Os09g0306700
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Structured Information
| Gene Name |
Os09g0306700 |
|---|---|
| Description |
Similar to Phytochrome and flowering time 1 protein |
| Version |
NM_001069359.2 GI:297609189 GeneID:4346673 |
| Length |
11270 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os09g0306700, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:8479792..8491061 |
| Sequence Coding Region |
8479793..8479968,8480035..8480097,8481506..8481536,8481638..8481701,8481822..8482000 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008402:8479792..8491061 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>tcatctctctctaacctcacgaaacctaacaagaagaagaagaagagaaattccggcaaggaagggagggagggagaagtcgttggtgcgggggagattgatttcgcgggagggaggggagctcgagaggcggtgattcggggagtcggcagggtggcgccgggtgcggcggcggcgacggcggcgctggggccgtactggcccgtcaccgtggcggactacgtcgagaagatcgtgcggagtttttgtgcacatgaaatggcaggacagaagctcgcagggacaccccctgaacttgcattagtcgtcttccatacccatggtccttatagcgctttttgtgtgcaacggagtggatggacaaaagatatgaatgtgtttctttcatggttatctggaatatcatttagtggtggaggctttagtgaagctgctatttctgaaggtcttgctgaagcattgatggtattgacatattggcatcgttcagttcttttcactttttgcacataa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>SSLSNLTKPNKKKKKRNSGKEGREGEVVGAGEIDFAGGRGAREA VIRGVGRVAPGAAAATAALGPYWPVTVADYVEKIVRSFCAHEMAGQKLAGTPPELALV VFHTHGPYSAFCVQRSGWTKDMNVFLSWLSGISFSGGGFSEAAISEGLAEALMVLTYW HRSVLFTFCT</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>2..177#244..306#1715..1745#1847..1910#2031..2209#gtcatctctctctaacctcacgaaacctaacaagaagaagaagaagagaaattccggcaaggaagggagggagggagaagtcgttggtgcgggggagattgatttcgcgggagggaggggagctcgagaggcggtgattcggggagtcggcagggtggcgccgggtgcggcggcggcgggggcggccgtcggggggatggcggcggcggcggccgagaggcagctggtggtggccgtggaggggacggcggcgctggggccgtactggcccgtcaccgtggcggactacgtcgagaagatcgtgcggtaatgctgcgcccgtgctttcctccccccgccgcgccaccctgctttcttgttactagttgactgtacggccgtcgcggattagtgcatcttggatttcttgatgtggaagaattggaccctttgttgattgtttagctgtttattttgagacgaagggagtacatggaacgcgaagcggtagctagttagttcttgatagtggaagttagcagctatccgtgtatgtgtttgatatacacagttttttagttatattagtcggatatatcgttcactccaagcattagtaggagatttggagatttgttgtttgctctcaccttcttaattgcaaacattaaatggtactagttagcttcaattctgtttcacaatgcttattcaaagagtaagaatgcaagcgcatcatcgatgtgtggaaattcgtggtttcttgatgaactggttggttgttggctatatggtgttgtggcacgagatacatctttttttgctcctgattcgaggagactttgtatcactgcatatgtgcagatctatgacagaatgtagcataattcatcttctactttgggttttatgccttttctagttcctccttgctcattcagaagtatttttcttcagtctagcatattttagtgttttttttttcatgaatgatgaatgattcccatgaaaaccaatttcagtttttggctggtgattttactactcttctgtacaaccagtaatgtaatgatgggatgtctgtttggttatggttatggcttttctgaagtccttgttttcactcttgttaattagttgatgttctggtttcgcatgggtgtaattggaatattcatcacatgagtcaaatttcttgtgttcaagcctttcaaataaaaaaaataatgaaagtgggagctgtttgtattgttggtcaataatcagtttgctctgaattattagggtttgtttgcagttgctatcctcctgtgcttattatttagcttctgtggaaacagttaagaaaaacttcgtagtctgtttgagaaatcaaattaatgttagacgaattctgttagtcaatttaaactgttatttctctgacaagtgttctgtttttagaactgaaataatatctctatttgcaacttgattaaaagagcagcagttagccaaacatcaaaatttctataagctactgtacggaacaggattatcatagtccacctcaacgcaaaatccaaatggagcctttgatgttatgtggtgatccaccacagcttcactctcatatacttactatcatgaaacttttaagctcatctcttgctagaaatttttgtcaatttctgtagcacttagtaacctttgcatttttagtactactattcatgaagcatttcaatttatgcaggagtttttgtgcacatgaaatggcaggacaggtaatttgctctcagtatttatcgtcggacttactacttgatccatgtttccttgacttgtgtcaaaactcaaaagtgtaaattattatcgtgttatgcagaagctcgcagggacaccccctgaacttgcattagtcgtcttccatacccatggtccttatagcggtaaagtttgatatcctccatgccctaagctttttattatgatccattgcaattatttgtatttagttctatatcaacaaaacatgtaagctatgataattcgcttttgattccttgcagctttttgtgtgcaacggagtggatggacaaaagatatgaatgtgtttctttcatggttatctggaatatcatttagtggtggaggctttagtgaagctgctatttctgaaggtcttgctgaagcattgatggtattgacatattggcatcgttcagttcttttcactttttgcacataatgacttcctctggtgtttcctgtactttttttttttggttcaaaatgcataaattagaaactgtggcttactacttccaaaatttcagtactgcatatggttgcctacttttgagttcccgtgcaaggttttagcattttgtttggcttgtgcaatcatgcttcatttggcatatgaaatgatgtttcttttttgccaaatggcacatctttcatgttaacatcaacagtagcaacctttagttccaggcaagttggggtaggctagagatgaaactgatgtgcagccacaaaaaaactaagggaagtatagtactagtaataacaatatagttaaagaagacgtgaattaggtcatgattctgggcatgtggaccgccaatttccatgcaactctatccaaaaccataattcatctccacaggaacgactgggatttttatgatggcttaccaatgttatcgcaacattcttcctttactcagcgttaggaccagctatgctgaagcaaaggcagagtttggtatcttattaacagagatattttgatttcctagatgaagggaaatacctcttttcatctctcactgcacctgaatttgggtccagttttgtctaaattagttgatctacaattttgtttctcatagtaagccctgtaaactattagttgagcctggacattatgtagaaccatgatacttaacaatacatgttctacccaaccttttggattactttattttccaagaattatagcttgttgtcttggtattgttatttccagtattctctagaatctgtcctttaatgcccttctgcacaacatatgattcatgtgagaaaattctaaggtggtttgcacatccacttatcagctattgtctcataaaaaatgtcttgatctggatatcagctacagatagccttaccttagtaaatagagtgtataactgtaatcaccatttcattaggttaatttttgtaaggaagattttcattagatcaaccctattaggaaactggatgtctgggccagtacccagaataagcagagtgaaactagtatgatcagaagtttaaattctatgaatgtacctatattagtatgttaattttcctatggtactgagtcttcaaaaatcaaaatttcagtcttcatccctactattataaagagggaatcgtcctcctccacctccacataaaagcctctttcctccataaaaactgtccaccctaaaaaaaactgtttactaataaagccaaccattgtataaacaccgaacagctcactgggcccaaatcctcccactaaacttaataaaaaaaaccattgcaatgcatgacagcatgagcctataactagttgaaaaatacttgggtctttgaatttgatatcattttatttcttgagttctctatgaattaaagtatttattgcctttatgattttatttcctgtgtgcaactagatactccaaggcagttctagtaacagtcagaatcatcaaagccatgaagtacaaaaacattgcatacttgttgcagcaagtaatccttatccactgcctacgcctgtctaccgcccccttgttcaaagtagcgatcacaaggagaacaatgatggagcaaaagaatcttgtcttgctgatgctgagactgttgcaaaatcatttgctcaggtcctacacaaatactgatatctagcatattgctgattacctgtgtttcaatgaagtggtcagcagtcattgttggttctaattaattttacttatattgatgtagtgctccgtttcattgtcggtggtatctcctaaacagcttccaactctgaaagcaatatacaatgcggtaatttcgttattttgttttgctaaattctgtaagccacaagccatctttaataatcttctcctggtattttacttgttcattgatggtatgatagttgcatcttgatttacagagggttgaaaaactcacttaagaatatatcttttaaaataaattataagcatgaacttgcagaactggccgctccactattacatatgttcttgtacttgtacacagtactaaacttcatattttcattaccattgaaataaaaagagtaaattttatcaaacaccacctattatggtccaagttgcacaaaaccacagggattttggcacatgacacataaccccatgtattatggccctaaggtttaacaagaccacaccgttaaccaattttacatactcctatatcaaagttttaaaagttttagttacattcatgtaacatttatatgatggataaaaaactcataaatttgtgatgtgattttataaatgatcaatagtgtggttgtgtgaaactttatagctataatacctggtggttaagtgtcacgtgccaaaacccatgtggttttgtgcaacttagaccacaacacctaaaggttaagtgaaatttactcaaataaaaatgaactcagtttggattgtactgtcattgtatcttatttgtggataagaaaaatatccatttatttcatttttttaattagttagtatcctgcctgaacttgctagctagtctttgtatggtttacagactataaatctatgaattggcatccttatctatcattagtttaatacaagcattttttaacttacatgatataaattttatcttctgcaagaccttcgacagtttgtactgatgaataa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