Os09g0248000
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Structured Information
| Gene Name |
Os09g0248000 |
|---|---|
| Description |
Protein of unknown function DUF516 family protein |
| Version |
NM_001069200.1 GI:115478139 GeneID:4346498 |
| Length |
13053 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os09g0248000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:4185792..4198844 |
| Sequence Coding Region |
4185909..4186010,4187262..4187445,4187765..4187907,4187985..4188086 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008402:4185792..4198844 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggtggtgctggtggtggcgacggcgtcggacccggcgtctatcggcccagccgccgccttcctcgccatgcccggctggtctcccggcccgcccatccccgaggggatggagagctttacaaacggggacgttcgactattgaagcatgaacgcagcatcattgcggaggatgatcttgacaaccggtggcaggcagccactggagaggctgtttctgaggtcatattcctcagcaaacacactgctgtctccaaccgtcctgcgcttactgtccatccaatcggtgtgccacatctaagagaagatgagacgccacctcaaggagggagaccaggatgggcagctctgcccaatcctcgaattggtccatggctccgtttgatgcaaaagattgcggtagaccaaggtcttgttccagagtttgagattacactggaagctactcaccatggaccagtcaccaatacaccaacgatgtttgttgagataggtatagatctacttccatgcttatattctctgtattag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MVVLVVATASDPASIGPAAAFLAMPGWSPGPPIPEGMESFTNGD VRLLKHERSIIAEDDLDNRWQAATGEAVSEVIFLSKHTAVSNRPALTVHPIGVPHLRE DETPPQGGRPGWAALPNPRIGPWLRLMQKIAVDQGLVPEFEITLEATHHGPVTNTPTM FVEIGIDLLPCLYSLY</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>118..219#1471..1654#1974..2116#2194..2295#ttctatcgatttttctcctggacaagagaagcagcagccgagcacgagcgcgagcggtgctctggtggaggagaggagagggaggcgtggtcggagtcggagtaggaggaagaggagatggtggtgctggtggtggcgacggcgtcggacccggcgtctatcggcccagccgccgccttcctcgccatgcccggctggtctcccggcccgcccatccccgtaagcaacccaccgccccccatcttatctagtcccatccaccccaatctcaaattccccaagacttgtagtgtagcacggggaagcgctgctccttaattagggtttgggccatggctatggctagtgtttatggttgtggagcaggtatcttgttcgatgcggcaggcgttttcttttctgaagactggaattgttcttctgttctgagctttgcaagcatatgcggccaggtgcccaggttataggatgcgcttttggtgcgggtttatgcaattacagatactagatagagatttgcatgtccatactagttgctacgcagatcgcaggacgattccggatgttataatctgtttttacatcattgcaaattaattcatgaatggatattgatagtataaaaatatatattgcccttagcttttcaagctcctctggactttgtcacatagttaccgtccacatgctgccacattaaaattgacatgacatgatgagtcacagcaaaatggagagtggcgtctatactgttctttttagtgacaaggaaaaggtaaaccatttgtatgtatgataatatataagaacgtcgatatatttaaagatgacactcgagcttttatccatgaataatgcaagcagatatcgtgcacttacagctatacgcctccataaaatattagggggaatctgtctcttacctttgaataatagaacttgctaatttaagtgtatggcagaagaaggtaagtcaccaatttgatcaattagcctcatcagaacaaatgtttgcgaaaatatatctgcctcaatcaacaaataaatccagatttaggtgactatggagctgataaacctgttcctaaagacgcatagcagaaccatggagaataacagtgctatgtttcttctatcatcagtgataaataatggtatgtcgaaaaagagttggtcagaatccggtgtccctgaactttccaaggttttgtctgcgtgtaaattgcttttccctacttcaggcaacatagaaggcaatgagtgatcagaatgcagatcatgtacaccaacacatatctattatgttccagtgactctgtttgttttattaagttttagcttcaaaaattattgttacaattttttttgtaacatccatcagatgttatgtttctggcattttgcagttctttaatttgttagaatgccgcgacaattccatataaatctctgatggtatatgttttgtaggaggggatggagagctttacaaacggggacgttcgactattgaagcatgaacgcagcatcattgcggaggatgatcttgacaaccggtggcaggcagccactggagaggctgtttctgaggtcatattcctcagcaaacacactgctgtctccaaccgtcctgcgcttactgtccatccaatcggttggttatttttagtcataaagtgctatatgtttcttgtttatccctggctctgttaaatgtttaatatttttctgtgtttgagttatattgaatacctaaataagatatgacataaatggtggttaataaacctgaaaaggtactgaacttgtattttgttatttgtttgtttacaaataatgcatctgtacttttttgagtgcaatacatatgcttatttgtgtaaattaatggttcatacttcatagtaccacatgtattcaattattttatattaaacatggtgtcatttttctttggtgtgtcgcaccttaaggtgtgccacatctaagagaagatgagacgccacctcaaggagggagaccaggatgggcagctctgcccaatcctcgaattggtccatggctccgtttgatgcaaaagattgcggtagaccaaggtcttgttccagagtttgaggtaccttttctgttgatgattttttttttcttctgaactttctgcttttaaaattctaattcttattgcttgtgaagattacactggaagctactcaccatggaccagtcaccaatacaccaacgatgtttgttgagataggtatagatctacttccatgcttatattctctgtattagcatgtatggtagggtgttttgtaaagcttcctacaaactggtttttgtcattgccctttacatgtcttttatagtttcagaaacatctgcgccattagcttactcaggtgtttcatgctgtacatttgttttgtgctctttgcctcccaaatgtcaatcatcaatgcctaaacacatgctaggacttttttgggggatagttgcaactattgcaatgggcatttcataatcaaaaagaatttgtgatttcacagataactaatattaagcattagtaatcatttgatcattcatgtaaatttgaaacttttaatttaatcatgttccacttgtagttgtgtacttgtgtaaacttagatagtttgccttagatacgtgtaaccttcttgagcagggaagagtcagctagcaaaattatatacacatttactccctccgtcccctaatataaggaattttgacattttacttgcactgtttgaccattcgtcttatttaaaaaaatttggaattattatttattttatttgtgacttactttattatccaaagtactttaagcacgacttttcgttttttatatttgcacaaattttttgaataagacgagtggtcaaatgttacaaaaaaaatagtgaatcctatatacctatacaaatcatccccactactagcaattctctgcatcctcatgcttccacgtcaccccgttttctcctagccattggatctcgatcaagcgcttctcccggtcaatctgttggcaatccattggatcaaatatcaatggttaatgtgcagtccctctgttttcttttgctggccaacaagcccaactttacacaccatcaagcccagtccacactccttggcccaatttccaccgcatcttcccacactccatccacaccaccattcccgttaccctcttgagttcgagcggtcacgtctccctgcgccgctagaaactgcgagtgcggcgccggcgcctcaccttccagatcctgcgtagcgtcgtggttccccgccagctcttggactgctcacctccaaatggaaaccaccgctcacctgtcgtggttcgatcgctcaaactttatagctgtcatcaagatagttgttgtctcctcaacttcaagaaactatcatcctccacatcctgttcggtcgaatcctcacacgctgcccgattcacttcctactgcatactatttcacaccggaaaccatcgttccattcgttttccctgcctttaaagcttcagccgcctcctcaccttcaagaaacctcaggggtatatattcatctaccaaaggtatgcttcttcctccttttcttgaaccataaccatatatgttcattcaatttattggcttacatttctcctttgaatcgcactcgattgatttgttcatgttatataccagattatcaatggattaaggacatacgagtattgatttggtttcggctcttcttcagatttccactgtcccaatatttatttggatttgtctcttcttcagatttgtactgtccctattcaataggattgaaatttatttggatttgtcacttcagatttctaccgtccctattcaacacgactgacatttatttggatttgtttcttcttcagatttatactgtccctattcaacaacattgaaatttatttagtatgtacaatttgttaaaggagccaattcatgatcatggtattatatgacgactctaaagatcatatatatgcatataccggttttatgtattgctgcaccttaatttgttttatttctgaatactccggttgcagatcattgctattagtagattagatactgtcgttgtagcagcagctctgggctactgctaaggtcagtcgccatggccatccaaagcagcagttgcagcataaatttcctcctatatgaatcctctattaagaaaaatatcaacaatacaatcggtaatgtttaattgtatctacttcattcatggtcatgttttccaaatattatattatgcccaccctacgttacttgctttgcaatttcttccataagaacaaaacaatatcatattttctgcagactatcagggactgagttcagcaatgaacttaatttaggtaaatattggtccttggatctgttcattttttttagatgaagggcaacgccctttgcatcctatggtggatgcaccttgcatctgtccatgctaaccttctttgctatatgatgttcttacttaacatacgggttaataagctacagtttgtgatggatgtaacttaattcttatctttcccttctttcttagtagaatataaaggatgctctttgtaatagcacacaattgaacataataggggattcatcatttatgtttctatcgatacaatctctctgccctaatgattagtatcctcaagaaaaaaaaattaagagagtttctgatgctttgtttagatatggtagctatactttttccaaagatagaaaatgtttaattttttggctttcaatttactttatggtataggatggtaagggattgagcgatgttgatccaataagttagtaagggattgcactatgtttatggattttttacattaatcataaaacatagattacctcacat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