaaagatagaatgagctattccaacaagaagtagaagtagtgctcactcattactttgcaagatttttcagtagatataaagtatgtgccttcaacattgattagccagattccaacttaactttagttctgctatggtcttatgcagcttttcgggtttaaaaatgcatctgttcagaggctgcttcgtgaacttatagttcgttcgactggagcagtgcagctaaacttgcctcatccagttacttctgatgctaattcacctttaagccgtaaggttgaagctgaaatttctgatggaaatgaagtttgcatggacaagacgggtggacctgctaaacgaagtatgaggccaagccaggaggaagggactgctaaaagggttcactaccagaatatttccacttcaactgataagtgccataatgagttggatataattgctgatgaaggttcaaacgaagtaagcagagctctttttttctagtatttgcccctgaagcatacttggtgtctgataacttctgtattgcatatattatggcagtacagctatagaaataaaatttttcacaacttcatgtggatggcattatggcaagtacattttattttacagtaaagatattgattggtcgcctaacatcaccggattttggtatacaataatattctggttgtgatttctctgttgtgctcaagcactggtggttgttttgtaagattaacactagccgatgtgtatatttactaccttctctattcatgaaagcaaatgccatataattttataaacatttggtaaagtgacaagccttatttcacaagcacggtgctgaataattactacgattcaaccttttgatacttatttgtatcccccccttttttttcaaatgttacttatctgtaccttcagggatcatgattatgctttagggatccatatggttctctctgggcactaattctgctagtgttacttttcttggtttccaaatgggctgcggagctctgtccagtgaattgctttcatatttcttccgctaatgaatatgtgaatgctttttattataatactatacccctgagtgagaaaatatgccttgtagttgtttacacatttctgtttactattacatgttttttagtttttacacattaatccatgtgaaaattaagatttgacgaaatatggtcatatttttgctgctggccaagggattgttacttgtgctttttaagcaacctgtgaattgtcatgctaatatatatatattttgaggcaccaaggttcatactacttgtagtagttgataagttgaaagctcagtatctgatattagtgttgtgcattgttcaagttgcaggatgccactggttcaagatgcacgtcttcttcgctggaagacatgccttgcaactcaacacatactttggttgacgacaatttaggtgaatttgttgcagattcacctgaacaagttgctttatcttctagttcttatttaagctctcaaaagtctgacctagaatcagctgagagagaagtagctaagtctatgatgtctattttgcttccccaagctattccctttctaaacaaaactcacagaaagaagaagaaggttaagcataaaaagagagaagaaactatttcaactacaactgctttagctgaaaatccatctgctgatggttgccgaggtatgtaagcttcatacttgtataaaacatatcttcgttgaaaatttgagtcactataagtaagaaatattgtcacattctcttagaaaaggaaaccttttacccaagtagcctactcagacaagagttaggacttaaggggtccatgacattgtgtttaatagagtttttggtcatgatttcttgtatcaagcaggtgtagttgtgtctacaagtacctgtgaaggaataaatataaaaacttctcaaacatattcccatgggcaatctctttgtgaaatggttaaagactgctgtggtaatgacgatggcatgattgatgagccaggccttaaatcagatgacatgaaagttgttgcagatagttttgaggatgatgagcagggttggtgtgacaataaatctaaatccatgggtgctcgctgtcatgatgatgatgcgtgctctaaggaaagtttgccgtatggtaacagggaagatcatgatggccactctgagtgtcagatggggatagatgatggcacaaacacacctgatgtggtatatgatcatgaaaaaggtcaatatgttttatctgaagcgctccttgcctgtctggaggaagaatttggtgcgaaggataattcctgccctgcaaactacaatcaaatcgatgttgggcggagacaaggtgagcagcactttgaggaccctagaagtgggattaacgatgactcatcaatttcggttggtatgtcagataagagcaacttgaggagtggattaattgatggttatgcacaagcttctgctaagagctggacaggaaattcaaggcatggagagtctttaacaaatttgttgcagagtccagttcattctaacgcacataacaatagtgagaaaatgggtggtaaatttgatgatactgagtttgttgacaaatttgttgcttttgacaaatatgggatgaaaagagtaaacactgttacagtgtggcctgttgatgttagaacaaaaacaggtaaaagaaatcaccctcttgaggagcaaaaagaatgtcaaactggatgcagaaatggcaatgagaacgcaatggtttccatcggttgtgggagttatgtttgtggtcgtgtacctcctaaggatgaagacaatgcttgccatgagcatgctcctcctgacgtcaaccatttaaatggtccattatgtagacacaaagaaacatcgccaagggtgtcaaatcttcatctagatcttatgggatgctatctgcatccaatgcctgtcttgtctatcgtcctaaacaccaaaaataacagcagcttactgatctatgtactctgtggccttctagagagctgtgaaagattcctttatgtgtatactatcgtccctaaggatcagcaagagacagcaccttattttgttggctacactcctcttctattgtcctccttggagcggtcatgtacaggaaatgtaagaacatactgtggttacaatttttcttttttggtcaacatgtaaagtgtactcactactttgatatcttttgttttcttcagctcccatttgaaaggtctgggttgcagttcacacctgatggccagtttctggtcctccttggcagtatcagaatgccttattgcaggttgtaatttcattccttagagccagccaagaaatgcgttggatgttctgattatattggtgctaaccacatatacttattaacaggaagcaaatcattgattgttcttgctccttgtgcaagttggatcagtgtgaggataattatttgaaaattgtatctgtggatttgggttatgtttcactcttgaccaaactgatggcttatgggtcactgtcatgcattttaatctgtgaaccaaattacattgtaaccgttgaagatggaagaaacttgcatatctggatgatggctgctgggtggaggtacttgtttctaccttactggtgtttaatgcttcctttccatcccattttttactttattggtttattgttgttatgaggcctccttcggcatcgcagtagattttcaaaaacacttattttctaggtttcaaacc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|
| External Link(s) |
