Os09g0110400
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Structured Information
| Gene Name |
Os09g0110400 |
|---|---|
| Description |
Similar to DNA-directed RNA polymerase II 36 kDa polypeptide A (EC 2.7.7.6) (RNA polymerase II subunit 3) |
| Version |
NM_001069107.1 GI:115477953 GeneID:4346392 |
| Length |
6940 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os09g0110400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:873822..880761 |
| Sequence Coding Region |
873918..874411,875255..875492,879925..880185 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008402:873822..880761 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008402:873822..880761 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>MERAAGGVSYQRFPRVRIRELKDDYAKFELRDTDASMANALRRV MIAEVPTVAIDLVEIEVNSSVLNDEFIAHRLGLIPLTSAAAMAMRFSRDCDACDGDGS CEYCSVEFHLAARATDSDQTLEVTSNDLRSTDPKVCPVDQARAYQHALGGTEPFDTAA AADQRGILIVKLRRGQELRLRAIARKGIGKDHAKWSPAATVTFMYEPEIRINEELMET LTLEEKRNLVESSPTKVFNIDPNTQQVVVEDAEAYTYDDEVIKKADAMGKPGLIEINA KEDSFIFTVETTGAITAYELIMNAITVLRQKLDAVRLQDDDADLGELGAHLVGG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>97..590#1434..1671#6104..6364#aaatcaaaaaccctcccgtcccatcccctccttgtgtagttgtgttgtttgcggcgaaaccctaggattgtctccggcggcggcggcggaaggatcatggagcgggcggcaggcggcgtgtcgtaccagcggttcccgcgggtgcggatccgcgagctgaaggacgactacgccaagttcgagctccgcgacaccgacgccagcatggccaacgccctccgccgcgtcatgatcgccgaggtccccaccgtcgccatcgacctcgtcgagatcgaggtcaactcctccgtcctcaacgacgagttcatcgcccaccgcctcggcctcatccccctcacctccgccgccgccatggccatgcgcttctcccgcgactgcgacgcctgcgacggcgacggctcctgcgagtactgctccgtcgagttccacctcgccgcccgcgccaccgactccgaccagaccctcgaggtcacctccaacgacctccgctccaccgaccccaaggtctgccccgtcgaccaggctagggcctaccagcacgccctcggcggaactgaacccttcgacaccgccgctgctgctgaccagaggtaaccccccctcccctattgccccattatggctattattgcaagtttatttcagttcaaaatgctgttaggaacaggttgactctatttttaacattatagactatcttgtttggcaactttagggaagaggattgggagtttagatgagggaattgttggtgagattaacatggaaatttgctttttagtcccaatctcttgtttggcagagatggtgggaatcgataaggagtttagctatagattagatcttaaatgaaaatggatggttgagatttgtttaggtaaagtaaaggagttccttcccaattaccaccctctacccaggtattagaaaggagggagttcctccctcaatttttctctatccccatcccacccaaactcatgtttcccaaccaaacagaacagttaataacctcatccctctaaactcccaatccccctaaaagctccgcccaaaccaaacggatccaggtctagcactgatctcttatccgaggcttttgttacaagtacaccatatgttcatttgcttccatttttcattcctatgtgaagcattgagcaaatgcccaaaattccaaattaacataactaatgtggcgaatattcctatatcagttccatgtttagaccgcaggtcatgttccagtcttatatttggatgatgccgacatacatgtattttctgttctcaaaattgtcctagttagattaggagcatctgctagtattttattatcttatattttcttttaaatgccataaaagctgtaagtgtactctctttctgaactaatacttacaaacaaccaacctataatattttaattccaggggcatactaattgtaaagctgcgtcggggccaagagctcaggctccgagcaattgctaggaagggaattggcaaggaccatgccaagtggtcccccgccgctactgtgactttcatgtatgagcctgaaatacgtatcaatgaagaactcatggaaacattgacactcgaggaaaaacgaaatttggtggagagtagccctacaaaagtgttcaacattgatcccaacactcaacaggtcagcatgttcttcacccccctctttattttttttgataatttggtttatttccccccatgatatcaccatctaagctttagagttcaacacagatagccatatttgattacttagatagtgatcaatatgttttgctgttttcaaatggcatgctgttctaaaatggcatgttctattgtcttacagtctgttactactgagtcttaggtacttctgttatagaaagccgtcactgaagtgacaatgtttgtcactacagtcaatctcttgtggcttatcggtttttatgcttagctatagtcgaatgccttggtttgagtgctgatctatcaaattgcatttgatatacagtgatgaaatgtattgttaagttctctagtgatcacatttttaggttggtacctgatcttctttttaatgaaaattgatacctacgtgggattgcattgttgctagtatatgtaatcttctgtaaattctattaccaaactaaatgagtaacaatgtttttgcctggatatattgtgtagtagcatgttcggtgaatttgtgttttgtctgttcccaagttatgttcaaattgttgatgaacattcaggaattgtgatgtccacattgcgcactgaactatgggaaaactatgcagatactgtttttaaatataaaatttgttaaagatgtggaattcagaattgctctgttcaatcttgttatagctgacataatgaaaagatatatgccataacccaatcacttttttgagcaaatgataagtgctggtatcactcaaaagagccccttgcatgaaaatgacaccaaaaaaactccctagcctacttttctattgtaagcttccaaagtaggggtattgaagaccgggtcatcccgttttgccaaacccagtgaagaactggatggcatgcaggctcctccagctgcaagtgtgcatgcacatgaaacttgtacactgagtgggtgagaaaattctgaaaaaatatttgtttaggcctattattacatatcgtcaagacatccctaaattctcagagtactcccatcctgggttcattgaagccttttttttaattttgccttcttggagggaactaacccattgccatccaaatcacatacacctactactggcattaaccagtaattcattttctgccacatattgaatacctcacatgtactggagaattaacatatctaaaatgtttcatgctaaagtcaagtttatattgtttgtctattggactttttatagtacgccaagtcattgtgaactatacattgttcacagatccaatggctaacattcatgttgaaacacctgatacgtggtaatggtaaaaaaatcaattgtttacatttttagtctatgaatgattgttgcattccaataaggaatggagcaatattttctaattttgaaattcaagtttgtattatatataaaaagcaataggttccctatttgaattaagtttagtatttttttgtgcagtgaagtatggatagtataattttgaaatggggatttcagtttataatggaagtttgaacaagattggaaaattataataatgtttaatttatgtttcatataatggctaaagtacagtcacttttcgtcataccaaactttttttgctgtatatttacatttagtactgtataacttggctgtttcttttttttttttaaaaaaaatcaaactttagccttccgctgatatgtgaacccattttttatttatgattgttgctgattttggtgtgctgcatcatagtagaaaacttggactggtcacttaaccattcaggcccctggttcaccgatgaccggccaagtggtctgactgccagtttggctggttcaaaactatttatttaaattgcatgttccccataggacacaaccagctgcttggcatggtggccaatggagttaaactccatccagctgacccaaagctcgagcccctgcgtgtgcaatttttatgtgtattatgacacaataggcacaataggcctccgcacgagtaatgggacctttatttgacccatgtttgtcacaacacacaggctaacctgtcccaactggtttatcgtctcttcaatcattttttacatccagatcgcacaagcctccaattctggtttatctctggtcaaaccagttgtccgtaatgattttcgcaccatgtgctacacatgtttattttacaaaggatactgtgcttttgccaatgatgtaccaatggaagcaaagtaaagcacagacaatcaacatttagtatctattgttgtcctcataagaggatagatggaccacaataaaagagcttttgacaattttagcaattttactgaaaatccactagaccacatcattttccttaacatttgtcccatagatcacttggatctttgttacttcactgtatttctatgttaaaccatgttatgctgctcggtgcattgctttgggtgctttgctttgtgaatgatatgagaaatattcctcaggattacttaataatgctttggacattctgctcttatgtcatgttccttgtgcatccgttattaagttgtacggagtacattcaagtcactgagccattgaatttccaactattcgacgaatacactctttgtatgtatggaatgcgctctctgggccagcagcccagcactattgccgctggcattccacccaggtcagcagttgtctggctatggccggagttcagccagtaccatattatctattttatgctacaataggcatttttatttgtcagttgatttggttgatatttaggaatatattaagaaatattagacgatttgttaggtcctctcctataaattacttctcatctatatctatatatcctatataattggaaccaaaagcttgacatgcataatcacatcatcaagaaaatattaacctttggatttttctcatgctttgatctcaaccattcatgtgtcatgtgcatttacaacccacttagtgtagttattactataaatctcaatatccattaaaaccatacatgccacctagacaaattatagccactaaatacctcacatgtttggtacataacaatttttgtgtaatatacactcgcaattcgatgaccattgtcacctactatcaagcttaaaatattgtcctcttagacattacaaactgttttcttcaagttttttttaattatttctaaatttttccactgcaacgcactgggtaaccactagt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|
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