Os09g0248200
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Structured Information
| Gene Name |
Os09g0248200 |
|---|---|
| Description |
Frigida-like family protein |
| Version |
NM_001069202.1 GI:115478143 GeneID:4346500 |
| Length |
8598 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os09g0248200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:4222481..4231078 |
| Sequence Coding Region |
4222801..4222829,4226488..4226857,4228150..4228319,4229554..4230607 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008402:4222481..4231078 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgtccgacatggagtccatggctacacttatggagtccacaggctccaagctgcagcagcttcagcgtgcatttgcagagctcgagagccagagcgctgtttccttgaacttaaagtggaagcaactggaggaccatttccatgggcttgagcagtcgctcaagaaaaagtttgatgatctgaaaaggcaggaagaggagttcgaggagacggttgcaaagtcagagcagatgctggagcaacaagaggctgttgtcgtggcaaaggaactgacttctcttgaaaaactgcagcagaaaagggatgccgcgttggctgtgatctttggcaagtccaagctgaacttgtctacgcctcttatcaacccaatcagcaaatccgtgaataacaatgctgtgtttaatggaaacatcggtggtagtctttctgttaagtggcccaaacctgcaactgcgcatggtgcatacctgcaagatgaaaacactgctgtgaagcctcgttctcaacttgttgtcctctgtgaagagatgaatgttaacgggcttcataagttcatatcagacaatcgcaaagacttaacatccatccgtgaggaaatccccgttgcacttaggggagcaactgatccatatggcttggtgttagcttctctagaagacttctattttggagacaatcttatattggatggcaaaaaggatggaaaccttctgggtgtacggaggacgtgcctcatgttgatggaatcacttgctcagctgcaaactgatgctactactggtttcatatcggaaggtcaagtgcttactgcaagtatcaaggagcgtgcaaaaaagattgctcttgagtggaaatccaagttggatagccttgactttgatgctagcaatgggaactgcctggaagcacatgcgtttcttcaactcctggctacctttggtatatttgctgaatttgcacaagatgagctgtgtaagctacttccctcagtcagtcgtcgtcgtcagacacctgagctttgtagaatacttggattgtcccagaacatgccaggtgtcattggagttctggttgaaaatgggagaactattgatgcaattaatttggcttatgcatttgagctgactaatcagtttgaaccggtggaattactgaaagcctatctacaggaggtcaagagtgtgccacatttcaagactggaaagatatctctgcaagtacagaatgaaatgaatgaacgagagctgtctgccttgaaagctgctattaagtgtatcgaggagcacaaacttgatgagaaatatccgattgacctgcttcagaaaagagttatccagctagagaaagctaaggcagacaagaggagggctgttgaagctgcaaagccacagtctaagaggcctcgtgccaatggatccgtatatgcgccacatactagctttcctgacaaaagcttctaccaggctgctccgccgcagaggcattcctacccttacgagaggcagtatgtgtatggtgctgaggcccatcaccatcccacaatgataagctcagctccctatggcatctcacctgcccacacaacatattatgagaaggatggggaacctaatcgtggatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSDMESMATLMESTGSKLQQLQRAFAELESQSAVSLNLKWKQLE DHFHGLEQSLKKKFDDLKRQEEEFEETVAKSEQMLEQQEAVVVAKELTSLEKLQQKRD AALAVIFGKSKLNLSTPLINPISKSVNNNAVFNGNIGGSLSVKWPKPATAHGAYLQDE NTAVKPRSQLVVLCEEMNVNGLHKFISDNRKDLTSIREEIPVALRGATDPYGLVLASL EDFYFGDNLILDGKKDGNLLGVRRTCLMLMESLAQLQTDATTGFISEGQVLTASIKER AKKIALEWKSKLDSLDFDASNGNCLEAHAFLQLLATFGIFAEFAQDELCKLLPSVSRR RQTPELCRILGLSQNMPGVIGVLVENGRTIDAINLAYAFELTNQFEPVELLKAYLQEV KSVPHFKTGKISLQVQNEMNERELSALKAAIKCIEEHKLDEKYPIDLLQKRVIQLEKA KADKRRAVEAAKPQSKRPRANGSVYAPHTSFPDKSFYQAAPPQRHSYPYERQYVYGAE AHHHPTMISSAPYGISPAHTTYYEKDGEPNRG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>8250..8278#4222..4591#2760..2929#472..1525#gaaaagcagacagacgcccacaacccaccaccacgtctagggttccgccgctcctccggccgccgccgccgccgccgccgacccccctcgatctcctccccgagccgccataggtggtggcgggggcgggggagctagcatccgtccgtcaacgcacatcgtcactgctgcttcctggtgagcatccatccgtttcgcatatcctctttctcatccctctctacccacccactttttcccctcgaattcgcgtcaaccctagcttctcttctagatctgaaagctgctgcttttctttcaatttgctattcttaatacgaataacagtttcgtttgttccccaaaaaaagtttgggatgaatccccatgtcccacgttagatccgcccctggttttatgtgcggtattgttgtttgtggtatgggtaccaacagctttcgttgttttcaccttttgcagaaatctgccaccatgtccgacatggagtccatggctacacttatggagtccacaggctccaagctgcagcagcttcagcgtgcatttgcagagctcgagagccagagcgctgtttccttgaacttaaagtggaagcaactggaggaccatttccatgggcttgagcagtcgctcaagaaaaagtttgatgatctgaaaaggcaggaagaggagttcgaggagacggttgcaaagtcagagcagatgctggagcaacaagaggctgttgtcgtggcaaaggaactgacttctcttgaaaaactgcagcagaaaagggatgccgcgttggctgtgatctttggcaagtccaagctgaacttgtctacgcctcttatcaacccaatcagcaaatccgtgaataacaatgctgtgtttaatggaaacatcggtggtagtctttctgttaagtggcccaaacctgcaactgcgcatggtgcatacctgcaagatgaaaacactgctgtgaagcctcgttctcaacttgttgtcctctgtgaagagatgaatgttaacgggcttcataagttcatatcagacaatcgcaaagacttaacatccatccgtgaggaaatccccgttgcacttaggggagcaactgatccatatggcttggtgttagcttctctagaagacttctattttggagacaatcttatattggatggcaaaaaggatggaaaccttctgggtgtacggaggacgtgcctcatgttgatggaatcacttgctcagctgcaaactgatgctactactggtttcatatcggaaggtcaagtgcttactgcaagtatcaaggagcgtgcaaaaaagattgctcttgagtggaaatccaagttggatagccttgactttgatgctagcaatgggaactgcctggaagcacatgcgtttcttcaactcctggctacctttggtatatttgctgaatttgcacaagatgagctgtgtaagctacttccctcagtcagtcgtcgtcgtcagacacctgagctttgtagaatacttggattgtcccagaacatgccaggtcagtgctatcatcgattaataatgcagcttgttccattgagcatcaataataaatggaattttctatttctctttgtcactcagatgtttagagaacacattctgaccacttcaataattgttcatatatctatatatctataccatgggatttattttctagttagtggctgcagcaagagatgcctacaagtaatcagaattgtagcattgctgtttagataatttgtatggaaaatctgcaggctgctacttataatttggcagccgcacaccgaacctcactatctagtatctgtattgtacttagtggcagcaaagtttccacagcttctaagctatgttatatgctcagttgaggtcttaatttaactgaatgtatttactaacttataaataacatatatgatcatatattctggagcataacaagctaagaggacgtcattcaattcgccgaccttgcccttgagcttgattacatactgggatgtgcttttgtgcatctattttagaaaaagaataatacgaatatctaagaaatatggttaatattattaggaggcaaatatgcattaaacaaaaaaagataaccattgaaagatttgccacccgcatggttttgaaacagtattaacctagacgctagtcagtggtcggtcaatgactagcggctgttgactagttagtaactagtcggtggttccaatatgtccaaaaataaaatattgctcaaaagtagctagccatttaacatgttttatagcatattttcagatcaagtactgactattgattattgagaaatataagactgacaatttgataagctgcatgaggtgaaggcgagagagcacgtggcggctcttgactgctccagacgtgtcatgggagggaataaccataggacctttcccacccctcttatcccacccgtttagcccaaattttcagtccatgccacttttctgtttcctagttgacctgtttaaccgactagtcacttgactaatattgatcaacttgaacgtactagaccgattttaaccaactaattcaccttttaccccctgacctaggtggattgttgctgactagtgactagtcaccgaggtccctttgctccatacttttaattttgcctttcttcttttccgcctttctgctgctgcatgttcttttcgtttttacaggtcagcacattttctcatgagatattttcttgatgttaggtgtcattggagttctggttgaaaatgggagaactattgatgcaattaatttggcttatgcatttgagctgactaatcagtttgaaccggtggaattactgaaagcctatctacaggaggtcaagagtgtgccacatttcaagactggaaagatatctctgcaagtacaggtgcacttttttcatttcaattttaaactgtatgataccctgtaaattttctttcacagaaccagggttcaagattgaagtgggaaacatagtaatcctggtctgctctgattttctttttttttaaaaaggcatggtttaatttagttccattttttccctcgaacatgcaggagggaatttagttgcgaaaattatcactaagaatttcaaaaccaaacactaaatcattgcaagacttcccttaaaaaaaatcaatatacacctgtaaaggctgagtgaaaatggagtcgaaatgaacaggattgcttgtagattgtagcaattctgttcgatggatcggttgccagttggtgacacatgcattcattctctaattgaatacgataaaagttcttttttcgtgaaaattacgacaatattgtgctggagtatttggactgaaagcaacttgttctctagtattctttcatgtggcaccatgacatcctgtcactacaatccacaaacggctcctcatgcttcatacctagtatagagattgttccagaatttccttggattgactagtttggatgggatttttcttagatccatgaaagtgaatcccgtgtagaactactagttacaccaactctgttaagaagctctgaaccacatgaaagtttatttttttcagctcgtggccctttgccaccataaacaaagttccagttcttttttctaacaacaggatagcttaacagtcttttaggagattatttagtacttgctctgtttttaactctaagctagtttcacctgtgcaactgtttgaactttctaattatgttgtgtgatccagcactccagctgatcgtgtttgaaaatttcctgatataaatggtaatgagacatttggccctttcagcaattgaattcagctactttgattcattaggttctatggctgtcaagtcgtatactgtaattgttcactcacttatttgatttatttatcctggaatagttaaagtacggggtttgatcatatcataaagttagcaaatcatttagccaccaatcagcttcaatgtagaagctgcagtgctgttctgaagaacttgaataataaagagctactttagcttgcaagatactattcagctatagttgcttgctaccttttctttcttgtgtggggtaacaaatattttctcttcttgctggtctgtacattttttaagcatatctgcgtgcattcctaattaattgtgattgtagtatatctgatgaattaccatattattcagaatgaaatgaatgaacgagagctgtctgccttgaaagctgctattaagtgtatcgaggagcacaaacttgatgagaaatatccgattgacctgcttcagaaaagagttatccagctagagaaagctaaggcagacaagaggagggctgttgaagctgcaaagccacagtctaagaggcctcgtgccaatggatccgtatatgcgccacatactagctttcctgacaaaagcttctaccaggctgctccgccgcagaggcattcctacccttacgagaggcagtatgtgtatggtgctgaggcccatcaccatcccacaatgataagctcagctccctatggcatctcacctgcccacacaacatattatggtaatggctatcaggttcagtaccaggtaccatatatccactgatggagagagcgtaatgtgctctttcctaactatgtactagcttttaacctgctgctactatgtgctgtagttgtatcaatccactagctagactgcctagcttaaattagttcgaccactcttgtgtgtgctgagtggccagtgtgaaaatctgttaatttccctcacgacttatgacataatttacttctaatgtctagttaaaataatttgcttttgtttaatatatagcctatggcatatatatgttggagttgagatagtcccagtactgcagaattctggaattatgtgctctgcttggtgga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|
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