Os09g0258000
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Structured Information
| Gene Name |
Os09g0258000 |
|---|---|
| Description |
Cellular retinaldehyde-binding/triple function, N-terminal domain containing protein |
| Version |
NM_001069234.1 GI:115478207 GeneID:4346537 |
| Length |
5493 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os09g0258000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:4915396..4920888 |
| Sequence Coding Region |
4915838..4916152,4916516..4916596,4916718..4916819,4917353..4917448,4917524..4917583 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008402:4915396..4920888 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcggccgcttcggaggaggccatcaagcagttctccgcgctgatggagctgctggatgagccgctcaagaccacattccagcatgtccatcaaggatacgcaagaggaactctggtgcgttttctaaaggccagagaatggaatgttccgaaagcacataaaatgttaatggattgcttaaattggaggatacaaaatgggattgacagcgttctggctaaacctatagtcccttctgatttatacagaactattcgggatacgctgctggttggattgacaggatactccaagcagggacaacctgtctatgcattcggtgttgggctcagtacccttgacaaggcatcggtgcactattatgtgcaatcacacatacagatgaatgaatatcgagatcgtgttgtactgccgaaagcctctaagatgttcgggaaacagattaacacttgcctaaaggttatggatatgacggggctgaagctttctgccttgaaccaaataaagatgttatctacgataacagccatcgatgaccttaactatcctgagaaaacagagacctatttcattgtcaatgctccatatgttttttcagcatgttggaaggttgtgaagcctcttctacaagaaagaacaaaaaggaaaattaaagtcctgtacggctcaggaagagatgaattactaaaggttatggactatgaggcactcccaaacttttgcaagcgagaaggatcaggctcgtcgaatgattcgtcggatggagttgattgctactcctatgatcacccttttcaccaggagctgtataattacatcaaacagcaagccctgaatgaagacttcatcggtcccataaagcaaggctcaatgcatgtggatgtgcccacacctgatctggaagaggccaagatcatggagacgatcgaatcggagctccacaaattcagtggagctaatggcctctcgcattcattcaacaagatcaagattgaaggtccgtga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAASEEAIKQFSALMELLDEPLKTTFQHVHQGYARGTLVRFLK AREWNVPKAHKMLMDCLNWRIQNGIDSVLAKPIVPSDLYRTIRDTLLVGLTGYSKQGQ PVYAFGVGLSTLDKASVHYYVQSHIQMNEYRDRVVLPKASKMFGKQINTCLKVMDMTG LKLSALNQIKMLSTITAIDDLNYPEKTETYFIVNAPYVFSACWKVVKPLLQERTKRKI KVLYGSGRDELLKVMDYEALPNFCKREGSGSSNDSSDGVDCYSYDHPFHQELYNYIKQ QALNEDFIGPIKQGSMHVDVPTPDLEEAKIMETIESELHKFSGANGLSHSFNKIKIEG P</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>4737..5051#4293..4373#4070..4171#3441..3536#3306..3365#2994..3047#2682..2759#2359..2412#2201..2284#504..532#269..323#gacctcaccatcgtcggccggacctccacggaccgcatacgcgcgacacgagcacacgaccacgcaatacgcagcagcagcagcagctacccagcagatcgatccgaccgacggaggaagaagataaaagggcagaagagaaggggtgtgtgtggaaaaggcgagtaaagactccagctttctccccgtttgacctcgccctgctcaccgcgaaggctcgcccccctccctcttccctccccgccgccgtcaccggcggcaggcagcaatggcggccgcttcggaggaggccatcaagcagttctccgcgctgatggagctgcgtgagtgttttctcttctctctattcttgattgctactgaaacaaataataataataataataataataataataataataataataataataataataatgaggagggaaggaaaagttgaacactatctctctccgaggttgttcttgtttgctgagatgcgctttgttttgttgcagtggatgagccgctcaagaccacattccaggtgccgatctgctctttctgctgccatggctggatctctttcttccttccttgctctgtattttgctctgctagaactaacttgttggttggtaatatttggtgatgtttctgcgttgggcgtgcggctgttttggccgagctttgcttgatttttttttttgcctctgcttctgtttcttgctttgcatttttggtggatttgggagttgcagctcccattctttgctcggttcttgcttggtgggtaaattttatagatctttgaaagttcattgtgatccgtagctcagctgtaatattgtcaagctttcttttatcaatttggaacatctttagtttttgttttctttatatggttttactttggtcatttctagctcatgctcttaaattgattgtctgactagttatagcgttcaagtttggtgctccaacagtttactttgtatttatatgatttctgttcggtcgcagtttttgtcactttttctatggtcaagttgcaattttttttcagactagtatctttttaggtgaaattgcacttcttttttttaccgtattcatgccgtggactcagggctaaaccactatcttcagctgtagttgagcaaatttgcggcgaaaaagttgagcaaattttgcttgacttgcacaggcagatatttttttttgtaagaagattttgggagatgttttaagtagtactttagtaccttttgcggtcctaattgcagctttggtacaagcagccaattttggggcaattcttggtgtcggtgccatgtactgtttgttcctagcttcgtcatttggagctcaagagctgtattattactttattacatctcgtctgactcagtcatctgtgccggctaggagagtttaattttccaaccatattcgttgattgttccaatggctatggtttctagatcccaagactttgtgaggtcaagtaccaccagaatgatgtatgtattgttagcagttggaagccaaactatttagtacatgggagggagatggctttgttgtgtgatctttcacggcaaggcttcttgttggtgtgaattgtgattcagacaccatgtcaccatgtggatctcggtggccgctaattaatggccgaagaagttgctgttgtttaatttggacgcttgctgatgagggatggaccttgtgttcctggactttgtgtggcctgggactgttcctggtggagatgtttcaattgccgatttggacttcttttatatgcttatgctctagctgtccttttcctgataagtatgatgccattagtgatctcaggaagatgtgtttggttgcgcaagcgcgctggaatcccaatatgtccactaagaaacaacatctttgtttcaaaaaaatatatttctttcccacagcagtcacaatgtcaccaccaaagaacaacatttgcttttctctccctgttgtgttgctagatgctttttcttgacctctgtctacatttgttatcttctttttccgttttgtttttttggatgcatgagttgcatttcctttttttccctacaaatattccatcactagttatatagtttttcatcagctgcttgtttgaaaataataattctaggggtgactaatgcttaactagtactatgctaaatgttcacagcatgtccatcaaggatacgcaagaggaactctggtgcgttttctaaaggccagagaatggaatgttccgaaagcacataaaatggtaaagcttgctttttgcactctactgacaacagataagttatttatctctgaatatttaattgtttgatgcagttaatggattgcttaaattggaggatacaaaatgggattgacagcgttctggctgtaagtacccttccattggagattggacggatttacttttaatttcttttgaggaatgcaagactgctctgctagtcagtgatttaaaatctgttacaagatgaattcaagttgatgccaaaaaaaaaaatcaatctcttgcacttgtagcagcaaacgtttcgaatgtcagatttgcatcatgtactgatccagaattgcactgcaaattgctaataggttcatcttatgctatttatctaaccagcaacttccgtttcttaatgcagaaacctatagtcccttctgatttatacagaactattcgggatacgctgctggttggattgacaggatactccaagcaggtatagcgaccagactcatttatttcattttttcataattttaatggagccttatgttcaaatctcacatttcttaagtcaaaaaaaaatctcacacttctttatctaaaattatctggttttggatggcattgtattgctgaacaatagtttcatttgacagcagtttgctttctctttgttgagtaaaggcttttttgctgttcttcgtctcatttcctctcctttttgtagggacaacctgtctatgcattcggtgttgggctcagtacccttgacaaggcatcggtaggtatttattgattagagtctgaacaaatctacctgggttaaatctaaaataatgtgcatagtagtatttgttcaaagccagattcactgagctaaagtctgataccattatggtagatgataaactaaattgcatttgattacttctaacttcagttataggattaggaattagcaactgtttaatacaaaacatagcatgatatatctttttcttggaaatattttgtctaaattacttcatttttgtactaggtgcactattatgtgcaatcacacatacagatgaatgaatatcgagatcgtgttgtactggtaagccttttctattgatgattcataatttcaatgttataaacagatattaagtatattttttctcttctttagccgaaagcctctaagatgttcgggaaacagattaacacttgcctaaaggttatggatatgacggggctgaagctttctgccttgaaccaaataaaggtaggctgtctttcgcatttgctaaaatcttctctctttccggtgtaacctctcagatatgcaagataactgacagtgggcttattttgtatgtggtaaaatgtttgatgtcaattcaaatttgaattcaagtgtcataaatcataaaaagagactctgtggtgcaaggggtcataaatcatgaacatgcctagaatcgagttaattggctttctgatctgcctaatacctaagagcagcttgtaatggattaattaaagtaatgcatttgatctccctcattttgttatctattctgcaactggatgtggatcacagattaatagtatcttctatgctgctgccaaactacttcattgtttagattatggaaagctaacaatattggtttattcattatactgatagcttaactttatgtgtgatgtttttggtttcaaggtttttgtatgctgaccttatgctataccaggctttcagttttcagtgaaaataaacttttcaatatgcttatcgacttcttcatgatgcagatgttatctacgataacagccatcgatgaccttaactatcctgagaaaacagagacctatttcattgtcaatgctccatatgttttttcagcatgttggaaggtcagtatacatatacaccatgcagtcaatttgcatacacgttctattattttcttaattccaacttccgtttgaaggttttgaagtttagcacatcattttttttttcatttgtggctaggttgtgaagcctcttctacaagaaagaacaaaaaggaaaattaaagtcctgtacggctcaggaagagatgaattactaaaggtaaatatcattaatctcttttacttaccattaactttctccacatactaggcggtacctgtaggttctgataaatgctatgagcttcaagtttaatttctattgcaagcatgtgggcaaaagttatgtggaattgtggaccaacctctccttactaaggaatccatcacacagtcagcacaactatgtttttggacgctcaaatttcacacgcatctgtgagcatgaataagctgactggaaagaagagctttttgtacaaccagccatcctaacttttagtggtcctgttgatctcatagcttatgagcgtcgtttagacgtgtattgggattacactaagatctcttatgtgactatcaggttatggactatgaggcactcccaaacttttgcaagcgagaaggatcaggctcgtcgaatgattcgtcggatggagttgattgctactcctatgatcacccttttcaccaggagctgtataattacatcaaac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