Os09g0272800
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
| Gene Name |
Os09g0272800 |
|---|---|
| Description |
Reverse transcriptase, RNA-dependent DNA polymerase family protein |
| Version |
NM_001188816.1 GI:297726762 GeneID:9268298 |
| Length |
7073 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os09g0272800, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:6029084..6036156 |
| Sequence Coding Region |
6029084..6030217,6031532..6031699,6032856..6032915,6033060..6033168,6033871..6034169 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008402:6029084..6036156 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008402:6029084..6036156 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggctactccagctaggttttcaactaagcctgatgttttcgatggaactgattttcctcattggtgttgtaagatgcaatcttacattatggctgaaaattatgatatttggaggaaagtttctcttccttatgtgattcctgaagccattaatactgatgctttaaaaactgagtttgaaaataattgcaaagctcgtaatattcttttgagtgggatttctcgttctgattatgatcgtgttgcacatcttgaaactgctcatgagatttggaatgctttgaaaaactttcatcaaggaacaaataatattaaagagcttcgtcgagatctttttaaaaaggagtacattaaatttgaggtgaaatctggagaggctttggatgactatctttctagatttaataaaattttgagtgatcttagatctgttgattcttcttatgatgttaattatccacaatctgatatttctcgtcactttttgaatggtcttgacatgtctatttgggagatgaaagttacatctattcaggagtctgttaacatgtctactttgactttggattcactttatactaaattgaaaacacatgggatgaatattctttctcgcaaagttgattctaaatcgagtgctttggtttcctcttcttcctctttggttattgatgcttcttcatctatgccttcttttcttgctgcttttaatgccacatccgatgatcaactcgaacaaatcaaggaggaggatttggctttggttgctaaccgaattgctcgagctatgaataatgccaggaacaggaaaagaggtggtccaaatcgttgctttgaatgtggttcaattgatcatcttcgttcgcattgtcctaagcttgggagaggcaaaagagaagacaaagacggtgagaagaccaacaacaacaagcccaacaactacaagtcgaagggttctaaccaagggaggaagatggagaatcttaggaaggcctttcaacaagtttgcgccgctttcgagccactaagtgatgtagatggtgaaagtggagatgatgataagggaaagaacgtctccgatgtgtgcttcatggtgcgtggtgaatctgacacagagtatgaagataatgaggctttggtggcaaggaaggagaacgtgtggatcgtggattccggttgttcgcggcacatgaccggtgataaaaattgcttctcctccctcaaaaaggcatccaagactgaatcaattgtctttgctaatgcttctaccagtgccgttgtcgctacaggtttggttaaggttcagggggaggatggtcgtatttttgaagacgagagcgactacgaccacgacgatgagaattcaacttcgaccagtactgaaacagaacgtggatcaacttcagaagttgctgctcctttgcacaatcaacgacgacatccgccggaacaaattattggtaatatagattttgctgagactatgcgcagggaatttgagatgagcatgatgggtgagttatcgtactttttgggattgcaaattaagcaaacacctcaaggtacctttgtgcatcaaacgaagtatacaaaggatcttttgcgacggttcaagatggagaattgcaagcaaatttcaacaccaattggttctacagttgtgttggatcctgatgaagatggtgaagctgttgatcaaaaggaatatagaagtatgattggatctttgttgtatctaactgcttctaggccagacatacagtttgctattctttggcttttatctactttgaaagattatggtcttacttttgagaaagtacctctcttttgtgataatactagtgctatcaatattgctaagaatcctattcaacactcacgcaccaagcacattgatattcgttttcactttttgagggatcatgttgagaaaggagatgttgagttgcagtttttggacacaaagttgcaaattgctgatattttcactaaacctttggattctaatcgctttgcttttcttcgtggtgaattgggcgtcattcatccttttggcatggtgactcgatgtctcgggagagtatttgcggtgatggaccgggagtcggcttggggataa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MATPARFSTKPDVFDGTDFPHWCCKMQSYIMAENYDIWRKVSLP YVIPEAINTDALKTEFENNCKARNILLSGISRSDYDRVAHLETAHEIWNALKNFHQGT NNIKELRRDLFKKEYIKFEVKSGEALDDYLSRFNKILSDLRSVDSSYDVNYPQSDISR HFLNGLDMSIWEMKVTSIQESVNMSTLTLDSLYTKLKTHGMNILSRKVDSKSSALVSS SSSLVIDASSSMPSFLAAFNATSDDQLEQIKEEDLALVANRIARAMNNARNRKRGGPN RCFECGSIDHLRSHCPKLGRGKREDKDGEKTNNNKPNNYKSKGSNQGRKMENLRKAFQ QVCAAFEPLSDVDGESGDDDKGKNVSDVCFMVRGESDTEYEDNEALVARKENVWIVDS GCSRHMTGDKNCFSSLKKASKTESIVFANASTSAVVATGLVKVQGEDGRIFEDESDYD HDDENSTSTSTETERGSTSEVAAPLHNQRRHPPEQIIGNIDFAETMRREFEMSMMGEL SYFLGLQIKQTPQGTFVHQTKYTKDLLRRFKMENCKQISTPIGSTVVLDPDEDGEAVD QKEYRSMIGSLLYLTASRPDIQFAILWLLSTLKDYGLTFEKVPLFCDNTSAINIAKNP IQHSRTKHIDIRFHFLRDHVEKGDVELQFLDTKLQIADIFTKPLDSNRFAFLRGELGV IHPFGMVTRCLGRVFAVMDRESAWG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..1134#2449..2616#3773..3832#3977..4085#4788..5086#5393..5686#7014..7073#atggctactccagctaggttttcaactaagcctgatgttttcgatggaactgattttcctcattggtgttgtaagatgcaatcttacattatggctgaaaattatgatatttggaggaaagtttctcttccttatgtgattcctgaagccattaatactgatgctttaaaaactgagtttgaaaataattgcaaagctcgtaatattcttttgagtgggatttctcgttctgattatgatcgtgttgcacatcttgaaactgctcatgagatttggaatgctttgaaaaactttcatcaaggaacaaataatattaaagagcttcgtcgagatctttttaaaaaggagtacattaaatttgaggtgaaatctggagaggctttggatgactatctttctagatttaataaaattttgagtgatcttagatctgttgattcttcttatgatgttaattatccacaatctgatatttctcgtcactttttgaatggtcttgacatgtctatttgggagatgaaagttacatctattcaggagtctgttaacatgtctactttgactttggattcactttatactaaattgaaaacacatgggatgaatattctttctcgcaaagttgattctaaatcgagtgctttggtttcctcttcttcctctttggttattgatgcttcttcatctatgccttcttttcttgctgcttttaatgccacatccgatgatcaactcgaacaaatcaaggaggaggatttggctttggttgctaaccgaattgctcgagctatgaataatgccaggaacaggaaaagaggtggtccaaatcgttgctttgaatgtggttcaattgatcatcttcgttcgcattgtcctaagcttgggagaggcaaaagagaagacaaagacggtgagaagaccaacaacaacaagcccaacaactacaagtcgaagggttctaaccaagggaggaagatggagaatcttaggaaggcctttcaacaagtttgcgccgctttcgagccactaagtgatgtagatggtgaaagtggagatgatgataagggaaagaacgtctccgatgtgtgcttcatggtgcgtggtgaatctgacacagagtatgaagataatgaggtgtgtgcttttgaagaagctattaatattttgagtgcaaaaaataaaaagtgtgagaagatatataaaaaacaggagtttatcattaaatctcttaaatctgaaattaacaggttaaaatctcttattcctaatgatgatgattgtgaaaattgtgaggttttaatgaatgagatttcaaaaattagagatgttaatgctgcacatgatttgaaaaatagatcttctcttgcttgttgttttgctttgcacacacgcactttggatgagttgtttttaactaaaaagttgttacaaaaatatcaaattgcttttcatgctagtttgatgtttaacatgatttctgctaaaaagttaaaacaacctcatgatgttttggattgctcaacatgtaatttgaataagatgaaactaaaagatgctttaggtcgtgttgagtacatggaagatgttgtgaaaaacaatgaagtgctttcttgccccaaatgtcgtaaaagcaaaggtgtcatggtagattgtgaaaattgtgctaatttgaaaaaagaggtttcttatttgaaaaattctttgctaagattttctgatggtaaaaataacctcaatatgattttggatcaatcaaaggttagcacaaataaccgtggtttaggttttgatccttatgctcataattctagacatcctcctgttgtgttaggtgttggtgctaaaagtggtgagattttgattaaacatgatactaataaaactgtgtttaaatctgctggtatcatgttaaccatgaatgtatcttcttcaaaatccaatgttgtgcatgcaaaacctcctgtttctgcttgtgttgctaaatcttcttgttctaacaatgtgtctaaacaacgtgaaaaatatacttgttctttttgtggaaaagatggacatattgttggtttttgtttcagattagctcataaacagaaaaaggagagagagattgcttttgcaaaatcaaagtggcaaaaatcgggttttccctcgaggaaaccggtcagaccgcagtggatctcgcggtcagaccggcgaccggtcagaccggctgcagagcctcggtcagaccagacaccggtcagaccggcggtacagaggtggtcagaccggcccccggtcagaccggccactgtacctcggtcagaccggcctcggaggaatttttctgaaaattccaaaattgatatgcctattgaatcttctggtcgtgtgtctcagtactggattcctaaatttttattatcatctaaccctagtactgaggcttcgacttctgcttgtgtgtaggctttggtggcaaggaaggagaacgtgtggatcgtggattccggttgttcgcggcacatgaccggtgataaaaattgcttctcctccctcaaaaaggcatccaagactgaatcaattgtctttgctaatgcttctaccagtgccgttgtcgctacaggtttggttaaggtaaatgaaaattttgaattgaagaatgtagctttggttaaggatttaaagtataatttgctttcagtttcacaaattgttgatgaaaattttgaggttcactttaagaaaactggaagtaaagtttttgattcttgtggtgattctgtgctgaatatttctcgctatgtaagagtgtttaaagctgattttgaaaattctgtttcacctgtgataacatgtttggttgctaagtttgataaagatgtgatgtttttggcatcgtagacttggacatattggttttgatcatctcactaggttaagtggtttggatcttgttcgtggtttgcctaaacttaagaaagatcttgatttggtttgtacaccgtgtcgtcatgctaagatggtttctacttcacatgctcctattgtttctgtgatgacggatgcaccgggacagctattacatatggacactgttggtccagctagagtgcaatctgttggaggaaagtggtatgtgttggttattgttgacgatttttctcgatattcttgggttttctttatggcaactaaggacgaagtttttcaacactttcgtggtttgtttcttcgattggagcttgaatttcctggttctttgaaaagaattcgaaatgataatggtggagagtttaaaaatgcttcatttgaacaattttgcaatgaaagaggtcttgaacataaattttcttctcctcgtgttcctcaacaaaacggtgttgttgaaagaaaaaatcgtgttttggttgagatggctagaacgatgttggatgaatataaaactcctagaaaattttgggctgaggctattaacactgcttgctatatttcaaatcgagttttcttgcgttctaaacttggaaaaacttcttatgaacttcgatttggtcatcaacccaaagtttcacatttgcgtgtttttggttgcaaatgctttgtcttgaaatctggaaatttggataagtttgaggcacgctctatcgatggattgtttcttggttaccccgcacacactcgtggctatcgtgtacttattttagggactaacaaaattgttgagacttgtgaagtttcttttgatgaggctagtcctggtactagacccgatattgcaggtacactgtcacaggttcagggggaggatggtcgtatttttgaagacgagagcgactacgaccacgacgatgaggtcggctcggccggtcagaccgggcgccaggccggtcagaccgccggcacacctccggtcagaccggctcatgaggagcggtcagaccggccaggttcgtcgggttcggatactgttgatgctgatcgagatggtcctctagagaattcaacttcgaccagtactgaaacagaacgtggatcaacttcagaagttgctgctcctttgcacaatcaacgacgacatccgccggaacaaattattggtaatataggtgagcggactacaaggtttaaggtaacgactcatgatgtttgtgcaaattctgcatttgttgcttcttttgaacccaaagatgtgtcacatgcattaactgatgaatcgtggattaacgccatgcatgaagaacttgaaaattttgagagaaacaaagtttggactttagttgaaccaccttctggacataatgttattggaaccaagtgggttttcaaaaataaacaaaatgaggatggtttgattgtgagaaataaagctaggcttgttgctcaaggttttactcaagttgagggtttggattttgatgaaacttttgctcctgttgctagaattgaggcaattagacttttgttggcttttgctgcttcaaaaggttttaaattgtatcaaatggatgcgaaaagtgcttttctaaatggttttatacaggaggaagtttatgtcaaacaaccaccatgttttgaaaatcctgattttcccaaccatgtttttaaattgtctaaagctttgtatggtttgaaacaagctcctagggcatggtatgataggcttaagaactttttgattgcgaaaggttttacaatgggaaaggttgacaaaacgctttttgttcttaagcatggtgataatcaacttttcgttcagatttatgtggatgatattatctttggttgttcgactcacgctttggttgtagattttgctgagactatgcgcagggaatttgagatgagcatgatgggtgagttatcgtactttttgggattgcaaattaagcaaacacctcaaggtacctttgtgcatcaaacgaagtatacaaaggatcttttgcgacggttcaagatggagaattgcaagcaaatttcaacaccaattggttctacagttgtgttggatcctgatgaagatggtgaagctgttgatcaaaaggaatatagaagtatgattggatctttgttgtatctaactgcttctaggccagacatacagtttgctgtgtgtttgtgtgcgcgctttcaagcttctcctcgtgcttcacatcgtcaagcggtcaagcgaataatgaggtatttgaatcatacacttgagtttggaatttggtattctacttcatcttctatatgcttaagtggatattcagatgctgattttggaggttgtagaattgataggaaaagtactagtggaacatgtcattttcttggtacatcattgattgcatggtcttctagtaaacaatctagtgttgctcaatcaactgctgaatctgaatatgttgctgctgctagctgttgttcacagattctttggcttttatctactttgaaagattatggtcttacttttgagaaagtacctctcttttgtgataatactagtgctatcaatattgctaagaatcctattcaacactcacgcaccaagcacattgatattcgttttcactttttgagggatcatgttgagaaaggagatgttgagttgcagtttttggacacaaagttgcaaattgctgatattttcactaaacctttggattctaatcgctttgcttttcttcgtggtgaattgggcgtcattcatccttttggcatggtttgaggggtagtttgtacctcatggttttatcaagcaaaaatatgataatgaaaaaattgagaaaagagagctttgtttatgcatatggtattttcttgtgcatgctagcaatactttgaaggtttatttgtctctagcatagcttgtatgtattctagtcttttcatgagatttagattttgcttttaagggagatgatgcattacacttaaattctatacttgaattaagaaaatatgcaatgttgatgctagcatatggtttgatttataaatgctctatatatatgctctattgacttgttattcctcaaatacctttaattgctcattgtgaaaaagagaataaaaaatataaaaaaaataaataccgaatccttggaaacagtcttgacgacaagaacgtattcgatgtgagcaaaataatatgtgtttagtgtttattcttcaacctatgtgcttgttaagatgttgcattataaatcgtatgaaatcatgaattttgattgttgattcaagcttaattgtaaaatctttgattcatggttatactttaatgcatgcttgttctgttatagatggattaatcttctttttattgcaacacatgacttgatatgctatatgtatgctaagctcttgaacattaatgaatataattcctatgcttgatgaaatcattgtcaaaagggggagaagtaatgtgaaaatttttggatttttttttgagaagcaaggtgattttttggagagttgaagagcatgtttttttgttcaattgggtatttctttcttttcaaaagggggagaagtttttttttggatttttgagcacgatgtgaacatttgtacgaagtgtgctttttaccaccaaataccaaaacatttttgtgagtttgccaatgtgttcatcaagggggagattgtaaaaccaaaggtgtttttgattattactctgtgatgaacaattgggcattggagattattggttttgttatttggaatttattcacgaagtggttttgaagatgattggatttcacaggtgaatctgcaggatttaatgtggaccggtcagaccgggctttggtagccggtcagaccggcgtgtaatgcccggtcagaccggcgcagcccgcggtctgaccggccgacactgtgtcggtttcggtttcgggttgtttatttggatatccgagtttattccatgattatgagttctagatggatactatacgtatgtaatactattgtttgctactaatgagtcaagttggagatagcttggtctcggaatatggtttttttgtttgttccatgtgtaggtgactcgatgtctcgggagagtatttgcggtgatggaccgggagtcggcttggggataa</dnaseqindica> |
| External Link(s) |